MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 48524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	ATG	2	6	127	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134083
2	NC_014657	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	312134083
3	NC_014657	AGG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134083
4	NC_014657	TCA	2	6	163	168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134083
5	NC_014657	A	6	6	168	173	100 %	0 %	0 %	0 %	312134083
6	NC_014657	AT	3	6	196	201	50 %	50 %	0 %	0 %	312134083
7	NC_014657	GT	3	6	234	239	0 %	50 %	50 %	0 %	312134083
8	NC_014657	GAC	2	6	243	248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134083
9	NC_014657	TTC	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134083
10	NC_014657	A	6	6	415	420	100 %	0 %	0 %	0 %	312134083
11	NC_014657	AAC	2	6	440	445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134083
12	NC_014657	TGT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134083
13	NC_014657	AAC	2	6	492	497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134083
14	NC_014657	ATGC	2	8	606	613	25 %	25 %	25 %	25 %	312134083
15	NC_014657	ATGT	2	8	657	664	25 %	50 %	25 %	0 %	312134083
16	NC_014657	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134083
17	NC_014657	GAC	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134083
18	NC_014657	AAAG	2	8	789	796	75 %	0 %	25 %	0 %	312134083
19	NC_014657	AGG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134083
20	NC_014657	CAAA	2	8	841	848	75 %	0 %	0 %	25 %	312134083
21	NC_014657	ATA	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134083
22	NC_014657	CAGA	2	8	865	872	50 %	0 %	25 %	25 %	312134083
23	NC_014657	AGA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134083
24	NC_014657	AAG	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134083
25	NC_014657	AAAC	2	8	1051	1058	75 %	0 %	0 %	25 %	312134083
26	NC_014657	AG	3	6	1062	1067	50 %	0 %	50 %	0 %	312134083
27	NC_014657	ACACAA	2	12	1171	1182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134083
28	NC_014657	A	7	7	1181	1187	100 %	0 %	0 %	0 %	312134083
29	NC_014657	AAG	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134083
30	NC_014657	AG	3	6	1314	1319	50 %	0 %	50 %	0 %	312134083
31	NC_014657	AT	3	6	1327	1332	50 %	50 %	0 %	0 %	312134083
32	NC_014657	CA	3	6	1371	1376	50 %	0 %	0 %	50 %	312134083
33	NC_014657	A	6	6	1396	1401	100 %	0 %	0 %	0 %	312134083
34	NC_014657	TGT	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134083
35	NC_014657	A	7	7	1455	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	312134083
36	NC_014657	AAT	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134083
37	NC_014657	TGT	2	6	1709	1714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
38	NC_014657	CTG	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134084
39	NC_014657	CAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134084
40	NC_014657	ACC	2	6	1830	1835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312134084
41	NC_014657	ATGCAA	2	12	1848	1859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312134084
42	NC_014657	A	7	7	1931	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	312134084
43	NC_014657	AG	3	6	1965	1970	50 %	0 %	50 %	0 %	312134084
44	NC_014657	AAG	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134084
45	NC_014657	AGA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134084
46	NC_014657	TTG	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
47	NC_014657	TTG	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
48	NC_014657	GAT	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134084
49	NC_014657	TTG	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
50	NC_014657	GTTGAA	2	12	2247	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134084
51	NC_014657	CAA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134084
52	NC_014657	T	6	6	2418	2423	0 %	100 %	0 %	0 %	312134084
53	NC_014657	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134084
54	NC_014657	GAT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134084
55	NC_014657	TGCTC	2	10	2620	2629	0 %	40 %	20 %	40 %	312134084
56	NC_014657	ATA	2	6	2839	2844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
57	NC_014657	T	6	6	2887	2892	0 %	100 %	0 %	0 %	312134085
58	NC_014657	ATAAA	2	10	2903	2912	80 %	20 %	0 %	0 %	312134085
59	NC_014657	CTTCT	2	10	2945	2954	0 %	60 %	0 %	40 %	312134085
60	NC_014657	TAA	2	6	3011	3016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
61	NC_014657	AAT	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
62	NC_014657	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	312134085
63	NC_014657	T	8	8	3176	3183	0 %	100 %	0 %	0 %	312134085
64	NC_014657	GAC	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134085
65	NC_014657	CTT	2	6	3304	3309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134085
66	NC_014657	ATA	2	6	3349	3354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
67	NC_014657	TCAGC	2	10	3369	3378	20 %	20 %	20 %	40 %	312134085
68	NC_014657	A	6	6	3420	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	312134085
69	NC_014657	CTTGAA	2	12	3481	3492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134085
70	NC_014657	GAA	3	9	3520	3528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134085
71	NC_014657	GGT	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134085
