MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 38912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014329	TTC	2	6	649132	649137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858032
11002	NC_014329	TCG	2	6	649148	649153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858032
11003	NC_014329	TTCC	2	8	649215	649222	0 %	50 %	0 %	50 %	300858032
11004	NC_014329	CTT	2	6	649330	649335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858032
11005	NC_014329	CGT	2	6	649374	649379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858032
11006	NC_014329	CGG	2	6	649410	649415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858032
11007	NC_014329	CAC	2	6	649425	649430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858032
11008	NC_014329	GAT	2	6	649440	649445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858032
11009	NC_014329	CAT	2	6	649476	649481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858032
11010	NC_014329	GGT	2	6	649510	649515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858032
11011	NC_014329	CA	3	6	649545	649550	50 %	0 %	0 %	50 %	300858032
11012	NC_014329	ACG	2	6	649583	649588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858032
11013	NC_014329	GC	3	6	649738	649743	0 %	0 %	50 %	50 %	300858032
11014	NC_014329	TGA	2	6	649787	649792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858032
11015	NC_014329	GCT	2	6	649816	649821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858032
11016	NC_014329	CTGGC	2	10	649961	649970	0 %	20 %	40 %	40 %	300858032
11017	NC_014329	ATG	2	6	650006	650011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858032
11018	NC_014329	GCA	2	6	650118	650123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858032
11019	NC_014329	CTT	2	6	650133	650138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858032
11020	NC_014329	TC	3	6	650141	650146	0 %	50 %	0 %	50 %	300858032
11021	NC_014329	GCT	2	6	650161	650166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858032
11022	NC_014329	GAA	2	6	650205	650210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858032
11023	NC_014329	TCT	2	6	650276	650281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858032
11024	NC_014329	CAG	2	6	650285	650290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858032
11025	NC_014329	GAT	2	6	650310	650315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858032
11026	NC_014329	CTGG	2	8	650383	650390	0 %	25 %	50 %	25 %	300858032
11027	NC_014329	TGG	2	6	650405	650410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858032
11028	NC_014329	TGA	2	6	650427	650432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858032
11029	NC_014329	CT	3	6	650457	650462	0 %	50 %	0 %	50 %	300858032
11030	NC_014329	GA	3	6	650666	650671	50 %	0 %	50 %	0 %	300858033
11031	NC_014329	GC	3	6	650677	650682	0 %	0 %	50 %	50 %	300858033
11032	NC_014329	GTT	2	6	650715	650720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858033
11033	NC_014329	CGG	2	6	650725	650730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858033
11034	NC_014329	GGGA	2	8	650758	650765	25 %	0 %	75 %	0 %	300858033
11035	NC_014329	CT	3	6	650789	650794	0 %	50 %	0 %	50 %	300858033
11036	NC_014329	GCCA	2	8	650797	650804	25 %	0 %	25 %	50 %	300858033
11037	NC_014329	CAG	3	9	650812	650820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858033
11038	NC_014329	CGG	2	6	650851	650856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858033
11039	NC_014329	AGAA	2	8	650945	650952	75 %	0 %	25 %	0 %	300858033
11040	NC_014329	CTGAGC	2	12	650967	650978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300858033
11041	NC_014329	GAT	2	6	651054	651059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858034
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11043	NC_014329	CAAA	2	8	651273	651280	75 %	0 %	0 %	25 %	300858034
11044	NC_014329	GCGA	2	8	651281	651288	25 %	0 %	50 %	25 %	300858034
11045	NC_014329	GTAC	2	8	651309	651316	25 %	25 %	25 %	25 %	300858034
11046	NC_014329	ACG	2	6	651357	651362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858034
11047	NC_014329	GCA	2	6	651552	651557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11048	NC_014329	TGAGA	2	10	651600	651609	40 %	20 %	40 %	0 %	300858035
11049	NC_014329	GCT	2	6	651610	651615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11050	NC_014329	TAC	2	6	651635	651640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858035
11051	NC_014329	TGC	2	6	651671	651676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11052	NC_014329	GTT	2	6	651722	651727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858035
11053	NC_014329	TGG	2	6	651774	651779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858035
11054	NC_014329	GTGG	2	8	651790	651797	0 %	25 %	75 %	0 %	300858035
11055	NC_014329	TGC	2	6	651822	651827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11056	NC_014329	AGA	2	6	651829	651834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858035
11057	NC_014329	CAG	2	6	651904	651909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11058	NC_014329	GC	3	6	651966	651971	0 %	0 %	50 %	50 %	300858035
11059	NC_014329	GCC	2	6	652016	652021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858035
11060	NC_014329	ACT	2	6	652059	652064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858035
11061	NC_014329	CGG	2	6	652069	652074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858035
11062	NC_014329	GAC	2	6	652207	652212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11063	NC_014329	GA	3	6	652216	652221	50 %	0 %	50 %	0 %	300858035
