MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_012032	TC	3	6	1055205	1055210	0 %	50 %	0 %	50 %	222524123
16502	NC_012032	ATT	2	6	1055384	1055389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524124
16503	NC_012032	GCT	2	6	1055399	1055404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524124
16504	NC_012032	TGG	2	6	1055417	1055422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524124
16505	NC_012032	CAGGAT	2	12	1055433	1055444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222524124
16506	NC_012032	AGT	2	6	1055579	1055584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524124
16507	NC_012032	GCG	2	6	1055717	1055722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524124
16508	NC_012032	GCC	2	6	1055776	1055781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524124
16509	NC_012032	AGC	2	6	1055782	1055787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524124
16510	NC_012032	ATA	2	6	1055833	1055838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524124
16511	NC_012032	CAG	2	6	1055868	1055873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524124
16512	NC_012032	CAG	2	6	1055913	1055918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524124
16513	NC_012032	CCA	2	6	1056004	1056009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524124
16514	NC_012032	GCA	2	6	1056026	1056031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524124
16515	NC_012032	CCG	2	6	1056045	1056050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524124
16516	NC_012032	TTG	2	6	1056060	1056065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524124
16517	NC_012032	CAC	2	6	1056084	1056089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524124
16518	NC_012032	AGA	2	6	1056125	1056130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524124
16519	NC_012032	ACC	2	6	1056168	1056173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524124
16520	NC_012032	TAC	2	6	1057634	1057639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524125
16521	NC_012032	CAC	2	6	1057693	1057698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524125
16522	NC_012032	ATC	2	6	1057702	1057707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524125
16523	NC_012032	CAA	2	6	1057801	1057806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524125
16524	NC_012032	AC	3	6	1057845	1057850	50 %	0 %	0 %	50 %	222524125
16525	NC_012032	CAC	2	6	1057924	1057929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524125
16526	NC_012032	CAA	2	6	1057936	1057941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524125
16527	NC_012032	TGG	2	6	1058070	1058075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524125
16528	NC_012032	CAGC	2	8	1058169	1058176	25 %	0 %	25 %	50 %	222524125
16529	NC_012032	CTG	2	6	1058191	1058196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524125
16530	NC_012032	CTG	2	6	1058234	1058239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524125
16531	NC_012032	ACC	2	6	1058251	1058256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524125
16532	NC_012032	CCG	2	6	1058342	1058347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524125
16533	NC_012032	ATC	2	6	1058387	1058392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524125
16534	NC_012032	CGC	2	6	1058439	1058444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524125
16535	NC_012032	CAG	2	6	1058578	1058583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524125
16536	NC_012032	GTC	2	6	1058588	1058593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524125
16537	NC_012032	ACT	2	6	1058665	1058670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524126
16538	NC_012032	CGG	2	6	1058690	1058695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524126
16539	NC_012032	TCA	2	6	1058745	1058750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524126
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16541	NC_012032	AGC	2	6	1058763	1058768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524126
16542	NC_012032	TCAC	2	8	1058778	1058785	25 %	25 %	0 %	50 %	222524126
16543	NC_012032	GC	3	6	1058793	1058798	0 %	0 %	50 %	50 %	222524126
16544	NC_012032	GCT	2	6	1058863	1058868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524126
16545	NC_012032	TCG	2	6	1058893	1058898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524126
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16550	NC_012032	GCC	2	6	1059052	1059057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524126
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16584	NC_012032	C	6	6	1060118	1060123	0 %	0 %	0 %	100 %	222524126
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16600	NC_012032	CCGA	2	8	1060676	1060683	25 %	0 %	25 %	50 %	222524126
16601	NC_012032	CCA	2	6	1060852	1060857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524126
16602	NC_012032	CCGCA	2	10	1060859	1060868	20 %	0 %	20 %	60 %	222524126
16603	NC_012032	CGC	2	6	1060911	1060916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524126
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16606	NC_012032	ACCC	2	8	1061047	1061054	25 %	0 %	0 %	75 %	222524126
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16610	NC_012032	A	6	6	1061175	1061180	100 %	0 %	0 %	0 %	222524126
16611	NC_012032	CGT	2	6	1061231	1061236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524126
16612	NC_012032	CGC	2	6	1061265	1061270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524126
16613	NC_012032	GAC	2	6	1061305	1061310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524126
16614	NC_012032	GATCGG	2	12	1061356	1061367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222524126
16615	NC_012032	CAA	2	6	1061375	1061380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524126
16616	NC_012032	GCA	2	6	1061404	1061409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524126
16617	NC_012032	CTG	2	6	1061451	1061456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524126
16618	NC_012032	ACCA	2	8	1061528	1061535	50 %	0 %	0 %	50 %	222524126
16619	NC_012032	CGG	2	6	1061600	1061605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524126
16620	NC_012032	AACG	2	8	1061607	1061614	50 %	0 %	25 %	25 %	222524126
