MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014329	GCTG	2	8	878823	878830	0 %	25 %	50 %	25 %	300858246
15002	NC_014329	GGC	2	6	878901	878906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858247
15003	NC_014329	TCA	2	6	879008	879013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858247
15004	NC_014329	AAG	2	6	879017	879022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858247
15005	NC_014329	CCA	2	6	879028	879033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858247
15006	NC_014329	CGG	2	6	879089	879094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858247
15007	NC_014329	TTC	2	6	879106	879111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858247
15008	NC_014329	GCC	2	6	879123	879128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858247
15009	NC_014329	GCA	2	6	879135	879140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858247
15010	NC_014329	TTC	2	6	879141	879146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858247
15011	NC_014329	TTG	2	6	879148	879153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858247
15012	NC_014329	AGG	2	6	879239	879244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858247
15013	NC_014329	GGT	2	6	879245	879250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858247
15014	NC_014329	GAA	2	6	879267	879272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858247
15015	NC_014329	GA	3	6	879324	879329	50 %	0 %	50 %	0 %	300858247
15016	NC_014329	T	6	6	879330	879335	0 %	100 %	0 %	0 %	300858247
15017	NC_014329	TGC	2	6	879397	879402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858247
15018	NC_014329	CAA	2	6	879437	879442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858247
15019	NC_014329	GCA	2	6	879537	879542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858247
15020	NC_014329	GAC	2	6	879561	879566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858247
15021	NC_014329	CTT	2	6	880150	880155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858248
15022	NC_014329	GTG	2	6	880208	880213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858248
15023	NC_014329	CAT	2	6	880231	880236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858248
15024	NC_014329	T	6	6	880238	880243	0 %	100 %	0 %	0 %	300858248
15025	NC_014329	GCCA	2	8	880249	880256	25 %	0 %	25 %	50 %	300858248
15026	NC_014329	CAT	2	6	880315	880320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858248
15027	NC_014329	GAT	2	6	880370	880375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858248
15028	NC_014329	GGTC	2	8	880396	880403	0 %	25 %	50 %	25 %	300858248
15029	NC_014329	TGG	2	6	880447	880452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858248
15030	NC_014329	CCT	2	6	880453	880458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858248
15031	NC_014329	GGT	2	6	880610	880615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858248
15032	NC_014329	ATGG	2	8	880712	880719	25 %	25 %	50 %	0 %	300858248
15033	NC_014329	GTT	2	6	880826	880831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858248
15034	NC_014329	CCT	2	6	880837	880842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858248
15035	NC_014329	TCC	2	6	880866	880871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858248
15036	NC_014329	TGA	2	6	880921	880926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858248
15037	NC_014329	GAAC	2	8	880943	880950	50 %	0 %	25 %	25 %	300858248
15038	NC_014329	TCT	2	6	880972	880977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858248
15039	NC_014329	TCT	2	6	880989	880994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858248
15040	NC_014329	TAA	2	6	881113	881118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858248
15041	NC_014329	TTC	2	6	881165	881170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858248
15042	NC_014329	TC	3	6	881205	881210	0 %	50 %	0 %	50 %	300858248
15043	NC_014329	CGG	2	6	881301	881306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858248
15044	NC_014329	CTT	2	6	881393	881398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858248
15045	NC_014329	GCT	2	6	881404	881409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858248
15046	NC_014329	GGGTT	2	10	881410	881419	0 %	40 %	60 %	0 %	300858248
15047	NC_014329	GGTG	2	8	881494	881501	0 %	25 %	75 %	0 %	300858248
15048	NC_014329	TGG	2	6	881517	881522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858248
15049	NC_014329	CTG	2	6	881532	881537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858248
15050	NC_014329	GAT	2	6	881554	881559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858248
15051	NC_014329	CGC	2	6	881581	881586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858248
15052	NC_014329	CAT	3	9	881671	881679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858248
15053	NC_014329	TTAC	2	8	881680	881687	25 %	50 %	0 %	25 %	300858248
15054	NC_014329	GGAT	2	8	881705	881712	25 %	25 %	50 %	0 %	300858248
15055	NC_014329	CTA	3	9	881777	881785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858249
15056	NC_014329	AGT	2	6	881829	881834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858249
15057	NC_014329	GAAT	2	8	881909	881916	50 %	25 %	25 %	0 %	300858249
15058	NC_014329	TGA	2	6	881958	881963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858249
15059	NC_014329	TGC	3	9	882015	882023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858249
15060	NC_014329	GTTT	2	8	882114	882121	0 %	75 %	25 %	0 %	300858249
15061	NC_014329	AG	3	6	882223	882228	50 %	0 %	50 %	0 %	300858249
15062	NC_014329	TGC	2	6	882282	882287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858249
15063	NC_014329	AGA	2	6	882309	882314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858249
15064	NC_014329	GCATC	2	10	882361	882370	20 %	20 %	20 %	40 %	300858249
15065	NC_014329	CGTTC	2	10	882410	882419	0 %	40 %	20 %	40 %	300858249
15066	NC_014329	GAT	2	6	882432	882437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858249
15067	NC_014329	GAAA	2	8	882549	882556	75 %	0 %	25 %	0 %	300858249
15068	NC_014329	TGG	2	6	882586	882591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858249
15069	NC_014329	TCT	2	6	882598	882603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858249
15070	NC_014329	TGA	2	6	882612	882617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858249
15071	NC_014329	ATC	2	6	882737	882742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858249
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15073	NC_014329	TGC	4	12	882765	882776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858249
15074	NC_014329	CG	3	6	882868	882873	0 %	0 %	50 %	50 %	300858249
15075	NC_014329	GAT	2	6	882892	882897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858249
