MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium difficile R20291 chromosome

Total Repeats: 92300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013316	AGTAAA	2	12	66371	66382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260685406
1003	NC_013316	ATA	2	6	66389	66394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260685406
1004	NC_013316	TTA	2	6	66398	66403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685406
1005	NC_013316	ACTCT	2	10	66437	66446	20 %	40 %	0 %	40 %	260685406
1006	NC_013316	AAG	2	6	66470	66475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260685406
1007	NC_013316	A	6	6	66478	66483	100 %	0 %	0 %	0 %	260685406
1008	NC_013316	TTA	2	6	66501	66506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685406
1009	NC_013316	GAT	2	6	66511	66516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685406
1010	NC_013316	TAG	2	6	66542	66547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685406
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1012	NC_013316	GTTT	2	8	66613	66620	0 %	75 %	25 %	0 %	260685407
1013	NC_013316	TACA	2	8	66645	66652	50 %	25 %	0 %	25 %	260685407
1014	NC_013316	TGT	2	6	66656	66661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260685407
1015	NC_013316	A	7	7	66670	66676	100 %	0 %	0 %	0 %	260685407
1016	NC_013316	ATG	2	6	66795	66800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685407
1017	NC_013316	ATA	2	6	66922	66927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260685407
1018	NC_013316	TTG	2	6	66928	66933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260685407
1019	NC_013316	GAA	2	6	66942	66947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260685407
1020	NC_013316	GTGA	2	8	66951	66958	25 %	25 %	50 %	0 %	260685407
1021	NC_013316	TTA	2	6	66960	66965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685407
1022	NC_013316	CAA	2	6	67160	67165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260685408
1023	NC_013316	AAAG	2	8	67182	67189	75 %	0 %	25 %	0 %	260685408
1024	NC_013316	AGT	2	6	67239	67244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685408
1025	NC_013316	TAA	2	6	67277	67282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260685408
1026	NC_013316	TAC	2	6	67287	67292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260685408
1027	NC_013316	TAG	2	6	67302	67307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685408
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1032	NC_013316	TTG	2	6	67497	67502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260685409
1033	NC_013316	ATG	2	6	67520	67525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685409
1034	NC_013316	AAT	3	9	67528	67536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260685409
1035	NC_013316	TAT	2	6	67627	67632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685409
1036	NC_013316	ACA	2	6	67666	67671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260685409
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1042	NC_013316	TAG	2	6	68046	68051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685409
1043	NC_013316	TAAA	2	8	68052	68059	75 %	25 %	0 %	0 %	260685409
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1050	NC_013316	TATTAA	2	12	68238	68249	50 %	50 %	0 %	0 %	260685409
1051	NC_013316	GCA	2	6	68261	68266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260685409
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1053	NC_013316	ATT	2	6	68281	68286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685409
1054	NC_013316	TA	3	6	68348	68353	50 %	50 %	0 %	0 %	260685409
1055	NC_013316	CAG	2	6	68364	68369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260685409
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1057	NC_013316	TAA	2	6	68544	68549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260685409
1058	NC_013316	AAT	2	6	68554	68559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260685409
1059	NC_013316	ATT	2	6	68575	68580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685409
1060	NC_013316	AACT	2	8	68587	68594	50 %	25 %	0 %	25 %	260685409
1061	NC_013316	ATT	2	6	68602	68607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685409
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1067	NC_013316	TACT	2	8	68892	68899	25 %	50 %	0 %	25 %	260685410
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1069	NC_013316	TAA	2	6	68954	68959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260685410
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1071	NC_013316	AT	4	8	68980	68987	50 %	50 %	0 %	0 %	260685410
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1091	NC_013316	TAG	2	6	69682	69687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685411
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1097	NC_013316	TGA	2	6	70097	70102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260685411
1098	NC_013316	GA	3	6	70118	70123	50 %	0 %	50 %	0 %	260685411
1099	NC_013316	T	6	6	70128	70133	0 %	100 %	0 %	0 %	260685411
1100	NC_013316	ATAA	2	8	70150	70157	75 %	25 %	0 %	0 %	260685411
1101	NC_013316	TTA	2	6	70340	70345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260685412
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1107	NC_013316	TCAT	2	8	70583	70590	25 %	50 %	0 %	25 %	260685412
1108	NC_013316	T	6	6	70621	70626	0 %	100 %	0 %	0 %	260685412
1109	NC_013316	GAAA	2	8	70688	70695	75 %	0 %	25 %	0 %	260685412
1110	NC_013316	ATTT	2	8	70698	70705	25 %	75 %	0 %	0 %	260685412
1111	NC_013316	A	7	7	70715	70721	100 %	0 %	0 %	0 %	260685412
1112	NC_013316	A	6	6	70750	70755	100 %	0 %	0 %	0 %	260685412
1113	NC_013316	CTT	2	6	70775	70780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260685412
1114	NC_013316	TAAA	2	8	70794	70801	75 %	25 %	0 %	0 %	260685412
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1120	NC_013316	T	6	6	71129	71134	0 %	100 %	0 %	0 %	260685412
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1123	NC_013316	GTT	2	6	71170	71175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260685412
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1125	NC_013316	AG	3	6	71206	71211	50 %	0 %	50 %	0 %	260685412
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