MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_012032	CGG	2	6	1182687	1182692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524217
18502	NC_012032	TGGCCC	2	12	1182740	1182751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222524217
18503	NC_012032	GGT	2	6	1182760	1182765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524217
18504	NC_012032	ACA	2	6	1182843	1182848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524217
18505	NC_012032	GTG	2	6	1182947	1182952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524217
18506	NC_012032	CCG	2	6	1182978	1182983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524217
18507	NC_012032	AGC	2	6	1183041	1183046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524217
18508	NC_012032	CGC	2	6	1183073	1183078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524217
18509	NC_012032	GAA	2	6	1183103	1183108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524217
18510	NC_012032	ACC	2	6	1183161	1183166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524217
18511	NC_012032	CAA	2	6	1183231	1183236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524217
18512	NC_012032	GTTG	2	8	1183295	1183302	0 %	50 %	50 %	0 %	222524217
18513	NC_012032	CAC	2	6	1183328	1183333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524217
18514	NC_012032	CGG	2	6	1183358	1183363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524217
18515	NC_012032	CGG	2	6	1183435	1183440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524217
18516	NC_012032	GCA	2	6	1183504	1183509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524217
18517	NC_012032	GA	4	8	1183513	1183520	50 %	0 %	50 %	0 %	222524217
18518	NC_012032	AAC	2	6	1183718	1183723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524217
18519	NC_012032	TCT	2	6	1183779	1183784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524217
18520	NC_012032	CAC	2	6	1183953	1183958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524218
18521	NC_012032	TGG	2	6	1184044	1184049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524218
18522	NC_012032	CAT	2	6	1184191	1184196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524219
18523	NC_012032	GTC	2	6	1184245	1184250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524219
18524	NC_012032	GCG	2	6	1184265	1184270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524219
18525	NC_012032	TGG	2	6	1184303	1184308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524219
18526	NC_012032	CTC	2	6	1184356	1184361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524219
18527	NC_012032	CAC	2	6	1184401	1184406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524219
18528	NC_012032	CCT	2	6	1184430	1184435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524219
18529	NC_012032	CGC	2	6	1184447	1184452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524219
18530	NC_012032	GTC	2	6	1184455	1184460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524219
18531	NC_012032	GGC	2	6	1184538	1184543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524219
18532	NC_012032	ATT	2	6	1184548	1184553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524219
18533	NC_012032	CCA	2	6	1184555	1184560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524219
18534	NC_012032	GTG	2	6	1184617	1184622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524219
18535	NC_012032	CTA	2	6	1184724	1184729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524219
18536	NC_012032	GCCCTG	2	12	1184755	1184766	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222524219
18537	NC_012032	ATT	2	6	1184785	1184790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524219
18538	NC_012032	CGG	2	6	1184793	1184798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524219
18539	NC_012032	CT	3	6	1184903	1184908	0 %	50 %	0 %	50 %	222524219
18540	NC_012032	GC	3	6	1184944	1184949	0 %	0 %	50 %	50 %	222524219
18541	NC_012032	GCC	2	6	1185069	1185074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524219
18542	NC_012032	CCA	2	6	1185082	1185087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524219
18543	NC_012032	GCGGGC	2	12	1185129	1185140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524219
18544	NC_012032	CGA	2	6	1185405	1185410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524220
18545	NC_012032	CGG	2	6	1185477	1185482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524220
18546	NC_012032	GTG	2	6	1185629	1185634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524220
18547	NC_012032	ACA	2	6	1185641	1185646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524220
18548	NC_012032	TGC	2	6	1185659	1185664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524220
