MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 79829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014355	CAT	2	6	638527	638532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036040
12003	NC_014355	GGT	2	6	638659	638664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036040
12004	NC_014355	ATTGG	2	10	638773	638782	20 %	40 %	40 %	0 %	302036040
12005	NC_014355	TGA	2	6	638793	638798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036040
12006	NC_014355	GCT	2	6	638929	638934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036040
12007	NC_014355	GTT	2	6	638968	638973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036040
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12009	NC_014355	CGG	2	6	639010	639015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036040
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12011	NC_014355	CTG	2	6	639089	639094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036040
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12015	NC_014355	GCGCG	2	10	639217	639226	0 %	0 %	60 %	40 %	302036041
12016	NC_014355	ACG	2	6	639229	639234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036041
12017	NC_014355	CTG	2	6	639235	639240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036041
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12020	NC_014355	GGA	2	6	639441	639446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302036041
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12052	NC_014355	CGGA	2	8	641882	641889	25 %	0 %	50 %	25 %	302036044
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12117	NC_014355	GTA	2	6	645933	645938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036050
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12120	NC_014355	GTT	2	6	646172	646177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036050
12121	NC_014355	GCA	2	6	646199	646204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036050
12122	NC_014355	CG	3	6	646234	646239	0 %	0 %	50 %	50 %	302036050
12123	NC_014355	CCG	2	6	646252	646257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036050
12124	NC_014355	CGG	2	6	646311	646316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036050
12125	NC_014355	GCC	2	6	646326	646331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036050
12126	NC_014355	CGT	2	6	646533	646538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036051
12127	NC_014355	TGGCGG	2	12	646570	646581	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302036051
12128	NC_014355	ACTG	2	8	646685	646692	25 %	25 %	25 %	25 %	302036051
12129	NC_014355	TGG	2	6	646789	646794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036051
12130	NC_014355	GTT	2	6	646886	646891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036051
12131	NC_014355	CAT	2	6	646919	646924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036051
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12140	NC_014355	GAT	2	6	647427	647432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036052
12141	NC_014355	GCGG	2	8	647461	647468	0 %	0 %	75 %	25 %	302036052
12142	NC_014355	CCG	3	9	647510	647518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036052
12143	NC_014355	CATGCG	2	12	647524	647535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302036052
12144	NC_014355	TTG	2	6	647553	647558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036052
12145	NC_014355	TCCGG	2	10	647589	647598	0 %	20 %	40 %	40 %	302036052
12146	NC_014355	ACA	2	6	647626	647631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302036052
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12149	NC_014355	CTG	2	6	647867	647872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036052
12150	NC_014355	GAA	2	6	647926	647931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302036052
12151	NC_014355	GATTC	2	10	647974	647983	20 %	40 %	20 %	20 %	302036052
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12154	NC_014355	CGG	3	9	648161	648169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036052
12155	NC_014355	TGC	2	6	648197	648202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036052
12156	NC_014355	CTG	2	6	648259	648264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036052
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12159	NC_014355	GGC	3	9	648468	648476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036052
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12163	NC_014355	GAA	2	6	648607	648612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302036052
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12166	NC_014355	CGAT	2	8	648710	648717	25 %	25 %	25 %	25 %	302036052
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12200	NC_014355	CTG	2	6	650519	650524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036054
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12203	NC_014355	CGGC	2	8	650592	650599	0 %	0 %	50 %	50 %	302036054
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12214	NC_014355	GCGTCG	2	12	651192	651203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302036054
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12222	NC_014355	TCG	2	6	651633	651638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036054
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12224	NC_014355	CTG	2	6	651755	651760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036054
12225	NC_014355	TCA	2	6	651849	651854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036054
12226	NC_014355	CAGG	2	8	651856	651863	25 %	0 %	50 %	25 %	302036054
12227	NC_014355	CAA	2	6	651917	651922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302036055
12228	NC_014355	A	6	6	651986	651991	100 %	0 %	0 %	0 %	302036055
12229	NC_014355	AG	3	6	652032	652037	50 %	0 %	50 %	0 %	302036055
12230	NC_014355	CGT	2	6	652149	652154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036056
12231	NC_014355	CGG	2	6	652176	652181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036056
12232	NC_014355	CGG	2	6	652251	652256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036056
12233	NC_014355	CGC	2	6	652286	652291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036056
12234	NC_014355	T	7	7	652358	652364	0 %	100 %	0 %	0 %	302036056
12235	NC_014355	GCCG	2	8	652369	652376	0 %	0 %	50 %	50 %	302036056
12236	NC_014355	CGG	2	6	652378	652383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036056
12237	NC_014355	CAT	2	6	652437	652442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036056
12238	NC_014355	TGG	3	9	652520	652528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036057
12239	NC_014355	TCG	2	6	652532	652537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036057
12240	NC_014355	TTC	2	6	652556	652561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036057
12241	NC_014355	ATC	2	6	652580	652585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036057
12242	NC_014355	GGT	2	6	652656	652661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036057
12243	NC_014355	GGT	2	6	652665	652670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036057
12244	NC_014355	CTGCTC	2	12	652675	652686	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302036057
12245	NC_014355	GT	3	6	652694	652699	0 %	50 %	50 %	0 %	302036057
12246	NC_014355	GCG	2	6	652763	652768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036057
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12252	NC_014355	TGA	2	6	653136	653141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036058
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12254	NC_014355	GCG	2	6	653366	653371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036058
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12263	NC_014355	CTCA	2	8	653854	653861	25 %	25 %	0 %	50 %	302036059
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12343	NC_014355	ATCG	2	8	657565	657572	25 %	25 %	25 %	25 %	302036060
