MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20009	NC_012032	ACCA	2	8	1276645	1276652	50 %	0 %	0 %	50 %	222524274
20010	NC_012032	TGG	2	6	1276710	1276715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524274
20011	NC_012032	CAGT	2	8	1276757	1276764	25 %	25 %	25 %	25 %	222524274
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20116	NC_012032	TC	3	6	1282247	1282252	0 %	50 %	0 %	50 %	222524282
20117	NC_012032	TCC	2	6	1282309	1282314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524282
20118	NC_012032	TTATCG	2	12	1282357	1282368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222524282
20119	NC_012032	GTCATT	2	12	1282371	1282382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222524282
20120	NC_012032	AGT	2	6	1282389	1282394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524282
20121	NC_012032	GGT	2	6	1282547	1282552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524283
20122	NC_012032	ATG	2	6	1282598	1282603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524283
20123	NC_012032	CGC	2	6	1282606	1282611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524283
20124	NC_012032	CTG	2	6	1282626	1282631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524283
20125	NC_012032	GTG	2	6	1282639	1282644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524283
20126	NC_012032	GAT	2	6	1282661	1282666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524283
20127	NC_012032	AG	3	6	1282687	1282692	50 %	0 %	50 %	0 %	222524283
20128	NC_012032	CTG	2	6	1282697	1282702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524283
20129	NC_012032	TGG	2	6	1282714	1282719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524283
20130	NC_012032	GTGC	2	8	1282739	1282746	0 %	25 %	50 %	25 %	222524283
20131	NC_012032	GCT	2	6	1282852	1282857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524283
20132	NC_012032	C	6	6	1282899	1282904	0 %	0 %	0 %	100 %	222524283
20133	NC_012032	TG	3	6	1282951	1282956	0 %	50 %	50 %	0 %	222524283
20134	NC_012032	GCT	2	6	1283080	1283085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524283
20135	NC_012032	CAT	3	9	1283098	1283106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524283
20136	NC_012032	GGC	2	6	1283110	1283115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524283
20137	NC_012032	TGGCC	2	10	1283197	1283206	0 %	20 %	40 %	40 %	222524283
20138	NC_012032	CCTGG	2	10	1283224	1283233	0 %	20 %	40 %	40 %	222524283
20139	NC_012032	TTG	2	6	1283285	1283290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524283
20140	NC_012032	CAG	2	6	1283305	1283310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524283
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20142	NC_012032	CTG	2	6	1283370	1283375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524283
20143	NC_012032	CGG	2	6	1283382	1283387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524283
20144	NC_012032	TGG	3	9	1283392	1283400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524283
20145	NC_012032	TTG	2	6	1283429	1283434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524283
20146	NC_012032	GAT	2	6	1283462	1283467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524283
20147	NC_012032	AGT	2	6	1283494	1283499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524283
20148	NC_012032	CTT	2	6	1283518	1283523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524283
20149	NC_012032	TGG	3	9	1283537	1283545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524283
20150	NC_012032	GCA	2	6	1283573	1283578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524283
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20152	NC_012032	GGTT	2	8	1283720	1283727	0 %	50 %	50 %	0 %	222524283
20153	NC_012032	TGGCA	2	10	1283826	1283835	20 %	20 %	40 %	20 %	222524283
20154	NC_012032	ATT	2	6	1283866	1283871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524283
20155	NC_012032	GCT	4	12	1283873	1283884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524283
20156	NC_012032	GTC	2	6	1283909	1283914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524283
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20167	NC_012032	ACC	2	6	1285836	1285841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524284
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20170	NC_012032	TGT	2	6	1286432	1286437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524285
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20202	NC_012032	GAT	2	6	1288226	1288231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524287
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20209	NC_012032	AT	3	6	1288626	1288631	50 %	50 %	0 %	0 %	222524288
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20215	NC_012032	CTGG	2	8	1288826	1288833	0 %	25 %	50 %	25 %	222524288
20216	NC_012032	CAGC	2	8	1288913	1288920	25 %	0 %	25 %	50 %	222524288
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20218	NC_012032	GTG	2	6	1288940	1288945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524288
20219	NC_012032	CACC	2	8	1288955	1288962	25 %	0 %	0 %	75 %	222524288
20220	NC_012032	CGC	2	6	1289022	1289027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524288
20221	NC_012032	AGCA	2	8	1289045	1289052	50 %	0 %	25 %	25 %	222524288
20222	NC_012032	GCT	2	6	1289110	1289115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524288
20223	NC_012032	CAG	2	6	1289150	1289155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524288
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20227	NC_012032	GCA	2	6	1289433	1289438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524289
20228	NC_012032	GC	3	6	1289496	1289501	0 %	0 %	50 %	50 %	222524289
20229	NC_012032	CCG	2	6	1289522	1289527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524289
20230	NC_012032	GCG	2	6	1289532	1289537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524289
20231	NC_012032	ACC	2	6	1289540	1289545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524289
20232	NC_012032	AGG	2	6	1289550	1289555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524289
