MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 6687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	TCT	2	6	119	124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587272
2	NC_012654	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	229587272
3	NC_012654	TAA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
4	NC_012654	TTC	2	6	141	146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587272
5	NC_012654	TCTTT	2	10	182	191	0 %	80 %	0 %	20 %	229587272
6	NC_012654	TCTT	2	8	214	221	0 %	75 %	0 %	25 %	229587272
7	NC_012654	TGT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587272
8	NC_012654	AAT	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
9	NC_012654	TTA	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587272
10	NC_012654	T	7	7	290	296	0 %	100 %	0 %	0 %	229587272
11	NC_012654	TAAA	2	8	299	306	75 %	25 %	0 %	0 %	229587272
12	NC_012654	AAT	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
13	NC_012654	TAA	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
14	NC_012654	TA	3	6	397	402	50 %	50 %	0 %	0 %	229587272
15	NC_012654	T	6	6	891	896	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
16	NC_012654	TTG	2	6	966	971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587273
17	NC_012654	ATA	2	6	986	991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587273
18	NC_012654	ATTT	2	8	1014	1021	25 %	75 %	0 %	0 %	229587273
19	NC_012654	TCT	2	6	1123	1128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587273
20	NC_012654	TA	3	6	1142	1147	50 %	50 %	0 %	0 %	229587273
21	NC_012654	TAG	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587273
22	NC_012654	TA	3	6	1262	1267	50 %	50 %	0 %	0 %	229587273
23	NC_012654	T	7	7	1275	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
24	NC_012654	ATT	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
25	NC_012654	T	6	6	1294	1299	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
26	NC_012654	ATT	2	6	1308	1313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
27	NC_012654	ATT	2	6	1323	1328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
28	NC_012654	TAT	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
29	NC_012654	TAG	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587273
30	NC_012654	TTA	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
31	NC_012654	ATA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587273
32	NC_012654	T	6	6	1434	1439	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
33	NC_012654	AT	3	6	1639	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
34	NC_012654	AT	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
35	NC_012654	TA	3	6	1724	1729	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
36	NC_012654	ATC	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
37	NC_012654	AAT	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587274
38	NC_012654	CTTT	2	8	1820	1827	0 %	75 %	0 %	25 %	229587274
39	NC_012654	ATC	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
40	NC_012654	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587274
41	NC_012654	TTTA	2	8	1883	1890	25 %	75 %	0 %	0 %	229587274
42	NC_012654	AAT	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587274
43	NC_012654	ATC	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
44	NC_012654	ATTA	2	8	3102	3109	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
45	NC_012654	TC	3	6	3120	3125	0 %	50 %	0 %	50 %	229587275
46	NC_012654	CATC	2	8	3126	3133	25 %	25 %	0 %	50 %	229587275
47	NC_012654	CTA	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
48	NC_012654	TAT	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
49	NC_012654	CTA	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
50	NC_012654	TAT	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
51	NC_012654	TGA	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
52	NC_012654	ATT	2	6	3269	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
53	NC_012654	ATTT	2	8	3295	3302	25 %	75 %	0 %	0 %	229587275
54	NC_012654	T	6	6	3318	3323	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
55	NC_012654	TAC	3	9	3332	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
56	NC_012654	T	6	6	3385	3390	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
57	NC_012654	GCCT	2	8	3395	3402	0 %	25 %	25 %	50 %	229587275
58	NC_012654	TAG	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
59	NC_012654	ACT	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
60	NC_012654	AT	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
61	NC_012654	ATT	2	6	3467	3472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
62	NC_012654	T	7	7	3506	3512	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
63	NC_012654	ATA	2	6	3513	3518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
64	NC_012654	TAAA	2	8	3548	3555	75 %	25 %	0 %	0 %	229587275
65	NC_012654	ATT	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
66	NC_012654	ATTT	2	8	3634	3641	25 %	75 %	0 %	0 %	229587275
67	NC_012654	AAT	2	6	3685	3690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
68	NC_012654	TGAT	2	8	3722	3729	25 %	50 %	25 %	0 %	229587275
69	NC_012654	TTA	2	6	3843	3848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
70	NC_012654	TA	3	6	3905	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
