MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 7520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	T	6	6	730	735	0 %	100 %	0 %	0 %	307591290
2	NC_014534	TTC	2	6	739	744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591290
3	NC_014534	GCC	3	9	773	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591290
4	NC_014534	T	6	6	814	819	0 %	100 %	0 %	0 %	307591290
5	NC_014534	CTTTT	2	10	823	832	0 %	80 %	0 %	20 %	307591290
6	NC_014534	CTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591290
7	NC_014534	T	6	6	869	874	0 %	100 %	0 %	0 %	307591290
8	NC_014534	TGAAAA	2	12	4486	4497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591291
9	NC_014534	AC	3	6	4521	4526	50 %	0 %	0 %	50 %	307591291
10	NC_014534	GAA	2	6	4560	4565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591291
11	NC_014534	AGA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591291
12	NC_014534	ACG	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591291
13	NC_014534	ATACTC	2	12	4746	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591292
14	NC_014534	TGG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591292
15	NC_014534	CAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591292
16	NC_014534	ATT	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591292
17	NC_014534	TCT	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591292
18	NC_014534	TC	3	6	5044	5049	0 %	50 %	0 %	50 %	307591292
19	NC_014534	CTA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591292
20	NC_014534	ATCA	2	8	5280	5287	50 %	25 %	0 %	25 %	307591293
21	NC_014534	GAT	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
22	NC_014534	GGC	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591293
23	NC_014534	AG	4	8	5546	5553	50 %	0 %	50 %	0 %	307591293
24	NC_014534	TTCG	2	8	5660	5667	0 %	50 %	25 %	25 %	307591293
25	NC_014534	ACA	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591293
26	NC_014534	CGC	3	9	5876	5884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591293
27	NC_014534	CGC	2	6	5888	5893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591293
28	NC_014534	GAC	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591293
29	NC_014534	TCA	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
30	NC_014534	T	6	6	5977	5982	0 %	100 %	0 %	0 %	307591293
31	NC_014534	GAA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591293
32	NC_014534	CTAC	2	8	6022	6029	25 %	25 %	0 %	50 %	307591293
33	NC_014534	AGA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591293
34	NC_014534	TGC	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591293
35	NC_014534	CTT	2	6	6260	6265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591293
36	NC_014534	ATT	2	6	6376	6381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591293
37	NC_014534	TTG	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591293
38	NC_014534	TGA	3	9	6488	6496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
39	NC_014534	AAG	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591293
40	NC_014534	CTA	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
41	NC_014534	ATC	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
42	NC_014534	CAAA	2	8	6737	6744	75 %	0 %	0 %	25 %	307591293
43	NC_014534	TGA	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
44	NC_014534	A	6	6	6933	6938	100 %	0 %	0 %	0 %	307591293
45	NC_014534	ATT	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591293
46	NC_014534	TGA	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
47	NC_014534	CCT	3	9	7146	7154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591293
48	NC_014534	ACCC	2	8	7207	7214	25 %	0 %	0 %	75 %	307591293
49	NC_014534	TCA	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
50	NC_014534	C	6	6	7291	7296	0 %	0 %	0 %	100 %	307591293
51	NC_014534	TCA	2	6	7303	7308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
52	NC_014534	ACC	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591293
53	NC_014534	CAA	2	6	7373	7378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591293
54	NC_014534	GCC	2	6	7395	7400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591293
55	NC_014534	AC	3	6	7446	7451	50 %	0 %	0 %	50 %	307591293
56	NC_014534	C	9	9	7481	7489	0 %	0 %	0 %	100 %	307591293
57	NC_014534	TGA	2	6	7549	7554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591293
58	NC_014534	TCA	2	6	7606	7611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
59	NC_014534	CTGG	2	8	7617	7624	0 %	25 %	50 %	25 %	307591293
60	NC_014534	A	6	6	7655	7660	100 %	0 %	0 %	0 %	307591293
61	NC_014534	AGGA	2	8	7662	7669	50 %	0 %	50 %	0 %	307591293
62	NC_014534	TCA	3	9	7682	7690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591293
63	NC_014534	ATA	2	6	7738	7743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591293
64	NC_014534	ATT	2	6	7777	7782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591293
65	NC_014534	TTA	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591294
66	NC_014534	GTA	2	6	8034	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591294
67	NC_014534	CGG	2	6	8065	8070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591294
68	NC_014534	TCA	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591294
69	NC_014534	A	6	6	8244	8249	100 %	0 %	0 %	0 %	307591294
70	NC_014534	GAA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591294
71	NC_014534	TTA	2	6	8361	8366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591294
72	NC_014534	TAC	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591294
