MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 4426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014502	AAT	2	6	192978	192983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149861
3002	NC_014502	CT	3	6	193005	193010	0 %	50 %	0 %	50 %	307149861
3003	NC_014502	T	6	6	193033	193038	0 %	100 %	0 %	0 %	307149861
3004	NC_014502	TGTTAG	2	12	193053	193064	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307149861
3005	NC_014502	CCA	2	6	193068	193073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149861
3006	NC_014502	T	6	6	193076	193081	0 %	100 %	0 %	0 %	307149861
3007	NC_014502	CATAA	2	10	193191	193200	60 %	20 %	0 %	20 %	307149861
3008	NC_014502	ATC	2	6	193204	193209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149861
3009	NC_014502	CAA	2	6	193230	193235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149861
3010	NC_014502	AGA	2	6	193243	193248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149861
3011	NC_014502	GA	3	6	193269	193274	50 %	0 %	50 %	0 %	307149861
3012	NC_014502	GAC	2	6	193313	193318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149861
3013	NC_014502	CAG	2	6	193319	193324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149861
3014	NC_014502	TTC	2	6	193591	193596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149862
3015	NC_014502	T	6	6	193664	193669	0 %	100 %	0 %	0 %	307149862
3016	NC_014502	CTT	2	6	193680	193685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149862
3017	NC_014502	AAG	2	6	193708	193713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149862
3018	NC_014502	TTC	2	6	193743	193748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149862
3019	NC_014502	ATT	2	6	193754	193759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149862
3020	NC_014502	GCC	2	6	193834	193839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149863
3021	NC_014502	G	6	6	193863	193868	0 %	0 %	100 %	0 %	307149863
3022	NC_014502	AAGG	2	8	193878	193885	50 %	0 %	50 %	0 %	307149863
3023	NC_014502	GTT	2	6	193985	193990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149863
3024	NC_014502	GGT	2	6	194007	194012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149863
3025	NC_014502	TCG	3	9	194068	194076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149863
3026	NC_014502	GGT	2	6	194080	194085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149863
3027	NC_014502	ATT	2	6	194187	194192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149863
3028	NC_014502	AAT	2	6	194296	194301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149863
3029	NC_014502	CT	3	6	194310	194315	0 %	50 %	0 %	50 %	307149863
3030	NC_014502	GTT	2	6	194342	194347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149863
3031	NC_014502	AGTC	2	8	194372	194379	25 %	25 %	25 %	25 %	307149863
3032	NC_014502	ATT	2	6	194421	194426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149863
3033	NC_014502	TTC	2	6	194427	194432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149863
3034	NC_014502	T	6	6	194630	194635	0 %	100 %	0 %	0 %	307149864
3035	NC_014502	TTC	2	6	194677	194682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149864
3036	NC_014502	CTT	3	9	194722	194730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149864
3037	NC_014502	CCGA	2	8	194737	194744	25 %	0 %	25 %	50 %	307149864
3038	NC_014502	GGGGAA	2	12	194848	194859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149865
3039	NC_014502	A	6	6	194858	194863	100 %	0 %	0 %	0 %	307149865
3040	NC_014502	CCA	2	6	194890	194895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149865
3041	NC_014502	TGT	2	6	194946	194951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149865
3042	NC_014502	CTT	2	6	194974	194979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149865
3043	NC_014502	TCTG	2	8	194980	194987	0 %	50 %	25 %	25 %	307149865
3044	NC_014502	GGC	2	6	195043	195048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149865
3045	NC_014502	T	7	7	195108	195114	0 %	100 %	0 %	0 %	307149865
3046	NC_014502	CTT	2	6	195189	195194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149865
3047	NC_014502	GTC	2	6	195208	195213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149865
3048	NC_014502	GA	3	6	195257	195262	50 %	0 %	50 %	0 %	307149865
3049	NC_014502	CTT	2	6	195372	195377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149865
3050	NC_014502	GCC	2	6	195425	195430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149865
3051	NC_014502	TTG	2	6	195451	195456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149865
3052	NC_014502	CTG	2	6	195457	195462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149865
3053	NC_014502	GAG	2	6	195542	195547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149865
3054	NC_014502	ATC	2	6	195668	195673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149865
3055	NC_014502	TGG	2	6	195712	195717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149866
3056	NC_014502	CTT	2	6	195756	195761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149866
3057	NC_014502	ATC	2	6	195769	195774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149866
3058	NC_014502	AGA	3	9	195818	195826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149866
3059	NC_014502	CCG	2	6	195864	195869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149866
3060	NC_014502	TA	3	6	195894	195899	50 %	50 %	0 %	0 %	307149866
3061	NC_014502	G	6	6	195925	195930	0 %	0 %	100 %	0 %	307149866
3062	NC_014502	TA	3	6	195958	195963	50 %	50 %	0 %	0 %	307149866
