MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 80394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014376	ATG	2	6	1126093	1126098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385447
19002	NC_014376	CTT	2	6	1126127	1126132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385447
19003	NC_014376	GAA	2	6	1126154	1126159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302385447
19004	NC_014376	TAC	2	6	1126176	1126181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302385447
19005	NC_014376	GAT	2	6	1126242	1126247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385447
19006	NC_014376	CCAT	2	8	1126327	1126334	25 %	25 %	0 %	50 %	302385447
19007	NC_014376	TTA	2	6	1126357	1126362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385447
19008	NC_014376	CCTT	2	8	1126486	1126493	0 %	50 %	0 %	50 %	302385448
19009	NC_014376	GCA	2	6	1126529	1126534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385448
19010	NC_014376	TGT	2	6	1126584	1126589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302385448
19011	NC_014376	CTG	2	6	1126646	1126651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302385448
19012	NC_014376	GAT	2	6	1126656	1126661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385448
19013	NC_014376	TTC	2	6	1126680	1126685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385448
19014	NC_014376	CAG	2	6	1126689	1126694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385448
19015	NC_014376	ATCA	2	8	1126713	1126720	50 %	25 %	0 %	25 %	302385448
19016	NC_014376	GCC	4	12	1126767	1126778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302385448
19017	NC_014376	CAG	2	6	1126841	1126846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385448
19018	NC_014376	CGG	2	6	1126867	1126872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302385448
19019	NC_014376	TCT	2	6	1126888	1126893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385448
19020	NC_014376	CAGC	2	8	1126919	1126926	25 %	0 %	25 %	50 %	302385448
19021	NC_014376	CTT	3	9	1126931	1126939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385448
19022	NC_014376	TGG	2	6	1127018	1127023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302385448
19023	NC_014376	CTCTT	2	10	1127058	1127067	0 %	60 %	0 %	40 %	302385448
19024	NC_014376	AG	4	8	1127121	1127128	50 %	0 %	50 %	0 %	302385448
19025	NC_014376	GTT	2	6	1127175	1127180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302385448
19026	NC_014376	ACC	2	6	1127212	1127217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302385448
19027	NC_014376	ACT	2	6	1127218	1127223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302385448
19028	NC_014376	CTT	2	6	1127231	1127236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385448
19029	NC_014376	GCC	2	6	1127313	1127318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302385448
19030	NC_014376	TCTTTT	2	12	1127336	1127347	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302385448
19031	NC_014376	ATT	2	6	1127464	1127469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385449
19032	NC_014376	T	6	6	1127486	1127491	0 %	100 %	0 %	0 %	302385449
19033	NC_014376	CTT	2	6	1127501	1127506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385449
19034	NC_014376	AAG	2	6	1127538	1127543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302385449
19035	NC_014376	CTT	2	6	1127578	1127583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385449
19036	NC_014376	CAG	2	6	1127659	1127664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385449
19037	NC_014376	TGT	2	6	1127699	1127704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302385449
19038	NC_014376	TTC	2	6	1127714	1127719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385449
19039	NC_014376	TGTGC	2	10	1127737	1127746	0 %	40 %	40 %	20 %	302385449
19040	NC_014376	TTCT	2	8	1127762	1127769	0 %	75 %	0 %	25 %	302385449
19041	NC_014376	AGC	2	6	1127828	1127833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385449
19042	NC_014376	ACA	2	6	1127859	1127864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302385449
19043	NC_014376	GGAA	2	8	1127905	1127912	50 %	0 %	50 %	0 %	302385449
19044	NC_014376	CCG	2	6	1127913	1127918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302385449
19045	NC_014376	TTC	2	6	1127931	1127936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385449
19046	NC_014376	ACT	2	6	1127949	1127954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302385449
19047	NC_014376	CCATAC	2	12	1127998	1128009	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	302385449
19048	NC_014376	GAT	2	6	1128023	1128028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385449
19049	NC_014376	AGGA	2	8	1128058	1128065	50 %	0 %	50 %	0 %	302385449
19050	NC_014376	GCC	2	6	1128113	1128118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302385449
19051	NC_014376	GAT	2	6	1128128	1128133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385449
19052	NC_014376	GAT	2	6	1128163	1128168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385449
19053	NC_014376	CATG	2	8	1128253	1128260	25 %	25 %	25 %	25 %	302385449
