MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26003	NC_014329	T	6	6	1555490	1555495	0 %	100 %	0 %	0 %	300858835
26004	NC_014329	CATA	2	8	1555507	1555514	50 %	25 %	0 %	25 %	300858835
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26009	NC_014329	GCA	3	9	1555875	1555883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858835
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26011	NC_014329	ACCG	2	8	1555942	1555949	25 %	0 %	25 %	50 %	300858835
26012	NC_014329	CGA	2	6	1556001	1556006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858835
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26014	NC_014329	CGA	2	6	1556072	1556077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858835
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26019	NC_014329	GC	3	6	1556354	1556359	0 %	0 %	50 %	50 %	300858836
26020	NC_014329	CCA	2	6	1556377	1556382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858836
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26035	NC_014329	CT	3	6	1557337	1557342	0 %	50 %	0 %	50 %	300858837
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26102	NC_014329	AGT	2	6	1561662	1561667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858840
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26107	NC_014329	AAG	2	6	1561878	1561883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858840
26108	NC_014329	CAGG	2	8	1561927	1561934	25 %	0 %	50 %	25 %	300858840
26109	NC_014329	CAA	2	6	1561945	1561950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858840
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26112	NC_014329	ATCAG	2	10	1562085	1562094	40 %	20 %	20 %	20 %	300858840
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26117	NC_014329	ATC	2	6	1562198	1562203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858840
26118	NC_014329	GGGA	2	8	1562205	1562212	25 %	0 %	75 %	0 %	300858840
26119	NC_014329	CA	3	6	1562252	1562257	50 %	0 %	0 %	50 %	300858840
26120	NC_014329	GCG	2	6	1562285	1562290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858840
26121	NC_014329	GAA	2	6	1562303	1562308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858840
26122	NC_014329	GTG	2	6	1562360	1562365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858840
26123	NC_014329	ACC	2	6	1562384	1562389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858840
26124	NC_014329	ATAA	2	8	1562471	1562478	75 %	25 %	0 %	0 %	300858840
26125	NC_014329	CAA	2	6	1562528	1562533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858840
26126	NC_014329	AG	3	6	1562548	1562553	50 %	0 %	50 %	0 %	300858840
26127	NC_014329	TTA	2	6	1562595	1562600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858840
26128	NC_014329	CAG	3	9	1562617	1562625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858840
26129	NC_014329	ATT	2	6	1562645	1562650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858840
26130	NC_014329	TTG	2	6	1562667	1562672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858840
26131	NC_014329	ACG	2	6	1562680	1562685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858841
26132	NC_014329	CAA	2	6	1562712	1562717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858841
26133	NC_014329	TCA	2	6	1562747	1562752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858841
26134	NC_014329	AATGC	2	10	1562811	1562820	40 %	20 %	20 %	20 %	300858841
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26136	NC_014329	AG	3	6	1562874	1562879	50 %	0 %	50 %	0 %	300858841
26137	NC_014329	GTA	2	6	1562920	1562925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858841
26138	NC_014329	CAA	2	6	1562961	1562966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858841
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26141	NC_014329	GGC	2	6	1563159	1563164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858841
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26143	NC_014329	CTT	2	6	1563319	1563324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858841
26144	NC_014329	TTC	2	6	1563332	1563337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858841
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26148	NC_014329	ACG	2	6	1563415	1563420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858841
26149	NC_014329	ACG	2	6	1563469	1563474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858841
26150	NC_014329	TTC	2	6	1563481	1563486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858841
26151	NC_014329	CTG	2	6	1563522	1563527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858841
26152	NC_014329	ATG	2	6	1563530	1563535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858841
26153	NC_014329	ACCAA	2	10	1563712	1563721	60 %	0 %	0 %	40 %	300858841
26154	NC_014329	TTTC	2	8	1563871	1563878	0 %	75 %	0 %	25 %	300858841
26155	NC_014329	ATTGCT	2	12	1563880	1563891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300858841
26156	NC_014329	ATCCA	2	10	1563902	1563911	40 %	20 %	0 %	40 %	300858841
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26161	NC_014329	TCTT	2	8	1564045	1564052	0 %	75 %	0 %	25 %	300858842
26162	NC_014329	TCA	2	6	1564054	1564059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858842
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26168	NC_014329	GCC	2	6	1564335	1564340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858842
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26171	NC_014329	GC	3	6	1564596	1564601	0 %	0 %	50 %	50 %	300858842
26172	NC_014329	CCGGTA	2	12	1564645	1564656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300858842
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26177	NC_014329	TGA	2	6	1564896	1564901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858843
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26187	NC_014329	CAAA	2	8	1565361	1565368	75 %	0 %	0 %	25 %	300858843
26188	NC_014329	TGC	2	6	1565458	1565463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858843
26189	NC_014329	CTTTT	2	10	1566053	1566062	0 %	80 %	0 %	20 %	300858844
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26194	NC_014329	GTG	2	6	1566570	1566575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858845
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26198	NC_014329	GGTA	2	8	1566709	1566716	25 %	25 %	50 %	0 %	300858845
26199	NC_014329	GCT	3	9	1566784	1566792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858845
