MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_014329	CGA	2	6	1429267	1429272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858726
24003	NC_014329	CAA	2	6	1429304	1429309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858726
24004	NC_014329	GGC	2	6	1429335	1429340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858726
24005	NC_014329	TCA	2	6	1429354	1429359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858726
24006	NC_014329	CT	3	6	1429366	1429371	0 %	50 %	0 %	50 %	300858726
24007	NC_014329	AGT	2	6	1429415	1429420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858726
24008	NC_014329	CTTC	2	8	1429466	1429473	0 %	50 %	0 %	50 %	300858726
24009	NC_014329	AGA	2	6	1429624	1429629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858727
24010	NC_014329	ACCA	2	8	1429643	1429650	50 %	0 %	0 %	50 %	300858727
24011	NC_014329	ACC	2	6	1429696	1429701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858727
24012	NC_014329	CAC	2	6	1429817	1429822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858727
24013	NC_014329	AGA	2	6	1429835	1429840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858727
24014	NC_014329	CCA	2	6	1429967	1429972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858727
24015	NC_014329	ACA	2	6	1430006	1430011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858727
24016	NC_014329	GA	3	6	1430046	1430051	50 %	0 %	50 %	0 %	300858727
24017	NC_014329	AAT	2	6	1430121	1430126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858727
24018	NC_014329	ATG	2	6	1430149	1430154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858727
24019	NC_014329	CTG	2	6	1430162	1430167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858727
24020	NC_014329	GCC	2	6	1430186	1430191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858727
24021	NC_014329	AAT	2	6	1430257	1430262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858727
24022	NC_014329	CAG	2	6	1430316	1430321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858727
24023	NC_014329	TAA	2	6	1430383	1430388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858727
24024	NC_014329	GGC	2	6	1430422	1430427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858727
24025	NC_014329	CAG	2	6	1430442	1430447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858727
24026	NC_014329	CAT	2	6	1430487	1430492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858727
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24028	NC_014329	T	6	6	1430708	1430713	0 %	100 %	0 %	0 %	300858728
24029	NC_014329	AAC	2	6	1430717	1430722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858728
24030	NC_014329	GCT	2	6	1430775	1430780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858728
24031	NC_014329	GCG	2	6	1430843	1430848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858728
24032	NC_014329	ACG	2	6	1430912	1430917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858728
24033	NC_014329	CTC	2	6	1430918	1430923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858728
24034	NC_014329	CAT	2	6	1431017	1431022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858728
24035	NC_014329	TTG	2	6	1431073	1431078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858728
24036	NC_014329	TAA	2	6	1431108	1431113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858728
24037	NC_014329	GTC	2	6	1431173	1431178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858728
24038	NC_014329	TCG	2	6	1431231	1431236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858728
24039	NC_014329	CG	3	6	1431414	1431419	0 %	0 %	50 %	50 %	300858729
24040	NC_014329	AAG	2	6	1431434	1431439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858729
24041	NC_014329	GAG	2	6	1431529	1431534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858729
24042	NC_014329	TCA	2	6	1431576	1431581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858729
24043	NC_014329	CTT	2	6	1431802	1431807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858729
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24050	NC_014329	TTA	2	6	1432501	1432506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858730
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24052	NC_014329	CAA	2	6	1432650	1432655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858730
24053	NC_014329	CTTCC	2	10	1432678	1432687	0 %	40 %	0 %	60 %	300858730
24054	NC_014329	CAG	2	6	1432734	1432739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858730
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24057	NC_014329	TGC	2	6	1432801	1432806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858730
24058	NC_014329	AGC	2	6	1432813	1432818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858730
24059	NC_014329	CAG	2	6	1432869	1432874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858730
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24061	NC_014329	CGA	2	6	1432925	1432930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858730
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24084	NC_014329	CAT	2	6	1433997	1434002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858731
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24096	NC_014329	TA	3	6	1434869	1434874	50 %	50 %	0 %	0 %	300858732
24097	NC_014329	A	6	6	1434923	1434928	100 %	0 %	0 %	0 %	300858732
24098	NC_014329	GCC	2	6	1434998	1435003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858732
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24100	NC_014329	TATC	2	8	1435053	1435060	25 %	50 %	0 %	25 %	300858732
