MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Zinderia insecticola CARI chromosome

Total Repeats: 9549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014497	TAAAA	2	10	24	33	80 %	20 %	0 %	0 %	307069504
2	NC_014497	A	6	6	42	47	100 %	0 %	0 %	0 %	307069504
3	NC_014497	AGA	3	9	55	63	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069504
4	NC_014497	TAA	2	6	89	94	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069504
5	NC_014497	AAAAT	2	10	95	104	80 %	20 %	0 %	0 %	307069504
6	NC_014497	A	7	7	108	114	100 %	0 %	0 %	0 %	307069504
7	NC_014497	TAAA	2	8	116	123	75 %	25 %	0 %	0 %	307069504
8	NC_014497	AAAAT	2	10	124	133	80 %	20 %	0 %	0 %	307069504
9	NC_014497	AAT	2	6	439	444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
10	NC_014497	AGG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307069505
11	NC_014497	AAT	2	6	481	486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
12	NC_014497	TAA	2	6	532	537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
13	NC_014497	A	6	6	536	541	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
14	NC_014497	A	6	6	544	549	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
15	NC_014497	TTA	2	6	568	573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
16	NC_014497	AGA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069505
17	NC_014497	TA	3	6	619	624	50 %	50 %	0 %	0 %	307069505
18	NC_014497	ATA	2	6	659	664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
19	NC_014497	TAT	3	9	688	696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
20	NC_014497	AAATA	2	10	697	706	80 %	20 %	0 %	0 %	307069505
21	NC_014497	GTA	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069505
22	NC_014497	TAAA	2	8	786	793	75 %	25 %	0 %	0 %	307069505
23	NC_014497	A	7	7	791	797	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
24	NC_014497	TTAAT	2	10	798	807	40 %	60 %	0 %	0 %	307069505
25	NC_014497	AAT	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
26	NC_014497	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069505
27	NC_014497	ATT	2	6	846	851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
28	NC_014497	AAATA	2	10	856	865	80 %	20 %	0 %	0 %	307069505
29	NC_014497	TAA	2	6	883	888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
30	NC_014497	A	10	10	893	902	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
31	NC_014497	AT	4	8	907	914	50 %	50 %	0 %	0 %	307069505
32	NC_014497	AATAA	2	10	917	926	80 %	20 %	0 %	0 %	307069505
33	NC_014497	ATT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
34	NC_014497	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
35	NC_014497	TAAATA	2	12	978	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
36	NC_014497	A	8	8	991	998	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
37	NC_014497	TA	3	6	999	1004	50 %	50 %	0 %	0 %	307069505
38	NC_014497	ATT	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
39	NC_014497	TA	3	6	1011	1016	50 %	50 %	0 %	0 %	307069505
40	NC_014497	A	8	8	1021	1028	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
41	NC_014497	A	7	7	1033	1039	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
42	NC_014497	ATAA	2	8	1052	1059	75 %	25 %	0 %	0 %	307069505
43	NC_014497	TAA	7	21	1057	1077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
44	NC_014497	ATT	2	6	1088	1093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
45	NC_014497	ATC	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069505
46	NC_014497	AAC	2	6	1177	1182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069505
47	NC_014497	ATAAA	2	10	1188	1197	80 %	20 %	0 %	0 %	307069505
48	NC_014497	A	6	6	1195	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
49	NC_014497	T	6	6	1208	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	307069505
50	NC_014497	TAA	2	6	1224	1229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
51	NC_014497	A	11	11	1252	1262	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
52	NC_014497	TAA	2	6	1267	1272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
53	NC_014497	AGAA	2	8	1276	1283	75 %	0 %	25 %	0 %	307069505
54	NC_014497	A	7	7	1291	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
55	NC_014497	A	7	7	1312	1318	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
56	NC_014497	TAATA	2	10	1321	1330	60 %	40 %	0 %	0 %	307069505
57	NC_014497	TATT	2	8	1334	1341	25 %	75 %	0 %	0 %	307069505
58	NC_014497	ATT	2	6	1357	1362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
59	NC_014497	A	6	6	1364	1369	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
60	NC_014497	ATT	2	6	1371	1376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
61	NC_014497	ATA	2	6	1379	1384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
62	NC_014497	A	10	10	1397	1406	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
63	NC_014497	TAA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
64	NC_014497	TAA	2	6	1434	1439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
65	NC_014497	A	7	7	1456	1462	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
66	NC_014497	TAA	4	12	1465	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
67	NC_014497	AAT	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
68	NC_014497	AT	4	8	1481	1488	50 %	50 %	0 %	0 %	307069505
69	NC_014497	A	6	6	1495	1500	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
70	NC_014497	AATT	2	8	1510	1517	50 %	50 %	0 %	0 %	307069505
