MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 56933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014720	TGAA	2	8	99	106	50 %	25 %	25 %	0 %	312621128
2	NC_014720	AGG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621128
3	NC_014720	A	6	6	134	139	100 %	0 %	0 %	0 %	312621128
4	NC_014720	AAAT	2	8	141	148	75 %	25 %	0 %	0 %	312621128
5	NC_014720	AT	3	6	162	167	50 %	50 %	0 %	0 %	312621128
6	NC_014720	GAC	2	6	209	214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621128
7	NC_014720	TAA	2	6	264	269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621128
8	NC_014720	TTC	2	6	339	344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621128
9	NC_014720	TGA	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621128
10	NC_014720	TGT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621128
11	NC_014720	AAC	3	9	455	463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621128
12	NC_014720	GCA	2	6	479	484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621128
13	NC_014720	ACC	2	6	502	507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621128
14	NC_014720	GA	3	6	512	517	50 %	0 %	50 %	0 %	312621128
15	NC_014720	TTTA	2	8	533	540	25 %	75 %	0 %	0 %	312621128
16	NC_014720	ATGC	2	8	572	579	25 %	25 %	25 %	25 %	312621128
17	NC_014720	TCA	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621128
18	NC_014720	TATG	2	8	622	629	25 %	50 %	25 %	0 %	312621128
19	NC_014720	AGAC	2	8	681	688	50 %	0 %	25 %	25 %	312621128
20	NC_014720	GAC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621128
21	NC_014720	GGAAA	2	10	752	761	60 %	0 %	40 %	0 %	312621128
22	NC_014720	AAG	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
23	NC_014720	AAG	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
24	NC_014720	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621128
25	NC_014720	TCA	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621128
26	NC_014720	CCA	2	6	839	844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621128
27	NC_014720	AGA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
28	NC_014720	GCC	2	6	913	918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312621128
29	NC_014720	A	6	6	950	955	100 %	0 %	0 %	0 %	312621128
30	NC_014720	AAAC	2	8	1017	1024	75 %	0 %	0 %	25 %	312621128
31	NC_014720	ACACAA	2	12	1137	1148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621128
32	NC_014720	A	7	7	1147	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	312621128
33	NC_014720	ATC	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621128
34	NC_014720	AAG	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
35	NC_014720	AGGCG	2	10	1312	1321	20 %	0 %	60 %	20 %	312621128
36	NC_014720	A	6	6	1362	1367	100 %	0 %	0 %	0 %	312621128
37	NC_014720	A	6	6	1399	1404	100 %	0 %	0 %	0 %	312621128
38	NC_014720	A	7	7	1421	1427	100 %	0 %	0 %	0 %	312621128
39	NC_014720	AAT	2	6	1443	1448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621128
40	NC_014720	TG	3	6	1465	1470	0 %	50 %	50 %	0 %	312621129
41	NC_014720	AT	3	6	1526	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	312621129
42	NC_014720	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621129
43	NC_014720	TAC	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621129
44	NC_014720	TGG	2	6	1620	1625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621129
45	NC_014720	A	7	7	1648	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	312621129
46	NC_014720	A	7	7	1661	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	312621130
47	NC_014720	AAG	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
48	NC_014720	ATA	2	6	1701	1706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621130
49	NC_014720	CTG	2	6	1722	1727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621130
50	NC_014720	CAA	2	6	1734	1739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621130
51	NC_014720	GT	3	6	1759	1764	0 %	50 %	50 %	0 %	312621130
52	NC_014720	AAT	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621130
53	NC_014720	TAGA	2	8	1848	1855	50 %	25 %	25 %	0 %	312621130
54	NC_014720	CTT	2	6	1880	1885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621130
55	NC_014720	A	6	6	1898	1903	100 %	0 %	0 %	0 %	312621130
56	NC_014720	GAA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
57	NC_014720	AGA	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
58	NC_014720	TTG	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621130
59	NC_014720	TTG	2	6	2061	2066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621130
60	NC_014720	AGA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
61	NC_014720	TGA	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621130
62	NC_014720	TTG	2	6	2166	2171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621130
63	NC_014720	TAAAA	2	10	2200	2209	80 %	20 %	0 %	0 %	312621130
64	NC_014720	GAAG	2	8	2222	2229	50 %	0 %	50 %	0 %	312621130
65	NC_014720	GAT	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621130
66	NC_014720	T	6	6	2315	2320	0 %	100 %	0 %	0 %	312621130
67	NC_014720	CAA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621130
68	NC_014720	ATTTCA	2	12	2429	2440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312621130
69	NC_014720	A	6	6	2493	2498	100 %	0 %	0 %	0 %	312621130
70	NC_014720	ATG	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621130
