MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 94505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012563	AATA	2	8	192	199	75 %	25 %	0 %	0 %	226947223
2	NC_012563	AAGT	2	8	221	228	50 %	25 %	25 %	0 %	226947223
3	NC_012563	AAT	2	6	271	276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
4	NC_012563	TTAC	2	8	361	368	25 %	50 %	0 %	25 %	226947223
5	NC_012563	A	7	7	372	378	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
6	NC_012563	ACT	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
7	NC_012563	GAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
8	NC_012563	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
9	NC_012563	A	7	7	419	425	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
10	NC_012563	ATA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
11	NC_012563	ATG	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
12	NC_012563	CTA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
13	NC_012563	GCA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947223
14	NC_012563	TAGCAG	2	12	548	559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226947223
15	NC_012563	TTTA	2	8	585	592	25 %	75 %	0 %	0 %	226947223
16	NC_012563	TA	3	6	591	596	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
17	NC_012563	TGG	2	6	597	602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226947223
18	NC_012563	ATGC	2	8	628	635	25 %	25 %	25 %	25 %	226947223
19	NC_012563	TA	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
20	NC_012563	AGT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
21	NC_012563	TCT	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226947223
22	NC_012563	AATT	3	12	710	721	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
23	NC_012563	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
24	NC_012563	AAAT	2	8	753	760	75 %	25 %	0 %	0 %	226947223
25	NC_012563	TGA	2	6	786	791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
26	NC_012563	AGAA	2	8	813	820	75 %	0 %	25 %	0 %	226947223
27	NC_012563	AACA	2	8	865	872	75 %	0 %	0 %	25 %	226947223
28	NC_012563	AAT	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
29	NC_012563	AGA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
30	NC_012563	A	6	6	1006	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
31	NC_012563	TA	4	8	1052	1059	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
32	NC_012563	TAA	2	6	1103	1108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
33	NC_012563	TAG	2	6	1112	1117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
34	NC_012563	TCA	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
35	NC_012563	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
36	NC_012563	AAAC	2	8	1192	1199	75 %	0 %	0 %	25 %	226947223
37	NC_012563	ATT	2	6	1219	1224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947223
38	NC_012563	AAG	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
39	NC_012563	TAT	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947223
40	NC_012563	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
41	NC_012563	AGA	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
42	NC_012563	GAA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
43	NC_012563	TAC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
44	NC_012563	TAA	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
45	NC_012563	A	7	7	1431	1437	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
46	NC_012563	TAAA	2	8	1469	1476	75 %	25 %	0 %	0 %	226947223
47	NC_012563	AAAAAT	2	12	1487	1498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947223
48	NC_012563	A	7	7	1773	1779	100 %	0 %	0 %	0 %	226947224
49	NC_012563	TAT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
50	NC_012563	TTA	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
51	NC_012563	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
52	NC_012563	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
53	NC_012563	ATA	2	6	1985	1990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
54	NC_012563	AAAT	2	8	2016	2023	75 %	25 %	0 %	0 %	226947224
55	NC_012563	AGA	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
56	NC_012563	ATA	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
57	NC_012563	AT	4	8	2078	2085	50 %	50 %	0 %	0 %	226947224
58	NC_012563	TAT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
59	NC_012563	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	226947224
60	NC_012563	TAG	2	6	2259	2264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
61	NC_012563	AAG	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
62	NC_012563	GTT	2	6	2300	2305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947224
63	NC_012563	GATAAT	2	12	2306	2317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947224
64	NC_012563	AGA	3	9	2371	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
65	NC_012563	TTTA	2	8	2419	2426	25 %	75 %	0 %	0 %	226947224
66	NC_012563	AAT	2	6	2443	2448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
67	NC_012563	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
68	NC_012563	TTA	2	6	2472	2477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
69	NC_012563	GAA	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
