MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Catenulispora acidiphila DSM 44928 chromosome

Total Repeats: 263269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013131	ACC	2	6	386	391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
2	NC_013131	GCCG	2	8	462	469	0 %	0 %	50 %	50 %	256389233
3	NC_013131	TGA	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389233
4	NC_013131	GAC	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
5	NC_013131	AGC	2	6	638	643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
6	NC_013131	ACC	2	6	661	666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
7	NC_013131	TCG	2	6	710	715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389233
8	NC_013131	GCCG	2	8	741	748	0 %	0 %	50 %	50 %	256389233
9	NC_013131	CGGC	2	8	749	756	0 %	0 %	50 %	50 %	256389233
10	NC_013131	CGC	2	6	764	769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
11	NC_013131	CAG	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
12	NC_013131	CGC	3	9	815	823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
13	NC_013131	CGG	2	6	857	862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389233
14	NC_013131	CCG	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
15	NC_013131	CGG	2	6	915	920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389233
16	NC_013131	CGC	2	6	935	940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
17	NC_013131	GCCC	2	8	951	958	0 %	0 %	25 %	75 %	256389233
18	NC_013131	GAG	2	6	961	966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
19	NC_013131	CGCTGT	2	12	986	997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389233
20	NC_013131	CTC	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389233
21	NC_013131	CGA	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
22	NC_013131	CAG	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
23	NC_013131	CGC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
24	NC_013131	GTCGCC	2	12	1132	1143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256389233
25	NC_013131	CG	3	6	1233	1238	0 %	0 %	50 %	50 %	256389233
26	NC_013131	GAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
27	NC_013131	TCA	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389233
28	NC_013131	ACC	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
29	NC_013131	CGA	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
30	NC_013131	AGG	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
31	NC_013131	AGG	2	6	1409	1414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
32	NC_013131	TTC	2	6	1417	1422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389233
33	NC_013131	GCC	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
34	NC_013131	AGC	2	6	1487	1492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
35	NC_013131	GGA	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
36	NC_013131	GCC	2	6	1554	1559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
37	NC_013131	AAG	2	6	1591	1596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389233
38	NC_013131	GCA	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
39	NC_013131	CGC	2	6	1619	1624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
40	NC_013131	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
41	NC_013131	GC	3	6	1682	1687	0 %	0 %	50 %	50 %	256389233
42	NC_013131	GAA	2	6	1758	1763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389233
43	NC_013131	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
44	NC_013131	GGA	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
45	NC_013131	GACC	2	8	1923	1930	25 %	0 %	25 %	50 %	256389233
46	NC_013131	CGG	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389233
47	NC_013131	CAC	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
48	NC_013131	CGCT	2	8	2005	2012	0 %	25 %	25 %	50 %	256389233
49	NC_013131	GCGCC	2	10	2022	2031	0 %	0 %	40 %	60 %	256389233
50	NC_013131	GCC	2	6	2901	2906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
51	NC_013131	CGG	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
52	NC_013131	GGAG	2	8	2947	2954	25 %	0 %	75 %	0 %	256389234
53	NC_013131	GGC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
54	NC_013131	TCC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389234
55	NC_013131	GCCGG	2	10	3043	3052	0 %	0 %	60 %	40 %	256389234
56	NC_013131	GCT	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389234
57	NC_013131	GGA	2	6	3187	3192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389234
58	NC_013131	CGACCG	2	12	3216	3227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256389234
59	NC_013131	CGC	2	6	3277	3282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
60	NC_013131	CGA	2	6	3289	3294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389234
61	NC_013131	ACCG	2	8	3359	3366	25 %	0 %	25 %	50 %	256389234
62	NC_013131	GAC	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389234
63	NC_013131	CGG	2	6	3475	3480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
64	NC_013131	CGG	2	6	3505	3510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
65	NC_013131	CGG	2	6	3578	3583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
66	NC_013131	CTG	2	6	3596	3601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389234
67	NC_013131	CGCT	2	8	3623	3630	0 %	25 %	25 %	50 %	256389234
68	NC_013131	ACA	2	6	3645	3650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256389234
69	NC_013131	GCC	2	6	3686	3691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
70	NC_013131	TGG	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389234
71	NC_013131	CGA	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389234
72	NC_013131	GCC	2	6	3939	3944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
73	NC_013131	AGG	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389234
74	NC_013131	TGA	2	6	3984	3989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389234
75	NC_013131	GGC	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
76	NC_013131	CGT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
77	NC_013131	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
78	NC_013131	CG	3	6	4261	4266	0 %	0 %	50 %	50 %	256389235
79	NC_013131	CCG	2	6	4285	4290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389235
80	NC_013131	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
81	NC_013131	CGG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
82	NC_013131	CTC	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389235
83	NC_013131	TCG	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