16621	NC_012032	CGA	2	6	1061630	1061635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524126
16622	NC_012032	CTGG	2	8	1061996	1062003	0 %	25 %	50 %	25 %	222524127
16623	NC_012032	CGCC	2	8	1062212	1062219	0 %	0 %	25 %	75 %	222524127
16624	NC_012032	TCA	2	6	1062244	1062249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524127
16625	NC_012032	CAT	2	6	1062266	1062271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524127
16626	NC_012032	CGG	2	6	1062272	1062277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524127
16627	NC_012032	GC	3	6	1062332	1062337	0 %	0 %	50 %	50 %	222524127
16628	NC_012032	CGC	3	9	1062344	1062352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524127
16629	NC_012032	CCG	2	6	1062379	1062384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524127
16630	NC_012032	GCC	2	6	1062405	1062410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524127
16631	NC_012032	CGC	2	6	1062461	1062466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524127
16632	NC_012032	GC	3	6	1062491	1062496	0 %	0 %	50 %	50 %	222524127
16633	NC_012032	TCT	2	6	1062553	1062558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524127
16634	NC_012032	TCG	2	6	1062607	1062612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524127
16635	NC_012032	TAC	2	6	1062778	1062783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524128
16636	NC_012032	CAC	2	6	1062986	1062991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524128
16637	NC_012032	CGG	2	6	1063045	1063050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524128
16638	NC_012032	CTG	2	6	1063100	1063105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524128
16639	NC_012032	CCA	2	6	1063168	1063173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524128
16640	NC_012032	CGC	2	6	1063175	1063180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524128
16641	NC_012032	ACC	2	6	1063215	1063220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524128
16642	NC_012032	TTCG	2	8	1063236	1063243	0 %	50 %	25 %	25 %	222524128
16643	NC_012032	TCG	2	6	1063255	1063260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524128
16644	NC_012032	GCG	3	9	1063312	1063320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524128
16645	NC_012032	ACG	3	9	1063372	1063380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524128
16646	NC_012032	GGT	2	6	1063572	1063577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524129
16647	NC_012032	TCC	2	6	1063587	1063592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524129
16648	NC_012032	CAC	2	6	1063626	1063631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524129
16649	NC_012032	C	6	6	1063631	1063636	0 %	0 %	0 %	100 %	222524129
16650	NC_012032	CAC	2	6	1063690	1063695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524129
16651	NC_012032	CCAC	2	8	1063718	1063725	25 %	0 %	0 %	75 %	222524129
16652	NC_012032	CGC	3	9	1063732	1063740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524129
16653	NC_012032	GCC	2	6	1063859	1063864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524129
16654	NC_012032	GAC	2	6	1063920	1063925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524129
16655	NC_012032	CGG	2	6	1064071	1064076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524129
16656	NC_012032	CGA	2	6	1064098	1064103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524129
16657	NC_012032	GCT	2	6	1064182	1064187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524129
16658	NC_012032	CGG	2	6	1064224	1064229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524129
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16660	NC_012032	TGC	2	6	1064279	1064284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524129
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16662	NC_012032	GGC	2	6	1064333	1064338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524129
16663	NC_012032	CGA	2	6	1064380	1064385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524129
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16667	NC_012032	GTGC	2	8	1064435	1064442	0 %	25 %	50 %	25 %	222524129
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16669	NC_012032	CAC	2	6	1064565	1064570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524129
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16674	NC_012032	CAT	2	6	1064766	1064771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524129
16675	NC_012032	GCA	2	6	1064798	1064803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524129
16676	NC_012032	CGG	2	6	1064817	1064822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524129
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16678	NC_012032	CGC	2	6	1064923	1064928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524129
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16684	NC_012032	CCG	2	6	1065302	1065307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524130
16685	NC_012032	GACC	2	8	1065315	1065322	25 %	0 %	25 %	50 %	222524130
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16689	NC_012032	CA	3	6	1065458	1065463	50 %	0 %	0 %	50 %	222524130
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16699	NC_012032	TGGG	2	8	1066735	1066742	0 %	25 %	75 %	0 %	222524131
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16702	NC_012032	CTC	2	6	1066839	1066844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524132
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16704	NC_012032	CTG	2	6	1066980	1066985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524132
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16712	NC_012032	GCA	2	6	1067347	1067352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524133
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16716	NC_012032	GCC	3	9	1067571	1067579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524133
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16720	NC_012032	CTG	2	6	1067669	1067674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524133
16721	NC_012032	CTG	2	6	1067690	1067695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524133
16722	NC_012032	CAGC	2	8	1067764	1067771	25 %	0 %	25 %	50 %	222524133
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16724	NC_012032	TGC	2	6	1067805	1067810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524133
