MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 95448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	CGC	2	6	32	37	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326789140
2	NC_015275	TAT	2	6	69	74	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
3	NC_015275	AGA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
4	NC_015275	A	6	6	165	170	100 %	0 %	0 %	0 %	326789140
5	NC_015275	TA	3	6	202	207	50 %	50 %	0 %	0 %	326789140
6	NC_015275	TAA	2	6	240	245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
7	NC_015275	ACT	3	9	283	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789140
8	NC_015275	AGC	2	6	317	322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789140
9	NC_015275	AAT	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
10	NC_015275	GTA	2	6	382	387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
11	NC_015275	TGC	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789140
12	NC_015275	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789140
13	NC_015275	CTT	2	6	560	565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
14	NC_015275	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
15	NC_015275	TGA	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
16	NC_015275	TAA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
17	NC_015275	GAT	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
18	NC_015275	ATTCA	2	10	667	676	40 %	40 %	0 %	20 %	326789140
19	NC_015275	AAG	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
20	NC_015275	TTC	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
21	NC_015275	TAA	2	6	738	743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
22	NC_015275	ATT	3	9	748	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
23	NC_015275	TCC	2	6	768	773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789140
24	NC_015275	AGA	2	6	792	797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
25	NC_015275	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
26	NC_015275	TCT	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
27	NC_015275	TAA	2	6	1008	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
28	NC_015275	ATT	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
29	NC_015275	AT	3	6	1092	1097	50 %	50 %	0 %	0 %	326789140
30	NC_015275	TAG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
31	NC_015275	ACTT	2	8	1114	1121	25 %	50 %	0 %	25 %	326789140
32	NC_015275	AGA	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
33	NC_015275	TCT	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
34	NC_015275	TC	3	6	1218	1223	0 %	50 %	0 %	50 %	326789140
35	NC_015275	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789140
36	NC_015275	TAC	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789140
37	NC_015275	TAT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
38	NC_015275	A	6	6	1286	1291	100 %	0 %	0 %	0 %	326789140
39	NC_015275	TAAA	2	8	1362	1369	75 %	25 %	0 %	0 %	326789140
40	NC_015275	CAA	2	6	1681	1686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789141
41	NC_015275	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
42	NC_015275	ACTT	2	8	1739	1746	25 %	50 %	0 %	25 %	326789141
43	NC_015275	TAG	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
44	NC_015275	TAA	2	6	1754	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
45	NC_015275	T	6	6	1834	1839	0 %	100 %	0 %	0 %	326789141
46	NC_015275	AAG	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
47	NC_015275	GTT	2	6	1869	1874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789141
48	NC_015275	GAT	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
49	NC_015275	TAT	2	6	1907	1912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789141
50	NC_015275	ATA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
51	NC_015275	GGAC	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	326789141
52	NC_015275	TAA	2	6	2222	2227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
53	NC_015275	GAA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
54	NC_015275	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
55	NC_015275	GTT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789141
56	NC_015275	CTT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789141
57	NC_015275	AAG	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
58	NC_015275	GAT	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
59	NC_015275	TGA	3	9	2609	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
60	NC_015275	ATGT	2	8	2620	2627	25 %	50 %	25 %	0 %	326789141
61	NC_015275	TAT	2	6	2657	2662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789141
62	NC_015275	GAA	2	6	2670	2675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
63	NC_015275	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789142
64	NC_015275	AGTT	2	8	2933	2940	25 %	50 %	25 %	0 %	326789142
65	NC_015275	GA	3	6	2951	2956	50 %	0 %	50 %	0 %	326789142
66	NC_015275	A	7	7	2974	2980	100 %	0 %	0 %	0 %	326789142
67	NC_015275	TGA	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789142