71	NC_014720	CTG	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621130
72	NC_014720	GA	3	6	2667	2672	50 %	0 %	50 %	0 %	312621130
73	NC_014720	GAC	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621130
74	NC_014720	TTC	2	6	2748	2753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621130
75	NC_014720	ACAA	2	8	2839	2846	75 %	0 %	0 %	25 %	312621131
76	NC_014720	T	6	6	2850	2855	0 %	100 %	0 %	0 %	312621131
77	NC_014720	TAA	2	6	2888	2893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621131
78	NC_014720	CTTCT	2	10	2908	2917	0 %	60 %	0 %	40 %	312621131
79	NC_014720	TG	3	6	2938	2943	0 %	50 %	50 %	0 %	312621131
80	NC_014720	TTCT	2	8	2987	2994	0 %	75 %	0 %	25 %	312621131
81	NC_014720	AAT	2	6	3077	3082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621131
82	NC_014720	T	6	6	3141	3146	0 %	100 %	0 %	0 %	312621131
83	NC_014720	CTT	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621131
84	NC_014720	ATA	2	6	3312	3317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621131
85	NC_014720	AGG	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621131
86	NC_014720	TAAA	2	8	3382	3389	75 %	25 %	0 %	0 %	312621131
87	NC_014720	TTTAG	2	10	3414	3423	20 %	60 %	20 %	0 %	312621131
88	NC_014720	AT	3	6	3455	3460	50 %	50 %	0 %	0 %	312621131
89	NC_014720	ATT	2	6	3468	3473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621131
90	NC_014720	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	312621131
91	NC_014720	ACA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621131
92	NC_014720	GATA	2	8	3581	3588	50 %	25 %	25 %	0 %	312621131
93	NC_014720	A	6	6	3588	3593	100 %	0 %	0 %	0 %	312621131
94	NC_014720	GCA	2	6	3633	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621131
95	NC_014720	CTTCT	2	10	3658	3667	0 %	60 %	0 %	40 %	312621131
96	NC_014720	A	6	6	3728	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	312621131
97	NC_014720	AGA	2	6	3779	3784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621131
98	NC_014720	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	312621131
99	NC_014720	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621132
100	NC_014720	TTG	2	6	4019	4024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621132
101	NC_014720	ATG	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621132
102	NC_014720	A	6	6	4041	4046	100 %	0 %	0 %	0 %	312621132
103	NC_014720	GAA	2	6	4073	4078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621132
104	NC_014720	AAT	2	6	4086	4091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621132
105	NC_014720	ATT	2	6	4182	4187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621133
106	NC_014720	TA	3	6	4302	4307	50 %	50 %	0 %	0 %	312621133
107	NC_014720	TTG	2	6	4351	4356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621133
108	NC_014720	GTG	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
109	NC_014720	A	6	6	4483	4488	100 %	0 %	0 %	0 %	312621133
110	NC_014720	GTG	2	6	4489	4494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
111	NC_014720	TTC	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
112	NC_014720	GA	3	6	4539	4544	50 %	0 %	50 %	0 %	312621133
113	NC_014720	GGT	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
114	NC_014720	TGT	2	6	4586	4591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621133
115	NC_014720	AACC	2	8	4669	4676	50 %	0 %	0 %	50 %	312621133
116	NC_014720	TAC	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621133
117	NC_014720	GACAG	2	10	4704	4713	40 %	0 %	40 %	20 %	312621133
118	NC_014720	CGA	2	6	4736	4741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621133
119	NC_014720	TGA	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621133
120	NC_014720	GA	4	8	4842	4849	50 %	0 %	50 %	0 %	312621133
121	NC_014720	TGG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
122	NC_014720	AGA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621133
123	NC_014720	GA	3	6	5014	5019	50 %	0 %	50 %	0 %	312621133
124	NC_014720	AAC	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621133
125	NC_014720	CTG	2	6	5086	5091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621133
126	NC_014720	A	6	6	5117	5122	100 %	0 %	0 %	0 %	312621133
127	NC_014720	CTT	2	6	5151	5156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
128	NC_014720	GACA	2	8	5224	5231	50 %	0 %	25 %	25 %	312621133
129	NC_014720	GC	3	6	5256	5261	0 %	0 %	50 %	50 %	312621133
130	NC_014720	T	6	6	5300	5305	0 %	100 %	0 %	0 %	312621133
131	NC_014720	AGA	2	6	5306	5311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621133
132	NC_014720	A	6	6	5327	5332	100 %	0 %	0 %	0 %	312621133
133	NC_014720	GGC	2	6	5354	5359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312621133
134	NC_014720	GC	3	6	5364	5369	0 %	0 %	50 %	50 %	312621133
135	NC_014720	A	6	6	5378	5383	100 %	0 %	0 %	0 %	312621133
136	NC_014720	AG	3	6	5388	5393	50 %	0 %	50 %	0 %	312621133
137	NC_014720	AAAG	2	8	5404	5411	75 %	0 %	25 %	0 %	312621133
138	NC_014720	CTT	2	6	5625	5630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
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269	NC_014720	TTTG	2	8	11087	11094	0 %	75 %	25 %	0 %	312621137
270	NC_014720	A	6	6	11139	11144	100 %	0 %	0 %	0 %	312621137
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272	NC_014720	GTTTT	2	10	11194	11203	0 %	80 %	20 %	0 %	312621137
273	NC_014720	TGA	2	6	11228	11233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621137
