MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 79829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014355	GAT	2	6	611657	611662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036015
11502	NC_014355	GCC	2	6	611685	611690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036015
11503	NC_014355	GACG	2	8	611843	611850	25 %	0 %	50 %	25 %	302036015
11504	NC_014355	TGCCAA	2	12	611879	611890	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302036015
11505	NC_014355	GGA	2	6	611919	611924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302036015
11506	NC_014355	GTC	2	6	612009	612014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036015
11507	NC_014355	TGG	2	6	612072	612077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036015
11508	NC_014355	GCT	4	12	612140	612151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036015
11509	NC_014355	CGC	2	6	612678	612683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036016
11510	NC_014355	TGC	2	6	612689	612694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036016
11511	NC_014355	TGG	2	6	612709	612714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036016
11512	NC_014355	AC	3	6	612757	612762	50 %	0 %	0 %	50 %	302036016
11513	NC_014355	GGCG	2	8	612771	612778	0 %	0 %	75 %	25 %	302036016
11514	NC_014355	CATC	2	8	612802	612809	25 %	25 %	0 %	50 %	302036016
11515	NC_014355	CTC	2	6	612869	612874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302036016
11516	NC_014355	TTC	2	6	612890	612895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036016
11517	NC_014355	GCC	3	9	612924	612932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036016
11518	NC_014355	CG	3	6	612961	612966	0 %	0 %	50 %	50 %	302036016
11519	NC_014355	CTG	2	6	612984	612989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036016
11520	NC_014355	GGC	2	6	613159	613164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
11521	NC_014355	CGG	2	6	613176	613181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
11522	NC_014355	CGG	2	6	613206	613211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
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11524	NC_014355	TGG	2	6	613257	613262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036017
11525	NC_014355	GCG	2	6	613436	613441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
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11527	NC_014355	CGTC	2	8	613617	613624	0 %	25 %	25 %	50 %	302036017
11528	NC_014355	TC	3	6	613708	613713	0 %	50 %	0 %	50 %	302036017
11529	NC_014355	GCG	2	6	613752	613757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
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11533	NC_014355	ACG	2	6	614006	614011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036017
11534	NC_014355	CG	3	6	614029	614034	0 %	0 %	50 %	50 %	302036017
11535	NC_014355	TGC	2	6	614037	614042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036017
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11539	NC_014355	GATC	2	8	614218	614225	25 %	25 %	25 %	25 %	302036017
11540	NC_014355	GGCG	2	8	614323	614330	0 %	0 %	75 %	25 %	302036017
11541	NC_014355	CTT	2	6	614365	614370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036017
11542	NC_014355	CGG	3	9	614422	614430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
11543	NC_014355	AAC	2	6	614502	614507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302036017
11544	NC_014355	CGGA	2	8	614528	614535	25 %	0 %	50 %	25 %	302036017
11545	NC_014355	TTC	2	6	614558	614563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036017
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11550	NC_014355	TGC	2	6	614649	614654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036017
11551	NC_014355	GCG	2	6	614687	614692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
11552	NC_014355	GGC	2	6	614702	614707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
11553	NC_014355	TCT	2	6	614712	614717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036017
11554	NC_014355	CCGC	2	8	614718	614725	0 %	0 %	25 %	75 %	302036017
11555	NC_014355	CCAA	2	8	614727	614734	50 %	0 %	0 %	50 %	302036017
11556	NC_014355	ATC	2	6	614793	614798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036017
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11560	NC_014355	GGC	2	6	615002	615007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036017
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11569	NC_014355	GGTC	2	8	615670	615677	0 %	25 %	50 %	25 %	302036018
11570	NC_014355	GTTCG	2	10	615718	615727	0 %	40 %	40 %	20 %	302036018
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11589	NC_014355	CACG	2	8	616417	616424	25 %	0 %	25 %	50 %	302036018
11590	NC_014355	CAT	2	6	616448	616453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036018
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11612	NC_014355	ATCGG	2	10	617618	617627	20 %	20 %	40 %	20 %	302036020
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11618	NC_014355	G	7	7	617944	617950	0 %	0 %	100 %	0 %	302036020
11619	NC_014355	GGC	2	6	618021	618026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036020
11620	NC_014355	CAAA	2	8	618174	618181	75 %	0 %	0 %	25 %	302036020
11621	NC_014355	TCCGGC	2	12	618283	618294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302036020
11622	NC_014355	TACG	2	8	618359	618366	25 %	25 %	25 %	25 %	302036020