18549	NC_012032	TGGC	2	8	1185685	1185692	0 %	25 %	50 %	25 %	222524220
18550	NC_012032	GAA	2	6	1185739	1185744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524220
18551	NC_012032	CGG	2	6	1185767	1185772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524220
18552	NC_012032	CCT	2	6	1185792	1185797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524220
18553	NC_012032	AACG	2	8	1185841	1185848	50 %	0 %	25 %	25 %	222524220
18554	NC_012032	TGG	2	6	1185893	1185898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524220
18555	NC_012032	CTC	2	6	1185924	1185929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524220
18556	NC_012032	AC	3	6	1185980	1185985	50 %	0 %	0 %	50 %	222524220
18557	NC_012032	C	6	6	1186039	1186044	0 %	0 %	0 %	100 %	222524220
18558	NC_012032	GCC	2	6	1186048	1186053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524220
18559	NC_012032	ACC	2	6	1186069	1186074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524220
18560	NC_012032	CCAA	2	8	1186078	1186085	50 %	0 %	0 %	50 %	222524220
18561	NC_012032	GAA	2	6	1186090	1186095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524220
18562	NC_012032	GCC	2	6	1186157	1186162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524220
18563	NC_012032	AACC	2	8	1186172	1186179	50 %	0 %	0 %	50 %	222524220
18564	NC_012032	GCA	2	6	1186220	1186225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524220
18565	NC_012032	GC	4	8	1186246	1186253	0 %	0 %	50 %	50 %	222524220
18566	NC_012032	ATT	2	6	1186351	1186356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524220
18567	NC_012032	TGGG	2	8	1186361	1186368	0 %	25 %	75 %	0 %	222524220
18568	NC_012032	CCA	2	6	1186463	1186468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524220
18569	NC_012032	GTG	2	6	1186526	1186531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524220
18570	NC_012032	CG	3	6	1186553	1186558	0 %	0 %	50 %	50 %	222524220
18571	NC_012032	CGAA	2	8	1186568	1186575	50 %	0 %	25 %	25 %	222524220
18572	NC_012032	ACT	2	6	1186592	1186597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524220
18573	NC_012032	CAA	2	6	1187118	1187123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524221
18574	NC_012032	CAG	2	6	1187145	1187150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524221
18575	NC_012032	CAC	2	6	1187315	1187320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524221
18576	NC_012032	AGC	2	6	1187323	1187328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524221
18577	NC_012032	CGT	2	6	1187355	1187360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524221
18578	NC_012032	CAT	2	6	1187417	1187422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524221
18579	NC_012032	ACC	2	6	1187451	1187456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524221
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18581	NC_012032	GC	3	6	1187509	1187514	0 %	0 %	50 %	50 %	222524221
18582	NC_012032	CGG	2	6	1187549	1187554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524221
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18584	NC_012032	TGC	2	6	1187607	1187612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524221
18585	NC_012032	CT	3	6	1187626	1187631	0 %	50 %	0 %	50 %	222524221
18586	NC_012032	CCGTA	2	10	1187634	1187643	20 %	20 %	20 %	40 %	222524221
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18588	NC_012032	CGC	2	6	1187724	1187729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524221
18589	NC_012032	ACC	2	6	1187806	1187811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524221
18590	NC_012032	CAC	2	6	1187814	1187819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524221
18591	NC_012032	TGG	2	6	1187853	1187858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524221
18592	NC_012032	CCG	2	6	1187879	1187884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524221
18593	NC_012032	TCGCC	2	10	1187984	1187993	0 %	20 %	20 %	60 %	222524221
18594	NC_012032	CAAC	2	8	1188001	1188008	50 %	0 %	0 %	50 %	222524221
18595	NC_012032	GACC	2	8	1188017	1188024	25 %	0 %	25 %	50 %	222524221
18596	NC_012032	GGTT	2	8	1188027	1188034	0 %	50 %	50 %	0 %	222524221
18597	NC_012032	TGA	2	6	1188173	1188178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524221
18598	NC_012032	CAG	2	6	1188204	1188209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524221
18599	NC_012032	AGCC	2	8	1188226	1188233	25 %	0 %	25 %	50 %	222524221
18600	NC_012032	GCG	2	6	1188320	1188325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524221
18601	NC_012032	CCT	2	6	1188383	1188388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524221
18602	NC_012032	ATC	2	6	1188400	1188405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524221
