MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_012032	CGT	2	6	1248160	1248165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19502	NC_012032	TCT	2	6	1248166	1248171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524251
19503	NC_012032	CCAG	2	8	1248229	1248236	25 %	0 %	25 %	50 %	222524251
19504	NC_012032	GCG	2	6	1248253	1248258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524251
19505	NC_012032	GCG	2	6	1248283	1248288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524251
19506	NC_012032	TGG	2	6	1248305	1248310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524251
19507	NC_012032	CAG	2	6	1248398	1248403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19508	NC_012032	GTT	2	6	1248462	1248467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524251
19509	NC_012032	AGC	2	6	1248489	1248494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19510	NC_012032	CAT	2	6	1248529	1248534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524251
19511	NC_012032	TGT	2	6	1248558	1248563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524251
19512	NC_012032	CGC	2	6	1248564	1248569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524251
19513	NC_012032	GCC	2	6	1248594	1248599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524251
19514	NC_012032	CAG	2	6	1248617	1248622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19515	NC_012032	CTG	2	6	1248639	1248644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19516	NC_012032	ACA	2	6	1248658	1248663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524251
19517	NC_012032	CT	4	8	1248664	1248671	0 %	50 %	0 %	50 %	222524251
19518	NC_012032	CAC	2	6	1248688	1248693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524251
19519	NC_012032	ATCGC	2	10	1248717	1248726	20 %	20 %	20 %	40 %	222524251
19520	NC_012032	CGA	2	6	1248730	1248735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19521	NC_012032	CGC	2	6	1248860	1248865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524251
19522	NC_012032	TC	4	8	1248875	1248882	0 %	50 %	0 %	50 %	222524251
19523	NC_012032	CTT	2	6	1248902	1248907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524251
19524	NC_012032	TCC	2	6	1248958	1248963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524251
19525	NC_012032	GAA	2	6	1248977	1248982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524251
19526	NC_012032	GCG	3	9	1249005	1249013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524251
19527	NC_012032	GCG	2	6	1249017	1249022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524251
19528	NC_012032	CAG	2	6	1249055	1249060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19529	NC_012032	CGG	2	6	1249061	1249066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524251
19530	NC_012032	TGA	2	6	1249114	1249119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524251
19531	NC_012032	GCG	2	6	1249165	1249170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524251
19532	NC_012032	CAG	2	6	1249192	1249197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19533	NC_012032	ACC	2	6	1249212	1249217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524251
19534	NC_012032	GGC	2	6	1249257	1249262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524251
19535	NC_012032	GTC	3	9	1249266	1249274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19536	NC_012032	GCT	2	6	1249282	1249287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524251
19537	NC_012032	AAC	2	6	1249314	1249319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524251
19538	NC_012032	GT	3	6	1250142	1250147	0 %	50 %	50 %	0 %	222524252
19539	NC_012032	CCG	2	6	1250290	1250295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524252
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19541	NC_012032	GAT	2	6	1250388	1250393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524252
19542	NC_012032	GT	3	6	1250457	1250462	0 %	50 %	50 %	0 %	222524252
19543	NC_012032	GCA	2	6	1250475	1250480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524252
19544	NC_012032	ATG	2	6	1250514	1250519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524252
19545	NC_012032	ATC	2	6	1250610	1250615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524253
19546	NC_012032	CTG	2	6	1250617	1250622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524253
19547	NC_012032	AC	3	6	1250624	1250629	50 %	0 %	0 %	50 %	222524253
19548	NC_012032	GAGGG	2	10	1250672	1250681	20 %	0 %	80 %	0 %	222524253
19549	NC_012032	GTTC	2	8	1250723	1250730	0 %	50 %	25 %	25 %	222524253
19550	NC_012032	GCC	2	6	1250754	1250759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524253
19551	NC_012032	GC	3	6	1250813	1250818	0 %	0 %	50 %	50 %	222524253
19552	NC_012032	GC	4	8	1250824	1250831	0 %	0 %	50 %	50 %	222524253
19553	NC_012032	TCA	2	6	1250861	1250866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524253
19554	NC_012032	ACC	2	6	1251203	1251208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524254
19555	NC_012032	GCG	2	6	1251219	1251224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524254
19556	NC_012032	TCA	2	6	1251285	1251290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524254
19557	NC_012032	ATC	2	6	1251301	1251306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524254
19558	NC_012032	TCG	2	6	1251332	1251337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524254
19559	NC_012032	CGTGCC	2	12	1251350	1251361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222524254
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19565	NC_012032	CGG	2	6	1251740	1251745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524255
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19569	NC_012032	GAA	2	6	1251839	1251844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524255
