MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 48524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014657	TGT	2	6	2182721	2182726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136039
44002	NC_014657	GTT	2	6	2182742	2182747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136039
44003	NC_014657	GATAT	2	10	2182749	2182758	40 %	40 %	20 %	0 %	312136039
44004	NC_014657	CTG	2	6	2182769	2182774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136039
44005	NC_014657	AGC	2	6	2182790	2182795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136039
44006	NC_014657	TCA	2	6	2182810	2182815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136039
44007	NC_014657	ATT	2	6	2182871	2182876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136040
44008	NC_014657	GCA	2	6	2182955	2182960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136040
44009	NC_014657	CTG	2	6	2183046	2183051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136040
44010	NC_014657	CAA	2	6	2183117	2183122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136040
44011	NC_014657	CAA	2	6	2183135	2183140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136040
44012	NC_014657	TTC	2	6	2183207	2183212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136040
44013	NC_014657	C	6	6	2183308	2183313	0 %	0 %	0 %	100 %	312136040
44014	NC_014657	A	6	6	2183337	2183342	100 %	0 %	0 %	0 %	312136040
44015	NC_014657	GAA	2	6	2183467	2183472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136040
44016	NC_014657	GTT	2	6	2183565	2183570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136040
44017	NC_014657	ATC	2	6	2183602	2183607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136040
44018	NC_014657	CCGATG	2	12	2183609	2183620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312136040
44019	NC_014657	ATC	2	6	2183635	2183640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136040
44020	NC_014657	T	6	6	2183657	2183662	0 %	100 %	0 %	0 %	312136041
44021	NC_014657	ATC	2	6	2183754	2183759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136041
44022	NC_014657	TTG	2	6	2183768	2183773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136041
44023	NC_014657	T	6	6	2183783	2183788	0 %	100 %	0 %	0 %	312136041
44024	NC_014657	TCC	2	6	2183823	2183828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136041
44025	NC_014657	TCA	2	6	2183834	2183839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136041
44026	NC_014657	CTG	2	6	2183861	2183866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136041
44027	NC_014657	GGT	2	6	2183875	2183880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136041
44028	NC_014657	AAG	2	6	2183988	2183993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136041
44029	NC_014657	CTT	2	6	2183995	2184000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136041
44030	NC_014657	T	6	6	2184030	2184035	0 %	100 %	0 %	0 %	312136041
44031	NC_014657	CTC	2	6	2184063	2184068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136041
44032	NC_014657	CTT	2	6	2184099	2184104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136041
44033	NC_014657	TA	3	6	2184108	2184113	50 %	50 %	0 %	0 %	312136041
44034	NC_014657	TCA	2	6	2184127	2184132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136041
44035	NC_014657	CCA	2	6	2184175	2184180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136041
44036	NC_014657	TGT	2	6	2184201	2184206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136041
44037	NC_014657	CAC	2	6	2184209	2184214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136041
44038	NC_014657	TTC	2	6	2184285	2184290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136041
44039	NC_014657	TGTT	2	8	2184300	2184307	0 %	75 %	25 %	0 %	312136041
44040	NC_014657	GCCT	2	8	2184312	2184319	0 %	25 %	25 %	50 %	312136041
44041	NC_014657	T	6	6	2184344	2184349	0 %	100 %	0 %	0 %	312136041
44042	NC_014657	AC	4	8	2184373	2184380	50 %	0 %	0 %	50 %	312136041
44043	NC_014657	AAC	2	6	2184381	2184386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136041
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44049	NC_014657	A	6	6	2184916	2184921	100 %	0 %	0 %	0 %	312136042
44050	NC_014657	GTT	2	6	2184952	2184957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136042
44051	NC_014657	TAT	2	6	2185022	2185027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136042
44052	NC_014657	CATC	2	8	2185028	2185035	25 %	25 %	0 %	50 %	312136042
44053	NC_014657	A	6	6	2185067	2185072	100 %	0 %	0 %	0 %	312136042
44054	NC_014657	T	6	6	2185113	2185118	0 %	100 %	0 %	0 %	312136042
44055	NC_014657	CTT	2	6	2185122	2185127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136042
44056	NC_014657	ATA	2	6	2185221	2185226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136042
44057	NC_014657	T	7	7	2185275	2185281	0 %	100 %	0 %	0 %	312136042
44058	NC_014657	GTTTTT	2	12	2185443	2185454	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312136042
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44062	NC_014657	T	6	6	2185596	2185601	0 %	100 %	0 %	0 %	312136042
44063	NC_014657	TCA	2	6	2185609	2185614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136042
44064	NC_014657	T	6	6	2185620	2185625	0 %	100 %	0 %	0 %	312136042
44065	NC_014657	TG	3	6	2185654	2185659	0 %	50 %	50 %	0 %	312136042
44066	NC_014657	TGT	3	9	2185676	2185684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136042
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44068	NC_014657	TCTT	2	8	2185718	2185725	0 %	75 %	0 %	25 %	312136042
44069	NC_014657	CAT	2	6	2185814	2185819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136042
44070	NC_014657	TGT	2	6	2185821	2185826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136042
