MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014329	GC	3	6	175988	175993	0 %	0 %	50 %	50 %	300857586
3002	NC_014329	GCC	2	6	175998	176003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857586
3003	NC_014329	CGT	2	6	176047	176052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857586
3004	NC_014329	CGG	2	6	176069	176074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857586
3005	NC_014329	CAA	2	6	176165	176170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857586
3006	NC_014329	TGT	2	6	176182	176187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857586
3007	NC_014329	CAT	2	6	176303	176308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857586
3008	NC_014329	AT	3	6	176441	176446	50 %	50 %	0 %	0 %	300857586
3009	NC_014329	CGC	2	6	176489	176494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857587
3010	NC_014329	CTA	2	6	176528	176533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857587
3011	NC_014329	CCAT	2	8	176543	176550	25 %	25 %	0 %	50 %	300857587
3012	NC_014329	CGA	2	6	176612	176617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857587
3013	NC_014329	TGGC	2	8	176636	176643	0 %	25 %	50 %	25 %	300857587
3014	NC_014329	CTG	2	6	176679	176684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857587
3015	NC_014329	GCCG	2	8	176706	176713	0 %	0 %	50 %	50 %	300857587
3016	NC_014329	TGG	2	6	176735	176740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857587
3017	NC_014329	AAG	2	6	176749	176754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857587
3018	NC_014329	AGT	2	6	176998	177003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857587
3019	NC_014329	TCG	2	6	177019	177024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857587
3020	NC_014329	CGT	2	6	177041	177046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857587
3021	NC_014329	ACA	2	6	177080	177085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857587
3022	NC_014329	TAA	2	6	177105	177110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857587
3023	NC_014329	CCA	2	6	177174	177179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857587
3024	NC_014329	CAC	2	6	177249	177254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857587
3025	NC_014329	AAG	2	6	177303	177308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857587
3026	NC_014329	GTC	2	6	177634	177639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857588
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3028	NC_014329	TCG	2	6	177681	177686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857588
3029	NC_014329	ACG	2	6	177725	177730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857588
3030	NC_014329	GTG	2	6	177736	177741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857588
3031	NC_014329	TAC	2	6	177759	177764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857588
3032	NC_014329	CGA	2	6	177765	177770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857588
3033	NC_014329	GCT	2	6	177771	177776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857588
3034	NC_014329	GCC	2	6	177804	177809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857588
3035	NC_014329	CG	3	6	177810	177815	0 %	0 %	50 %	50 %	300857588
3036	NC_014329	CAC	2	6	177933	177938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857588
3037	NC_014329	TGAA	2	8	177998	178005	50 %	25 %	25 %	0 %	300857588
3038	NC_014329	TTG	2	6	178019	178024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857588
3039	NC_014329	GTG	2	6	178076	178081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857588
3040	NC_014329	CGG	2	6	178094	178099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857588
3041	NC_014329	CTG	2	6	178166	178171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857588
3042	NC_014329	ATGC	2	8	178190	178197	25 %	25 %	25 %	25 %	300857588
3043	NC_014329	GAG	2	6	178219	178224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857588
3044	NC_014329	CGTT	2	8	178308	178315	0 %	50 %	25 %	25 %	300857588
3045	NC_014329	CGT	2	6	178316	178321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857588
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3048	NC_014329	TGC	2	6	178598	178603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857588
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3050	NC_014329	ACG	2	6	178643	178648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857588
3051	NC_014329	TCG	2	6	178670	178675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857588
3052	NC_014329	ATTGA	2	10	178747	178756	40 %	40 %	20 %	0 %	300857588
3053	NC_014329	TAC	2	6	178758	178763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857588
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3056	NC_014329	AG	3	6	179248	179253	50 %	0 %	50 %	0 %	300857589
3057	NC_014329	GA	3	6	179279	179284	50 %	0 %	50 %	0 %	300857589
3058	NC_014329	CTG	2	6	179364	179369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857589
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3060	NC_014329	TAC	2	6	179416	179421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857589
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3064	NC_014329	T	6	6	179690	179695	0 %	100 %	0 %	0 %	300857589
3065	NC_014329	TAC	2	6	179719	179724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857589
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3069	NC_014329	AT	3	6	179876	179881	50 %	50 %	0 %	0 %	300857589
3070	NC_014329	CTA	2	6	179948	179953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857589
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3083	NC_014329	ACT	2	6	180997	181002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857589
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3086	NC_014329	GTGGA	2	10	181156	181165	20 %	20 %	60 %	0 %	300857589
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3091	NC_014329	CGG	2	6	181428	181433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857589
3092	NC_014329	TGC	2	6	181459	181464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857589
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3099	NC_014329	ACCTTT	2	12	181970	181981	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	300857589
3100	NC_014329	TGA	2	6	182143	182148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857589
3101	NC_014329	CAG	2	6	182324	182329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857589
3102	NC_014329	GAA	2	6	182368	182373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857589
3103	NC_014329	GCAC	2	8	182381	182388	25 %	0 %	25 %	50 %	300857589
3104	NC_014329	TGC	2	6	182419	182424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857589
3105	NC_014329	TCC	2	6	182448	182453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857589
3106	NC_014329	TGACTA	2	12	182726	182737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300857590
3107	NC_014329	CGT	2	6	182745	182750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857590
3108	NC_014329	GAG	2	6	182794	182799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857590
3109	NC_014329	T	6	6	182826	182831	0 %	100 %	0 %	0 %	300857590
3110	NC_014329	CTG	2	6	182846	182851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857590
3111	NC_014329	TC	3	6	182917	182922	0 %	50 %	0 %	50 %	300857590
3112	NC_014329	GCA	2	6	182957	182962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857590