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15080	NC_014329	TACG	2	8	883136	883143	25 %	25 %	25 %	25 %	300858249
15081	NC_014329	AGT	2	6	883161	883166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858249
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15083	NC_014329	CG	3	6	883302	883307	0 %	0 %	50 %	50 %	300858249
15084	NC_014329	TGGT	2	8	883358	883365	0 %	50 %	50 %	0 %	300858249
15085	NC_014329	CCA	2	6	883413	883418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858250
15086	NC_014329	TCG	2	6	883439	883444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858250
15087	NC_014329	TGG	2	6	883522	883527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858250
15088	NC_014329	GAC	2	6	883533	883538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858250
15089	NC_014329	GCT	3	9	883563	883571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858250
15090	NC_014329	TGG	2	6	883574	883579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858250
15091	NC_014329	GGTG	2	8	883633	883640	0 %	25 %	75 %	0 %	300858250
15092	NC_014329	TCC	2	6	883709	883714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858250
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15095	NC_014329	TC	3	6	883945	883950	0 %	50 %	0 %	50 %	300858250
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15099	NC_014329	GGT	2	6	884145	884150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858250
15100	NC_014329	C	6	6	884182	884187	0 %	0 %	0 %	100 %	300858250
15101	NC_014329	AT	3	6	884372	884377	50 %	50 %	0 %	0 %	300858250
15102	NC_014329	ATA	2	6	884401	884406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858250
15103	NC_014329	GGC	2	6	884576	884581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858250
15104	NC_014329	AGC	2	6	884607	884612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858250
15105	NC_014329	ACA	2	6	884617	884622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858250
15106	NC_014329	AGT	2	6	884639	884644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858250
15107	NC_014329	GGCAG	2	10	884654	884663	20 %	0 %	60 %	20 %	300858250
15108	NC_014329	CGG	2	6	884679	884684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858250
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15110	NC_014329	TGC	2	6	885062	885067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858251
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15116	NC_014329	GTA	2	6	885424	885429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858251
15117	NC_014329	CCT	2	6	885533	885538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858251
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15119	NC_014329	GAT	2	6	885673	885678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858251
15120	NC_014329	AGC	2	6	885723	885728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858251
15121	NC_014329	GAA	2	6	885793	885798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858251
15122	NC_014329	AGG	2	6	885930	885935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858251
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15124	NC_014329	GGA	2	6	885997	886002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858251
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15131	NC_014329	AGT	2	6	886443	886448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858252
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15135	NC_014329	AGC	2	6	886548	886553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858252
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15139	NC_014329	CGGA	2	8	886798	886805	25 %	0 %	50 %	25 %	300858252
15140	NC_014329	TCCT	2	8	886904	886911	0 %	50 %	0 %	50 %	300858252
15141	NC_014329	TGA	2	6	886961	886966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858252
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15143	NC_014329	CG	3	6	887009	887014	0 %	0 %	50 %	50 %	300858252
15144	NC_014329	TGC	2	6	887045	887050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858252
15145	NC_014329	GCT	2	6	887095	887100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858252
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15148	NC_014329	GAGACG	2	12	887460	887471	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	300858253
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15151	NC_014329	TGT	2	6	887633	887638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858253
15152	NC_014329	GGT	2	6	887874	887879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858253
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15154	NC_014329	TAT	2	6	888067	888072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858254
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15158	NC_014329	CTG	2	6	888263	888268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858254
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15160	NC_014329	GCC	2	6	888376	888381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858254
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15168	NC_014329	CGGT	2	8	888652	888659	0 %	25 %	50 %	25 %	300858254
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15221	NC_014329	CGA	2	6	891650	891655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858255
15222	NC_014329	GAA	2	6	891663	891668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858255
15223	NC_014329	CTG	2	6	891742	891747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858255
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15226	NC_014329	TCC	2	6	891908	891913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858255
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15230	NC_014329	GCT	2	6	892130	892135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858255
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15232	NC_014329	CAT	2	6	892157	892162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858255
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15234	NC_014329	ACTT	2	8	892213	892220	25 %	50 %	0 %	25 %	300858255
15235	NC_014329	AGC	2	6	892225	892230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858255
15236	NC_014329	AAG	2	6	892233	892238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858255
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15238	NC_014329	CAG	2	6	892326	892331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858256
15239	NC_014329	TGT	2	6	892404	892409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858256
15240	NC_014329	ATC	2	6	892448	892453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858256
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15470	NC_014329	TTGGT	2	10	906968	906977	0 %	60 %	40 %	0 %	300858273
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