20233	NC_012032	CGCCTG	2	12	1289558	1289569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222524289
20234	NC_012032	CGC	2	6	1289574	1289579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524289
20235	NC_012032	GCG	2	6	1289668	1289673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524289
20236	NC_012032	TCCG	2	8	1289689	1289696	0 %	25 %	25 %	50 %	222524289
20237	NC_012032	AGCC	2	8	1289714	1289721	25 %	0 %	25 %	50 %	222524289
20238	NC_012032	GCA	2	6	1289800	1289805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524289
20239	NC_012032	CAC	2	6	1289806	1289811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524289
20240	NC_012032	GCA	3	9	1289826	1289834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524289
20241	NC_012032	CAG	2	6	1289987	1289992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524289
20242	NC_012032	TGG	2	6	1290008	1290013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524289
20243	NC_012032	CGG	2	6	1290014	1290019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524289
20244	NC_012032	GCCAT	2	10	1290091	1290100	20 %	20 %	20 %	40 %	222524289
20245	NC_012032	TGCA	2	8	1290167	1290174	25 %	25 %	25 %	25 %	222524289
20246	NC_012032	ACA	2	6	1290306	1290311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524289
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20249	NC_012032	GCA	2	6	1290345	1290350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524289
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20252	NC_012032	ATC	2	6	1290575	1290580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524290
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20258	NC_012032	CGC	2	6	1290965	1290970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524290
20259	NC_012032	CTT	2	6	1290985	1290990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524290
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20347	NC_012032	AT	3	6	1295423	1295428	50 %	50 %	0 %	0 %	222524293
20348	NC_012032	CTG	3	9	1295458	1295466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524293
20349	NC_012032	GGT	2	6	1295472	1295477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524293
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20461	NC_012032	GCC	2	6	1301888	1301893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524299
20462	NC_012032	TCGT	2	8	1301929	1301936	0 %	50 %	25 %	25 %	222524299
20463	NC_012032	GGC	2	6	1301938	1301943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524299
20464	NC_012032	GTA	2	6	1301989	1301994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524299
20465	NC_012032	GCC	2	6	1302204	1302209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524300
20466	NC_012032	CCAG	2	8	1302246	1302253	25 %	0 %	25 %	50 %	222524300
20467	NC_012032	CCG	2	6	1302297	1302302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524300
20468	NC_012032	CAT	2	6	1302308	1302313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524300
20469	NC_012032	CAC	2	6	1302380	1302385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524300
20470	NC_012032	ATC	2	6	1302392	1302397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524300
20471	NC_012032	CAC	2	6	1302607	1302612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524300
20472	NC_012032	CAT	2	6	1302614	1302619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524300
20473	NC_012032	TCAC	2	8	1302849	1302856	25 %	25 %	0 %	50 %	222524300
20474	NC_012032	CAC	2	6	1302871	1302876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524300
20475	NC_012032	GCT	2	6	1302877	1302882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524300
20476	NC_012032	TCA	2	6	1302885	1302890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524300
20477	NC_012032	CCA	2	6	1303056	1303061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524300
20478	NC_012032	AAT	2	6	1303073	1303078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524300
20479	NC_012032	GTTC	2	8	1303088	1303095	0 %	50 %	25 %	25 %	222524300
20480	NC_012032	ACC	2	6	1303109	1303114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524300
20481	NC_012032	AGG	2	6	1303212	1303217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524300
20482	NC_012032	GCCA	2	8	1303237	1303244	25 %	0 %	25 %	50 %	222524300
20483	NC_012032	TCA	2	6	1303363	1303368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524300
20484	NC_012032	TCA	2	6	1303377	1303382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524300
20485	NC_012032	TAA	2	6	1303495	1303500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524300
20486	NC_012032	GAA	2	6	1303511	1303516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524300
20487	NC_012032	GAA	2	6	1303529	1303534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524300
20488	NC_012032	ACC	2	6	1303760	1303765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524300
20489	NC_012032	CCCAG	2	10	1303864	1303873	20 %	0 %	20 %	60 %	222524300
20490	NC_012032	CCG	2	6	1303893	1303898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524300
20491	NC_012032	GCC	2	6	1303929	1303934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524300
20492	NC_012032	CGC	2	6	1303977	1303982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524300
20493	NC_012032	G	6	6	1304046	1304051	0 %	0 %	100 %	0 %	222524300
20494	NC_012032	ATC	2	6	1304058	1304063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524300
20495	NC_012032	AAC	2	6	1304198	1304203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524300
20496	NC_012032	GAA	3	9	1304324	1304332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524300
20497	NC_012032	GCG	2	6	1304378	1304383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524300
20498	NC_012032	CGC	2	6	1304435	1304440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524300
20499	NC_012032	AGG	2	6	1304541	1304546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524300
20500	NC_012032	ATC	2	6	1304700	1304705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524301

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