68	NC_015275	TAAC	2	8	3031	3038	50 %	25 %	0 %	25 %	326789142
69	NC_015275	AGAA	2	8	3221	3228	75 %	0 %	25 %	0 %	326789143
70	NC_015275	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789143
71	NC_015275	TAAT	2	8	3335	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	326789143
72	NC_015275	A	6	6	3423	3428	100 %	0 %	0 %	0 %	326789143
73	NC_015275	CT	3	6	3495	3500	0 %	50 %	0 %	50 %	326789143
74	NC_015275	AAC	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789143
75	NC_015275	TAA	2	6	3558	3563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
76	NC_015275	GAA	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789143
77	NC_015275	CTG	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789143
78	NC_015275	TTA	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789143
79	NC_015275	ATG	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789143
80	NC_015275	AT	3	6	3683	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	326789143
81	NC_015275	TA	3	6	3714	3719	50 %	50 %	0 %	0 %	326789143
82	NC_015275	GAAA	2	8	3749	3756	75 %	0 %	25 %	0 %	326789143
83	NC_015275	AG	3	6	3769	3774	50 %	0 %	50 %	0 %	326789143
84	NC_015275	GAT	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789143
85	NC_015275	ACA	2	6	3873	3878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789143
86	NC_015275	TTCT	2	8	3890	3897	0 %	75 %	0 %	25 %	326789143
87	NC_015275	A	6	6	3925	3930	100 %	0 %	0 %	0 %	326789143
88	NC_015275	TA	3	6	3931	3936	50 %	50 %	0 %	0 %	326789143
89	NC_015275	TGA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789143
90	NC_015275	TTCT	2	8	3968	3975	0 %	75 %	0 %	25 %	326789143
91	NC_015275	ATA	2	6	3986	3991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
92	NC_015275	AC	3	6	4013	4018	50 %	0 %	0 %	50 %	326789143
93	NC_015275	TAA	2	6	4034	4039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
94	NC_015275	A	6	6	4076	4081	100 %	0 %	0 %	0 %	326789143
95	NC_015275	TA	3	6	4091	4096	50 %	50 %	0 %	0 %	326789143
96	NC_015275	ATA	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
97	NC_015275	GCA	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
98	NC_015275	CAAATA	2	12	4270	4281	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	326789144
99	NC_015275	GTAT	2	8	4316	4323	25 %	50 %	25 %	0 %	326789144
100	NC_015275	TAG	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
101	NC_015275	TGA	2	6	4386	4391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
102	NC_015275	TTA	2	6	4415	4420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789144
103	NC_015275	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
104	NC_015275	TGG	3	9	4554	4562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789144
105	NC_015275	AGT	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
106	NC_015275	GTA	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
107	NC_015275	TAA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
108	NC_015275	GAA	2	6	4771	4776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789144
109	NC_015275	AAC	2	6	4802	4807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789144
110	NC_015275	TAG	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
111	NC_015275	GA	4	8	4861	4868	50 %	0 %	50 %	0 %	326789144
112	NC_015275	GGT	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789144
113	NC_015275	ACA	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789144
114	NC_015275	TAA	2	6	4932	4937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
115	NC_015275	CTAT	2	8	4949	4956	25 %	50 %	0 %	25 %	326789144
116	NC_015275	GA	3	6	4979	4984	50 %	0 %	50 %	0 %	326789144
117	NC_015275	TAA	2	6	5055	5060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
118	NC_015275	A	6	6	5115	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	326789144
119	NC_015275	GAT	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
120	NC_015275	CTG	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789144
121	NC_015275	AGC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
122	NC_015275	GCA	2	6	5377	5382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
123	NC_015275	GCA	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
124	NC_015275	AT	4	8	5503	5510	50 %	50 %	0 %	0 %	326789144
125	NC_015275	TGG	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789144
126	NC_015275	TGA	2	6	5682	5687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
127	NC_015275	ACC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789144
128	NC_015275	TTTA	2	8	5843	5850	25 %	75 %	0 %	0 %	326789144
129	NC_015275	A	7	7	5855	5861	100 %	0 %	0 %	0 %	326789144
130	NC_015275	TGA	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
131	NC_015275	GAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789144
132	NC_015275	GA	3	6	5963	5968	50 %	0 %	50 %	0 %	326789144
133	NC_015275	AAC	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789144
134	NC_015275	TGA	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
135	NC_015275	GCA	4	12	6043	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
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