MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 81527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013161	TCA	2	6	194675	194680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058113
3502	NC_013161	TGG	2	6	194696	194701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058113
3503	NC_013161	TTGA	2	8	194722	194729	25 %	50 %	25 %	0 %	257058113
3504	NC_013161	TTG	2	6	194809	194814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058113
3505	NC_013161	T	6	6	194832	194837	0 %	100 %	0 %	0 %	257058113
3506	NC_013161	T	10	10	194914	194923	0 %	100 %	0 %	0 %	257058114
3507	NC_013161	TCT	2	6	194926	194931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058114
3508	NC_013161	AGA	2	6	194967	194972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058114
3509	NC_013161	GCT	2	6	194986	194991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058114
3510	NC_013161	AAG	2	6	195053	195058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058114
3511	NC_013161	TGC	2	6	195067	195072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058114
3512	NC_013161	TTG	2	6	195098	195103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058114
3513	NC_013161	GAA	2	6	195194	195199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058115
3514	NC_013161	TAAG	2	8	195206	195213	50 %	25 %	25 %	0 %	257058115
3515	NC_013161	C	6	6	195229	195234	0 %	0 %	0 %	100 %	257058115
3516	NC_013161	GCT	2	6	195252	195257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058115
3517	NC_013161	A	6	6	195264	195269	100 %	0 %	0 %	0 %	257058115
3518	NC_013161	GAC	2	6	195289	195294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058115
3519	NC_013161	CTC	2	6	195325	195330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058115
3520	NC_013161	GTG	2	6	195363	195368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058115
3521	NC_013161	TAA	2	6	195371	195376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058115
3522	NC_013161	ATC	2	6	195402	195407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058115
3523	NC_013161	CTG	2	6	195440	195445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058115
3524	NC_013161	AAC	2	6	195483	195488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058115
3525	NC_013161	CCA	2	6	195507	195512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058115
3526	NC_013161	ACT	2	6	195659	195664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058115
3527	NC_013161	GCT	2	6	195738	195743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058115
3528	NC_013161	CTA	2	6	195745	195750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058115
3529	NC_013161	C	6	6	195794	195799	0 %	0 %	0 %	100 %	257058115
3530	NC_013161	ATA	2	6	195880	195885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058115
3531	NC_013161	CGG	2	6	195895	195900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058115
3532	NC_013161	ATT	2	6	196073	196078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
3533	NC_013161	ACG	2	6	196120	196125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058116
3534	NC_013161	CAA	2	6	196163	196168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058116
3535	NC_013161	CTA	2	6	196248	196253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058116
3536	NC_013161	AGA	3	9	196267	196275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058116
3537	NC_013161	CG	3	6	196316	196321	0 %	0 %	50 %	50 %	257058116
3538	NC_013161	ATGTTA	2	12	196487	196498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257058116
3539	NC_013161	A	6	6	196527	196532	100 %	0 %	0 %	0 %	257058116
3540	NC_013161	TCG	2	6	196533	196538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058116
3541	NC_013161	CCT	2	6	196547	196552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058116
3542	NC_013161	AGGG	2	8	196561	196568	25 %	0 %	75 %	0 %	257058116
3543	NC_013161	TC	3	6	196580	196585	0 %	50 %	0 %	50 %	257058116
3544	NC_013161	GCG	2	6	196646	196651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058116
3545	NC_013161	CGGAA	2	10	196660	196669	40 %	0 %	40 %	20 %	257058116
3546	NC_013161	CCG	2	6	196764	196769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058116
3547	NC_013161	AGC	2	6	196819	196824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058116
3548	NC_013161	ATTG	2	8	196834	196841	25 %	50 %	25 %	0 %	257058116
3549	NC_013161	CAG	2	6	196863	196868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058116
3550	NC_013161	TTA	2	6	196871	196876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
3551	NC_013161	CAGT	2	8	196909	196916	25 %	25 %	25 %	25 %	257058116
3552	NC_013161	GCAA	2	8	196953	196960	50 %	0 %	25 %	25 %	257058116
3553	NC_013161	ATT	2	6	196994	196999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
3554	NC_013161	AAC	2	6	197102	197107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058116
3555	NC_013161	TTA	2	6	197120	197125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
3556	NC_013161	AAAC	2	8	197285	197292	75 %	0 %	0 %	25 %	257058116
3557	NC_013161	GAA	2	6	197315	197320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058116
3558	NC_013161	AGA	2	6	197457	197462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058117
3559	NC_013161	TGC	2	6	197465	197470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058117
3560	NC_013161	GAAC	2	8	197523	197530	50 %	0 %	25 %	25 %	257058117
3561	NC_013161	AAT	2	6	197610	197615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058117
3562	NC_013161	TA	4	8	197624	197631	50 %	50 %	0 %	0 %	257058117
