MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 49575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014392	ATG	2	6	127	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870732
2	NC_014392	TGAA	2	8	133	140	50 %	25 %	25 %	0 %	302870732
3	NC_014392	AGG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302870732
4	NC_014392	A	6	6	168	173	100 %	0 %	0 %	0 %	302870732
5	NC_014392	GACA	2	8	191	198	50 %	0 %	25 %	25 %	302870732
6	NC_014392	TGA	2	6	242	247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870732
7	NC_014392	TC	3	6	346	351	0 %	50 %	0 %	50 %	302870732
8	NC_014392	TTC	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870732
9	NC_014392	CAAG	2	8	416	423	50 %	0 %	25 %	25 %	302870732
10	NC_014392	TGT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870732
11	NC_014392	AAC	3	9	489	497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870732
12	NC_014392	ACC	2	6	536	541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302870732
13	NC_014392	GA	3	6	546	551	50 %	0 %	50 %	0 %	302870732
14	NC_014392	CGG	2	6	575	580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302870732
15	NC_014392	AGAC	2	8	715	722	50 %	0 %	25 %	25 %	302870732
16	NC_014392	GAC	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302870732
17	NC_014392	AGAA	2	8	791	798	75 %	0 %	25 %	0 %	302870732
18	NC_014392	AGG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302870732
19	NC_014392	CA	3	6	816	821	50 %	0 %	0 %	50 %	302870732
20	NC_014392	AAG	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
21	NC_014392	ATA	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870732
22	NC_014392	GCC	2	6	872	877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302870732
23	NC_014392	AGA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
24	NC_014392	GCC	2	6	947	952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302870732
25	NC_014392	AAG	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
26	NC_014392	AG	3	6	1062	1067	50 %	0 %	50 %	0 %	302870732
27	NC_014392	TAAA	2	8	1081	1088	75 %	25 %	0 %	0 %	302870732
28	NC_014392	A	6	6	1182	1187	100 %	0 %	0 %	0 %	302870732
29	NC_014392	AAG	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870732
30	NC_014392	AG	3	6	1314	1319	50 %	0 %	50 %	0 %	302870732
31	NC_014392	AGGCG	2	10	1346	1355	20 %	0 %	60 %	20 %	302870732
32	NC_014392	CA	3	6	1371	1376	50 %	0 %	0 %	50 %	302870732
33	NC_014392	A	6	6	1396	1401	100 %	0 %	0 %	0 %	302870732
34	NC_014392	CAA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870732
35	NC_014392	A	7	7	1455	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	302870732
36	NC_014392	AAT	3	9	1477	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870732
37	NC_014392	GCG	2	6	2365	2370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302870733
38	NC_014392	TGA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
39	NC_014392	AAAG	2	8	2556	2563	75 %	0 %	25 %	0 %	302870733
40	NC_014392	TGG	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302870733
41	NC_014392	AGA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870733
42	NC_014392	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870733
43	NC_014392	GTAT	2	8	2792	2799	25 %	50 %	25 %	0 %	302870733
44	NC_014392	CGA	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302870733
45	NC_014392	TGGA	2	8	2816	2823	25 %	25 %	50 %	0 %	302870733
46	NC_014392	GTA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
47	NC_014392	GATA	2	8	2996	3003	50 %	25 %	25 %	0 %	302870733
48	NC_014392	CAAG	2	8	3106	3113	50 %	0 %	25 %	25 %	302870733
49	NC_014392	CA	3	6	3139	3144	50 %	0 %	0 %	50 %	302870733
50	NC_014392	TAG	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
51	NC_014392	ACT	2	6	3259	3264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870733
52	NC_014392	GA	3	6	3443	3448	50 %	0 %	50 %	0 %	302870733
53	NC_014392	ATG	2	6	3468	3473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870733
54	NC_014392	GGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302870733
55	NC_014392	AAGG	2	8	3524	3531	50 %	0 %	50 %	0 %	302870733
56	NC_014392	AG	3	6	3567	3572	50 %	0 %	50 %	0 %	302870733
57	NC_014392	AG	3	6	3617	3622	50 %	0 %	50 %	0 %	302870733
58	NC_014392	TGGA	2	8	3637	3644	25 %	25 %	50 %	0 %	302870733
59	NC_014392	GGT	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302870733
60	NC_014392	TGTC	2	8	3742	3749	0 %	50 %	25 %	25 %	302870733
61	NC_014392	CTG	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870733
62	NC_014392	TGT	2	6	3949	3954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870734
63	NC_014392	CAA	2	6	4008	4013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870734
64	NC_014392	GT	3	6	4033	4038	0 %	50 %	50 %	0 %	302870734
65	NC_014392	ATGCAA	2	12	4088	4099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302870734
66	NC_014392	AAAGC	2	10	4145	4154	60 %	0 %	20 %	20 %	302870734
67	NC_014392	A	6	6	4172	4177	100 %	0 %	0 %	0 %	302870734
68	NC_014392	AGA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870734
69	NC_014392	AGA	2	6	4236	4241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870734
70	NC_014392	TTG	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870734
71	NC_014392	GAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870734
72	NC_014392	TTG	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870734
73	NC_014392	TGA	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870734