3063	NC_014502	TTC	2	6	195976	195981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149866
3064	NC_014502	TCA	2	6	196056	196061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149867
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3066	NC_014502	TCC	2	6	196151	196156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149867
3067	NC_014502	AGT	2	6	196172	196177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149867
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3070	NC_014502	T	6	6	196225	196230	0 %	100 %	0 %	0 %	307149867
3071	NC_014502	TGC	2	6	196308	196313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149867
3072	NC_014502	ATA	2	6	196398	196403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149867
3073	NC_014502	ATG	2	6	196462	196467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149867
3074	NC_014502	A	6	6	196497	196502	100 %	0 %	0 %	0 %	307149867
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3082	NC_014502	GAA	2	6	196925	196930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149868
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3085	NC_014502	ACCGT	2	10	197139	197148	20 %	20 %	20 %	40 %	307149868
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3088	NC_014502	CCA	2	6	197235	197240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149868
3089	NC_014502	TCA	2	6	197254	197259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149868
3090	NC_014502	TGGT	2	8	197261	197268	0 %	50 %	50 %	0 %	307149868
3091	NC_014502	TAG	2	6	197280	197285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149868
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3093	NC_014502	TCT	2	6	197339	197344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149868
3094	NC_014502	AGT	2	6	197379	197384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149868
3095	NC_014502	TTGA	2	8	197397	197404	25 %	50 %	25 %	0 %	307149868
3096	NC_014502	TGGA	2	8	197427	197434	25 %	25 %	50 %	0 %	307149868
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3101	NC_014502	TGA	2	6	197745	197750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149869
3102	NC_014502	ATA	2	6	197813	197818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149869
3103	NC_014502	TTG	3	9	197828	197836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149870
3104	NC_014502	GTT	2	6	197943	197948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149870
3105	NC_014502	AATA	2	8	197980	197987	75 %	25 %	0 %	0 %	307149870
3106	NC_014502	TTGT	2	8	198014	198021	0 %	75 %	25 %	0 %	307149870
3107	NC_014502	GCA	2	6	198182	198187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149871
3108	NC_014502	CAG	2	6	198353	198358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149871
3109	NC_014502	CAAA	2	8	198403	198410	75 %	0 %	0 %	25 %	307149871
3110	NC_014502	CTTT	2	8	198559	198566	0 %	75 %	0 %	25 %	307149871
3111	NC_014502	CAA	2	6	198585	198590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149871
3112	NC_014502	TAAT	2	8	198638	198645	50 %	50 %	0 %	0 %	307149871
3113	NC_014502	CT	3	6	198953	198958	0 %	50 %	0 %	50 %	307149872
3114	NC_014502	AGA	2	6	199005	199010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149872
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3116	NC_014502	AGA	2	6	199159	199164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149872
3117	NC_014502	ATA	2	6	199185	199190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149872
3118	NC_014502	AGACAA	2	12	199261	199272	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307149872
3119	NC_014502	A	7	7	199275	199281	100 %	0 %	0 %	0 %	307149872
3120	NC_014502	ACAG	2	8	199640	199647	50 %	0 %	25 %	25 %	307149873
3121	NC_014502	A	6	6	199736	199741	100 %	0 %	0 %	0 %	307149873
3122	NC_014502	TAA	2	6	199751	199756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149873
3123	NC_014502	ATT	2	6	199774	199779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149873
3124	NC_014502	GTC	2	6	199810	199815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149873
3125	NC_014502	GAT	2	6	199862	199867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149873
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3127	NC_014502	CGT	2	6	199896	199901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149873
3128	NC_014502	T	6	6	199904	199909	0 %	100 %	0 %	0 %	307149873
3129	NC_014502	ATT	2	6	199944	199949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149873
3130	NC_014502	ACT	2	6	200025	200030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149873
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3136	NC_014502	A	6	6	200349	200354	100 %	0 %	0 %	0 %	307149873
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3145	NC_014502	ATC	2	6	201002	201007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149874
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3153	NC_014502	GGC	2	6	201630	201635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149874
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3231	NC_014502	GTA	2	6	217112	217117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149879
3232	NC_014502	AAT	2	6	217203	217208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149879
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3238	NC_014502	AAT	2	6	217407	217412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149880
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3241	NC_014502	TC	3	6	217938	217943	0 %	50 %	0 %	50 %	307149881