71	NC_012654	TAT	2	6	3931	3936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
72	NC_012654	TA	3	6	3965	3970	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
73	NC_012654	AT	3	6	3976	3981	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
74	NC_012654	ACT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
75	NC_012654	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
76	NC_012654	ATT	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
77	NC_012654	TAT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
78	NC_012654	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
79	NC_012654	CATA	2	8	4183	4190	50 %	25 %	0 %	25 %	229587275
80	NC_012654	TAT	2	6	4192	4197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
81	NC_012654	T	6	6	4209	4214	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
82	NC_012654	TAC	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
83	NC_012654	ATTA	2	8	4244	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
84	NC_012654	TA	3	6	4300	4305	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
85	NC_012654	ATC	3	9	4337	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
86	NC_012654	TA	3	6	4348	4353	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
87	NC_012654	AT	3	6	4389	4394	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
88	NC_012654	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
89	NC_012654	T	6	6	4415	4420	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
90	NC_012654	TAT	2	6	4468	4473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
91	NC_012654	TAT	2	6	4519	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
92	NC_012654	AT	4	8	4526	4533	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
93	NC_012654	TAA	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
94	NC_012654	ATTT	2	8	4639	4646	25 %	75 %	0 %	0 %	229587275
95	NC_012654	ATC	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
96	NC_012654	ATT	2	6	4715	4720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
97	NC_012654	TAT	2	6	4757	4762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
98	NC_012654	T	6	6	4796	4801	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
99	NC_012654	T	6	6	4804	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
100	NC_012654	TTA	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
101	NC_012654	CCAA	2	8	4843	4850	50 %	0 %	0 %	50 %	229587275
102	NC_012654	TA	3	6	4859	4864	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
103	NC_012654	TA	3	6	5053	5058	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
104	NC_012654	TA	3	6	5087	5092	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
105	NC_012654	TCA	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
106	NC_012654	TTA	2	6	5211	5216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
107	NC_012654	TA	3	6	5225	5230	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
108	NC_012654	GAA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587275
109	NC_012654	A	7	7	5239	5245	100 %	0 %	0 %	0 %	229587275
110	NC_012654	TAA	2	6	5267	5272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
111	NC_012654	AAT	2	6	5297	5302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
112	NC_012654	TATT	2	8	5355	5362	25 %	75 %	0 %	0 %	229587275
113	NC_012654	T	6	6	5373	5378	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
114	NC_012654	ATA	2	6	5489	5494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
115	NC_012654	TTG	2	6	5495	5500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587275
116	NC_012654	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
117	NC_012654	GCT	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587275
118	NC_012654	TCT	2	6	5559	5564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
119	NC_012654	TCT	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
120	NC_012654	A	6	6	5606	5611	100 %	0 %	0 %	0 %	229587275
121	NC_012654	ATT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
122	NC_012654	TTA	2	6	5655	5660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
123	NC_012654	TTA	2	6	5692	5697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
124	NC_012654	T	6	6	5745	5750	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
125	NC_012654	TTA	3	9	5766	5774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
126	NC_012654	TGC	2	6	5801	5806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587275
127	NC_012654	TTAAA	2	10	5821	5830	60 %	40 %	0 %	0 %	229587275
128	NC_012654	CAT	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
129	NC_012654	A	6	6	5924	5929	100 %	0 %	0 %	0 %	229587275
130	NC_012654	TCA	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
131	NC_012654	ATCT	2	8	5992	5999	25 %	50 %	0 %	25 %	229587275
132	NC_012654	AGT	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
133	NC_012654	CTA	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
134	NC_012654	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
135	NC_012654	TTA	2	6	6132	6137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
136	NC_012654	TAA	2	6	6138	6143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
137	NC_012654	T	6	6	6158	6163	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
138	NC_012654	CTAT	2	8	6171	6178	25 %	50 %	0 %	25 %	229587275
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