12344	NC_014355	GA	3	6	657578	657583	50 %	0 %	50 %	0 %	302036060
12345	NC_014355	GTT	2	6	657585	657590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036060
12346	NC_014355	AGC	2	6	657765	657770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036061
12347	NC_014355	CTCG	2	8	657787	657794	0 %	25 %	25 %	50 %	302036061
12348	NC_014355	TCT	2	6	657802	657807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036061
12349	NC_014355	GCG	2	6	657832	657837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036061
12350	NC_014355	CAT	2	6	658009	658014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036061
12351	NC_014355	TGG	2	6	658062	658067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036061
12352	NC_014355	GAC	3	9	658150	658158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036061
12353	NC_014355	TGA	2	6	658178	658183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036061
12354	NC_014355	TG	3	6	658189	658194	0 %	50 %	50 %	0 %	302036062
12355	NC_014355	TGGA	2	8	658196	658203	25 %	25 %	50 %	0 %	302036062
12356	NC_014355	CGG	3	9	658206	658214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036062
12357	NC_014355	GAT	2	6	658350	658355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036062
12358	NC_014355	CCG	2	6	658359	658364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036062
12359	NC_014355	TCG	2	6	658465	658470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036062
12360	NC_014355	GTC	2	6	658513	658518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036062
12361	NC_014355	GCT	2	6	658578	658583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036062
12362	NC_014355	ATG	2	6	658723	658728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036063
12363	NC_014355	GCC	2	6	658843	658848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036063
12364	NC_014355	GGC	2	6	658857	658862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036063
12365	NC_014355	TCG	2	6	658864	658869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036063
12366	NC_014355	CAA	2	6	658870	658875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302036063
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12370	NC_014355	TCA	2	6	659108	659113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036063
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12377	NC_014355	CGA	2	6	659288	659293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036063
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12380	NC_014355	GGAT	2	8	659493	659500	25 %	25 %	50 %	0 %	302036063
12381	NC_014355	GC	3	6	659560	659565	0 %	0 %	50 %	50 %	302036063
12382	NC_014355	ACGAC	2	10	659579	659588	40 %	0 %	20 %	40 %	302036063
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12385	NC_014355	TAC	2	6	659626	659631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036063
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12389	NC_014355	GAT	2	6	659803	659808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036063
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12394	NC_014355	CGG	2	6	660128	660133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036063
12395	NC_014355	GCC	2	6	660142	660147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036063
12396	NC_014355	GAC	2	6	660282	660287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036063
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12398	NC_014355	GCA	2	6	660368	660373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036063
12399	NC_014355	GC	3	6	660443	660448	0 %	0 %	50 %	50 %	302036063
12400	NC_014355	TGC	3	9	660449	660457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036063
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12404	NC_014355	G	6	6	660747	660752	0 %	0 %	100 %	0 %	302036063
12405	NC_014355	GA	3	6	660928	660933	50 %	0 %	50 %	0 %	302036064
12406	NC_014355	CG	3	6	660976	660981	0 %	0 %	50 %	50 %	302036064
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12417	NC_014355	TGCT	2	8	661711	661718	0 %	50 %	25 %	25 %	302036065
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12422	NC_014355	CGGAC	2	10	662238	662247	20 %	0 %	40 %	40 %	302036066
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12431	NC_014355	GTT	2	6	662693	662698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036067
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12434	NC_014355	TCG	2	6	662832	662837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036067
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12459	NC_014355	CGT	2	6	664130	664135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036067
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12465	NC_014355	GGA	2	6	664260	664265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302036067
12466	NC_014355	TGC	2	6	664475	664480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036068
12467	NC_014355	TGA	2	6	664491	664496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036068
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12469	NC_014355	GAT	2	6	664515	664520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036068
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12471	NC_014355	GCT	2	6	664570	664575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036068
12472	NC_014355	TGA	2	6	664584	664589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036068
12473	NC_014355	GCG	2	6	664646	664651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036068
12474	NC_014355	CAC	2	6	664678	664683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036068
12475	NC_014355	CGAG	2	8	664695	664702	25 %	0 %	50 %	25 %	302036068
12476	NC_014355	ACG	2	6	664703	664708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036068
12477	NC_014355	AGC	2	6	664733	664738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036068
12478	NC_014355	AGCACG	2	12	664766	664777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036068
12479	NC_014355	TGC	2	6	664893	664898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036068
12480	NC_014355	TGTGC	2	10	664900	664909	0 %	40 %	40 %	20 %	302036068
12481	NC_014355	GCG	2	6	665229	665234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036069
12482	NC_014355	ACC	2	6	665281	665286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036069
12483	NC_014355	ACG	2	6	665335	665340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036069
12484	NC_014355	GAG	3	9	665394	665402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302036069
12485	NC_014355	TGG	2	6	665460	665465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036070
12486	NC_014355	GCG	3	9	665487	665495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036070
12487	NC_014355	ATCA	2	8	665516	665523	50 %	25 %	0 %	25 %	302036070
12488	NC_014355	TTCT	2	8	665540	665547	0 %	75 %	0 %	25 %	302036070
12489	NC_014355	TTC	3	9	665582	665590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036070
12490	NC_014355	ATG	2	6	665703	665708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036070
12491	NC_014355	GTT	2	6	665807	665812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036070
12492	NC_014355	TCA	2	6	665860	665865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036070
12493	NC_014355	TCGGC	2	10	665962	665971	0 %	20 %	40 %	40 %	302036070
12494	NC_014355	GTA	2	6	665988	665993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036070
12495	NC_014355	ACC	2	6	666010	666015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036070
12496	NC_014355	ATC	2	6	666045	666050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036070
12497	NC_014355	TTC	2	6	666066	666071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036070
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12499	NC_014355	CAG	2	6	666247	666252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036071
12500	NC_014355	GGT	2	6	666256	666261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036071

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