MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 49575

< Previous12...888990919293949596979899100Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_014392	TAC	3	9	2528910	2528918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872916
49502	NC_014392	CAA	2	6	2528959	2528964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302872916
49503	NC_014392	ACA	2	6	2528991	2528996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302872916
49504	NC_014392	CAGG	2	8	2529048	2529055	25 %	0 %	50 %	25 %	302872916
49505	NC_014392	AAG	2	6	2529115	2529120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302872916
49506	NC_014392	TTG	2	6	2529163	2529168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302872916
49507	NC_014392	GCA	2	6	2529189	2529194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302872916
49508	NC_014392	GT	3	6	2529305	2529310	0 %	50 %	50 %	0 %	302872916
49509	NC_014392	AAT	2	6	2529341	2529346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302872916
49510	NC_014392	TG	3	6	2529350	2529355	0 %	50 %	50 %	0 %	302872916
49511	NC_014392	TAT	2	6	2529361	2529366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302872916
49512	NC_014392	TGT	2	6	2529428	2529433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302872916
49513	NC_014392	A	7	7	2529479	2529485	100 %	0 %	0 %	0 %	302872916
49514	NC_014392	T	6	6	2529580	2529585	0 %	100 %	0 %	0 %	302872917
49515	NC_014392	AATAG	2	10	2529589	2529598	60 %	20 %	20 %	0 %	302872917
49516	NC_014392	A	6	6	2529639	2529644	100 %	0 %	0 %	0 %	302872917
49517	NC_014392	ATCT	2	8	2529709	2529716	25 %	50 %	0 %	25 %	302872917
49518	NC_014392	CAT	2	6	2529759	2529764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872917
49519	NC_014392	CAA	2	6	2529779	2529784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302872917
49520	NC_014392	TCACA	2	10	2529816	2529825	40 %	20 %	0 %	40 %	302872917
49521	NC_014392	TTG	2	6	2529845	2529850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302872917
49522	NC_014392	T	6	6	2529892	2529897	0 %	100 %	0 %	0 %	302872917
49523	NC_014392	TA	3	6	2529921	2529926	50 %	50 %	0 %	0 %	302872917
49524	NC_014392	AAC	2	6	2529972	2529977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302872917
49525	NC_014392	T	6	6	2530027	2530032	0 %	100 %	0 %	0 %	302872917
49526	NC_014392	A	7	7	2530061	2530067	100 %	0 %	0 %	0 %	302872917
49527	NC_014392	GGC	2	6	2530087	2530092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302872917
49528	NC_014392	AAT	2	6	2530119	2530124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302872917
49529	NC_014392	A	6	6	2530155	2530160	100 %	0 %	0 %	0 %	302872917
49530	NC_014392	AT	3	6	2530220	2530225	50 %	50 %	0 %	0 %	302872917
49531	NC_014392	GTACTT	2	12	2530243	2530254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302872917
49532	NC_014392	ACA	2	6	2530393	2530398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302872917
49533	NC_014392	CAG	2	6	2530445	2530450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302872917
49534	NC_014392	TA	3	6	2530504	2530509	50 %	50 %	0 %	0 %	302872917
49535	NC_014392	GCT	2	6	2530656	2530661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302872918
49536	NC_014392	TAC	2	6	2530666	2530671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872918
49537	NC_014392	ACAAAA	2	12	2530753	2530764	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	302872918
49538	NC_014392	GTG	2	6	2530856	2530861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302872918
49539	NC_014392	TCA	2	6	2530866	2530871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872918
49540	NC_014392	TCA	2	6	2530914	2530919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872918
49541	NC_014392	A	6	6	2530923	2530928	100 %	0 %	0 %	0 %	302872918
49542	NC_014392	CTTTT	2	10	2530929	2530938	0 %	80 %	0 %	20 %	302872918
49543	NC_014392	ATA	2	6	2530942	2530947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302872918
49544	NC_014392	ATA	2	6	2530950	2530955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302872918
49545	NC_014392	TTA	2	6	2530957	2530962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302872918
49546	NC_014392	GCA	2	6	2530963	2530968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302872918
49547	NC_014392	CTA	2	6	2530975	2530980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872918
49548	NC_014392	TAA	2	6	2531128	2531133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302872918
49549	NC_014392	ACT	2	6	2531137	2531142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872918
49550	NC_014392	ATGTCA	2	12	2531190	2531201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302872918
49551	NC_014392	GTT	2	6	2531217	2531222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302872918
49552	NC_014392	CAC	2	6	2531231	2531236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302872918
49553	NC_014392	A	6	6	2531284	2531289	100 %	0 %	0 %	0 %	302872918
49554	NC_014392	AAT	2	6	2531301	2531306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302872918
49555	NC_014392	GAG	2	6	2531334	2531339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302872918
49556	NC_014392	AAG	2	6	2531372	2531377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302872918
49557	NC_014392	AT	3	6	2531382	2531387	50 %	50 %	0 %	0 %	302872918
49558	NC_014392	CAT	2	6	2531441	2531446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302872918
49559	NC_014392	AAAAG	2	10	2531454	2531463	80 %	0 %	20 %	0 %	302872918
49560	NC_014392	T	7	7	2531474	2531480	0 %	100 %	0 %	0 %	302872918
49561	NC_014392	TTC	2	6	2531528	2531533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302872918
49562	NC_014392	TAAAAA	2	12	2531554	2531565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	302872918
49563	NC_014392	A	7	7	2531561	2531567	100 %	0 %	0 %	0 %	302872918
49564	NC_014392	CAG	2	6	2531573	2531578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302872918
49565	NC_014392	AGA	2	6	2531599	2531604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302872918
49566	NC_014392	A	6	6	2531610	2531615	100 %	0 %	0 %	0 %	302872918
49567	NC_014392	TAT	2	6	2531658	2531663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302872918
49568	NC_014392	ATG	2	6	2531748	2531753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302872918
49569	NC_014392	GAT	2	6	2531788	2531793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302872919
49570	NC_014392	AGA	2	6	2531858	2531863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302872919
49571	NC_014392	T	6	6	2531882	2531887	0 %	100 %	0 %	0 %	302872919
49572	NC_014392	T	6	6	2531893	2531898	0 %	100 %	0 %	0 %	302872919
49573	NC_014392	ATTC	2	8	2531911	2531918	25 %	50 %	0 %	25 %	302872919
49574	NC_014392	A	6	6	2531973	2531978	100 %	0 %	0 %	0 %	302872919
49575	NC_014392	TTTA	2	8	2531998	2532005	25 %	75 %	0 %	0 %	302872919

< Previous12...888990919293949596979899100Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.