11064	NC_014329	GCA	2	6	652281	652286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11065	NC_014329	GCA	2	6	652350	652355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858035
11066	NC_014329	CTAG	2	8	652661	652668	25 %	25 %	25 %	25 %	300858036
11067	NC_014329	AGA	2	6	652750	652755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858036
11068	NC_014329	GAT	2	6	652842	652847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858036
11069	NC_014329	TGC	2	6	652860	652865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858036
11070	NC_014329	AAAC	2	8	652866	652873	75 %	0 %	0 %	25 %	300858036
11071	NC_014329	TC	3	6	652888	652893	0 %	50 %	0 %	50 %	300858036
11072	NC_014329	GGA	2	6	652934	652939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858036
11073	NC_014329	CG	3	6	652952	652957	0 %	0 %	50 %	50 %	300858036
11074	NC_014329	AGG	2	6	652984	652989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858036
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11077	NC_014329	CTG	2	6	653141	653146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858036
11078	NC_014329	CAC	2	6	653160	653165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858036
11079	NC_014329	CTG	2	6	653180	653185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858036
11080	NC_014329	TGGT	2	8	653236	653243	0 %	50 %	50 %	0 %	300858036
11081	NC_014329	AAT	2	6	653287	653292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858036
11082	NC_014329	GAA	2	6	653334	653339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858036
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11084	NC_014329	GAGC	2	8	653371	653378	25 %	0 %	50 %	25 %	300858036
11085	NC_014329	TC	3	6	653414	653419	0 %	50 %	0 %	50 %	300858036
11086	NC_014329	GGA	2	6	653442	653447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858036
11087	NC_014329	AGC	2	6	653491	653496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858036
11088	NC_014329	AAT	2	6	653601	653606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858036
11089	NC_014329	TCCT	2	8	653628	653635	0 %	50 %	0 %	50 %	300858036
11090	NC_014329	AAG	2	6	653673	653678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858036
11091	NC_014329	AAG	2	6	653778	653783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858036
11092	NC_014329	ACG	2	6	653785	653790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858036
11093	NC_014329	GT	3	6	653870	653875	0 %	50 %	50 %	0 %	300858036
11094	NC_014329	AGA	2	6	654116	654121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858037
11095	NC_014329	T	7	7	654143	654149	0 %	100 %	0 %	0 %	300858037
11096	NC_014329	AGT	2	6	654341	654346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858037
11097	NC_014329	GGCG	2	8	654356	654363	0 %	0 %	75 %	25 %	300858037
11098	NC_014329	T	6	6	654408	654413	0 %	100 %	0 %	0 %	300858037
11099	NC_014329	TGC	2	6	654420	654425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858037
11100	NC_014329	GAA	2	6	654490	654495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858037
11101	NC_014329	CTTT	2	8	654541	654548	0 %	75 %	0 %	25 %	300858037
11102	NC_014329	T	6	6	654546	654551	0 %	100 %	0 %	0 %	300858037
11103	NC_014329	GTT	2	6	654559	654564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858037
11104	NC_014329	CAT	2	6	654605	654610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858037
11105	NC_014329	CCA	2	6	655055	655060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858038
11106	NC_014329	AGC	2	6	655103	655108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858038
11107	NC_014329	GC	3	6	655225	655230	0 %	0 %	50 %	50 %	300858038
11108	NC_014329	ATC	2	6	655233	655238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858038
11109	NC_014329	AGCGCC	2	12	655254	655265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300858038
11110	NC_014329	GAA	2	6	655319	655324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858038
11111	NC_014329	CAT	2	6	655349	655354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858038
11112	NC_014329	CGG	2	6	655380	655385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858038
11113	NC_014329	CCGATT	2	12	655449	655460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300858038
11114	NC_014329	ACA	2	6	655488	655493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858038
11115	NC_014329	ATG	2	6	655530	655535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858038
11116	NC_014329	GCA	2	6	655722	655727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858038
11117	NC_014329	CAT	2	6	655946	655951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858038
11118	NC_014329	GCG	2	6	655959	655964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858038
11119	NC_014329	AGA	2	6	656019	656024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858038
11120	NC_014329	GAT	2	6	656033	656038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858038
11121	NC_014329	TGC	2	6	656091	656096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858038
11122	NC_014329	CTG	2	6	656103	656108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858038
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11124	NC_014329	TGC	2	6	656228	656233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858038
11125	NC_014329	CTGT	2	8	656327	656334	0 %	50 %	25 %	25 %	300858038
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11229	NC_014329	ATCA	2	8	662285	662292	50 %	25 %	0 %	25 %	300858043
11230	NC_014329	TCAGC	2	10	662301	662310	20 %	20 %	20 %	40 %	300858043
11231	NC_014329	A	6	6	662311	662316	100 %	0 %	0 %	0 %	300858043