3242	NC_014502	CTGT	2	8	217988	217995	0 %	50 %	25 %	25 %	307149881
3243	NC_014502	GAT	2	6	218021	218026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149881
3244	NC_014502	GA	3	6	218105	218110	50 %	0 %	50 %	0 %	307149881
3245	NC_014502	TAT	2	6	218114	218119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149881
3246	NC_014502	T	6	6	218119	218124	0 %	100 %	0 %	0 %	307149881
3247	NC_014502	TTCT	2	8	218128	218135	0 %	75 %	0 %	25 %	307149881
3248	NC_014502	AAT	2	6	218583	218588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149882
3249	NC_014502	TCA	2	6	218598	218603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149882
3250	NC_014502	CAA	2	6	218617	218622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149882
3251	NC_014502	CTT	2	6	218635	218640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149882
3252	NC_014502	AAT	2	6	218669	218674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149882
3253	NC_014502	AGA	2	6	218744	218749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149882
3254	NC_014502	TTTG	2	8	218793	218800	0 %	75 %	25 %	0 %	307149882
3255	NC_014502	T	8	8	218811	218818	0 %	100 %	0 %	0 %	307149882
3256	NC_014502	TTA	2	6	218847	218852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149882
3257	NC_014502	TTC	3	9	218869	218877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149882
3258	NC_014502	T	6	6	218917	218922	0 %	100 %	0 %	0 %	307149883
3259	NC_014502	TTC	2	6	218953	218958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149883
3260	NC_014502	CTT	2	6	218996	219001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149883
3261	NC_014502	CAAA	2	8	219015	219022	75 %	0 %	0 %	25 %	307149883
3262	NC_014502	ATA	2	6	219062	219067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149883
3263	NC_014502	ATT	2	6	219089	219094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149883
3264	NC_014502	ATT	2	6	219135	219140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149884
3265	NC_014502	CGA	2	6	219169	219174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149884
3266	NC_014502	TTC	2	6	219220	219225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149884
3267	NC_014502	TCA	2	6	219245	219250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149884
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3269	NC_014502	CCT	3	9	219287	219295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149884
3270	NC_014502	GGT	2	6	219323	219328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149884
3271	NC_014502	GCT	2	6	219341	219346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149884
3272	NC_014502	GGAG	2	8	219377	219384	25 %	0 %	75 %	0 %	307149884
3273	NC_014502	TTTGA	2	10	219385	219394	20 %	60 %	20 %	0 %	307149884
3274	NC_014502	GA	3	6	219393	219398	50 %	0 %	50 %	0 %	307149884
3275	NC_014502	GAT	2	6	219479	219484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149884
3276	NC_014502	ATT	2	6	219533	219538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149884
3277	NC_014502	GTTT	2	8	219798	219805	0 %	75 %	25 %	0 %	307149885
3278	NC_014502	CTT	2	6	219808	219813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149885
3279	NC_014502	TCA	2	6	219825	219830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149885
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3281	NC_014502	AAAG	2	8	219891	219898	75 %	0 %	25 %	0 %	307149885
3282	NC_014502	TCAA	2	8	219921	219928	50 %	25 %	0 %	25 %	307149885
3283	NC_014502	TGT	2	6	219950	219955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149885
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3286	NC_014502	TGG	2	6	220112	220117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149886
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3353	NC_014502	TCA	2	6	224943	224948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149891
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3355	NC_014502	T	6	6	225057	225062	0 %	100 %	0 %	0 %	307149891
3356	NC_014502	TAT	2	6	225089	225094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149891
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3361	NC_014502	TAAA	2	8	225280	225287	75 %	25 %	0 %	0 %	307149891
3362	NC_014502	GAC	2	6	225304	225309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149891
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3365	NC_014502	TTG	2	6	225471	225476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149891
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3367	NC_014502	GAT	2	6	225535	225540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149891
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3490	NC_014502	TAA	2	6	241138	241143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149899
3491	NC_014502	TGA	2	6	241196	241201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149899
3492	NC_014502	CAT	2	6	241215	241220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149899
3493	NC_014502	TAA	2	6	241237	241242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149899
3494	NC_014502	TAG	2	6	241273	241278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149899
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3498	NC_014502	GATT	2	8	241584	241591	25 %	50 %	25 %	0 %	307149900
3499	NC_014502	TGA	2	6	241620	241625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149900
3500	NC_014502	TAT	2	6	241639	241644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149900

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