MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014774	CTT	2	6	548	553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121752
2	NC_014774	TCA	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
3	NC_014774	T	7	7	642	648	0 %	100 %	0 %	0 %	315121752
4	NC_014774	CAT	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
5	NC_014774	GATT	2	8	716	723	25 %	50 %	25 %	0 %	315121752
6	NC_014774	CAT	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
7	NC_014774	A	6	6	771	776	100 %	0 %	0 %	0 %	315121752
8	NC_014774	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121752
9	NC_014774	GCA	2	6	790	795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121752
10	NC_014774	CGC	2	6	883	888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121752
11	NC_014774	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121752
12	NC_014774	CAT	3	9	950	958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
13	NC_014774	ATTCA	2	10	960	969	40 %	40 %	0 %	20 %	315121752
14	NC_014774	TTTTG	2	10	1012	1021	0 %	80 %	20 %	0 %	315121752
15	NC_014774	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	315121752
16	NC_014774	ACA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121752
17	NC_014774	AGA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121752
18	NC_014774	ATTT	2	8	1205	1212	25 %	75 %	0 %	0 %	315121752
19	NC_014774	AATC	2	8	1269	1276	50 %	25 %	0 %	25 %	315121752
20	NC_014774	TTG	2	6	1286	1291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121752
21	NC_014774	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121752
22	NC_014774	TTC	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121752
23	NC_014774	CAA	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
24	NC_014774	GAT	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121753
25	NC_014774	CAT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121753
26	NC_014774	CAA	2	6	2052	2057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
27	NC_014774	TAA	2	6	2203	2208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121753
28	NC_014774	T	6	6	2215	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	315121753
29	NC_014774	AAC	2	6	2229	2234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
30	NC_014774	TCC	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121753
31	NC_014774	CAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
32	NC_014774	TGT	2	6	2324	2329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121753
33	NC_014774	CAAATG	2	12	2353	2364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315121753
34	NC_014774	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121753
35	NC_014774	ACT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121753
36	NC_014774	TTG	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121753
37	NC_014774	TCAAA	2	10	2598	2607	60 %	20 %	0 %	20 %	315121753
38	NC_014774	TAA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
39	NC_014774	AAT	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
40	NC_014774	CAT	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121754
41	NC_014774	TTG	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
42	NC_014774	ATA	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
43	NC_014774	A	6	6	2807	2812	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
44	NC_014774	AAGCAA	2	12	2848	2859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315121754
45	NC_014774	TAT	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
46	NC_014774	TAATT	2	10	2886	2895	40 %	60 %	0 %	0 %	315121754
47	NC_014774	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
48	NC_014774	GAA	2	6	3045	3050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121754
49	NC_014774	ATT	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
50	NC_014774	AAT	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
51	NC_014774	A	8	8	3081	3088	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
52	NC_014774	TAA	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
53	NC_014774	TTGA	2	8	3149	3156	25 %	50 %	25 %	0 %	315121754
54	NC_014774	TC	3	6	3183	3188	0 %	50 %	0 %	50 %	315121754
55	NC_014774	AAT	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
56	NC_014774	TGT	2	6	3285	3290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
57	NC_014774	TAA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
58	NC_014774	A	6	6	3350	3355	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
59	NC_014774	AAT	2	6	3371	3376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
60	NC_014774	CCA	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121754
61	NC_014774	ATC	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121754
62	NC_014774	AAT	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
63	NC_014774	A	7	7	3448	3454	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
64	NC_014774	CAAA	2	8	3491	3498	75 %	0 %	0 %	25 %	315121754
65	NC_014774	A	9	9	3496	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
66	NC_014774	AGAA	2	8	3515	3522	75 %	0 %	25 %	0 %	315121754
67	NC_014774	TTA	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
68	NC_014774	TAG	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121754
69	NC_014774	CCT	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121754
