MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 95448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015275	GTA	2	6	29277	29282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789162
502	NC_015275	AAG	2	6	29290	29295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789162
503	NC_015275	GTAT	2	8	29305	29312	25 %	50 %	25 %	0 %	326789162
504	NC_015275	CTA	2	6	29339	29344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789162
505	NC_015275	TA	3	6	29343	29348	50 %	50 %	0 %	0 %	326789162
506	NC_015275	AAT	2	6	29388	29393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789162
507	NC_015275	AGA	2	6	29423	29428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789162
508	NC_015275	TCTG	2	8	29472	29479	0 %	50 %	25 %	25 %	326789162
509	NC_015275	TAC	2	6	29504	29509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789162
510	NC_015275	TAA	2	6	29528	29533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789162
511	NC_015275	TAC	2	6	29572	29577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789162
512	NC_015275	A	6	6	29600	29605	100 %	0 %	0 %	0 %	326789162
513	NC_015275	AATT	2	8	29692	29699	50 %	50 %	0 %	0 %	326789162
514	NC_015275	AGGA	2	8	29757	29764	50 %	0 %	50 %	0 %	326789162
515	NC_015275	A	7	7	29881	29887	100 %	0 %	0 %	0 %	326789162
516	NC_015275	TAA	2	6	29888	29893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789162
517	NC_015275	ATG	2	6	30136	30141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789163
518	NC_015275	GTA	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789163
519	NC_015275	ATTG	2	8	30249	30256	25 %	50 %	25 %	0 %	326789163
520	NC_015275	TTC	2	6	30271	30276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789163
521	NC_015275	TCA	2	6	30332	30337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789163
522	NC_015275	TTA	2	6	30346	30351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789163
523	NC_015275	TCT	2	6	30384	30389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789163
524	NC_015275	GA	3	6	30392	30397	50 %	0 %	50 %	0 %	326789163
525	NC_015275	AGG	2	6	30437	30442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789163
526	NC_015275	AATG	2	8	30468	30475	50 %	25 %	25 %	0 %	326789163
527	NC_015275	AAC	2	6	30513	30518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789163
528	NC_015275	ATT	2	6	30597	30602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789163
529	NC_015275	AGA	2	6	30623	30628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789163
530	NC_015275	GGA	2	6	30698	30703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789163
531	NC_015275	TA	3	6	30716	30721	50 %	50 %	0 %	0 %	326789163
532	NC_015275	TGA	2	6	31003	31008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789164
533	NC_015275	TTA	2	6	31020	31025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789164
534	NC_015275	ATT	2	6	31049	31054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789164
535	NC_015275	A	8	8	31056	31063	100 %	0 %	0 %	0 %	326789164
536	NC_015275	GTTG	2	8	31064	31071	0 %	50 %	50 %	0 %	326789164
537	NC_015275	TGG	2	6	31094	31099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789164
538	NC_015275	A	6	6	31132	31137	100 %	0 %	0 %	0 %	326789164
539	NC_015275	TAT	2	6	31237	31242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789164
540	NC_015275	ATA	2	6	31251	31256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789164
541	NC_015275	AAC	2	6	31258	31263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789164
542	NC_015275	AGGT	2	8	31290	31297	25 %	25 %	50 %	0 %	326789164
543	NC_015275	ACT	2	6	31357	31362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789164
544	NC_015275	TAA	2	6	31402	31407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789164
545	NC_015275	AG	4	8	31506	31513	50 %	0 %	50 %	0 %	326789164
546	NC_015275	AGT	2	6	31567	31572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789164
547	NC_015275	CAAG	2	8	31602	31609	50 %	0 %	25 %	25 %	326789164
548	NC_015275	ACA	2	6	31637	31642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789164
549	NC_015275	GTA	2	6	31646	31651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789164
550	NC_015275	GGA	2	6	31652	31657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789164
551	NC_015275	AGC	2	6	31669	31674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789164
552	NC_015275	TTC	2	6	31729	31734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789164
553	NC_015275	AGA	2	6	31888	31893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789164
554	NC_015275	A	7	7	31911	31917	100 %	0 %	0 %	0 %	326789164
555	NC_015275	AAGT	2	8	31956	31963	50 %	25 %	25 %	0 %	326789164
556	NC_015275	TTAT	2	8	31980	31987	25 %	75 %	0 %	0 %	326789164
557	NC_015275	TTACC	2	10	31988	31997	20 %	40 %	0 %	40 %	326789164
558	NC_015275	CAC	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789164
559	NC_015275	GTG	2	6	32037	32042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789164
560	NC_015275	TAT	2	6	32092	32097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789164
561	NC_015275	TTA	2	6	32117	32122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789164
562	NC_015275	GGT	2	6	32186	32191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789164
563	NC_015275	ATTT	2	8	32223	32230	25 %	75 %	0 %	0 %	326789164