11623	NC_014355	GCT	2	6	618427	618432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036020
11624	NC_014355	CCA	2	6	618456	618461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036020
11625	NC_014355	TTC	2	6	618473	618478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302036020
11626	NC_014355	CGAT	2	8	618510	618517	25 %	25 %	25 %	25 %	302036020
11627	NC_014355	TCC	2	6	618541	618546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302036020
11628	NC_014355	CCG	2	6	618558	618563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036020
11629	NC_014355	CGG	2	6	618676	618681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036020
11630	NC_014355	AGGGCG	2	12	618703	618714	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302036020
11631	NC_014355	GCC	2	6	618740	618745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036020
11632	NC_014355	CCT	2	6	618793	618798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302036020
11633	NC_014355	CGA	2	6	618873	618878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036020
11634	NC_014355	CGC	2	6	618891	618896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036020
11635	NC_014355	AGC	2	6	618906	618911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036020
11636	NC_014355	ACC	2	6	618972	618977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036020
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11638	NC_014355	CG	3	6	619027	619032	0 %	0 %	50 %	50 %	302036020
11639	NC_014355	AGC	2	6	619047	619052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036020
11640	NC_014355	GAT	2	6	619363	619368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036020
11641	NC_014355	TAC	2	6	619424	619429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036020
11642	NC_014355	GC	3	6	619482	619487	0 %	0 %	50 %	50 %	302036020
11643	NC_014355	GCC	2	6	619583	619588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036021
11644	NC_014355	GTTG	2	8	619599	619606	0 %	50 %	50 %	0 %	302036021
11645	NC_014355	GCA	2	6	619668	619673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036021
11646	NC_014355	CGA	2	6	619696	619701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036021
11647	NC_014355	GGT	2	6	619742	619747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036021
11648	NC_014355	G	7	7	619807	619813	0 %	0 %	100 %	0 %	302036021
11649	NC_014355	CAC	2	6	619919	619924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036021
11650	NC_014355	TCG	2	6	619929	619934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036021
11651	NC_014355	CCGG	3	12	619972	619983	0 %	0 %	50 %	50 %	302036021
11652	NC_014355	CGG	2	6	619987	619992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036021
11653	NC_014355	TCG	2	6	620010	620015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036021
11654	NC_014355	CCG	2	6	620066	620071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036021
11655	NC_014355	TGG	2	6	620141	620146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036021
11656	NC_014355	CGG	2	6	620155	620160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036021
11657	NC_014355	GCG	2	6	620168	620173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036021
11658	NC_014355	GCTC	2	8	620244	620251	0 %	25 %	25 %	50 %	302036021
11659	NC_014355	CCA	2	6	620331	620336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036021
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11661	NC_014355	GGC	2	6	620433	620438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036021
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11666	NC_014355	TTCA	2	8	620606	620613	25 %	50 %	0 %	25 %	302036021
11667	NC_014355	GGC	2	6	620724	620729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036021
11668	NC_014355	GCC	2	6	620755	620760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302036021
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11672	NC_014355	CGG	2	6	620950	620955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036022
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11674	NC_014355	GGC	2	6	621008	621013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036022
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11676	NC_014355	GCT	2	6	621057	621062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036022
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11679	NC_014355	CAC	2	6	621126	621131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036022
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11682	NC_014355	CGT	2	6	621198	621203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036022
11683	NC_014355	AAC	2	6	621208	621213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302036022
11684	NC_014355	CGG	2	6	621220	621225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036022
11685	NC_014355	ATCAA	2	10	621279	621288	60 %	20 %	0 %	20 %	302036023
11686	NC_014355	CAT	2	6	621307	621312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036023
11687	NC_014355	TCA	2	6	621351	621356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036023
11688	NC_014355	GCGA	2	8	621398	621405	25 %	0 %	50 %	25 %	302036023
11689	NC_014355	GTCACC	2	12	621428	621439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302036023
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11691	NC_014355	GC	3	6	621535	621540	0 %	0 %	50 %	50 %	302036023
11692	NC_014355	TCG	2	6	621567	621572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036023