19054	NC_014376	TCG	2	6	1128288	1128293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302385449
19055	NC_014376	AAGT	2	8	1128404	1128411	50 %	25 %	25 %	0 %	302385449
19056	NC_014376	T	6	6	1128568	1128573	0 %	100 %	0 %	0 %	302385449
19057	NC_014376	AAG	3	9	1128582	1128590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302385449
19058	NC_014376	TGC	2	6	1128878	1128883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302385450
19059	NC_014376	TCT	2	6	1128922	1128927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385450
19060	NC_014376	TGAGCC	2	12	1128939	1128950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302385450
19061	NC_014376	ATG	2	6	1128996	1129001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385450
19062	NC_014376	TTC	2	6	1129067	1129072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385450
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19070	NC_014376	TGT	2	6	1129432	1129437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302385450
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19099	NC_014376	AACA	2	8	1130788	1130795	75 %	0 %	0 %	25 %	302385451
19100	NC_014376	TTC	2	6	1130821	1130826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385451
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19102	NC_014376	CAGG	2	8	1130876	1130883	25 %	0 %	50 %	25 %	302385451
19103	NC_014376	AGC	2	6	1130944	1130949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385451
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19105	NC_014376	ATT	2	6	1131022	1131027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385451
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19113	NC_014376	TCT	2	6	1131771	1131776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385452
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19115	NC_014376	T	6	6	1131969	1131974	0 %	100 %	0 %	0 %	302385452
19116	NC_014376	TCT	2	6	1132065	1132070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385452
19117	NC_014376	AGT	2	6	1132143	1132148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385452
19118	NC_014376	CAT	2	6	1132163	1132168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302385452
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19215	NC_014376	A	6	6	1139005	1139010	100 %	0 %	0 %	0 %	302385456
19216	NC_014376	GAAA	2	8	1139062	1139069	75 %	0 %	25 %	0 %	302385456
19217	NC_014376	TAC	2	6	1139131	1139136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302385456
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19219	NC_014376	TGA	3	9	1139224	1139232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385456
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19221	NC_014376	A	7	7	1139347	1139353	100 %	0 %	0 %	0 %	302385457
19222	NC_014376	GAA	2	6	1139354	1139359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302385457
19223	NC_014376	TAT	2	6	1139393	1139398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385457
19224	NC_014376	CTGC	2	8	1139469	1139476	0 %	25 %	25 %	50 %	302385457
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19226	NC_014376	GGAA	2	8	1139554	1139561	50 %	0 %	50 %	0 %	302385457
19227	NC_014376	CGG	2	6	1139578	1139583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302385457
19228	NC_014376	AGA	2	6	1139599	1139604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302385457
19229	NC_014376	GGA	2	6	1139641	1139646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302385457
19230	NC_014376	GCA	2	6	1139654	1139659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385457
19231	NC_014376	GAA	2	6	1139663	1139668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302385457
19232	NC_014376	GAT	2	6	1139691	1139696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385457
19233	NC_014376	TGT	2	6	1139936	1139941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302385458
19234	NC_014376	GAT	2	6	1139977	1139982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385458
19235	NC_014376	GCT	2	6	1140004	1140009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302385458
19236	NC_014376	ATGA	2	8	1140031	1140038	50 %	25 %	25 %	0 %	302385458
19237	NC_014376	AGGA	2	8	1140062	1140069	50 %	0 %	50 %	0 %	302385458
19238	NC_014376	ATG	2	6	1140151	1140156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385458
19239	NC_014376	TTA	2	6	1140230	1140235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385458
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19243	NC_014376	GCG	2	6	1140509	1140514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302385458
19244	NC_014376	TTA	2	6	1140624	1140629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385458
19245	NC_014376	TGA	2	6	1140729	1140734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385458
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19247	NC_014376	AGG	2	6	1140771	1140776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302385458
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19249	NC_014376	TGA	2	6	1140887	1140892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385459