72	NC_014657	ACA	2	6	3580	3585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134085
73	NC_014657	TGC	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134085
74	NC_014657	AGA	2	6	3758	3763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134085
75	NC_014657	A	8	8	3763	3770	100 %	0 %	0 %	0 %	312134085
76	NC_014657	TGACAG	2	12	3852	3863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134085
77	NC_014657	GAAA	2	8	3883	3890	75 %	0 %	25 %	0 %	312134085
78	NC_014657	A	6	6	3896	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	312134085
79	NC_014657	TCA	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134086
80	NC_014657	CTT	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134086
81	NC_014657	AGA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134086
82	NC_014657	CAGGA	2	10	4047	4056	40 %	0 %	40 %	20 %	312134086
83	NC_014657	TTG	2	6	4057	4062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134086
84	NC_014657	ATG	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134086
85	NC_014657	A	7	7	4079	4085	100 %	0 %	0 %	0 %	312134086
86	NC_014657	ATA	2	6	4089	4094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134086
87	NC_014657	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134086
88	NC_014657	GTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134086
89	NC_014657	GGATA	2	10	4249	4258	40 %	20 %	40 %	0 %	312134087
90	NC_014657	AAT	2	6	4259	4264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134087
91	NC_014657	TA	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	312134087
92	NC_014657	TCA	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134087
93	NC_014657	TCG	2	6	4389	4394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134087
94	NC_014657	GTT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134087
95	NC_014657	TGCA	2	8	4554	4561	25 %	25 %	25 %	25 %	312134087
96	NC_014657	GGT	2	6	4562	4567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134087
97	NC_014657	CGG	2	6	4597	4602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312134087
98	NC_014657	TGT	2	6	4624	4629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134087
99	NC_014657	AT	3	6	4679	4684	50 %	50 %	0 %	0 %	312134087
100	NC_014657	CGA	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134087
101	NC_014657	GA	4	8	4880	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	312134087
102	NC_014657	A	7	7	4887	4893	100 %	0 %	0 %	0 %	312134087
103	NC_014657	ATG	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134087
104	NC_014657	ACA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134087
105	NC_014657	CAA	2	6	5085	5090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134087
106	NC_014657	CTG	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134087
107	NC_014657	A	7	7	5155	5161	100 %	0 %	0 %	0 %	312134087
108	NC_014657	GC	3	6	5294	5299	0 %	0 %	50 %	50 %	312134087
109	NC_014657	TGC	2	6	5332	5337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134087
110	NC_014657	T	6	6	5338	5343	0 %	100 %	0 %	0 %	312134087
111	NC_014657	AGA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
112	NC_014657	A	6	6	5365	5370	100 %	0 %	0 %	0 %	312134087
113	NC_014657	GC	3	6	5402	5407	0 %	0 %	50 %	50 %	312134087
114	NC_014657	A	7	7	5416	5422	100 %	0 %	0 %	0 %	312134087
115	NC_014657	AG	3	6	5426	5431	50 %	0 %	50 %	0 %	312134087
116	NC_014657	TAA	2	6	5436	5441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134087
117	NC_014657	GGT	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134087
118	NC_014657	AAGC	2	8	5628	5635	50 %	0 %	25 %	25 %	312134087
119	NC_014657	CTT	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134087
120	NC_014657	A	6	6	5717	5722	100 %	0 %	0 %	0 %	312134087
121	NC_014657	CTT	3	9	5786	5794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134087
122	NC_014657	CTTT	2	8	5796	5803	0 %	75 %	0 %	25 %	312134087
123	NC_014657	GAA	2	6	6021	6026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
124	NC_014657	TTC	3	9	6027	6035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134087
125	NC_014657	AGA	2	6	6064	6069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
126	NC_014657	AAG	2	6	6106	6111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
127	NC_014657	AG	3	6	6110	6115	50 %	0 %	50 %	0 %	312134087
128	NC_014657	AT	3	6	6153	6158	50 %	50 %	0 %	0 %	312134087
129	NC_014657	CAG	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134088
130	NC_014657	TGT	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134088
131	NC_014657	AAT	2	6	6301	6306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134088
132	NC_014657	T	6	6	6311	6316	0 %	100 %	0 %	0 %	312134088
133	NC_014657	TTGT	2	8	6402	6409	0 %	75 %	25 %	0 %	312134088
134	NC_014657	GGCA	2	8	6418	6425	25 %	0 %	50 %	25 %	312134088
135	NC_014657	AAG	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134088
136	NC_014657	TAA	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134088
137	NC_014657	ATAAA	2	10	6468	6477	80 %	20 %	0 %	0 %	312134088
138	NC_014657	GTTTT	2	10	6486	6495	0 %	80 %	20 %	0 %	312134088
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269	NC_014657	ATT	2	6	11998	12003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134092
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300	NC_014657	GATT	2	8	13081	13088	25 %	50 %	25 %	0 %	312134092
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