70	NC_014774	TAG	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121754
71	NC_014774	CATAA	2	10	3636	3645	60 %	20 %	0 %	20 %	315121754
72	NC_014774	GCC	2	6	3673	3678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121754
73	NC_014774	CAA	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121754
74	NC_014774	A	6	6	3704	3709	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
75	NC_014774	GTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
76	NC_014774	GCTA	2	8	3791	3798	25 %	25 %	25 %	25 %	315121754
77	NC_014774	A	6	6	3809	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	315121754
78	NC_014774	CAA	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121754
79	NC_014774	AAATT	2	10	3849	3858	60 %	40 %	0 %	0 %	315121754
80	NC_014774	ATCC	2	8	3894	3901	25 %	25 %	0 %	50 %	315121754
81	NC_014774	CAC	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121754
82	NC_014774	ATA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
83	NC_014774	AG	3	6	4058	4063	50 %	0 %	50 %	0 %	315121754
84	NC_014774	TGCC	2	8	4067	4074	0 %	25 %	25 %	50 %	315121754
85	NC_014774	AAT	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
86	NC_014774	ATAA	2	8	4099	4106	75 %	25 %	0 %	0 %	315121754
87	NC_014774	AAAT	2	8	4114	4121	75 %	25 %	0 %	0 %	315121754
88	NC_014774	AT	3	6	4143	4148	50 %	50 %	0 %	0 %	315121754
89	NC_014774	AAG	2	6	4169	4174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121754
90	NC_014774	TGAC	2	8	4235	4242	25 %	25 %	25 %	25 %	315121754
91	NC_014774	TCT	2	6	4289	4294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121755
92	NC_014774	T	6	6	4329	4334	0 %	100 %	0 %	0 %	315121755
93	NC_014774	AAC	2	6	4544	4549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121755
94	NC_014774	ATAA	2	8	4750	4757	75 %	25 %	0 %	0 %	315121755
95	NC_014774	TG	3	6	4769	4774	0 %	50 %	50 %	0 %	315121755
96	NC_014774	TAA	2	6	4779	4784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121755
97	NC_014774	TCA	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121755
98	NC_014774	ATAA	2	8	4828	4835	75 %	25 %	0 %	0 %	315121755
99	NC_014774	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121755
100	NC_014774	TTCCA	2	10	4877	4886	20 %	40 %	0 %	40 %	315121755
101	NC_014774	CT	3	6	4919	4924	0 %	50 %	0 %	50 %	315121755
102	NC_014774	AAAC	2	8	4927	4934	75 %	0 %	0 %	25 %	315121755
103	NC_014774	T	7	7	4938	4944	0 %	100 %	0 %	0 %	315121755
104	NC_014774	ATT	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121755
105	NC_014774	TAA	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121755
106	NC_014774	CAT	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121755
107	NC_014774	AGA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121755
108	NC_014774	TTTTA	2	10	5092	5101	20 %	80 %	0 %	0 %	315121755
109	NC_014774	C	6	6	5109	5114	0 %	0 %	0 %	100 %	315121755
110	NC_014774	ACTA	2	8	5200	5207	50 %	25 %	0 %	25 %	315121755
111	NC_014774	TAA	2	6	5583	5588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121756
112	NC_014774	T	6	6	5612	5617	0 %	100 %	0 %	0 %	315121756
113	NC_014774	AAT	2	6	5771	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121756
114	NC_014774	AGC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121756
115	NC_014774	ATTT	2	8	5804	5811	25 %	75 %	0 %	0 %	315121756
116	NC_014774	TTC	2	6	5813	5818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121756
117	NC_014774	T	7	7	5821	5827	0 %	100 %	0 %	0 %	315121756
118	NC_014774	ATG	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121757
119	NC_014774	A	9	9	6899	6907	100 %	0 %	0 %	0 %	315121757
120	NC_014774	ATC	3	9	6929	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121757
121	NC_014774	TGT	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121757
122	NC_014774	AGT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121757
123	NC_014774	GAATCT	2	12	6966	6977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315121757
124	NC_014774	CT	3	6	7101	7106	0 %	50 %	0 %	50 %	315121757
125	NC_014774	AAT	2	6	7107	7112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121757
126	NC_014774	AGGATA	2	12	7135	7146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315121757
127	NC_014774	GTA	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121757
128	NC_014774	CAA	2	6	7190	7195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121757
129	NC_014774	A	7	7	7225	7231	100 %	0 %	0 %	0 %	315121757
130	NC_014774	AAGG	2	8	7239	7246	50 %	0 %	50 %	0 %	315121757
131	NC_014774	GGA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121757
132	NC_014774	AGA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121757
133	NC_014774	GGTT	2	8	7362	7369	0 %	50 %	50 %	0 %	315121757
134	NC_014774	TGG	2	6	7401	7406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315121757
135	NC_014774	AAC	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121758
136	NC_014774	ACTT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	0 %	25 %	315121758
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393	NC_014774	T	6	6	22174	22179	0 %	100 %	0 %	0 %	315121773
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395	NC_014774	ATA	2	6	22308	22313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121773
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