19250	NC_014376	TGG	2	6	1140910	1140915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302385459
19251	NC_014376	TTA	2	6	1140964	1140969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385459
19252	NC_014376	AGG	2	6	1140979	1140984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302385459
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19254	NC_014376	AT	3	6	1141242	1141247	50 %	50 %	0 %	0 %	302385459
19255	NC_014376	A	6	6	1141301	1141306	100 %	0 %	0 %	0 %	302385459
19256	NC_014376	GCA	2	6	1141345	1141350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385459
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19258	NC_014376	GCA	2	6	1141376	1141381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385460
19259	NC_014376	GAG	2	6	1141450	1141455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302385460
19260	NC_014376	CTTA	2	8	1141486	1141493	25 %	50 %	0 %	25 %	302385460
19261	NC_014376	AAGGTG	2	12	1141543	1141554	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302385460
19262	NC_014376	GAC	2	6	1141641	1141646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385460
19263	NC_014376	TTA	2	6	1141678	1141683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385460
19264	NC_014376	GCT	2	6	1141687	1141692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302385460
19265	NC_014376	AAG	2	6	1141755	1141760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302385460
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19267	NC_014376	GAC	2	6	1141966	1141971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385460
19268	NC_014376	TCTG	2	8	1141983	1141990	0 %	50 %	25 %	25 %	302385460
19269	NC_014376	TAT	2	6	1142047	1142052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385460
19270	NC_014376	TCT	2	6	1142226	1142231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302385460
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19290	NC_014376	CCTG	2	8	1143138	1143145	0 %	25 %	25 %	50 %	302385462
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19302	NC_014376	TGG	3	9	1143781	1143789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302385463
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19307	NC_014376	AAC	2	6	1144046	1144051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302385463
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19316	NC_014376	ATG	2	6	1144489	1144494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385464
19317	NC_014376	GGT	2	6	1144509	1144514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302385464
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19319	NC_014376	TCCA	2	8	1144549	1144556	25 %	25 %	0 %	50 %	302385464
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19321	NC_014376	GGC	2	6	1144629	1144634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302385464
19322	NC_014376	GCT	2	6	1144749	1144754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302385464
19323	NC_014376	G	6	6	1144773	1144778	0 %	0 %	100 %	0 %	302385464
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19327	NC_014376	ATG	2	6	1145051	1145056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385465
19328	NC_014376	CGGGAT	2	12	1145071	1145082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302385465
19329	NC_014376	TTA	2	6	1145142	1145147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385465
19330	NC_014376	TAT	2	6	1145159	1145164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385465
19331	NC_014376	T	6	6	1145173	1145178	0 %	100 %	0 %	0 %	302385465
19332	NC_014376	ACT	2	6	1145205	1145210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302385465
19333	NC_014376	CAG	2	6	1145333	1145338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302385465
19334	NC_014376	T	6	6	1145357	1145362	0 %	100 %	0 %	0 %	302385465
19335	NC_014376	CAA	2	6	1145392	1145397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302385465
19336	NC_014376	GA	3	6	1145421	1145426	50 %	0 %	50 %	0 %	302385465
19337	NC_014376	ATGC	2	8	1145452	1145459	25 %	25 %	25 %	25 %	302385465
19338	NC_014376	A	6	6	1145688	1145693	100 %	0 %	0 %	0 %	302385466
19339	NC_014376	AT	3	6	1145730	1145735	50 %	50 %	0 %	0 %	302385466
19340	NC_014376	ATTT	2	8	1145757	1145764	25 %	75 %	0 %	0 %	302385466
19341	NC_014376	GAT	3	9	1145810	1145818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385466
19342	NC_014376	TATG	2	8	1145837	1145844	25 %	50 %	25 %	0 %	302385466
19343	NC_014376	CTG	2	6	1145854	1145859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302385466
19344	NC_014376	TAT	2	6	1145868	1145873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302385466
19345	NC_014376	ATG	2	6	1145932	1145937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385466
19346	NC_014376	TCTG	2	8	1145939	1145946	0 %	50 %	25 %	25 %	302385466
19347	NC_014376	AG	3	6	1145997	1146002	50 %	0 %	50 %	0 %	302385466
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19465	NC_014376	ATG	2	6	1152618	1152623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302385473
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