11232	NC_014329	GTG	2	6	662339	662344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858043
11233	NC_014329	AAG	2	6	662449	662454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858043
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11235	NC_014329	GTCTT	2	10	662546	662555	0 %	60 %	20 %	20 %	300858044
11236	NC_014329	T	6	6	662554	662559	0 %	100 %	0 %	0 %	300858044
11237	NC_014329	GCT	2	6	662587	662592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858044
11238	NC_014329	CCT	2	6	662595	662600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858044
11239	NC_014329	C	6	6	662662	662667	0 %	0 %	0 %	100 %	300858044
11240	NC_014329	TTG	2	6	662741	662746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858044
11241	NC_014329	TAACCA	2	12	662771	662782	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	300858044
11242	NC_014329	TGG	2	6	662836	662841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858044
11243	NC_014329	CAT	2	6	662898	662903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858044
11244	NC_014329	TGG	2	6	662936	662941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858044
11245	NC_014329	TGC	2	6	662966	662971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858044
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11249	NC_014329	TGCT	2	8	663128	663135	0 %	50 %	25 %	25 %	300858044
11250	NC_014329	ACG	2	6	663159	663164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858044
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11252	NC_014329	ATC	2	6	663263	663268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858044
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11255	NC_014329	GCT	2	6	663437	663442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858045
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11258	NC_014329	GCG	3	9	663507	663515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858045
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11264	NC_014329	GTA	2	6	663807	663812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858045
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11269	NC_014329	TTGGCG	2	12	664030	664041	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300858045
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11342	NC_014329	GCCT	2	8	668741	668748	0 %	25 %	25 %	50 %	300858051
11343	NC_014329	AGG	2	6	668779	668784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858051
11344	NC_014329	GCGCT	2	10	668817	668826	0 %	20 %	40 %	40 %	300858051
11345	NC_014329	GGA	2	6	668886	668891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858051
11346	NC_014329	CGA	2	6	668940	668945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858051
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11349	NC_014329	ACTC	2	8	669199	669206	25 %	25 %	0 %	50 %	300858051
11350	NC_014329	TGC	2	6	669222	669227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858051
11351	NC_014329	CCGGTG	2	12	669246	669257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300858051
11352	NC_014329	GTC	2	6	669260	669265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858051
11353	NC_014329	AGG	2	6	669297	669302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858051
11354	NC_014329	ATG	2	6	669324	669329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858051
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11477	NC_014329	GGA	2	6	676277	676282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858055
11478	NC_014329	CGAT	2	8	676337	676344	25 %	25 %	25 %	25 %	300858055
11479	NC_014329	CA	3	6	676359	676364	50 %	0 %	0 %	50 %	300858055
11480	NC_014329	CTG	2	6	676380	676385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858055
11481	NC_014329	GGT	2	6	676415	676420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858055
11482	NC_014329	ACA	2	6	676752	676757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858055
11483	NC_014329	TCC	2	6	676834	676839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858055
11484	NC_014329	CGA	2	6	676853	676858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858055
11485	NC_014329	CTC	2	6	676862	676867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858055
11486	NC_014329	ATT	2	6	676881	676886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300858055
11487	NC_014329	TGG	2	6	676887	676892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858055
11488	NC_014329	GCCA	2	8	676903	676910	25 %	0 %	25 %	50 %	300858055
11489	NC_014329	TCT	2	6	676987	676992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858056
11490	NC_014329	TGG	2	6	677005	677010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858056
11491	NC_014329	TGCA	2	8	677050	677057	25 %	25 %	25 %	25 %	300858056
11492	NC_014329	TGT	2	6	677134	677139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858056
11493	NC_014329	AGTA	2	8	677173	677180	50 %	25 %	25 %	0 %	300858056
11494	NC_014329	TTG	2	6	677196	677201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858056
11495	NC_014329	CAT	2	6	677257	677262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858056
11496	NC_014329	GAT	2	6	677293	677298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858056
11497	NC_014329	GCGAT	2	10	677340	677349	20 %	20 %	40 %	20 %	300858056
11498	NC_014329	TAAT	2	8	677381	677388	50 %	50 %	0 %	0 %	300858056
11499	NC_014329	TCG	2	6	677494	677499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858057
11500	NC_014329	AGA	2	6	677502	677507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858057

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