MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ2

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012657	ACC	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229599880
2	NC_012657	GTCT	2	8	2088	2095	0 %	50 %	25 %	25 %	229599880
3	NC_012657	A	7	7	2140	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	229599880
4	NC_012657	ATTATA	2	12	2185	2196	50 %	50 %	0 %	0 %	229599877
5	NC_012657	TAAA	2	8	2197	2204	75 %	25 %	0 %	0 %	229599877
6	NC_012657	TTTA	2	8	2264	2271	25 %	75 %	0 %	0 %	229599877
7	NC_012657	TACT	2	8	2278	2285	25 %	50 %	0 %	25 %	229599877
8	NC_012657	TAAT	2	8	2293	2300	50 %	50 %	0 %	0 %	229599877
9	NC_012657	TTA	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599877
10	NC_012657	CTG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229599877
11	NC_012657	TAT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599877
12	NC_012657	TAA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599878
13	NC_012657	ATT	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
14	NC_012657	TTA	2	6	4249	4254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
15	NC_012657	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
16	NC_012657	TTA	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
17	NC_012657	TAT	2	6	4344	4349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
18	NC_012657	ATTTTT	2	12	4350	4361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229599878
19	NC_012657	TAA	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599878
20	NC_012657	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
21	NC_012657	T	8	8	4450	4457	0 %	100 %	0 %	0 %	229599878
22	NC_012657	TAT	2	6	4484	4489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
23	NC_012657	TAT	3	9	4499	4507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599878
24	NC_012657	TGT	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229599878
25	NC_012657	TTTA	2	8	4593	4600	25 %	75 %	0 %	0 %	229599878
26	NC_012657	T	6	6	4608	4613	0 %	100 %	0 %	0 %	229599878
27	NC_012657	T	7	7	4634	4640	0 %	100 %	0 %	0 %	229599878
28	NC_012657	TAA	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599878
29	NC_012657	CAC	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229599878
30	NC_012657	TATT	2	8	5107	5114	25 %	75 %	0 %	0 %	229599882
31	NC_012657	CT	3	6	5119	5124	0 %	50 %	0 %	50 %	229599882
32	NC_012657	ATT	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
33	NC_012657	T	6	6	5137	5142	0 %	100 %	0 %	0 %	229599882
34	NC_012657	GTA	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599882
35	NC_012657	TTA	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
36	NC_012657	TAT	2	6	5230	5235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
37	NC_012657	T	6	6	5239	5244	0 %	100 %	0 %	0 %	229599882
38	NC_012657	T	7	7	5256	5262	0 %	100 %	0 %	0 %	229599882
39	NC_012657	CTT	2	6	5280	5285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229599882
40	NC_012657	GTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229599882
41	NC_012657	CTTC	2	8	5358	5365	0 %	50 %	0 %	50 %	229599882
42	NC_012657	CTGA	2	8	5367	5374	25 %	25 %	25 %	25 %	229599882
43	NC_012657	TAA	2	6	5410	5415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
44	NC_012657	ATTT	2	8	5418	5425	25 %	75 %	0 %	0 %	229599882
45	NC_012657	TAAAA	2	10	5434	5443	80 %	20 %	0 %	0 %	229599882
46	NC_012657	TAT	2	6	5469	5474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
47	NC_012657	T	6	6	5485	5490	0 %	100 %	0 %	0 %	229599882
48	NC_012657	TAA	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
49	NC_012657	TTA	2	6	5543	5548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
50	NC_012657	AAT	2	6	5549	5554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
51	NC_012657	CTT	2	6	5574	5579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229599882
52	NC_012657	T	6	6	5629	5634	0 %	100 %	0 %	0 %	229599882
53	NC_012657	TAA	2	6	5644	5649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599882
54	NC_012657	TAT	3	9	5701	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599882
55	NC_012657	AT	3	6	5730	5735	50 %	50 %	0 %	0 %	229599882
56	NC_012657	ATT	2	6	7268	7273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599879
57	NC_012657	GGT	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229599879
58	NC_012657	TAC	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599879
59	NC_012657	TGA	2	6	7417	7422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599879
60	NC_012657	GAT	2	6	7430	7435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229599879
61	NC_012657	A	6	6	7488	7493	100 %	0 %	0 %	0 %	229599879
62	NC_012657	ATT	2	6	7500	7505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599879
63	NC_012657	A	7	7	7571	7577	100 %	0 %	0 %	0 %	229599879
64	NC_012657	GGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229599879
65	NC_012657	AAC	2	6	7746	7751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229599879
66	NC_012657	TAT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599879
67	NC_012657	AAG	2	6	7824	7829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229599879
68	NC_012657	AAT	2	6	7922	7927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599879
69	NC_012657	ATC	2	6	7933	7938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599879
70	NC_012657	TAA	2	6	7941	7946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599879
71	NC_012657	AGG	2	6	7948	7953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229599879
72	NC_012657	AAT	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599879
73	NC_012657	CTA	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599879
74	NC_012657	ACAA	2	8	8114	8121	75 %	0 %	0 %	25 %	229599879
75	NC_012657	TTTC	2	8	8123	8130	0 %	75 %	0 %	25 %	229599879
76	NC_012657	TA	3	6	8768	8773	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
77	NC_012657	ATGA	2	8	8858	8865	50 %	25 %	25 %	0 %	229599881
78	NC_012657	T	7	7	8919	8925	0 %	100 %	0 %	0 %	229599881
79	NC_012657	TAT	2	6	8939	8944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599881
80	NC_012657	TAT	2	6	9048	9053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599881
81	NC_012657	AT	3	6	9052	9057	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
82	NC_012657	TTCTAT	2	12	9078	9089	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	229599881
83	NC_012657	TAA	2	6	9123	9128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599881
84	NC_012657	TA	3	6	9152	9157	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
85	NC_012657	ATT	3	9	9163	9171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229599881
86	NC_012657	ATTT	2	8	9197	9204	25 %	75 %	0 %	0 %	229599881
87	NC_012657	T	6	6	9209	9214	0 %	100 %	0 %	0 %	229599881
88	NC_012657	CAT	2	6	9236	9241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229599881
89	NC_012657	TTTGCT	2	12	9251	9262	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	229599881
90	NC_012657	TAAT	2	8	9289	9296	50 %	50 %	0 %	0 %	229599881
91	NC_012657	AAT	2	6	9310	9315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229599881

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.