24101	NC_014329	ACC	2	6	1435062	1435067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858732
24102	NC_014329	GT	4	8	1435341	1435348	0 %	50 %	50 %	0 %	300858733
24103	NC_014329	GTA	2	6	1435357	1435362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858733
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24105	NC_014329	CGCC	2	8	1435528	1435535	0 %	0 %	25 %	75 %	300858733
24106	NC_014329	TGC	2	6	1435554	1435559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858733
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24108	NC_014329	GCT	2	6	1435649	1435654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858733
24109	NC_014329	CAAT	2	8	1435693	1435700	50 %	25 %	0 %	25 %	300858733
24110	NC_014329	CA	3	6	1435718	1435723	50 %	0 %	0 %	50 %	300858733
24111	NC_014329	ACA	2	6	1435751	1435756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858733
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24113	NC_014329	GCC	2	6	1435837	1435842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858733
24114	NC_014329	AT	3	6	1435906	1435911	50 %	50 %	0 %	0 %	300858733
24115	NC_014329	AGC	2	6	1435921	1435926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858733
24116	NC_014329	GCC	3	9	1435945	1435953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858733
24117	NC_014329	GC	3	6	1435959	1435964	0 %	0 %	50 %	50 %	300858733
24118	NC_014329	CCAG	2	8	1436003	1436010	25 %	0 %	25 %	50 %	300858733
24119	NC_014329	ACCT	2	8	1436105	1436112	25 %	25 %	0 %	50 %	300858733
24120	NC_014329	TGGCT	2	10	1436469	1436478	0 %	40 %	40 %	20 %	300858734
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24124	NC_014329	GCC	2	6	1436937	1436942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858734
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24135	NC_014329	CCAAG	2	10	1437513	1437522	40 %	0 %	20 %	40 %	300858734
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24217	NC_014329	TGTC	2	8	1443168	1443175	0 %	50 %	25 %	25 %	300858740
24218	NC_014329	CCG	2	6	1443286	1443291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858740
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24221	NC_014329	CG	3	6	1443339	1443344	0 %	0 %	50 %	50 %	300858740
24222	NC_014329	CTTT	2	8	1443405	1443412	0 %	75 %	0 %	25 %	300858740
24223	NC_014329	CCA	2	6	1443558	1443563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858740
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24226	NC_014329	GC	3	6	1443676	1443681	0 %	0 %	50 %	50 %	300858740
24227	NC_014329	T	6	6	1443808	1443813	0 %	100 %	0 %	0 %	300858740
24228	NC_014329	TG	3	6	1443991	1443996	0 %	50 %	50 %	0 %	300858740
24229	NC_014329	CTG	2	6	1444062	1444067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858740
24230	NC_014329	GCA	2	6	1444070	1444075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858740
24231	NC_014329	AGA	2	6	1444076	1444081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858740
24232	NC_014329	GC	3	6	1444113	1444118	0 %	0 %	50 %	50 %	300858740
24233	NC_014329	CTT	2	6	1444119	1444124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858740
24234	NC_014329	GCTC	2	8	1444127	1444134	0 %	25 %	25 %	50 %	300858740
24235	NC_014329	GAG	2	6	1444163	1444168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858740
24236	NC_014329	CAG	2	6	1444200	1444205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858740
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24240	NC_014329	ATA	2	6	1444430	1444435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858740
24241	NC_014329	GCA	2	6	1444442	1444447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858740
24242	NC_014329	GCT	2	6	1444620	1444625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858740
24243	NC_014329	TCG	2	6	1444663	1444668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858740
24244	NC_014329	CTT	2	6	1444669	1444674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858740
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24253	NC_014329	TCT	2	6	1445145	1445150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858741
24254	NC_014329	CG	3	6	1445163	1445168	0 %	0 %	50 %	50 %	300858741
24255	NC_014329	TTC	2	6	1445240	1445245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858741
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24262	NC_014329	TTC	2	6	1445611	1445616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858741
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24303	NC_014329	TG	3	6	1448059	1448064	0 %	50 %	50 %	0 %	300858743
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24322	NC_014329	T	6	6	1448843	1448848	0 %	100 %	0 %	0 %	300858744
24323	NC_014329	TCG	2	6	1448898	1448903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858744
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24331	NC_014329	ACTC	2	8	1449437	1449444	25 %	25 %	0 %	50 %	300858745
24332	NC_014329	TTC	2	6	1449454	1449459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858745
24333	NC_014329	CTT	2	6	1449505	1449510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858745
24334	NC_014329	ATG	2	6	1449534	1449539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858745
24335	NC_014329	GCA	2	6	1449643	1449648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858746
24336	NC_014329	CTT	2	6	1449650	1449655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858746
24337	NC_014329	AGC	2	6	1449696	1449701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858746
