MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014329	TGG	2	6	824379	824384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858196
14002	NC_014329	CGACG	2	10	824403	824412	20 %	0 %	40 %	40 %	300858196
14003	NC_014329	TCG	2	6	824417	824422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858196
14004	NC_014329	GAG	2	6	824437	824442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858196
14005	NC_014329	AT	3	6	824451	824456	50 %	50 %	0 %	0 %	300858196
14006	NC_014329	TCCA	2	8	824542	824549	25 %	25 %	0 %	50 %	300858196
14007	NC_014329	GTG	2	6	824584	824589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858196
14008	NC_014329	CTG	2	6	824691	824696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858197
14009	NC_014329	TGG	2	6	824721	824726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858197
14010	NC_014329	CAC	2	6	824744	824749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858197
14011	NC_014329	GAG	2	6	824750	824755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858197
14012	NC_014329	GC	3	6	824834	824839	0 %	0 %	50 %	50 %	300858197
14013	NC_014329	CAG	2	6	824898	824903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858197
14014	NC_014329	TTCC	2	8	824910	824917	0 %	50 %	0 %	50 %	300858197
14015	NC_014329	CAA	2	6	825095	825100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858197
14016	NC_014329	GAAC	2	8	825243	825250	50 %	0 %	25 %	25 %	300858197
14017	NC_014329	GCCT	2	8	825320	825327	0 %	25 %	25 %	50 %	300858197
14018	NC_014329	CGATG	2	10	825442	825451	20 %	20 %	40 %	20 %	300858197
14019	NC_014329	GCT	2	6	825545	825550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858197
14020	NC_014329	TC	4	8	825552	825559	0 %	50 %	0 %	50 %	300858197
14021	NC_014329	AAGA	2	8	825677	825684	75 %	0 %	25 %	0 %	300858197
14022	NC_014329	TTG	2	6	825728	825733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858197
14023	NC_014329	A	6	6	825788	825793	100 %	0 %	0 %	0 %	300858198
14024	NC_014329	CTG	2	6	825878	825883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858198
14025	NC_014329	GAC	2	6	825901	825906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858198
14026	NC_014329	CCT	2	6	825970	825975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858198
14027	NC_014329	ATC	2	6	826013	826018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858198
14028	NC_014329	CTA	2	6	826020	826025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858198
14029	NC_014329	CGG	2	6	826083	826088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858198
14030	NC_014329	CGG	2	6	826133	826138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858198
14031	NC_014329	TC	3	6	826140	826145	0 %	50 %	0 %	50 %	300858198
14032	NC_014329	CTT	2	6	826221	826226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858198
14033	NC_014329	CGCA	2	8	826227	826234	25 %	0 %	25 %	50 %	300858198
14034	NC_014329	TGTC	2	8	826266	826273	0 %	50 %	25 %	25 %	300858198
14035	NC_014329	CGA	2	6	826296	826301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858198
14036	NC_014329	GA	3	6	826367	826372	50 %	0 %	50 %	0 %	300858198
14037	NC_014329	TGG	2	6	826388	826393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858198
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14039	NC_014329	GTTT	2	8	826735	826742	0 %	75 %	25 %	0 %	300858199
14040	NC_014329	GAA	2	6	826751	826756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858199
14041	NC_014329	GTG	2	6	826766	826771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858199
14042	NC_014329	GC	3	6	826831	826836	0 %	0 %	50 %	50 %	300858199
14043	NC_014329	TCA	2	6	826875	826880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858199
14044	NC_014329	TCG	2	6	826930	826935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858199
14045	NC_014329	AT	3	6	826942	826947	50 %	50 %	0 %	0 %	300858199
14046	NC_014329	CA	3	6	826953	826958	50 %	0 %	0 %	50 %	300858199
14047	NC_014329	CGG	2	6	826960	826965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858199
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14050	NC_014329	ACG	2	6	827143	827148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858199
14051	NC_014329	CGA	2	6	827152	827157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858199
14052	NC_014329	GGC	2	6	827260	827265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858199
14053	NC_014329	GGC	2	6	827293	827298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858199
14054	NC_014329	TTCG	2	8	827301	827308	0 %	50 %	25 %	25 %	300858199
14055	NC_014329	GAA	2	6	827318	827323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858199
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14062	NC_014329	CGGG	2	8	827539	827546	0 %	0 %	75 %	25 %	300858200
14063	NC_014329	CGA	2	6	827684	827689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858200
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14087	NC_014329	CTA	2	6	829050	829055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858203
14088	NC_014329	GAC	2	6	829072	829077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858203
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14091	NC_014329	GATC	2	8	829374	829381	25 %	25 %	25 %	25 %	300858203
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14093	NC_014329	GAGCCA	2	12	829411	829422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858203
14094	NC_014329	CATC	2	8	829494	829501	25 %	25 %	0 %	50 %	300858203
14095	NC_014329	GA	3	6	829516	829521	50 %	0 %	50 %	0 %	300858203
14096	NC_014329	CGGA	2	8	829717	829724	25 %	0 %	50 %	25 %	300858204
14097	NC_014329	GA	3	6	829737	829742	50 %	0 %	50 %	0 %	300858204
14098	NC_014329	CAA	2	6	829761	829766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858204
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14101	NC_014329	GAT	2	6	829861	829866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858204
14102	NC_014329	TCAG	2	8	829889	829896	25 %	25 %	25 %	25 %	300858204
14103	NC_014329	TCG	2	6	829913	829918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858204
14104	NC_014329	ATCT	2	8	829941	829948	25 %	50 %	0 %	25 %	300858204
14105	NC_014329	GTGA	2	8	829969	829976	25 %	25 %	50 %	0 %	300858204
14106	NC_014329	TTC	2	6	830023	830028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858204
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14109	NC_014329	GTC	2	6	830206	830211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858204
14110	NC_014329	TCA	2	6	830229	830234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858204
14111	NC_014329	AAAT	2	8	830239	830246	75 %	25 %	0 %	0 %	300858204
14112	NC_014329	TCA	2	6	830267	830272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858204
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14119	NC_014329	ATA	2	6	830480	830485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858204
14120	NC_014329	GTG	2	6	830487	830492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858204
14121	NC_014329	CGA	2	6	830526	830531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858204
14122	NC_014329	AGCA	2	8	830617	830624	50 %	0 %	25 %	25 %	300858204