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19579	NC_012032	CGA	2	6	1252370	1252375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524255
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19583	NC_012032	AATC	2	8	1252576	1252583	50 %	25 %	0 %	25 %	222524256
19584	NC_012032	CCAC	2	8	1252593	1252600	25 %	0 %	0 %	75 %	222524256
19585	NC_012032	CAG	2	6	1252625	1252630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524256
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19587	NC_012032	CAT	2	6	1252690	1252695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524256
19588	NC_012032	CAC	2	6	1252703	1252708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524256
19589	NC_012032	CGT	2	6	1252731	1252736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524256
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19591	NC_012032	CAGC	2	8	1253026	1253033	25 %	0 %	25 %	50 %	222524256
19592	NC_012032	AGC	2	6	1253055	1253060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524256
19593	NC_012032	GGGCC	2	10	1253104	1253113	0 %	0 %	60 %	40 %	222524256
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19597	NC_012032	GCA	2	6	1253329	1253334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524256
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19601	NC_012032	AG	3	6	1253528	1253533	50 %	0 %	50 %	0 %	222524256
19602	NC_012032	CCCGG	2	10	1253543	1253552	0 %	0 %	40 %	60 %	222524256
19603	NC_012032	CT	3	6	1253571	1253576	0 %	50 %	0 %	50 %	222524256
19604	NC_012032	GCA	2	6	1253578	1253583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524256
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19606	NC_012032	CGT	2	6	1253783	1253788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524256
19607	NC_012032	TCA	2	6	1253824	1253829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524256
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19613	NC_012032	CGG	2	6	1254052	1254057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524256
19614	NC_012032	GCA	3	9	1254216	1254224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524256
19615	NC_012032	CAC	2	6	1254235	1254240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524256
19616	NC_012032	GAA	2	6	1254279	1254284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524256
19617	NC_012032	TGA	2	6	1254293	1254298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524256
19618	NC_012032	AG	3	6	1254380	1254385	50 %	0 %	50 %	0 %	222524257
19619	NC_012032	CAG	2	6	1254432	1254437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524257
19620	NC_012032	CTT	2	6	1254573	1254578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524257
19621	NC_012032	GGC	3	9	1254612	1254620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524257
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19623	NC_012032	CAG	2	6	1254648	1254653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524257
19624	NC_012032	CCA	2	6	1254667	1254672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524257
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19630	NC_012032	AAC	2	6	1255080	1255085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524257
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19632	NC_012032	GCCTT	2	10	1255180	1255189	0 %	40 %	20 %	40 %	222524257
19633	NC_012032	GCCA	2	8	1255243	1255250	25 %	0 %	25 %	50 %	222524257
19634	NC_012032	GTC	2	6	1255258	1255263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524257
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19659	NC_012032	GATC	2	8	1256860	1256867	25 %	25 %	25 %	25 %	222524259
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19730	NC_012032	CTG	2	6	1261285	1261290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524264
19731	NC_012032	GCA	2	6	1261302	1261307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524264
19732	NC_012032	GCC	2	6	1261325	1261330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524264
19733	NC_012032	CGC	2	6	1261367	1261372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524264
19734	NC_012032	CTGGC	2	10	1261400	1261409	0 %	20 %	40 %	40 %	222524264
19735	NC_012032	GAGC	2	8	1261410	1261417	25 %	0 %	50 %	25 %	222524264
19736	NC_012032	CTG	2	6	1261454	1261459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524264
19737	NC_012032	CGCT	2	8	1261475	1261482	0 %	25 %	25 %	50 %	222524264
19738	NC_012032	GTT	2	6	1261503	1261508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524264
19739	NC_012032	GCT	2	6	1261591	1261596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524264
19740	NC_012032	TCA	2	6	1261652	1261657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524264
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19742	NC_012032	TCA	2	6	1261679	1261684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524264
19743	NC_012032	CGT	2	6	1261691	1261696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524264
19744	NC_012032	GTT	2	6	1261699	1261704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524264
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19749	NC_012032	GCCC	2	8	1261964	1261971	0 %	0 %	25 %	75 %	222524264
19750	NC_012032	CGC	2	6	1262017	1262022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524264
19751	NC_012032	GC	3	6	1262159	1262164	0 %	0 %	50 %	50 %	222524264
19752	NC_012032	TCA	2	6	1262195	1262200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524264
19753	NC_012032	GTC	2	6	1262221	1262226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524264
19754	NC_012032	GCC	2	6	1262244	1262249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524264
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19758	NC_012032	ATG	2	6	1262468	1262473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524264
19759	NC_012032	CCT	2	6	1262493	1262498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524264