84	NC_013131	GCG	2	6	4447	4452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
85	NC_013131	CGG	2	6	4487	4492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
86	NC_013131	CGA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389235
87	NC_013131	GCCG	2	8	4541	4548	0 %	0 %	50 %	50 %	256389235
88	NC_013131	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
89	NC_013131	CAT	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389235
90	NC_013131	GCT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
91	NC_013131	AGG	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389235
92	NC_013131	GCT	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
93	NC_013131	CTG	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
94	NC_013131	GAC	3	9	4767	4775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389235
95	NC_013131	CGA	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389235
96	NC_013131	CG	3	6	4889	4894	0 %	0 %	50 %	50 %	256389235
97	NC_013131	AGG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389235
98	NC_013131	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389235
99	NC_013131	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
100	NC_013131	GAA	2	6	4973	4978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389235
101	NC_013131	CCTC	2	8	5041	5048	0 %	25 %	0 %	75 %	256389236
102	NC_013131	TCG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
103	NC_013131	GC	3	6	5188	5193	0 %	0 %	50 %	50 %	256389236
104	NC_013131	CG	3	6	5194	5199	0 %	0 %	50 %	50 %	256389236
105	NC_013131	GC	3	6	5207	5212	0 %	0 %	50 %	50 %	256389236
106	NC_013131	CGGG	2	8	5263	5270	0 %	0 %	75 %	25 %	256389236
107	NC_013131	CG	4	8	5277	5284	0 %	0 %	50 %	50 %	256389236
108	NC_013131	CCGCGC	2	12	5304	5315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
109	NC_013131	TGC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
110	NC_013131	AGA	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389236
111	NC_013131	GCC	2	6	5392	5397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
112	NC_013131	TCG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
113	NC_013131	AGC	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
114	NC_013131	TGC	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
115	NC_013131	GCG	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389236
116	NC_013131	ACC	3	9	5560	5568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389236
117	NC_013131	CGC	2	6	5594	5599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
118	NC_013131	GC	3	6	5598	5603	0 %	0 %	50 %	50 %	256389236
119	NC_013131	C	6	6	5626	5631	0 %	0 %	0 %	100 %	256389236
120	NC_013131	GGC	2	6	5664	5669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389236
121	NC_013131	CGA	2	6	5692	5697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
122	NC_013131	CCG	2	6	5701	5706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
123	NC_013131	CCG	2	6	5719	5724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
124	NC_013131	GGTC	2	8	5798	5805	0 %	25 %	50 %	25 %	256389236
125	NC_013131	CGA	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
126	NC_013131	CCT	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389236
127	NC_013131	ACA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256389236
128	NC_013131	GC	3	6	5862	5867	0 %	0 %	50 %	50 %	256389236
129	NC_013131	GCCA	2	8	5874	5881	25 %	0 %	25 %	50 %	256389236
130	NC_013131	CTG	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
131	NC_013131	CGG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389236
132	NC_013131	CGA	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
133	NC_013131	GCC	3	9	6010	6018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
134	NC_013131	TCA	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389236
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138	NC_013131	GCC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389237
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143	NC_013131	CGG	3	9	6393	6401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389237
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155	NC_013131	CGG	2	6	7458	7463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389238
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159	NC_013131	CGG	2	6	7578	7583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389238
160	NC_013131	CGG	2	6	7596	7601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389238
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163	NC_013131	GTCGAG	2	12	7648	7659	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256389238
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174	NC_013131	CCGCG	2	10	8145	8154	0 %	0 %	40 %	60 %	256389238
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257	NC_013131	CAC	2	6	10954	10959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389239
258	NC_013131	CAC	2	6	10964	10969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389239
259	NC_013131	GCT	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389239
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261	NC_013131	CG	4	8	11044	11051	0 %	0 %	50 %	50 %	256389239
262	NC_013131	CTG	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389239
263	NC_013131	AAG	2	6	11171	11176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389239
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382	NC_013131	GAG	2	6	16860	16865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389246
383	NC_013131	CGGCC	2	10	16889	16898	0 %	0 %	40 %	60 %	256389246
384	NC_013131	GAA	2	6	16927	16932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389246
385	NC_013131	GAC	2	6	16943	16948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389246
386	NC_013131	GGA	2	6	16949	16954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389246
387	NC_013131	ATC	2	6	17012	17017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389247
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391	NC_013131	TCG	2	6	17331	17336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389247
392	NC_013131	CGT	2	6	17401	17406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389247
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497	NC_013131	CGGC	2	8	22517	22524	0 %	0 %	50 %	50 %	256389253
498	NC_013131	GCCG	2	8	22596	22603	0 %	0 %	50 %	50 %	256389253
499	NC_013131	GCG	2	6	22630	22635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389253
500	NC_013131	TCG	2	6	22639	22644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389253

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