73	NC_014534	ATT	2	6	8450	8455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591294
74	NC_014534	GCC	2	6	8510	8515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591294
75	NC_014534	T	7	7	8529	8535	0 %	100 %	0 %	0 %	307591294
76	NC_014534	A	6	6	8609	8614	100 %	0 %	0 %	0 %	307591294
77	NC_014534	CTT	2	6	8664	8669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591294
78	NC_014534	ATTTA	2	10	8680	8689	40 %	60 %	0 %	0 %	307591294
79	NC_014534	TTTC	2	8	8706	8713	0 %	75 %	0 %	25 %	307591294
80	NC_014534	GCCA	2	8	8835	8842	25 %	0 %	25 %	50 %	307591294
81	NC_014534	GA	3	6	8917	8922	50 %	0 %	50 %	0 %	307591294
82	NC_014534	TTG	2	6	8928	8933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591294
83	NC_014534	C	6	6	11027	11032	0 %	0 %	0 %	100 %	307591295
84	NC_014534	AAG	2	6	11044	11049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591295
85	NC_014534	ACC	2	6	11089	11094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591295
86	NC_014534	GAC	2	6	11095	11100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591295
87	NC_014534	CAA	2	6	11109	11114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591295
88	NC_014534	GCC	2	6	11131	11136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591295
89	NC_014534	CGA	2	6	11163	11168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591295
90	NC_014534	AC	3	6	11182	11187	50 %	0 %	0 %	50 %	307591295
91	NC_014534	C	8	8	11218	11225	0 %	0 %	0 %	100 %	307591295
92	NC_014534	CGG	2	6	11267	11272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591295
93	NC_014534	TGA	2	6	11285	11290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591295
94	NC_014534	TCA	2	6	11342	11347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591295
95	NC_014534	CTGG	2	8	11353	11360	0 %	25 %	50 %	25 %	307591295
96	NC_014534	TCA	3	9	11418	11426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591295
97	NC_014534	TTCC	2	8	11457	11464	0 %	50 %	0 %	50 %	307591295
98	NC_014534	ATA	2	6	11474	11479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591295
99	NC_014534	ATT	2	6	11513	11518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591295
100	NC_014534	TTG	2	6	11765	11770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591296
101	NC_014534	TTC	2	6	11789	11794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591296
102	NC_014534	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	307591296
103	NC_014534	CTG	2	6	11932	11937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591296
104	NC_014534	T	6	6	11958	11963	0 %	100 %	0 %	0 %	307591296
105	NC_014534	TGC	2	6	12003	12008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591296
106	NC_014534	GCA	2	6	12103	12108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591296
107	NC_014534	GT	3	6	12122	12127	0 %	50 %	50 %	0 %	307591296
108	NC_014534	T	6	6	12145	12150	0 %	100 %	0 %	0 %	307591296
109	NC_014534	CAA	2	6	12247	12252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591297
110	NC_014534	ATC	2	6	12295	12300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591297
111	NC_014534	AAC	2	6	12341	12346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591297
112	NC_014534	A	6	6	12401	12406	100 %	0 %	0 %	0 %	307591297
113	NC_014534	A	6	6	12433	12438	100 %	0 %	0 %	0 %	307591297
114	NC_014534	AAC	2	6	12497	12502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591297
115	NC_014534	AAG	2	6	12518	12523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591297
116	NC_014534	ATA	2	6	12735	12740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591298
117	NC_014534	AGA	2	6	12746	12751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591298
118	NC_014534	TGT	3	9	12766	12774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591298
119	NC_014534	T	6	6	12789	12794	0 %	100 %	0 %	0 %	307591298
120	NC_014534	TTG	2	6	12925	12930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591298
121	NC_014534	T	8	8	12980	12987	0 %	100 %	0 %	0 %	307591298
122	NC_014534	GA	3	6	13019	13024	50 %	0 %	50 %	0 %	307591298
123	NC_014534	A	6	6	13049	13054	100 %	0 %	0 %	0 %	307591298
124	NC_014534	CTT	2	6	13139	13144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591299
125	NC_014534	T	6	6	13176	13181	0 %	100 %	0 %	0 %	307591299
126	NC_014534	GCT	2	6	13195	13200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591299
127	NC_014534	TA	3	6	13227	13232	50 %	50 %	0 %	0 %	307591299
128	NC_014534	TCC	2	6	13312	13317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591299
129	NC_014534	GAT	2	6	13385	13390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591299
130	NC_014534	AAT	2	6	13613	13618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591299
131	NC_014534	CT	3	6	13651	13656	0 %	50 %	0 %	50 %	307591299
132	NC_014534	AGG	2	6	13689	13694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307591299
133	NC_014534	TGG	2	6	13713	13718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591299
134	NC_014534	T	6	6	13800	13805	0 %	100 %	0 %	0 %	307591299
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142	NC_014534	T	6	6	14119	14124	0 %	100 %	0 %	0 %	307591300
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264	NC_014534	TA	3	6	21330	21335	50 %	50 %	0 %	0 %	307591304
265	NC_014534	GTG	2	6	21377	21382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591304
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271	NC_014534	T	7	7	21794	21800	0 %	100 %	0 %	0 %	307591304
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290	NC_014534	TA	3	6	22744	22749	50 %	50 %	0 %	0 %	307591304
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