MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 32541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015380	AAT	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812976
2	NC_015380	CAT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812976
3	NC_015380	T	7	7	634	640	0 %	100 %	0 %	0 %	330812976
4	NC_015380	CTT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812976
5	NC_015380	GAT	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812976
6	NC_015380	T	7	7	740	746	0 %	100 %	0 %	0 %	330812976
7	NC_015380	CAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812976
8	NC_015380	CCA	2	6	931	936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812976
9	NC_015380	CA	3	6	935	940	50 %	0 %	0 %	50 %	330812976
10	NC_015380	AGT	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812976
11	NC_015380	TCC	3	9	1011	1019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812976
12	NC_015380	CTC	3	9	1097	1105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812976
13	NC_015380	TTAA	2	8	1183	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	330812976
14	NC_015380	GCA	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812976
15	NC_015380	T	6	6	1368	1373	0 %	100 %	0 %	0 %	330812976
16	NC_015380	AGA	2	6	1380	1385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812976
17	NC_015380	AAT	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812976
18	NC_015380	T	7	7	1482	1488	0 %	100 %	0 %	0 %	330812976
19	NC_015380	TGT	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812977
20	NC_015380	TAA	2	6	1636	1641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
21	NC_015380	ATT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812977
22	NC_015380	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812977
23	NC_015380	T	7	7	1660	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	330812977
24	NC_015380	AAT	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
25	NC_015380	TTC	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812977
26	NC_015380	TAA	2	6	1853	1858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
27	NC_015380	CTGCAA	2	12	1942	1953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330812977
28	NC_015380	CAA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812977
29	NC_015380	TAA	2	6	2038	2043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812977
30	NC_015380	CT	3	6	2046	2051	0 %	50 %	0 %	50 %	330812977
31	NC_015380	TCT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812977
32	NC_015380	ACCTT	2	10	2105	2114	20 %	40 %	0 %	40 %	330812978
33	NC_015380	TCATT	2	10	2151	2160	20 %	60 %	0 %	20 %	330812978
34	NC_015380	ATC	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812978
35	NC_015380	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812978
36	NC_015380	TTA	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812978
37	NC_015380	AAT	2	6	2361	2366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812978
38	NC_015380	AAAT	2	8	2424	2431	75 %	25 %	0 %	0 %	330812978
39	NC_015380	TATC	2	8	2508	2515	25 %	50 %	0 %	25 %	330812978
40	NC_015380	CCA	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812978
41	NC_015380	TGT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812978
42	NC_015380	GTA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812978
43	NC_015380	ATC	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812978
44	NC_015380	AG	3	6	2752	2757	50 %	0 %	50 %	0 %	330812978
45	NC_015380	TC	4	8	2766	2773	0 %	50 %	0 %	50 %	330812978
46	NC_015380	CCA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812978
47	NC_015380	T	6	6	2839	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	330812978
48	NC_015380	AAC	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812978
49	NC_015380	AGA	2	6	2926	2931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812978
50	NC_015380	T	8	8	2952	2959	0 %	100 %	0 %	0 %	330812978
51	NC_015380	TTAC	2	8	2975	2982	25 %	50 %	0 %	25 %	330812978
52	NC_015380	TCA	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812978
53	NC_015380	TGCAT	2	10	3041	3050	20 %	40 %	20 %	20 %	330812978
54	NC_015380	TCT	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812978
55	NC_015380	AACT	2	8	3163	3170	50 %	25 %	0 %	25 %	330812978
56	NC_015380	TAA	2	6	3204	3209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812978
57	NC_015380	CTC	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812978
58	NC_015380	A	6	6	3225	3230	100 %	0 %	0 %	0 %	330812978
59	NC_015380	T	7	7	3235	3241	0 %	100 %	0 %	0 %	330812978
60	NC_015380	TTG	2	6	3275	3280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812978
61	NC_015380	T	6	6	3321	3326	0 %	100 %	0 %	0 %	330812978
62	NC_015380	T	6	6	3346	3351	0 %	100 %	0 %	0 %	330812978
63	NC_015380	ATCA	2	8	3373	3380	50 %	25 %	0 %	25 %	330812978
64	NC_015380	TTGA	2	8	3442	3449	25 %	50 %	25 %	0 %	330812978
65	NC_015380	GGAAT	2	10	3569	3578	40 %	20 %	40 %	0 %	330812978
66	NC_015380	T	9	9	3726	3734	0 %	100 %	0 %	0 %	330812978
67	NC_015380	CTC	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812978
68	NC_015380	AT	3	6	3788	3793	50 %	50 %	0 %	0 %	330812978
69	NC_015380	TGA	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812978
70	NC_015380	CTTT	2	8	3925	3932	0 %	75 %	0 %	25 %	330812979
71	NC_015380	AAT	2	6	3933	3938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