564	NC_015275	CAAT	2	8	32247	32254	50 %	25 %	0 %	25 %	326789164
565	NC_015275	AAG	2	6	32325	32330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789164
566	NC_015275	AAT	2	6	32341	32346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789164
567	NC_015275	ACA	2	6	32357	32362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789164
568	NC_015275	TTA	2	6	32389	32394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789164
569	NC_015275	TA	3	6	32424	32429	50 %	50 %	0 %	0 %	326789164
570	NC_015275	CAT	2	6	32456	32461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789164
571	NC_015275	TAAAA	2	10	32486	32495	80 %	20 %	0 %	0 %	326789164
572	NC_015275	A	6	6	32519	32524	100 %	0 %	0 %	0 %	326789165
573	NC_015275	T	6	6	32533	32538	0 %	100 %	0 %	0 %	326789165
574	NC_015275	CA	3	6	32671	32676	50 %	0 %	0 %	50 %	326789165
575	NC_015275	CTA	2	6	32708	32713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789165
576	NC_015275	CAG	2	6	32714	32719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789165
577	NC_015275	TGA	2	6	32880	32885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789165
578	NC_015275	AGT	2	6	32886	32891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789165
579	NC_015275	CTT	2	6	32932	32937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789165
580	NC_015275	TAA	2	6	32958	32963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789165
581	NC_015275	CATG	2	8	32973	32980	25 %	25 %	25 %	25 %	326789165
582	NC_015275	AAC	2	6	32988	32993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789165
583	NC_015275	AGG	2	6	33063	33068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789165
584	NC_015275	GGT	2	6	33088	33093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789165
585	NC_015275	CCAAAA	2	12	33220	33231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789165
586	NC_015275	ATAC	2	8	33302	33309	50 %	25 %	0 %	25 %	326789165
587	NC_015275	AAC	2	6	33388	33393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789165
588	NC_015275	CAA	2	6	33458	33463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789165
589	NC_015275	ATG	2	6	33470	33475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789165
590	NC_015275	CAA	2	6	33476	33481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789165
591	NC_015275	AAG	2	6	33549	33554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789165
592	NC_015275	GAA	2	6	33565	33570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789165
593	NC_015275	ATTT	2	8	33575	33582	25 %	75 %	0 %	0 %	326789165
594	NC_015275	AT	3	6	33588	33593	50 %	50 %	0 %	0 %	326789165
595	NC_015275	AGA	2	6	33660	33665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789165
596	NC_015275	ACA	2	6	33765	33770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789165
597	NC_015275	TAA	2	6	33780	33785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789165
598	NC_015275	AT	3	6	33825	33830	50 %	50 %	0 %	0 %	326789165
599	NC_015275	AATA	3	12	33838	33849	75 %	25 %	0 %	0 %	326789165
600	NC_015275	TAA	2	6	33976	33981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789166
601	NC_015275	TAC	2	6	34082	34087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789166
602	NC_015275	TAT	2	6	34115	34120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789166
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604	NC_015275	ATT	2	6	34167	34172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789166
605	NC_015275	AGTAGC	2	12	34226	34237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	326789166
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607	NC_015275	AGG	2	6	34273	34278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789166
608	NC_015275	GAA	2	6	34287	34292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789166
609	NC_015275	ACTT	2	8	34305	34312	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
610	NC_015275	TAG	2	6	34330	34335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789166
611	NC_015275	AGA	2	6	34346	34351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789166
612	NC_015275	AGA	2	6	34364	34369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789166
613	NC_015275	GGTATT	2	12	34380	34391	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	326789166
614	NC_015275	AACA	2	8	34432	34439	75 %	0 %	0 %	25 %	326789166
615	NC_015275	AAATC	2	10	34466	34475	60 %	20 %	0 %	20 %	326789166
616	NC_015275	TTTG	2	8	34481	34488	0 %	75 %	25 %	0 %	326789166
617	NC_015275	TCTT	2	8	34520	34527	0 %	75 %	0 %	25 %	326789166
618	NC_015275	GAA	2	6	34557	34562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789166
619	NC_015275	TAG	2	6	34678	34683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789166
620	NC_015275	GGA	2	6	34712	34717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789166
621	NC_015275	AT	3	6	34720	34725	50 %	50 %	0 %	0 %	326789166
622	NC_015275	CTTA	2	8	34736	34743	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
623	NC_015275	ACAA	2	8	34750	34757	75 %	0 %	0 %	25 %	326789166
624	NC_015275	ATGA	2	8	34809	34816	50 %	25 %	25 %	0 %	326789166
625	NC_015275	GAA	2	6	34839	34844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789166
626	NC_015275	TGA	3	9	34858	34866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789166
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