24338	NC_014329	CTT	2	6	1449723	1449728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858746
24339	NC_014329	CGA	2	6	1450015	1450020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858746
24340	NC_014329	AAC	2	6	1450038	1450043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858746
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24342	NC_014329	CCA	2	6	1450346	1450351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858747
24343	NC_014329	TTG	2	6	1450361	1450366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858747
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24345	NC_014329	ACC	2	6	1450498	1450503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858747
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24347	NC_014329	C	6	6	1450598	1450603	0 %	0 %	0 %	100 %	300858747
24348	NC_014329	TCA	2	6	1450629	1450634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858747
24349	NC_014329	AAG	2	6	1450649	1450654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858747
24350	NC_014329	CTA	2	6	1450659	1450664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858747
24351	NC_014329	CGT	2	6	1450715	1450720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858747
24352	NC_014329	TCA	2	6	1450802	1450807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858747
24353	NC_014329	GCA	2	6	1450845	1450850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858747
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24356	NC_014329	CTG	2	6	1451027	1451032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858747
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24454	NC_014329	TTA	2	6	1457192	1457197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858751
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24462	NC_014329	AGC	2	6	1457749	1457754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858751
24463	NC_014329	CTA	2	6	1457765	1457770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858751
24464	NC_014329	ATG	2	6	1457843	1457848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858751
24465	NC_014329	AAC	2	6	1457947	1457952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858751
24466	NC_014329	CCA	2	6	1458146	1458151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858751
24467	NC_014329	TCA	2	6	1458167	1458172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858751
24468	NC_014329	TTC	2	6	1458184	1458189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858751
24469	NC_014329	GAA	2	6	1458197	1458202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858751
24470	NC_014329	ACA	2	6	1458279	1458284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858751
24471	NC_014329	TAC	2	6	1458342	1458347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858751
24472	NC_014329	CG	3	6	1458353	1458358	0 %	0 %	50 %	50 %	300858751
24473	NC_014329	AAT	2	6	1458391	1458396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858751
24474	NC_014329	CG	3	6	1458456	1458461	0 %	0 %	50 %	50 %	300858751
24475	NC_014329	AGC	2	6	1458506	1458511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858752
24476	NC_014329	CGG	2	6	1458532	1458537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858752
24477	NC_014329	GAAGC	2	10	1458541	1458550	40 %	0 %	40 %	20 %	300858752
24478	NC_014329	CTC	2	6	1458565	1458570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858752
24479	NC_014329	GCT	2	6	1458589	1458594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858752
24480	NC_014329	CAC	2	6	1458609	1458614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858752
24481	NC_014329	CCG	2	6	1458682	1458687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858752
24482	NC_014329	TGCG	2	8	1458735	1458742	0 %	25 %	50 %	25 %	300858752
24483	NC_014329	CGG	2	6	1458891	1458896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858752
24484	NC_014329	CCA	2	6	1458925	1458930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858752
24485	NC_014329	GAG	2	6	1458934	1458939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858752
24486	NC_014329	GGA	2	6	1458979	1458984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858752
24487	NC_014329	CAA	2	6	1458992	1458997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858752
24488	NC_014329	AAT	2	6	1459037	1459042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858752
24489	NC_014329	ACC	2	6	1459178	1459183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858752
24490	NC_014329	CGG	2	6	1459259	1459264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858752
24491	NC_014329	AAG	2	6	1459275	1459280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858752
24492	NC_014329	GTT	2	6	1459442	1459447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858752
24493	NC_014329	C	6	6	1459466	1459471	0 %	0 %	0 %	100 %	300858752
24494	NC_014329	GTT	2	6	1459565	1459570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858752
24495	NC_014329	CAAA	2	8	1459581	1459588	75 %	0 %	0 %	25 %	300858752
24496	NC_014329	CG	3	6	1459695	1459700	0 %	0 %	50 %	50 %	300858752
24497	NC_014329	GCT	2	6	1459705	1459710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858752
24498	NC_014329	TG	3	6	1459770	1459775	0 %	50 %	50 %	0 %	300858752
24499	NC_014329	ATT	2	6	1459885	1459890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858752
24500	NC_014329	CTT	2	6	1459898	1459903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858752

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