274	NC_014720	CT	3	6	11315	11320	0 %	50 %	0 %	50 %	312621137
275	NC_014720	AGGTTG	2	12	11343	11354	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312621137
276	NC_014720	AAT	2	6	11442	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621138
277	NC_014720	AGA	2	6	11462	11467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621138
278	NC_014720	TTA	2	6	11477	11482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621138
279	NC_014720	TTG	2	6	11497	11502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621138
280	NC_014720	GAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621139
281	NC_014720	AAG	2	6	12921	12926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
282	NC_014720	ATT	2	6	12935	12940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
283	NC_014720	TTC	2	6	12945	12950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621140
284	NC_014720	GTA	2	6	13000	13005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
285	NC_014720	GATG	2	8	13069	13076	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
286	NC_014720	ATT	2	6	13089	13094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
287	NC_014720	TGT	2	6	13160	13165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621140
288	NC_014720	CTT	2	6	13197	13202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621140
289	NC_014720	GAG	2	6	13203	13208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621140
290	NC_014720	AGA	2	6	13226	13231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
291	NC_014720	TGGTT	2	10	13292	13301	0 %	60 %	40 %	0 %	312621140
292	NC_014720	ACCAA	2	10	13328	13337	60 %	0 %	0 %	40 %	312621140
293	NC_014720	GTTT	2	8	13355	13362	0 %	75 %	25 %	0 %	312621140
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295	NC_014720	GAGT	2	8	13375	13382	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
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297	NC_014720	AGCA	2	8	13410	13417	50 %	0 %	25 %	25 %	312621140
298	NC_014720	AAG	2	6	13425	13430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
299	NC_014720	AAT	2	6	13475	13480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
300	NC_014720	AAG	2	6	13535	13540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
301	NC_014720	TATT	2	8	13597	13604	25 %	75 %	0 %	0 %	312621140
302	NC_014720	ATC	2	6	13621	13626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621140
303	NC_014720	GCGA	2	8	13644	13651	25 %	0 %	50 %	25 %	312621140
304	NC_014720	T	6	6	13653	13658	0 %	100 %	0 %	0 %	312621140
305	NC_014720	TTG	3	9	13663	13671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621140
306	NC_014720	GTG	2	6	13762	13767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621140
307	NC_014720	AGA	2	6	13823	13828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
308	NC_014720	GAT	2	6	13872	13877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
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310	NC_014720	GT	3	6	13925	13930	0 %	50 %	50 %	0 %	312621140
311	NC_014720	TGAA	2	8	13966	13973	50 %	25 %	25 %	0 %	312621140
312	NC_014720	AG	3	6	13995	14000	50 %	0 %	50 %	0 %	312621140
313	NC_014720	GAA	2	6	14043	14048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
314	NC_014720	A	7	7	14078	14084	100 %	0 %	0 %	0 %	312621140
315	NC_014720	TTA	2	6	14188	14193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
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381	NC_014720	TGGG	2	8	16876	16883	0 %	25 %	75 %	0 %	312621140
382	NC_014720	GTA	2	6	17011	17016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
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385	NC_014720	ATA	2	6	17161	17166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
386	NC_014720	CAGA	2	8	17178	17185	50 %	0 %	25 %	25 %	312621140
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390	NC_014720	TA	3	6	17328	17333	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
391	NC_014720	TAT	2	6	17361	17366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
392	NC_014720	ATATGA	2	12	17423	17434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312621140
393	NC_014720	AAAT	2	8	17458	17465	75 %	25 %	0 %	0 %	312621140
394	NC_014720	GTATAT	2	12	17547	17558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312621140
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396	NC_014720	ATCG	2	8	17586	17593	25 %	25 %	25 %	25 %	312621140
397	NC_014720	CAA	2	6	17600	17605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621140
398	NC_014720	GAT	2	6	17622	17627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
399	NC_014720	GAAG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	312621140
400	NC_014720	ATG	2	6	17746	17751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
401	NC_014720	TTG	2	6	17764	17769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621140
402	NC_014720	AGA	2	6	17774	17779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
403	NC_014720	TAA	2	6	17789	17794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
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405	NC_014720	ATATGA	2	12	17864	17875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312621140
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484	NC_014720	GTAAT	2	10	20647	20656	40 %	40 %	20 %	0 %	312621140
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