72	NC_015380	AAT	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
73	NC_015380	ATTTT	2	10	4062	4071	20 %	80 %	0 %	0 %	330812979
74	NC_015380	ATTT	2	8	4082	4089	25 %	75 %	0 %	0 %	330812979
75	NC_015380	AAT	2	6	4100	4105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
76	NC_015380	T	7	7	4148	4154	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
77	NC_015380	TAA	2	6	4198	4203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
78	NC_015380	TAA	2	6	4246	4251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812979
79	NC_015380	CTT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812979
80	NC_015380	A	7	7	4317	4323	100 %	0 %	0 %	0 %	330812979
81	NC_015380	T	6	6	4370	4375	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
82	NC_015380	T	6	6	4400	4405	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
83	NC_015380	GAAT	2	8	4431	4438	50 %	25 %	25 %	0 %	330812979
84	NC_015380	CT	3	6	4451	4456	0 %	50 %	0 %	50 %	330812979
85	NC_015380	TAAAG	2	10	4507	4516	60 %	20 %	20 %	0 %	330812979
86	NC_015380	CCAC	2	8	4524	4531	25 %	0 %	0 %	75 %	330812979
87	NC_015380	T	8	8	4548	4555	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
88	NC_015380	T	7	7	4570	4576	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
89	NC_015380	T	9	9	4610	4618	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
90	NC_015380	ATG	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812979
91	NC_015380	T	7	7	4651	4657	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
92	NC_015380	T	7	7	4739	4745	0 %	100 %	0 %	0 %	330812979
93	NC_015380	ATT	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812979
94	NC_015380	ATT	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812980
95	NC_015380	CAA	2	6	4844	4849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812980
96	NC_015380	TAA	2	6	4881	4886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
97	NC_015380	T	6	6	4905	4910	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
98	NC_015380	T	7	7	4914	4920	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
99	NC_015380	T	6	6	4945	4950	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
100	NC_015380	AAT	3	9	4971	4979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
101	NC_015380	AAC	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812980
102	NC_015380	AGT	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812980
103	NC_015380	TAA	2	6	5121	5126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
104	NC_015380	TCT	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812980
105	NC_015380	T	9	9	5148	5156	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
106	NC_015380	T	6	6	5166	5171	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
107	NC_015380	TCT	2	6	5188	5193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812980
108	NC_015380	T	7	7	5210	5216	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
109	NC_015380	T	7	7	5225	5231	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
110	NC_015380	ACT	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812980
111	NC_015380	AAT	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812980
112	NC_015380	T	6	6	5361	5366	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
113	NC_015380	CTT	2	6	5450	5455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812980
114	NC_015380	AACC	2	8	5470	5477	50 %	0 %	0 %	50 %	330812980
115	NC_015380	GTT	2	6	5504	5509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
116	NC_015380	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
117	NC_015380	CCT	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812980
118	NC_015380	A	6	6	5576	5581	100 %	0 %	0 %	0 %	330812980
119	NC_015380	ACT	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812980
120	NC_015380	CCAT	2	8	5608	5615	25 %	25 %	0 %	50 %	330812980
121	NC_015380	TAAA	2	8	5618	5625	75 %	25 %	0 %	0 %	330812980
122	NC_015380	CTG	2	6	5723	5728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812980
123	NC_015380	ACC	2	6	5736	5741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812980
124	NC_015380	AGCA	2	8	5763	5770	50 %	0 %	25 %	25 %	330812980
125	NC_015380	TTGCT	2	10	5786	5795	0 %	60 %	20 %	20 %	330812980
126	NC_015380	AATT	2	8	5877	5884	50 %	50 %	0 %	0 %	330812980
127	NC_015380	T	6	6	5898	5903	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
128	NC_015380	GTT	2	6	5949	5954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
129	NC_015380	T	6	6	6014	6019	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
130	NC_015380	TGT	2	6	6031	6036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
131	NC_015380	A	7	7	6051	6057	100 %	0 %	0 %	0 %	330812980
132	NC_015380	TGG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812980
133	NC_015380	GGAAA	2	10	6086	6095	60 %	0 %	40 %	0 %	330812980
134	NC_015380	TGT	2	6	6100	6105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812980
135	NC_015380	CTA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812980
136	NC_015380	AT	3	6	6140	6145	50 %	50 %	0 %	0 %	330812980
137	NC_015380	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	330812980
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139	NC_015380	T	6	6	6267	6272	0 %	100 %	0 %	0 %	330812980
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