MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014329	CTTC	2	8	146646	146653	0 %	50 %	0 %	50 %	300857560
2502	NC_014329	TCC	2	6	146704	146709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857560
2503	NC_014329	ATGG	2	8	146732	146739	25 %	25 %	50 %	0 %	300857560
2504	NC_014329	TGCT	2	8	146757	146764	0 %	50 %	25 %	25 %	300857560
2505	NC_014329	TG	3	6	146899	146904	0 %	50 %	50 %	0 %	300857561
2506	NC_014329	CCA	2	6	147012	147017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857561
2507	NC_014329	GGC	2	6	147170	147175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857561
2508	NC_014329	GCA	2	6	147216	147221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857561
2509	NC_014329	TGC	2	6	147330	147335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857561
2510	NC_014329	TTA	2	6	147339	147344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857561
2511	NC_014329	CA	3	6	147349	147354	50 %	0 %	0 %	50 %	300857561
2512	NC_014329	GGTA	2	8	147444	147451	25 %	25 %	50 %	0 %	300857561
2513	NC_014329	GTG	2	6	147504	147509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857562
2514	NC_014329	CG	3	6	147589	147594	0 %	0 %	50 %	50 %	300857562
2515	NC_014329	CCT	2	6	147607	147612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857562
2516	NC_014329	GC	3	6	147615	147620	0 %	0 %	50 %	50 %	300857562
2517	NC_014329	GC	3	6	147627	147632	0 %	0 %	50 %	50 %	300857562
2518	NC_014329	TAA	2	6	147749	147754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857562
2519	NC_014329	TGA	2	6	147761	147766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857562
2520	NC_014329	TCA	2	6	147826	147831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857562
2521	NC_014329	CGA	2	6	147833	147838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2522	NC_014329	CA	3	6	147854	147859	50 %	0 %	0 %	50 %	300857562
2523	NC_014329	GGA	2	6	147887	147892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857562
2524	NC_014329	CCA	2	6	147894	147899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857562
2525	NC_014329	CCA	2	6	147922	147927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857562
2526	NC_014329	CAT	2	6	147969	147974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857562
2527	NC_014329	GCTT	2	8	147985	147992	0 %	50 %	25 %	25 %	300857562
2528	NC_014329	CTA	2	6	148014	148019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857562
2529	NC_014329	GCT	2	6	148127	148132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2530	NC_014329	CTA	2	6	148179	148184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857562
2531	NC_014329	TGA	2	6	148193	148198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857562
2532	NC_014329	CGC	2	6	148211	148216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857562
2533	NC_014329	AGC	2	6	148244	148249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2534	NC_014329	ACC	2	6	148257	148262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857562
2535	NC_014329	CGC	2	6	148268	148273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857562
2536	NC_014329	CTTG	2	8	148313	148320	0 %	50 %	25 %	25 %	300857562
2537	NC_014329	GC	3	6	148412	148417	0 %	0 %	50 %	50 %	300857562
2538	NC_014329	TG	3	6	148528	148533	0 %	50 %	50 %	0 %	300857562
2539	NC_014329	TGC	3	9	148540	148548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2540	NC_014329	CTG	2	6	148636	148641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2541	NC_014329	GAA	2	6	148713	148718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857562
2542	NC_014329	CTC	2	6	148750	148755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857562
2543	NC_014329	CAG	2	6	148771	148776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2544	NC_014329	CCT	2	6	148878	148883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857562
2545	NC_014329	GAC	2	6	148929	148934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2546	NC_014329	TGC	2	6	148940	148945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2547	NC_014329	CG	4	8	148953	148960	0 %	0 %	50 %	50 %	300857562
2548	NC_014329	AAG	2	6	148989	148994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857562
2549	NC_014329	ATA	2	6	149068	149073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857562
2550	NC_014329	CAT	2	6	149117	149122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857562
2551	NC_014329	GTT	2	6	149172	149177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857562
2552	NC_014329	CGG	2	6	149194	149199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857562
2553	NC_014329	TCT	2	6	149271	149276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857562
2554	NC_014329	GAC	2	6	149280	149285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2555	NC_014329	CTG	2	6	149329	149334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857562
2556	NC_014329	AAC	2	6	149338	149343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857562
2557	NC_014329	GTG	2	6	149371	149376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857562
2558	NC_014329	CGC	2	6	149401	149406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857562
2559	NC_014329	TGG	2	6	149408	149413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857562
2560	NC_014329	GATG	2	8	149466	149473	25 %	25 %	50 %	0 %	300857562
2561	NC_014329	ATG	2	6	149515	149520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857562
2562	NC_014329	GAA	2	6	149525	149530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857562
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2565	NC_014329	CCG	2	6	149769	149774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857562
2566	NC_014329	TGA	2	6	149798	149803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857562
2567	NC_014329	CA	3	6	149826	149831	50 %	0 %	0 %	50 %	300857562
2568	NC_014329	ACT	2	6	149856	149861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857562
2569	NC_014329	GAGGAA	2	12	149895	149906	50 %	0 %	50 %	0 %	300857562
2570	NC_014329	ACC	2	6	149944	149949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857562
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2572	NC_014329	GC	3	6	149997	150002	0 %	0 %	50 %	50 %	300857562