3563	NC_013161	TCA	2	6	197732	197737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058117
3564	NC_013161	TA	3	6	197806	197811	50 %	50 %	0 %	0 %	257058117
3565	NC_013161	TCC	2	6	197967	197972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058117
3566	NC_013161	CCT	2	6	198040	198045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058117
3567	NC_013161	CAT	2	6	198067	198072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058117
3568	NC_013161	TATT	2	8	198140	198147	25 %	75 %	0 %	0 %	257058117
3569	NC_013161	TGA	2	6	198180	198185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058117
3570	NC_013161	AGC	2	6	198201	198206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058117
3571	NC_013161	GAA	2	6	198211	198216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058117
3572	NC_013161	T	6	6	198276	198281	0 %	100 %	0 %	0 %	257058117
3573	NC_013161	ACG	2	6	198321	198326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058117
3574	NC_013161	GTC	2	6	198334	198339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058117
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3576	NC_013161	TGA	2	6	198465	198470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058117
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3578	NC_013161	TCG	2	6	198540	198545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058117
3579	NC_013161	ACC	2	6	198554	198559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058117
3580	NC_013161	AGC	2	6	198576	198581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058117
3581	NC_013161	TTA	2	6	198638	198643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058117
3582	NC_013161	ATC	2	6	198651	198656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058117
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3585	NC_013161	TTGT	2	8	198710	198717	0 %	75 %	25 %	0 %	257058117
3586	NC_013161	GAT	2	6	198739	198744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058117
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3588	NC_013161	GAA	2	6	198820	198825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058117
3589	NC_013161	TTAA	2	8	198963	198970	50 %	50 %	0 %	0 %	257058118
3590	NC_013161	TGA	2	6	199010	199015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058118
3591	NC_013161	TAA	2	6	199024	199029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
3592	NC_013161	TCC	2	6	199123	199128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058118
3593	NC_013161	TAA	2	6	199135	199140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
3594	NC_013161	AATC	2	8	199161	199168	50 %	25 %	0 %	25 %	257058118
3595	NC_013161	AATATT	2	12	199213	199224	50 %	50 %	0 %	0 %	257058118
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3599	NC_013161	AAT	2	6	199318	199323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
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3601	NC_013161	TCA	2	6	199376	199381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058118
3602	NC_013161	AGA	2	6	199393	199398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058118
3603	NC_013161	AAAT	2	8	199441	199448	75 %	25 %	0 %	0 %	257058118
3604	NC_013161	GGA	2	6	199499	199504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058118
3605	NC_013161	CCT	2	6	199517	199522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058118
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3608	NC_013161	TGGC	2	8	199578	199585	0 %	25 %	50 %	25 %	257058118
3609	NC_013161	TAATA	2	10	199599	199608	60 %	40 %	0 %	0 %	257058118
3610	NC_013161	TAA	3	9	199653	199661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
3611	NC_013161	T	7	7	199720	199726	0 %	100 %	0 %	0 %	257058118
3612	NC_013161	TAA	2	6	199798	199803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
3613	NC_013161	AG	3	6	199828	199833	50 %	0 %	50 %	0 %	257058118
3614	NC_013161	CTTC	2	8	199865	199872	0 %	50 %	0 %	50 %	257058118
3615	NC_013161	GAC	2	6	199879	199884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058118
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3617	NC_013161	TC	3	6	199907	199912	0 %	50 %	0 %	50 %	257058118
3618	NC_013161	AACG	2	8	199997	200004	50 %	0 %	25 %	25 %	257058118
3619	NC_013161	TCA	2	6	200036	200041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058118
3620	NC_013161	TCC	2	6	200089	200094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058118
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3622	NC_013161	CCT	2	6	200387	200392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058119
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3990	NC_013161	T	6	6	220382	220387	0 %	100 %	0 %	0 %	257058142
3991	NC_013161	TAT	2	6	220465	220470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058142
3992	NC_013161	T	7	7	220520	220526	0 %	100 %	0 %	0 %	257058142
3993	NC_013161	T	7	7	220534	220540	0 %	100 %	0 %	0 %	257058142
3994	NC_013161	ATT	2	6	220606	220611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058143
3995	NC_013161	T	6	6	220625	220630	0 %	100 %	0 %	0 %	257058143
3996	NC_013161	TCG	2	6	220649	220654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058143
3997	NC_013161	TGACGA	2	12	220710	220721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257058143
3998	NC_013161	CTT	2	6	220834	220839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058143
3999	NC_013161	GA	3	6	220908	220913	50 %	0 %	50 %	0 %	257058143
4000	NC_013161	ATCACC	2	12	221114	221125	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257058144

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