MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38607	NC_014329	CAACG	2	10	2320129	2320138	40 %	0 %	20 %	40 %	300859513
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38617	NC_014329	GGT	2	6	2320567	2320572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859513
38618	NC_014329	AAC	2	6	2320606	2320611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300859513
38619	NC_014329	GGC	2	6	2320652	2320657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859513
38620	NC_014329	AGA	2	6	2320663	2320668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300859513
38621	NC_014329	GCC	2	6	2320670	2320675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859513
38622	NC_014329	GATT	2	8	2320794	2320801	25 %	50 %	25 %	0 %	300859513
38623	NC_014329	CGA	2	6	2320923	2320928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859513
38624	NC_014329	TGA	2	6	2320953	2320958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300859513
38625	NC_014329	GGAA	2	8	2321023	2321030	50 %	0 %	50 %	0 %	300859513
38626	NC_014329	ACT	2	6	2321063	2321068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859514
38627	NC_014329	AC	3	6	2321075	2321080	50 %	0 %	0 %	50 %	300859514
38628	NC_014329	CGA	2	6	2321107	2321112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859514
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38630	NC_014329	TTGC	2	8	2321163	2321170	0 %	50 %	25 %	25 %	300859514
38631	NC_014329	CGC	2	6	2321203	2321208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859514
38632	NC_014329	A	6	6	2321350	2321355	100 %	0 %	0 %	0 %	300859514
38633	NC_014329	CAT	2	6	2321372	2321377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859514
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38635	NC_014329	CGAT	2	8	2321395	2321402	25 %	25 %	25 %	25 %	300859514
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38637	NC_014329	GGA	2	6	2321592	2321597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859514
38638	NC_014329	GT	3	6	2321617	2321622	0 %	50 %	50 %	0 %	300859514
38639	NC_014329	CT	3	6	2321685	2321690	0 %	50 %	0 %	50 %	300859514
38640	NC_014329	AGGCG	2	10	2321792	2321801	20 %	0 %	60 %	20 %	300859514
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38644	NC_014329	GCC	2	6	2321895	2321900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300859514
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38646	NC_014329	GTT	2	6	2321932	2321937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859514
38647	NC_014329	TAGCG	2	10	2321990	2321999	20 %	20 %	40 %	20 %	300859514
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38652	NC_014329	AAAG	2	8	2322351	2322358	75 %	0 %	25 %	0 %	300859514
38653	NC_014329	C	6	6	2322374	2322379	0 %	0 %	0 %	100 %	300859514
38654	NC_014329	CAC	2	6	2322521	2322526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300859514
38655	NC_014329	ATA	2	6	2322568	2322573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300859514
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38673	NC_014329	TGGC	2	8	2323551	2323558	0 %	25 %	50 %	25 %	300859514
38674	NC_014329	GCG	2	6	2323572	2323577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300859514
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38721	NC_014329	TTCT	2	8	2325969	2325976	0 %	75 %	0 %	25 %	300859515
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38724	NC_014329	CAT	2	6	2326042	2326047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859515
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38727	NC_014329	TTG	2	6	2326226	2326231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859515
38728	NC_014329	GCT	3	9	2326358	2326366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859515
38729	NC_014329	AGC	2	6	2326372	2326377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859515
38730	NC_014329	GCTA	2	8	2326402	2326409	25 %	25 %	25 %	25 %	300859515
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38732	NC_014329	TGG	2	6	2326470	2326475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859515
38733	NC_014329	TGC	2	6	2326537	2326542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859515
38734	NC_014329	TCAG	2	8	2326563	2326570	25 %	25 %	25 %	25 %	300859515
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38847	NC_014329	GAG	2	6	2333490	2333495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300859522
38848	NC_014329	ATC	2	6	2333526	2333531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859522
38849	NC_014329	TGT	2	6	2333536	2333541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300859522
38850	NC_014329	AGC	2	6	2333544	2333549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859522
38851	NC_014329	TCA	2	6	2333601	2333606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859522
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38853	NC_014329	G	6	6	2333645	2333650	0 %	0 %	100 %	0 %	300859522
38854	NC_014329	CTG	2	6	2333681	2333686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859522
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38858	NC_014329	TCT	2	6	2333826	2333831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859522
38859	NC_014329	GGT	2	6	2333881	2333886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859522
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38861	NC_014329	GGT	2	6	2333987	2333992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300859522
38862	NC_014329	CG	3	6	2334086	2334091	0 %	0 %	50 %	50 %	300859522
38863	NC_014329	GCA	3	9	2334099	2334107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300859522
38864	NC_014329	GTC	2	6	2334131	2334136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859522
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38873	NC_014329	T	6	6	2335103	2335108	0 %	100 %	0 %	0 %	300859524
38874	NC_014329	CTT	2	6	2335115	2335120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859524
38875	NC_014329	CTT	2	6	2335195	2335200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300859524
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38882	NC_014329	TCA	2	6	2335342	2335347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859524
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38889	NC_014329	CAT	2	6	2335808	2335813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300859524
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38907	NC_014329	CTG	2	6	2336743	2336748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300859526
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.