26200	NC_014329	TGTTC	2	10	1566793	1566802	0 %	60 %	20 %	20 %	300858845
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26202	NC_014329	CAG	2	6	1566865	1566870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858845
26203	NC_014329	GAA	2	6	1566904	1566909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858845
26204	NC_014329	CTTG	2	8	1567022	1567029	0 %	50 %	25 %	25 %	300858845
26205	NC_014329	CAG	3	9	1567033	1567041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858845
26206	NC_014329	CAT	2	6	1567051	1567056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858845
26207	NC_014329	GAA	3	9	1567205	1567213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858845
26208	NC_014329	GAT	2	6	1567238	1567243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858845
26209	NC_014329	TGT	2	6	1567267	1567272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858845
26210	NC_014329	CTTT	2	8	1567306	1567313	0 %	75 %	0 %	25 %	300858845
26211	NC_014329	GC	3	6	1567314	1567319	0 %	0 %	50 %	50 %	300858845
26212	NC_014329	ATA	2	6	1567362	1567367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858845
26213	NC_014329	ACCCAG	3	18	1567389	1567406	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300858845
26214	NC_014329	CCAA	2	8	1567448	1567455	50 %	0 %	0 %	50 %	300858845
26215	NC_014329	CCA	2	6	1567518	1567523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858845
26216	NC_014329	CAC	2	6	1567534	1567539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858845
26217	NC_014329	TGC	2	6	1567572	1567577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858845
26218	NC_014329	CG	3	6	1567585	1567590	0 %	0 %	50 %	50 %	300858845
26219	NC_014329	CTT	2	6	1568108	1568113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858846
26220	NC_014329	ATC	2	6	1568255	1568260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858846
26221	NC_014329	GTT	2	6	1568423	1568428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858846
26222	NC_014329	CAC	2	6	1568435	1568440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858846
26223	NC_014329	AGG	2	6	1568502	1568507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858846
26224	NC_014329	T	6	6	1568580	1568585	0 %	100 %	0 %	0 %	300858846
26225	NC_014329	GAA	2	6	1568593	1568598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858846
26226	NC_014329	CGG	2	6	1568755	1568760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858846
26227	NC_014329	CG	3	6	1568852	1568857	0 %	0 %	50 %	50 %	300858846
26228	NC_014329	TCCT	2	8	1568906	1568913	0 %	50 %	0 %	50 %	300858846
26229	NC_014329	TTG	2	6	1568972	1568977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858846
26230	NC_014329	CAC	2	6	1568983	1568988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858846
26231	NC_014329	GA	4	8	1568996	1569003	50 %	0 %	50 %	0 %	300858846
26232	NC_014329	CTG	2	6	1569036	1569041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858846
26233	NC_014329	ACGCCA	2	12	1569090	1569101	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300858846
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26459	NC_014329	CT	3	6	1583355	1583360	0 %	50 %	0 %	50 %	300858857
26460	NC_014329	GAT	2	6	1583390	1583395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858857
26461	NC_014329	CAT	2	6	1583414	1583419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858857
26462	NC_014329	TGA	2	6	1583420	1583425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858857
26463	NC_014329	GCG	2	6	1583484	1583489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858857
26464	NC_014329	TGA	2	6	1583543	1583548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858857
26465	NC_014329	GCT	2	6	1583597	1583602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858857
26466	NC_014329	CTA	2	6	1583663	1583668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858857
26467	NC_014329	TA	3	6	1583751	1583756	50 %	50 %	0 %	0 %	300858857
26468	NC_014329	GGCC	2	8	1583798	1583805	0 %	0 %	50 %	50 %	300858857
26469	NC_014329	GCT	2	6	1583822	1583827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858857
26470	NC_014329	GCTT	2	8	1583837	1583844	0 %	50 %	25 %	25 %	300858857
26471	NC_014329	A	6	6	1583949	1583954	100 %	0 %	0 %	0 %	300858857
26472	NC_014329	CGT	2	6	1584036	1584041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858857
26473	NC_014329	GCA	2	6	1584042	1584047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858857
26474	NC_014329	A	6	6	1584204	1584209	100 %	0 %	0 %	0 %	300858857
26475	NC_014329	ACG	2	6	1584578	1584583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858858
26476	NC_014329	ACG	2	6	1584590	1584595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858858
26477	NC_014329	ACT	2	6	1584596	1584601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858858
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26482	NC_014329	CAT	2	6	1584835	1584840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858859
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26484	NC_014329	AGCT	2	8	1584971	1584978	25 %	25 %	25 %	25 %	300858859
26485	NC_014329	GCTGT	2	10	1585029	1585038	0 %	40 %	40 %	20 %	300858859
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26489	NC_014329	CGCTG	2	10	1585180	1585189	0 %	20 %	40 %	40 %	300858859
26490	NC_014329	CTG	2	6	1585382	1585387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858860
26491	NC_014329	ATCC	2	8	1585392	1585399	25 %	25 %	0 %	50 %	300858860
26492	NC_014329	CG	3	6	1585489	1585494	0 %	0 %	50 %	50 %	300858860
26493	NC_014329	GGA	2	6	1585569	1585574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858860
26494	NC_014329	GGC	2	6	1585615	1585620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858860
26495	NC_014329	AT	3	6	1585654	1585659	50 %	50 %	0 %	0 %	300858860
26496	NC_014329	GAG	2	6	1585714	1585719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858860
26497	NC_014329	TAT	2	6	1585903	1585908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858860
26498	NC_014329	CAT	2	6	1585914	1585919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858860
26499	NC_014329	TAC	2	6	1585947	1585952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858860
26500	NC_014329	CTG	2	6	1586017	1586022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858860

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