74	NC_014392	ATA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870734
75	NC_014392	CAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870734
76	NC_014392	T	6	6	4658	4663	0 %	100 %	0 %	0 %	302870734
77	NC_014392	AAAC	2	8	4797	4804	75 %	0 %	0 %	25 %	302870734
78	NC_014392	GAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870734
79	NC_014392	ATA	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870735
80	NC_014392	ATC	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870735
81	NC_014392	T	6	6	5122	5127	0 %	100 %	0 %	0 %	302870735
82	NC_014392	ATAAA	2	10	5138	5147	80 %	20 %	0 %	0 %	302870735
83	NC_014392	CTTCT	2	10	5180	5189	0 %	60 %	0 %	40 %	302870735
84	NC_014392	TG	3	6	5210	5215	0 %	50 %	50 %	0 %	302870735
85	NC_014392	AAT	2	6	5349	5354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870735
86	NC_014392	A	6	6	5365	5370	100 %	0 %	0 %	0 %	302870735
87	NC_014392	T	8	8	5411	5418	0 %	100 %	0 %	0 %	302870735
88	NC_014392	CGC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302870735
89	NC_014392	CTT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870735
90	NC_014392	ATA	2	6	5584	5589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870735
91	NC_014392	A	6	6	5655	5660	100 %	0 %	0 %	0 %	302870735
92	NC_014392	AAAT	2	8	5703	5710	75 %	25 %	0 %	0 %	302870735
93	NC_014392	CTTGAA	2	12	5716	5727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870735
94	NC_014392	TTAA	2	8	5788	5795	50 %	50 %	0 %	0 %	302870735
95	NC_014392	ACA	2	6	5815	5820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870735
96	NC_014392	TGC	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870735
97	NC_014392	AGA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870735
98	NC_014392	A	6	6	6000	6005	100 %	0 %	0 %	0 %	302870735
99	NC_014392	GAAA	2	8	6118	6125	75 %	0 %	25 %	0 %	302870735
100	NC_014392	A	6	6	6131	6136	100 %	0 %	0 %	0 %	302870735
101	NC_014392	TCA	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870736
102	NC_014392	CTT	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870736
103	NC_014392	AGA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870736
104	NC_014392	CAGGA	2	10	6282	6291	40 %	0 %	40 %	20 %	302870736
105	NC_014392	ACG	2	6	6304	6309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302870736
106	NC_014392	A	7	7	6314	6320	100 %	0 %	0 %	0 %	302870736
107	NC_014392	ATA	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870736
108	NC_014392	AAT	2	6	6359	6364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870736
109	NC_014392	GAAT	2	8	6487	6494	50 %	25 %	25 %	0 %	302870737
110	NC_014392	TA	3	6	6576	6581	50 %	50 %	0 %	0 %	302870737
111	NC_014392	AG	3	6	6595	6600	50 %	0 %	50 %	0 %	302870737
112	NC_014392	TCA	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870737
113	NC_014392	TTG	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870737
114	NC_014392	TTA	2	6	6679	6684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870737
115	NC_014392	A	6	6	6757	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	302870737
116	NC_014392	TTC	2	6	6787	6792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
117	NC_014392	GGT	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302870737
118	NC_014392	TGT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870737
119	NC_014392	TAT	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870737
120	NC_014392	TGA	3	9	7010	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870737
121	NC_014392	GA	4	8	7116	7123	50 %	0 %	50 %	0 %	302870737
122	NC_014392	A	7	7	7123	7129	100 %	0 %	0 %	0 %	302870737
123	NC_014392	ATG	2	6	7153	7158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870737
124	NC_014392	TGCAG	2	10	7262	7271	20 %	20 %	40 %	20 %	302870737
125	NC_014392	GA	3	6	7288	7293	50 %	0 %	50 %	0 %	302870737
126	NC_014392	AT	3	6	7296	7301	50 %	50 %	0 %	0 %	302870737
127	NC_014392	ACA	2	6	7312	7317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870737
128	NC_014392	CTG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870737
129	NC_014392	CTT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
130	NC_014392	AGA	2	6	7580	7585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870737
131	NC_014392	AGA	2	6	7603	7608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870737
132	NC_014392	A	6	6	7652	7657	100 %	0 %	0 %	0 %	302870737
133	NC_014392	AG	3	6	7662	7667	50 %	0 %	50 %	0 %	302870737
134	NC_014392	CTG	2	6	7780	7785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302870737
135	NC_014392	CTT	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
136	NC_014392	A	6	6	7953	7958	100 %	0 %	0 %	0 %	302870737
137	NC_014392	CTT	3	9	8022	8030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
138	NC_014392	TCT	2	6	8035	8040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870737
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268	NC_014392	AAG	2	6	13751	13756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870743
269	NC_014392	T	6	6	13795	13800	0 %	100 %	0 %	0 %	302870743
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271	NC_014392	TTCAAA	2	12	13855	13866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302870743
272	NC_014392	TCTGTA	2	12	13994	14005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302870743
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