44071	NC_014657	CTG	2	6	2185850	2185855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136042
44072	NC_014657	AAT	2	6	2185857	2185862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136042
44073	NC_014657	CAA	2	6	2185916	2185921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136042
44074	NC_014657	TA	3	6	2185926	2185931	50 %	50 %	0 %	0 %	312136042
44075	NC_014657	TGCT	2	8	2186001	2186008	0 %	50 %	25 %	25 %	312136042
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44077	NC_014657	TCA	2	6	2186077	2186082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136042
44078	NC_014657	CTG	2	6	2186145	2186150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136042
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44084	NC_014657	GCA	2	6	2186430	2186435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136043
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44088	NC_014657	T	6	6	2186494	2186499	0 %	100 %	0 %	0 %	312136043
44089	NC_014657	T	6	6	2186502	2186507	0 %	100 %	0 %	0 %	312136043
44090	NC_014657	AGC	2	6	2186516	2186521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136043
44091	NC_014657	TCG	2	6	2186547	2186552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136043
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44094	NC_014657	AT	3	6	2186708	2186713	50 %	50 %	0 %	0 %	312136043
44095	NC_014657	ATA	2	6	2186720	2186725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136043
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44097	NC_014657	AT	3	6	2186795	2186800	50 %	50 %	0 %	0 %	312136043
44098	NC_014657	CATC	2	8	2186809	2186816	25 %	25 %	0 %	50 %	312136043
44099	NC_014657	TA	3	6	2186843	2186848	50 %	50 %	0 %	0 %	312136043
44100	NC_014657	T	6	6	2186977	2186982	0 %	100 %	0 %	0 %	312136043
44101	NC_014657	TGGA	2	8	2187115	2187122	25 %	25 %	50 %	0 %	312136043
44102	NC_014657	ATT	2	6	2187125	2187130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136043
44103	NC_014657	TTG	2	6	2187131	2187136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136043
44104	NC_014657	T	6	6	2187151	2187156	0 %	100 %	0 %	0 %	312136043
44105	NC_014657	CTGT	2	8	2187208	2187215	0 %	50 %	25 %	25 %	312136043
44106	NC_014657	A	6	6	2187329	2187334	100 %	0 %	0 %	0 %	312136043
44107	NC_014657	AAGA	2	8	2187550	2187557	75 %	0 %	25 %	0 %	312136043
44108	NC_014657	ATT	2	6	2187563	2187568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136043
44109	NC_014657	AGA	2	6	2187606	2187611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136043
44110	NC_014657	CAA	2	6	2187625	2187630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136043
44111	NC_014657	TCGGG	2	10	2187664	2187673	0 %	20 %	60 %	20 %	312136043
44112	NC_014657	TAA	2	6	2187742	2187747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136043
44113	NC_014657	GCC	2	6	2187771	2187776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312136043
44114	NC_014657	T	6	6	2187785	2187790	0 %	100 %	0 %	0 %	312136043
44115	NC_014657	AAC	2	6	2187792	2187797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136043
44116	NC_014657	AGT	2	6	2187833	2187838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136044
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44118	NC_014657	GTG	2	6	2187976	2187981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136044
44119	NC_014657	TCA	2	6	2188022	2188027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136044
44120	NC_014657	CAA	2	6	2188079	2188084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136044
44121	NC_014657	CCA	2	6	2188090	2188095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136044
44122	NC_014657	GAT	2	6	2188137	2188142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136044
44123	NC_014657	AT	3	6	2188141	2188146	50 %	50 %	0 %	0 %	312136044
44124	NC_014657	CA	3	6	2188202	2188207	50 %	0 %	0 %	50 %	312136044
44125	NC_014657	CTGT	2	8	2188211	2188218	0 %	50 %	25 %	25 %	312136044
44126	NC_014657	A	6	6	2188226	2188231	100 %	0 %	0 %	0 %	312136044
44127	NC_014657	AT	3	6	2188300	2188305	50 %	50 %	0 %	0 %	312136044
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44131	NC_014657	ACC	3	9	2188501	2188509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136044
44132	NC_014657	CTCAC	2	10	2188528	2188537	20 %	20 %	0 %	60 %	312136044
44133	NC_014657	CTTT	2	8	2188603	2188610	0 %	75 %	0 %	25 %	312136044
44134	NC_014657	GTG	2	6	2188649	2188654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136044
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44137	NC_014657	AT	3	6	2188813	2188818	50 %	50 %	0 %	0 %	312136044
44138	NC_014657	ATTT	2	8	2188953	2188960	25 %	75 %	0 %	0 %	312136044
44139	NC_014657	AT	3	6	2188971	2188976	50 %	50 %	0 %	0 %	312136044
44140	NC_014657	ATT	2	6	2188996	2189001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136044
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44222	NC_014657	T	6	6	2192501	2192506	0 %	100 %	0 %	0 %	312136047
44223	NC_014657	ATCA	2	8	2192509	2192516	50 %	25 %	0 %	25 %	312136047
44224	NC_014657	T	6	6	2192708	2192713	0 %	100 %	0 %	0 %	312136047
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44230	NC_014657	GT	3	6	2193021	2193026	0 %	50 %	50 %	0 %	312136048
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44232	NC_014657	AAT	2	6	2193159	2193164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136048
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44234	NC_014657	A	6	6	2193190	2193195	100 %	0 %	0 %	0 %	312136048
44235	NC_014657	A	6	6	2193213	2193218	100 %	0 %	0 %	0 %	312136048
44236	NC_014657	TG	3	6	2193327	2193332	0 %	50 %	50 %	0 %	312136048
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