19760	NC_012032	GCA	2	6	1262562	1262567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524264
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19841	NC_012032	C	6	6	1266564	1266569	0 %	0 %	0 %	100 %	222524267
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19847	NC_012032	TCA	2	6	1266988	1266993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524268
19848	NC_012032	GAC	2	6	1266995	1267000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524268
19849	NC_012032	CCG	2	6	1267029	1267034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524268
19850	NC_012032	CGT	2	6	1267453	1267458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524269
19851	NC_012032	CTG	2	6	1267462	1267467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524269
19852	NC_012032	TCCA	2	8	1267646	1267653	25 %	25 %	0 %	50 %	222524269
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19854	NC_012032	GTGC	2	8	1267915	1267922	0 %	25 %	50 %	25 %	222524269
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19866	NC_012032	GTTG	2	8	1268358	1268365	0 %	50 %	50 %	0 %	222524270
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19948	NC_012032	ATCGT	2	10	1273679	1273688	20 %	40 %	20 %	20 %	222524272
19949	NC_012032	CGT	2	6	1273724	1273729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524272
19950	NC_012032	GCC	2	6	1273849	1273854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524272
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19952	NC_012032	GCG	2	6	1273919	1273924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524272
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19954	NC_012032	CAT	2	6	1273969	1273974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524272
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19957	NC_012032	CAG	2	6	1274110	1274115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524272
19958	NC_012032	AGG	2	6	1274256	1274261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524272
19959	NC_012032	GCCA	2	8	1274283	1274290	25 %	0 %	25 %	50 %	222524272
19960	NC_012032	TGC	2	6	1274326	1274331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524272
19961	NC_012032	CGA	2	6	1274431	1274436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524273
19962	NC_012032	GT	3	6	1274451	1274456	0 %	50 %	50 %	0 %	222524273
19963	NC_012032	CAA	2	6	1274677	1274682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524273
19964	NC_012032	TCA	2	6	1274737	1274742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524273
19965	NC_012032	CGG	2	6	1274798	1274803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524273
19966	NC_012032	TCT	2	6	1274853	1274858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524273
19967	NC_012032	GCTG	2	8	1274925	1274932	0 %	25 %	50 %	25 %	222524273
19968	NC_012032	GAA	2	6	1274939	1274944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524273
19969	NC_012032	A	6	6	1274943	1274948	100 %	0 %	0 %	0 %	222524273
19970	NC_012032	GGT	2	6	1275069	1275074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524273
19971	NC_012032	TGA	2	6	1275109	1275114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524273
19972	NC_012032	GAT	2	6	1275131	1275136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524273
19973	NC_012032	ATCAAG	2	12	1275143	1275154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222524273
19974	NC_012032	CGG	2	6	1275173	1275178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524273
19975	NC_012032	TTG	2	6	1275195	1275200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524273
19976	NC_012032	TGG	2	6	1275226	1275231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524273
19977	NC_012032	CGTGAT	2	12	1275353	1275364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222524273
19978	NC_012032	ACCT	2	8	1275371	1275378	25 %	25 %	0 %	50 %	222524273
19979	NC_012032	TTGA	2	8	1275394	1275401	25 %	50 %	25 %	0 %	222524273
19980	NC_012032	GCA	2	6	1275402	1275407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524273
19981	NC_012032	CAA	2	6	1275422	1275427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524273
19982	NC_012032	CAG	2	6	1275447	1275452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524273
19983	NC_012032	GAT	2	6	1275472	1275477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524273
19984	NC_012032	CCAT	2	8	1275565	1275572	25 %	25 %	0 %	50 %	222524274
19985	NC_012032	C	6	6	1275585	1275590	0 %	0 %	0 %	100 %	222524274
19986	NC_012032	ATG	2	6	1275592	1275597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524274
19987	NC_012032	CTT	2	6	1275620	1275625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524274
19988	NC_012032	TGA	2	6	1275626	1275631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524274
19989	NC_012032	GCA	2	6	1275673	1275678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524274
19990	NC_012032	CGC	2	6	1275690	1275695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524274
19991	NC_012032	GGTGG	2	10	1275721	1275730	0 %	20 %	80 %	0 %	222524274
19992	NC_012032	GGGC	2	8	1275778	1275785	0 %	0 %	75 %	25 %	222524274
19993	NC_012032	TTG	2	6	1275802	1275807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524274
19994	NC_012032	CAG	2	6	1275811	1275816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524274
19995	NC_012032	CTC	2	6	1275984	1275989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524274
19996	NC_012032	TGC	2	6	1276000	1276005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524274
19997	NC_012032	GCT	2	6	1276041	1276046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524274
19998	NC_012032	CTG	2	6	1276157	1276162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524274
19999	NC_012032	TTG	2	6	1276200	1276205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524274
20000	NC_012032	CCACG	2	10	1276209	1276218	20 %	0 %	20 %	60 %	222524274

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