18603	NC_012032	CGG	3	9	1188422	1188430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524221
18604	NC_012032	CAA	2	6	1188560	1188565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524221
18605	NC_012032	ACC	2	6	1188640	1188645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524221
18606	NC_012032	CCG	2	6	1188652	1188657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524221
18607	NC_012032	CGGT	2	8	1188674	1188681	0 %	25 %	50 %	25 %	222524221
18608	NC_012032	AGCACC	2	12	1188763	1188774	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222524221
18609	NC_012032	CAC	2	6	1188801	1188806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524221
18610	NC_012032	TCA	2	6	1188827	1188832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524221
18611	NC_012032	GCCAGC	2	12	1188907	1188918	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222524221
18612	NC_012032	CGG	2	6	1189021	1189026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524221
18613	NC_012032	CGT	2	6	1189182	1189187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524221
18614	NC_012032	ATCC	2	8	1189242	1189249	25 %	25 %	0 %	50 %	222524221
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18616	NC_012032	ATGAAA	2	12	1189360	1189371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222524222
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18730	NC_012032	GC	3	6	1201559	1201564	0 %	0 %	50 %	50 %	222524226
18731	NC_012032	GGC	2	6	1201634	1201639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524226
18732	NC_012032	AGC	2	6	1201734	1201739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524226
18733	NC_012032	GC	3	6	1201803	1201808	0 %	0 %	50 %	50 %	222524226
18734	NC_012032	GGC	2	6	1201849	1201854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524226
18735	NC_012032	TCT	2	6	1201888	1201893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524226
18736	NC_012032	CGA	2	6	1202067	1202072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524226
18737	NC_012032	ATCA	2	8	1202078	1202085	50 %	25 %	0 %	25 %	222524226
18738	NC_012032	GCA	2	6	1202104	1202109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524226
18739	NC_012032	GAT	2	6	1202129	1202134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524226
18740	NC_012032	GCA	2	6	1202275	1202280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524226
18741	NC_012032	ATC	2	6	1202289	1202294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524226
18742	NC_012032	CCA	2	6	1202329	1202334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524226
18743	NC_012032	CTT	2	6	1202354	1202359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524226
18744	NC_012032	CCG	2	6	1202360	1202365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524226
18745	NC_012032	TTC	2	6	1202399	1202404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524226
18746	NC_012032	CGCAC	2	10	1202445	1202454	20 %	0 %	20 %	60 %	222524226
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18749	NC_012032	GAT	2	6	1202584	1202589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524226
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18754	NC_012032	CTT	2	6	1202908	1202913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524226
18755	NC_012032	TCT	2	6	1203016	1203021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524226
18756	NC_012032	CGA	2	6	1203024	1203029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524226
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18758	NC_012032	TCT	2	6	1203075	1203080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524226
18759	NC_012032	ATG	2	6	1203093	1203098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524226
18760	NC_012032	CGAAG	2	10	1203101	1203110	40 %	0 %	40 %	20 %	222524226
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18762	NC_012032	TTGG	2	8	1203333	1203340	0 %	50 %	50 %	0 %	222524226
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18773	NC_012032	GCT	2	6	1204146	1204151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524227
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18829	NC_012032	AAGA	2	8	1207087	1207094	75 %	0 %	25 %	0 %	222524227
18830	NC_012032	GGT	2	6	1207117	1207122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524227
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18842	NC_012032	CCGC	2	8	1208385	1208392	0 %	0 %	25 %	75 %	222524228
18843	NC_012032	GTC	2	6	1208477	1208482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524228
18844	NC_012032	GCG	2	6	1208560	1208565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524228
18845	NC_012032	AG	3	6	1208581	1208586	50 %	0 %	50 %	0 %	222524228