14123	NC_014329	CTC	2	6	830644	830649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858204
14124	NC_014329	ATC	2	6	830653	830658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858204
14125	NC_014329	TAC	2	6	830722	830727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858204
14126	NC_014329	CCT	2	6	830729	830734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858204
14127	NC_014329	GATC	2	8	830751	830758	25 %	25 %	25 %	25 %	300858204
14128	NC_014329	ATC	2	6	830767	830772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858204
14129	NC_014329	CGC	2	6	830829	830834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858204
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14131	NC_014329	TCA	2	6	830909	830914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858204
14132	NC_014329	CGT	2	6	830931	830936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858204
14133	NC_014329	TGG	2	6	831017	831022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858204
14134	NC_014329	CTG	2	6	831057	831062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858204
14135	NC_014329	TGAG	2	8	831202	831209	25 %	25 %	50 %	0 %	300858205
14136	NC_014329	CAG	2	6	831290	831295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858205
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14138	NC_014329	CTC	2	6	831565	831570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858205
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14140	NC_014329	CG	3	6	831653	831658	0 %	0 %	50 %	50 %	300858205
14141	NC_014329	GAG	2	6	831756	831761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858205
14142	NC_014329	CGT	2	6	831782	831787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858205
14143	NC_014329	TGCG	2	8	832050	832057	0 %	25 %	50 %	25 %	300858206
14144	NC_014329	TCA	2	6	832090	832095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858206
14145	NC_014329	CGTC	2	8	832117	832124	0 %	25 %	25 %	50 %	300858206
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14148	NC_014329	AC	3	6	832227	832232	50 %	0 %	0 %	50 %	300858206
14149	NC_014329	GCG	2	6	832243	832248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858206
14150	NC_014329	T	6	6	832265	832270	0 %	100 %	0 %	0 %	300858206
14151	NC_014329	GCA	2	6	832277	832282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858206
14152	NC_014329	TGC	2	6	832347	832352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858206
14153	NC_014329	CG	3	6	832414	832419	0 %	0 %	50 %	50 %	300858206
14154	NC_014329	TCCT	2	8	832457	832464	0 %	50 %	0 %	50 %	300858206
14155	NC_014329	GGC	2	6	832614	832619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858206
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14175	NC_014329	CCAG	3	12	833430	833441	25 %	0 %	25 %	50 %	300858207
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14183	NC_014329	TGG	2	6	834136	834141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858207
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14209	NC_014329	ACG	2	6	835774	835779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858209
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14212	NC_014329	GCG	3	9	835869	835877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858209
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14218	NC_014329	CGT	2	6	836135	836140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858210
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14223	NC_014329	TTC	2	6	836401	836406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858211
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14225	NC_014329	ATC	2	6	836450	836455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858211
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14230	NC_014329	AGC	2	6	836629	836634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858211
14231	NC_014329	A	7	7	836690	836696	100 %	0 %	0 %	0 %	300858211
14232	NC_014329	CAA	2	6	836735	836740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858211
14233	NC_014329	CGC	2	6	836976	836981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858212
14234	NC_014329	CGC	4	12	837069	837080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858212
14235	NC_014329	CTG	2	6	837198	837203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858212
14236	NC_014329	GAC	2	6	837223	837228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858212
14237	NC_014329	AAG	2	6	837229	837234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858212
14238	NC_014329	GGAG	2	8	837287	837294	25 %	0 %	75 %	0 %	300858212
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14240	NC_014329	TGT	2	6	837344	837349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858212
14241	NC_014329	GCA	2	6	837360	837365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858212
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14244	NC_014329	GAC	2	6	837587	837592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858212
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14358	NC_014329	CGA	2	6	843740	843745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858216
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14476	NC_014329	TCCA	2	8	849659	849666	25 %	25 %	0 %	50 %	300858219
14477	NC_014329	CG	3	6	849703	849708	0 %	0 %	50 %	50 %	300858219
14478	NC_014329	GCG	2	6	849742	849747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858219
14479	NC_014329	ACA	2	6	849748	849753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858219
14480	NC_014329	CGT	2	6	849869	849874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858219
14481	NC_014329	CGG	2	6	849908	849913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858219
14482	NC_014329	CAG	2	6	850007	850012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858219
14483	NC_014329	TGA	2	6	850096	850101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858219
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14485	NC_014329	CAGC	2	8	850187	850194	25 %	0 %	25 %	50 %	300858220
14486	NC_014329	TCC	2	6	850219	850224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858220
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14490	NC_014329	TGGG	2	8	850342	850349	0 %	25 %	75 %	0 %	300858220
14491	NC_014329	CAAC	2	8	850387	850394	50 %	0 %	0 %	50 %	300858220
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14493	NC_014329	CGG	2	6	850497	850502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858220
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14495	NC_014329	GAT	2	6	850636	850641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858220
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14497	NC_014329	CAA	2	6	850725	850730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858220
14498	NC_014329	CAG	2	6	850751	850756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858220
14499	NC_014329	TG	4	8	850781	850788	0 %	50 %	50 %	0 %	300858220
14500	NC_014329	GCA	2	6	850795	850800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858220

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