11693	NC_014355	CAG	2	6	621605	621610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036023
11694	NC_014355	AGT	2	6	621622	621627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036023
11695	NC_014355	ATG	2	6	621681	621686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036024
11696	NC_014355	GCA	2	6	621701	621706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036024
11697	NC_014355	ATG	2	6	621720	621725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036024
11698	NC_014355	CAG	2	6	621828	621833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036024
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11702	NC_014355	GAC	2	6	622193	622198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036024
11703	NC_014355	CGTG	2	8	622205	622212	0 %	25 %	50 %	25 %	302036024
11704	NC_014355	CG	3	6	622312	622317	0 %	0 %	50 %	50 %	302036024
11705	NC_014355	TCG	2	6	622326	622331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036024
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11709	NC_014355	GGA	2	6	622508	622513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302036024
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11712	NC_014355	CGG	2	6	622682	622687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036024
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11717	NC_014355	ACG	2	6	622894	622899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036024
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11720	NC_014355	CG	3	6	623002	623007	0 %	0 %	50 %	50 %	302036024
11721	NC_014355	CGG	2	6	623048	623053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036024
11722	NC_014355	GGC	2	6	623096	623101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036024
11723	NC_014355	ATTA	2	8	623142	623149	50 %	50 %	0 %	0 %	302036024
11724	NC_014355	GACC	2	8	623230	623237	25 %	0 %	25 %	50 %	302036024
11725	NC_014355	AGA	2	6	623350	623355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302036024
11726	NC_014355	ATC	2	6	623445	623450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036024
11727	NC_014355	CGA	2	6	623464	623469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036024
11728	NC_014355	TCC	2	6	623499	623504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302036024
11729	NC_014355	AC	3	6	623574	623579	50 %	0 %	0 %	50 %	302036024
11730	NC_014355	GC	3	6	623679	623684	0 %	0 %	50 %	50 %	302036024
11731	NC_014355	CATC	2	8	623715	623722	25 %	25 %	0 %	50 %	302036024
11732	NC_014355	GGTT	2	8	623733	623740	0 %	50 %	50 %	0 %	302036024
11733	NC_014355	GAC	2	6	623744	623749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036024
11734	NC_014355	AAC	3	9	623772	623780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302036024
11735	NC_014355	GC	3	6	623791	623796	0 %	0 %	50 %	50 %	302036024
11736	NC_014355	GTT	2	6	623807	623812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036024
11737	NC_014355	CCT	2	6	623851	623856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302036024
11738	NC_014355	TCTA	2	8	623875	623882	25 %	50 %	0 %	25 %	302036024
11739	NC_014355	GCG	2	6	623923	623928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036024
11740	NC_014355	GTT	2	6	623963	623968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302036024
11741	NC_014355	GGC	2	6	623997	624002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036024
11742	NC_014355	CAT	2	6	624412	624417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302036025
11743	NC_014355	CGT	2	6	624443	624448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036025
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11979	NC_014355	ATCG	2	8	637488	637495	25 %	25 %	25 %	25 %	302036039
11980	NC_014355	CGA	2	6	637498	637503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302036039
11981	NC_014355	GGT	3	9	637511	637519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302036039
11982	NC_014355	CGG	3	9	637624	637632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036039
11983	NC_014355	GGAT	2	8	637729	637736	25 %	25 %	50 %	0 %	302036039
11984	NC_014355	CGG	2	6	637757	637762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036039
11985	NC_014355	GC	4	8	637785	637792	0 %	0 %	50 %	50 %	302036039
11986	NC_014355	CGACC	2	10	637802	637811	20 %	0 %	20 %	60 %	302036039
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11989	NC_014355	GAT	2	6	637955	637960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302036039
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11991	NC_014355	GCT	2	6	638002	638007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036040
11992	NC_014355	GGC	2	6	638034	638039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036040
11993	NC_014355	CGG	2	6	638062	638067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036040
11994	NC_014355	GCG	2	6	638127	638132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036040
11995	NC_014355	GGC	3	9	638137	638145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302036040
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11998	NC_014355	G	7	7	638388	638394	0 %	0 %	100 %	0 %	302036040
11999	NC_014355	ACC	2	6	638465	638470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302036040
12000	NC_014355	GTC	2	6	638492	638497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302036040

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