2573	NC_014329	CAAA	2	8	150089	150096	75 %	0 %	0 %	25 %	300857563
2574	NC_014329	GGCGCA	2	12	150144	150155	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300857563
2575	NC_014329	AATGG	2	10	150256	150265	40 %	20 %	40 %	0 %	300857563
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2578	NC_014329	TTG	2	6	150332	150337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857563
2579	NC_014329	AGA	2	6	150383	150388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857563
2580	NC_014329	TGT	2	6	150545	150550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857564
2581	NC_014329	TGA	2	6	150576	150581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857564
2582	NC_014329	TGC	2	6	150721	150726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857564
2583	NC_014329	GTG	2	6	150793	150798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857564
2584	NC_014329	TGGG	2	8	150863	150870	0 %	25 %	75 %	0 %	300857564
2585	NC_014329	GCTA	2	8	150882	150889	25 %	25 %	25 %	25 %	300857564
2586	NC_014329	TGC	2	6	150923	150928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857564
2587	NC_014329	CTT	2	6	151061	151066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857564
2588	NC_014329	TGG	2	6	151100	151105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857564
2589	NC_014329	ACC	2	6	151223	151228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857565
2590	NC_014329	GTGAG	2	10	151239	151248	20 %	20 %	60 %	0 %	300857565
2591	NC_014329	TAG	2	6	151279	151284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857565
2592	NC_014329	GCT	2	6	151417	151422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857565
2593	NC_014329	GCT	2	6	151550	151555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857565
2594	NC_014329	ATA	2	6	151569	151574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857565
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2598	NC_014329	ACC	2	6	151730	151735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857565
2599	NC_014329	CCA	2	6	151740	151745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857565
2600	NC_014329	ATG	2	6	151835	151840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857565
2601	NC_014329	TGG	2	6	151892	151897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857565
2602	NC_014329	GCG	2	6	151904	151909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857565
2603	NC_014329	GGC	2	6	151966	151971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857565
2604	NC_014329	ATA	2	6	151972	151977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857565
2605	NC_014329	CTGAA	2	10	152037	152046	40 %	20 %	20 %	20 %	300857565
2606	NC_014329	GCG	2	6	152076	152081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857565
2607	NC_014329	ATA	2	6	152186	152191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857565
2608	NC_014329	GCT	2	6	152231	152236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857565
2609	NC_014329	AAT	2	6	152320	152325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857565
2610	NC_014329	CGG	2	6	152517	152522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857565
2611	NC_014329	AGC	3	9	152531	152539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857565
2612	NC_014329	ATT	2	6	152555	152560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300857565
2613	NC_014329	TGGG	2	8	152584	152591	0 %	25 %	75 %	0 %	300857566
2614	NC_014329	GC	3	6	152624	152629	0 %	0 %	50 %	50 %	300857566
2615	NC_014329	TGC	2	6	152659	152664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857566
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2617	NC_014329	GGC	2	6	152706	152711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857566
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2619	NC_014329	AGG	2	6	152822	152827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857566
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2621	NC_014329	AGCGCC	2	12	152890	152901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300857566
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2850	NC_014329	TTAT	2	8	166079	166086	25 %	75 %	0 %	0 %	300857580
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2861	NC_014329	GTGC	2	8	167034	167041	0 %	25 %	50 %	25 %	300857581
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2864	NC_014329	TCCA	2	8	167170	167177	25 %	25 %	0 %	50 %	300857581
2865	NC_014329	GCA	2	6	167292	167297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857581
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2984	NC_014329	TCC	2	6	174884	174889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857585
2985	NC_014329	CAC	2	6	174978	174983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857585
2986	NC_014329	ACT	2	6	174995	175000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857585
2987	NC_014329	GAA	2	6	175018	175023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857585
2988	NC_014329	GGC	2	6	175030	175035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857585
2989	NC_014329	CGT	2	6	175112	175117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857585
2990	NC_014329	GCT	2	6	175407	175412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857586
2991	NC_014329	T	6	6	175451	175456	0 %	100 %	0 %	0 %	300857586
2992	NC_014329	GCG	2	6	175468	175473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857586
2993	NC_014329	GC	3	6	175561	175566	0 %	0 %	50 %	50 %	300857586
2994	NC_014329	AGC	2	6	175625	175630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857586
2995	NC_014329	CCG	2	6	175705	175710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857586
2996	NC_014329	GATGGC	2	12	175715	175726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300857586
2997	NC_014329	GGC	2	6	175747	175752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857586
2998	NC_014329	TG	3	6	175759	175764	0 %	50 %	50 %	0 %	300857586
2999	NC_014329	CTGG	2	8	175884	175891	0 %	25 %	50 %	25 %	300857586
3000	NC_014329	TTC	2	6	175914	175919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857586

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