MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 21903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012985	TCT	2	6	26389	26394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
502	NC_012985	TCA	2	6	26440	26445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
503	NC_012985	TCT	2	6	26479	26484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
504	NC_012985	ACA	2	6	26503	26508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
505	NC_012985	ACG	2	6	26582	26587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
506	NC_012985	AACT	2	8	26594	26601	50 %	25 %	0 %	25 %	254780143
507	NC_012985	CAG	2	6	26630	26635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
508	NC_012985	CTCGCT	2	12	26689	26700	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254780143
509	NC_012985	CCT	2	6	26704	26709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780143
510	NC_012985	ACG	2	6	26727	26732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
511	NC_012985	TG	4	8	26733	26740	0 %	50 %	50 %	0 %	254780143
512	NC_012985	AG	3	6	26752	26757	50 %	0 %	50 %	0 %	254780143
513	NC_012985	TTC	2	6	26766	26771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
514	NC_012985	CAG	2	6	26810	26815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
515	NC_012985	ACA	2	6	26818	26823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
516	NC_012985	TAA	2	6	26834	26839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
517	NC_012985	TGA	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780143
518	NC_012985	TTC	2	6	26929	26934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
519	NC_012985	GAAC	2	8	26950	26957	50 %	0 %	25 %	25 %	254780143
520	NC_012985	CGA	2	6	26959	26964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
521	NC_012985	TCA	2	6	26983	26988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
522	NC_012985	ATA	2	6	27028	27033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
523	NC_012985	AAT	2	6	27036	27041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
524	NC_012985	TCT	2	6	27043	27048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
525	NC_012985	CAT	2	6	27065	27070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
526	NC_012985	AAAGA	2	10	27144	27153	80 %	0 %	20 %	0 %	254780143
527	NC_012985	ATT	3	9	27282	27290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780143
528	NC_012985	TCA	2	6	27358	27363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
529	NC_012985	AT	4	8	27382	27389	50 %	50 %	0 %	0 %	254780143
530	NC_012985	TCT	2	6	27415	27420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
531	NC_012985	TACA	2	8	27423	27430	50 %	25 %	0 %	25 %	254780143
532	NC_012985	TTTC	2	8	27476	27483	0 %	75 %	0 %	25 %	254780143
533	NC_012985	TAA	2	6	27492	27497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
534	NC_012985	TTTC	2	8	27510	27517	0 %	75 %	0 %	25 %	254780143
535	NC_012985	GAA	2	6	27559	27564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780143
536	NC_012985	ACCA	2	8	27576	27583	50 %	0 %	0 %	50 %	254780143
537	NC_012985	A	6	6	27694	27699	100 %	0 %	0 %	0 %	254780143
538	NC_012985	TCTA	2	8	27723	27730	25 %	50 %	0 %	25 %	254780143
539	NC_012985	ATGA	2	8	27738	27745	50 %	25 %	25 %	0 %	254780143
540	NC_012985	TCCA	2	8	27769	27776	25 %	25 %	0 %	50 %	254780143
541	NC_012985	AAT	2	6	27792	27797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
542	NC_012985	AAC	2	6	27885	27890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
543	NC_012985	TAA	2	6	27908	27913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
544	NC_012985	ATC	2	6	28077	28082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
545	NC_012985	AGC	2	6	28173	28178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
546	NC_012985	TCA	3	9	28217	28225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
547	NC_012985	A	6	6	28225	28230	100 %	0 %	0 %	0 %	254780143
548	NC_012985	T	6	6	28288	28293	0 %	100 %	0 %	0 %	254780143
549	NC_012985	A	6	6	28296	28301	100 %	0 %	0 %	0 %	254780143
550	NC_012985	TCT	2	6	28496	28501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780144
551	NC_012985	TCATT	2	10	28502	28511	20 %	60 %	0 %	20 %	254780144
552	NC_012985	GC	3	6	28600	28605	0 %	0 %	50 %	50 %	254780144
553	NC_012985	TGA	2	6	28613	28618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780144
554	NC_012985	T	7	7	28625	28631	0 %	100 %	0 %	0 %	254780144
555	NC_012985	ATC	2	6	28638	28643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780144
556	NC_012985	TAC	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780144
557	NC_012985	GCA	2	6	28684	28689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780144
558	NC_012985	GCA	2	6	28702	28707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780144
559	NC_012985	CAA	2	6	28715	28720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780144
560	NC_012985	GCAGAA	2	12	28732	28743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254780144
561	NC_012985	TAAGAG	2	12	28790	28801	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	254780144
562	NC_012985	CAA	2	6	28814	28819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780144
563	NC_012985	AAC	2	6	28929	28934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780145
564	NC_012985	AAG	2	6	28953	28958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780145