3113	NC_014329	GCC	2	6	182992	182997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857590
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3115	NC_014329	AAC	2	6	183085	183090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857590
3116	NC_014329	ATT	2	6	183103	183108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857590
3117	NC_014329	CAC	2	6	183123	183128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857590
3118	NC_014329	AGA	2	6	183312	183317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857590
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3120	NC_014329	AC	3	6	183498	183503	50 %	0 %	0 %	50 %	300857590
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3231	NC_014329	CTG	3	9	190697	190705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857596
3232	NC_014329	AGCGC	2	10	190729	190738	20 %	0 %	40 %	40 %	300857596
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3237	NC_014329	CAT	3	9	190844	190852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857596
3238	NC_014329	CAA	2	6	190906	190911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857596
3239	NC_014329	ACGC	2	8	190939	190946	25 %	0 %	25 %	50 %	300857596
3240	NC_014329	AAT	2	6	190947	190952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857596
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3242	NC_014329	GCA	2	6	191235	191240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857597
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3248	NC_014329	ACG	2	6	191502	191507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857597
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3355	NC_014329	GGCCC	2	10	196861	196870	0 %	0 %	40 %	60 %	300857602
3356	NC_014329	TGA	2	6	196917	196922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857602
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3359	NC_014329	GAT	2	6	197154	197159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857603
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3361	NC_014329	ATC	2	6	197269	197274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857603
3362	NC_014329	ATC	2	6	197329	197334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857603
3363	NC_014329	AAT	2	6	197349	197354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857603
3364	NC_014329	TGG	2	6	197363	197368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857603
3365	NC_014329	AGG	2	6	197384	197389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857603
3366	NC_014329	TCC	2	6	197409	197414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857604
3367	NC_014329	AAG	2	6	197573	197578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857604
3368	NC_014329	GGA	2	6	197591	197596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857604
3369	NC_014329	GTC	2	6	197606	197611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857604
3370	NC_014329	TTC	2	6	197612	197617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857604
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3372	NC_014329	TGC	2	6	197731	197736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857604
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3374	NC_014329	GT	3	6	197838	197843	0 %	50 %	50 %	0 %	300857605
3375	NC_014329	TGG	2	6	197879	197884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857605
3376	NC_014329	CGT	2	6	197931	197936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857605
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3379	NC_014329	TGG	2	6	198217	198222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857605
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3399	NC_014329	TGA	2	6	199257	199262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857605
3400	NC_014329	AAGC	2	8	199317	199324	50 %	0 %	25 %	25 %	300857605
3401	NC_014329	CAA	2	6	199332	199337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857605
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3413	NC_014329	GAT	2	6	199837	199842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857607
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3415	NC_014329	TGCT	2	8	199896	199903	0 %	50 %	25 %	25 %	300857607
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3421	NC_014329	GCGT	2	8	200246	200253	0 %	25 %	50 %	25 %	300857607
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3423	NC_014329	CAT	2	6	200298	200303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857607
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3428	NC_014329	GAATT	2	10	200426	200435	40 %	40 %	20 %	0 %	300857607
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3432	NC_014329	GCT	2	6	200771	200776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857607
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3435	NC_014329	ATG	2	6	200794	200799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857607
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3440	NC_014329	CAT	2	6	201182	201187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857607
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3442	NC_014329	ACC	2	6	201274	201279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857607
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3450	NC_014329	AGG	2	6	201559	201564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857607
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3452	NC_014329	G	6	6	201642	201647	0 %	0 %	100 %	0 %	300857607
3453	NC_014329	CGC	2	6	201666	201671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857607
3454	NC_014329	GAA	2	6	201712	201717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857607
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3463	NC_014329	GCA	2	6	202249	202254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857607
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3475	NC_014329	CAGC	2	8	202775	202782	25 %	0 %	25 %	50 %	300857607
3476	NC_014329	GCT	2	6	203035	203040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857608
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3479	NC_014329	AGC	2	6	203219	203224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857608
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3482	NC_014329	AAC	2	6	203277	203282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857608
3483	NC_014329	CCGC	2	8	203285	203292	0 %	0 %	25 %	75 %	300857608
3484	NC_014329	GCC	2	6	203335	203340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857608
3485	NC_014329	CGC	2	6	203700	203705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857608
3486	NC_014329	GATGG	2	10	203764	203773	20 %	20 %	60 %	0 %	300857608
3487	NC_014329	ACCA	2	8	203779	203786	50 %	0 %	0 %	50 %	300857608
3488	NC_014329	CG	4	8	203807	203814	0 %	0 %	50 %	50 %	300857608
3489	NC_014329	AAG	2	6	203849	203854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857608
3490	NC_014329	CGC	2	6	203898	203903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857608
3491	NC_014329	GCC	2	6	203917	203922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857608
3492	NC_014329	GTA	2	6	203950	203955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857608
3493	NC_014329	GCG	2	6	204028	204033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857608
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