70	NC_012563	ATA	2	6	2516	2521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
71	NC_012563	CT	3	6	2560	2565	0 %	50 %	0 %	50 %	226947224
72	NC_012563	AAG	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
73	NC_012563	GAT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
74	NC_012563	TAA	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
75	NC_012563	GAA	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
76	NC_012563	AGT	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
77	NC_012563	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
78	NC_012563	A	6	6	2797	2802	100 %	0 %	0 %	0 %	226947224
79	NC_012563	AAT	2	6	2852	2857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
80	NC_012563	AATT	2	8	2893	2900	50 %	50 %	0 %	0 %	226947225
81	NC_012563	ATA	2	6	2906	2911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947225
82	NC_012563	TTCT	2	8	2920	2927	0 %	75 %	0 %	25 %	226947225
83	NC_012563	CAA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226947225
84	NC_012563	T	6	6	2969	2974	0 %	100 %	0 %	0 %	226947225
85	NC_012563	AAGTTA	2	12	2988	2999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947225
86	NC_012563	A	6	6	3012	3017	100 %	0 %	0 %	0 %	226947225
87	NC_012563	GAC	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947225
88	NC_012563	TAA	2	6	3058	3063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947225
89	NC_012563	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947225
90	NC_012563	TA	3	6	3167	3172	50 %	50 %	0 %	0 %	226947226
91	NC_012563	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
92	NC_012563	TAA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
93	NC_012563	ATG	2	6	3204	3209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
94	NC_012563	CAAATA	2	12	3231	3242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226947226
95	NC_012563	TAA	2	6	3253	3258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
96	NC_012563	TA	3	6	3289	3294	50 %	50 %	0 %	0 %	226947226
97	NC_012563	ATAAAG	2	12	3327	3338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947226
98	NC_012563	ATA	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
99	NC_012563	AT	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	226947226
100	NC_012563	A	6	6	3437	3442	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
101	NC_012563	TAAA	2	8	3453	3460	75 %	25 %	0 %	0 %	226947226
102	NC_012563	ATAAAA	2	12	3461	3472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947226
103	NC_012563	A	8	8	3469	3476	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
104	NC_012563	TGT	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947226
105	NC_012563	AGA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
106	NC_012563	AAT	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
107	NC_012563	TAT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
108	NC_012563	ATA	2	6	3624	3629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
109	NC_012563	GAAA	2	8	3641	3648	75 %	0 %	25 %	0 %	226947226
110	NC_012563	A	6	6	3658	3663	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
111	NC_012563	ATG	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
112	NC_012563	AG	3	6	3739	3744	50 %	0 %	50 %	0 %	226947226
113	NC_012563	TAAAT	2	10	3760	3769	60 %	40 %	0 %	0 %	226947226
114	NC_012563	ATT	2	6	3770	3775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
115	NC_012563	AAG	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
116	NC_012563	AGA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
117	NC_012563	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
118	NC_012563	A	7	7	3898	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
119	NC_012563	GA	3	6	3911	3916	50 %	0 %	50 %	0 %	226947226
120	NC_012563	GAT	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
121	NC_012563	AAGT	2	8	3954	3961	50 %	25 %	25 %	0 %	226947226
122	NC_012563	ACA	2	6	4000	4005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226947226
123	NC_012563	CAT	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947226
124	NC_012563	ATA	2	6	4046	4051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
125	NC_012563	A	6	6	4051	4056	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
126	NC_012563	ATA	2	6	4058	4063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
127	NC_012563	GAT	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
128	NC_012563	TAA	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
129	NC_012563	AGA	2	6	4180	4185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
130	NC_012563	TAA	2	6	4231	4236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
131	NC_012563	TAAAA	2	10	4240	4249	80 %	20 %	0 %	0 %	226947226
132	NC_012563	TTC	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226947227
133	NC_012563	GTA	3	9	4303	4311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947227
134	NC_012563	GGAT	2	8	4398	4405	25 %	25 %	50 %	0 %	226947227
135	NC_012563	TTG	2	6	4406	4411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947227
136	NC_012563	AT	3	6	4474	4479	50 %	50 %	0 %	0 %	226947227
137	NC_012563	ATG	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
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