565	NC_012985	AAG	2	6	29030	29035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780145
566	NC_012985	CCA	2	6	29083	29088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780145
567	NC_012985	ATT	2	6	29103	29108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780145
568	NC_012985	GACGA	2	10	29232	29241	40 %	0 %	40 %	20 %	254780145
569	NC_012985	CCA	2	6	29263	29268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780145
570	NC_012985	CAA	3	9	29330	29338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780145
571	NC_012985	AGA	3	9	29346	29354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780145
572	NC_012985	A	6	6	29354	29359	100 %	0 %	0 %	0 %	254780145
573	NC_012985	CTTA	2	8	29361	29368	25 %	50 %	0 %	25 %	254780145
574	NC_012985	ACA	2	6	29684	29689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780146
575	NC_012985	T	7	7	29721	29727	0 %	100 %	0 %	0 %	254780146
576	NC_012985	GAAA	2	8	29734	29741	75 %	0 %	25 %	0 %	254780146
577	NC_012985	AAT	2	6	29761	29766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780146
578	NC_012985	CAC	2	6	29796	29801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780146
579	NC_012985	CAG	2	6	29817	29822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780146
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581	NC_012985	ATA	2	6	29864	29869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780146
582	NC_012985	CAT	2	6	29911	29916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780146
583	NC_012985	ATCT	2	8	29944	29951	25 %	50 %	0 %	25 %	254780146
584	NC_012985	TCT	2	6	29978	29983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780146
585	NC_012985	CAA	2	6	29988	29993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780146
586	NC_012985	AAC	2	6	30085	30090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780146
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588	NC_012985	CTG	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780146
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590	NC_012985	CCA	2	6	30319	30324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780147
591	NC_012985	TCAATA	2	12	30339	30350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254780147
592	NC_012985	T	6	6	30461	30466	0 %	100 %	0 %	0 %	254780147
593	NC_012985	A	6	6	30470	30475	100 %	0 %	0 %	0 %	254780147
594	NC_012985	GTAAAA	2	12	30498	30509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254780147
595	NC_012985	AGT	2	6	30533	30538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780147
596	NC_012985	TGGGA	2	10	30539	30548	20 %	20 %	60 %	0 %	254780147
597	NC_012985	CGG	2	6	30638	30643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254780147
598	NC_012985	ACT	2	6	30693	30698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780147
599	NC_012985	TCT	2	6	30805	30810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780148
600	NC_012985	TTC	2	6	30884	30889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780148
601	NC_012985	AAG	2	6	30916	30921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780148
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604	NC_012985	GGAT	2	8	31043	31050	25 %	25 %	50 %	0 %	254780148
605	NC_012985	ACC	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780148
606	NC_012985	CCA	2	6	31260	31265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780148
607	NC_012985	CTT	2	6	31280	31285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780148
608	NC_012985	TA	3	6	31310	31315	50 %	50 %	0 %	0 %	254780148
609	NC_012985	AAAAT	2	10	31368	31377	80 %	20 %	0 %	0 %	254780149
610	NC_012985	A	8	8	31410	31417	100 %	0 %	0 %	0 %	254780149
611	NC_012985	ACA	2	6	31432	31437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780149
612	NC_012985	ATT	2	6	31440	31445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780149
613	NC_012985	ACA	2	6	31446	31451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780149
614	NC_012985	TCT	2	6	31492	31497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780149
615	NC_012985	A	7	7	31520	31526	100 %	0 %	0 %	0 %	254780149
616	NC_012985	TAT	2	6	31788	31793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780150
617	NC_012985	TCC	2	6	31832	31837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780150
618	NC_012985	ATAA	2	8	31880	31887	75 %	25 %	0 %	0 %	254780150
619	NC_012985	CCG	2	6	31966	31971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254780150
620	NC_012985	GTA	2	6	32013	32018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780150
621	NC_012985	ACC	2	6	32021	32026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780150
622	NC_012985	AAC	2	6	32096	32101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780150
623	NC_012985	GAA	2	6	32137	32142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780150
624	NC_012985	CTT	2	6	32222	32227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780150
625	NC_012985	ACC	2	6	32228	32233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780150
626	NC_012985	ATT	2	6	32241	32246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780150
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628	NC_012985	A	6	6	32343	32348	100 %	0 %	0 %	0 %	254780150
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