71	NC_014497	AAAT	2	8	1530	1537	75 %	25 %	0 %	0 %	307069505
72	NC_014497	ATA	2	6	1541	1546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
73	NC_014497	AAT	4	12	1547	1558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
74	NC_014497	TAA	3	9	1561	1569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
75	NC_014497	TAT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
76	NC_014497	ATT	2	6	1584	1589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
77	NC_014497	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
78	NC_014497	A	8	8	1621	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
79	NC_014497	TATT	2	8	1635	1642	25 %	75 %	0 %	0 %	307069505
80	NC_014497	ATAA	2	8	1643	1650	75 %	25 %	0 %	0 %	307069505
81	NC_014497	A	6	6	1649	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
82	NC_014497	TAA	2	6	1674	1679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
83	NC_014497	A	6	6	1683	1688	100 %	0 %	0 %	0 %	307069505
84	NC_014497	TA	4	8	1689	1696	50 %	50 %	0 %	0 %	307069505
85	NC_014497	TAA	2	6	1711	1716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
86	NC_014497	ATT	2	6	1744	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069505
87	NC_014497	T	6	6	1758	1763	0 %	100 %	0 %	0 %	307069505
88	NC_014497	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069505
89	NC_014497	A	7	7	1797	1803	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
90	NC_014497	TAA	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
91	NC_014497	GGT	3	9	1822	1830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307069506
92	NC_014497	AGC	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069506
93	NC_014497	AT	3	6	1853	1858	50 %	50 %	0 %	0 %	307069506
94	NC_014497	TTA	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069506
95	NC_014497	TAA	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
96	NC_014497	GGT	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307069506
97	NC_014497	GGT	2	6	1984	1989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307069506
98	NC_014497	TGA	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069506
99	NC_014497	ATT	2	6	2039	2044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069506
100	NC_014497	CTA	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069506
101	NC_014497	TAGA	2	8	2081	2088	50 %	25 %	25 %	0 %	307069506
102	NC_014497	TAAT	2	8	2108	2115	50 %	50 %	0 %	0 %	307069506
103	NC_014497	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
104	NC_014497	A	8	8	2128	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
105	NC_014497	TTTATT	2	12	2136	2147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307069506
106	NC_014497	TAT	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069506
107	NC_014497	TGA	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069506
108	NC_014497	TAA	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
109	NC_014497	A	7	7	2177	2183	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
110	NC_014497	A	6	6	2205	2210	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
111	NC_014497	TAA	3	9	2237	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
112	NC_014497	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	307069506
113	NC_014497	ATT	2	6	2331	2336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069506
114	NC_014497	A	7	7	2346	2352	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
115	NC_014497	ACC	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307069506
116	NC_014497	TAGAT	2	10	2394	2403	40 %	40 %	20 %	0 %	307069506
117	NC_014497	T	6	6	2418	2423	0 %	100 %	0 %	0 %	307069506
118	NC_014497	A	7	7	2430	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
119	NC_014497	ATA	2	6	2480	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
120	NC_014497	A	10	10	2490	2499	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
121	NC_014497	AATT	2	8	2502	2509	50 %	50 %	0 %	0 %	307069506
122	NC_014497	ACTAAT	2	12	2518	2529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307069506
123	NC_014497	TTA	2	6	2538	2543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069506
124	NC_014497	TA	3	6	2542	2547	50 %	50 %	0 %	0 %	307069506
125	NC_014497	A	9	9	2550	2558	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
126	NC_014497	TTTA	2	8	2574	2581	25 %	75 %	0 %	0 %	307069506
127	NC_014497	TAA	2	6	2637	2642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
128	NC_014497	A	10	10	2649	2658	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
129	NC_014497	ATT	2	6	2819	2824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069506
130	NC_014497	CATT	2	8	2845	2852	25 %	50 %	0 %	25 %	307069506
131	NC_014497	ATT	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069506
132	NC_014497	ATTT	2	8	2873	2880	25 %	75 %	0 %	0 %	307069506
133	NC_014497	T	6	6	2878	2883	0 %	100 %	0 %	0 %	307069506
134	NC_014497	ACT	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069506
135	NC_014497	GAA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069506
136	NC_014497	GCA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069506
137	NC_014497	AAT	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
138	NC_014497	CTT	2	6	2954	2959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069506
139	NC_014497	ATA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069506
140	NC_014497	A	9	9	2974	2982	100 %	0 %	0 %	0 %	307069506
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