18846	NC_012032	GGCCAG	2	12	1208603	1208614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222524228
18847	NC_012032	TGA	2	6	1208629	1208634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524228
18848	NC_012032	GAC	2	6	1208719	1208724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524228
18849	NC_012032	TGA	2	6	1208728	1208733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524228
18850	NC_012032	CGG	2	6	1208767	1208772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524228
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18852	NC_012032	AG	3	6	1208834	1208839	50 %	0 %	50 %	0 %	222524228
18853	NC_012032	GCT	2	6	1208876	1208881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524228
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18857	NC_012032	GCGG	2	8	1209019	1209026	0 %	0 %	75 %	25 %	222524228
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18960	NC_012032	GTG	2	6	1214287	1214292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524232
18961	NC_012032	GGT	2	6	1214313	1214318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524232
18962	NC_012032	GGT	2	6	1214340	1214345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524232
18963	NC_012032	GCTG	2	8	1214427	1214434	0 %	25 %	50 %	25 %	222524232
18964	NC_012032	TTG	2	6	1214435	1214440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524232
18965	NC_012032	CAA	2	6	1214441	1214446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524232
18966	NC_012032	TCAA	2	8	1214671	1214678	50 %	25 %	0 %	25 %	222524232
18967	NC_012032	GT	3	6	1214696	1214701	0 %	50 %	50 %	0 %	222524232
18968	NC_012032	AC	3	6	1214716	1214721	50 %	0 %	0 %	50 %	222524232
18969	NC_012032	CGTCA	2	10	1214745	1214754	20 %	20 %	20 %	40 %	222524232
18970	NC_012032	GGCA	2	8	1214766	1214773	25 %	0 %	50 %	25 %	222524232
18971	NC_012032	GTT	2	6	1214811	1214816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524232
18972	NC_012032	TTG	2	6	1214833	1214838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524232
18973	NC_012032	TGGT	2	8	1214857	1214864	0 %	50 %	50 %	0 %	222524232
18974	NC_012032	CGTG	2	8	1214906	1214913	0 %	25 %	50 %	25 %	222524232
18975	NC_012032	CAC	2	6	1214981	1214986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524232
18976	NC_012032	GTAC	2	8	1215003	1215010	25 %	25 %	25 %	25 %	222524232
18977	NC_012032	ACC	2	6	1215099	1215104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524232
18978	NC_012032	CGG	2	6	1215117	1215122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524232
18979	NC_012032	GTTG	2	8	1215153	1215160	0 %	50 %	50 %	0 %	222524232
18980	NC_012032	CCA	2	6	1215265	1215270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524232
18981	NC_012032	GTG	2	6	1215343	1215348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524232
18982	NC_012032	CCA	2	6	1215373	1215378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524232
18983	NC_012032	GAC	2	6	1215506	1215511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524232
18984	NC_012032	CGC	2	6	1215512	1215517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524232
18985	NC_012032	GCA	2	6	1215574	1215579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524232
18986	NC_012032	ATC	2	6	1215747	1215752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524232
18987	NC_012032	TGG	2	6	1215825	1215830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524232
18988	NC_012032	GCA	2	6	1215892	1215897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524232
18989	NC_012032	CTG	2	6	1215915	1215920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524232
18990	NC_012032	GTG	2	6	1215958	1215963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524232
18991	NC_012032	GTGA	2	8	1215966	1215973	25 %	25 %	50 %	0 %	222524232
18992	NC_012032	CCA	2	6	1215990	1215995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524232
18993	NC_012032	ACC	2	6	1216152	1216157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524232
18994	NC_012032	TCA	2	6	1216216	1216221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524232
18995	NC_012032	TGT	2	6	1216241	1216246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524232
18996	NC_012032	CTT	2	6	1216281	1216286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524232
18997	NC_012032	GGT	2	6	1216293	1216298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524232
18998	NC_012032	TCG	2	6	1216360	1216365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524232
18999	NC_012032	GGCCC	2	10	1216460	1216469	0 %	0 %	40 %	60 %	222524232
19000	NC_012032	CCG	2	6	1216555	1216560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524232

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