16725	NC_012032	GAA	2	6	1067843	1067848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524133
16726	NC_012032	GGT	2	6	1067859	1067864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524133
16727	NC_012032	AGC	2	6	1067889	1067894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524133
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16729	NC_012032	CAC	2	6	1067966	1067971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524133
16730	NC_012032	ATC	2	6	1068023	1068028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524133
16731	NC_012032	TGGTC	2	10	1068076	1068085	0 %	40 %	40 %	20 %	222524133
16732	NC_012032	GCG	2	6	1068090	1068095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524133
16733	NC_012032	CTG	2	6	1068110	1068115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524133
16734	NC_012032	CTG	2	6	1068158	1068163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524133
16735	NC_012032	CTG	3	9	1068239	1068247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524133
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16737	NC_012032	TAGA	2	8	1068320	1068327	50 %	25 %	25 %	0 %	222524133
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16742	NC_012032	CTTGC	2	10	1068716	1068725	0 %	40 %	20 %	40 %	222524133
16743	NC_012032	CTC	2	6	1068758	1068763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524133
16744	NC_012032	CAC	2	6	1068797	1068802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524133
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16746	NC_012032	CTG	2	6	1068831	1068836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524133
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16757	NC_012032	GCA	2	6	1069317	1069322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524133
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16834	NC_012032	TAT	2	6	1074380	1074385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524135
16835	NC_012032	G	6	6	1074592	1074597	0 %	0 %	100 %	0 %	222524135
16836	NC_012032	TGATC	2	10	1074635	1074644	20 %	40 %	20 %	20 %	222524135
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16839	NC_012032	TTC	2	6	1074804	1074809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524135
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16842	NC_012032	TCA	2	6	1074987	1074992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524135
16843	NC_012032	CTCG	2	8	1075007	1075014	0 %	25 %	25 %	50 %	222524135
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16845	NC_012032	ATT	2	6	1075146	1075151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524135
16846	NC_012032	AAT	2	6	1075206	1075211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524135
16847	NC_012032	GGT	2	6	1075262	1075267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524135
16848	NC_012032	GTGCCC	2	12	1075400	1075411	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222524136
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16850	NC_012032	GCT	2	6	1075449	1075454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524136
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16853	NC_012032	TC	3	6	1075659	1075664	0 %	50 %	0 %	50 %	222524136
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16949	NC_012032	TGCC	2	8	1082214	1082221	0 %	25 %	25 %	50 %	222524140
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16951	NC_012032	TCCC	2	8	1082240	1082247	0 %	25 %	0 %	75 %	222524140
16952	NC_012032	CGG	2	6	1082270	1082275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524140
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16959	NC_012032	ACA	2	6	1082456	1082461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524140
16960	NC_012032	CG	3	6	1082992	1082997	0 %	0 %	50 %	50 %	222524141
16961	NC_012032	CGG	2	6	1083022	1083027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524141
16962	NC_012032	CAG	2	6	1083056	1083061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524141
16963	NC_012032	ATA	2	6	1083068	1083073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524141
16964	NC_012032	GCA	2	6	1083123	1083128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524141
16965	NC_012032	ATG	2	6	1083129	1083134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524141
16966	NC_012032	GCT	2	6	1083145	1083150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524141
16967	NC_012032	GGAG	2	8	1083169	1083176	25 %	0 %	75 %	0 %	222524141
16968	NC_012032	CTG	2	6	1083215	1083220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524141
16969	NC_012032	GTG	3	9	1083246	1083254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524141
16970	NC_012032	CAG	2	6	1083332	1083337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524141
16971	NC_012032	ATC	2	6	1083345	1083350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524141
16972	NC_012032	ATC	2	6	1083360	1083365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524141
16973	NC_012032	GGA	2	6	1083388	1083393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524141
16974	NC_012032	AGGC	2	8	1083394	1083401	25 %	0 %	50 %	25 %	222524141
16975	NC_012032	CAT	2	6	1083437	1083442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524141
16976	NC_012032	ACC	2	6	1083483	1083488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524141
16977	NC_012032	CAG	2	6	1083494	1083499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524141
16978	NC_012032	GAC	2	6	1083561	1083566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524142
16979	NC_012032	CGCCAG	2	12	1083595	1083606	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222524142
16980	NC_012032	AGG	2	6	1083626	1083631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524142
16981	NC_012032	GCC	2	6	1083635	1083640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524142
16982	NC_012032	CGG	2	6	1083648	1083653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524142
16983	NC_012032	CATA	2	8	1083658	1083665	50 %	25 %	0 %	25 %	222524142
16984	NC_012032	CAG	2	6	1083688	1083693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524142
16985	NC_012032	CATC	2	8	1083695	1083702	25 %	25 %	0 %	50 %	222524142
16986	NC_012032	GTGAG	2	10	1083720	1083729	20 %	20 %	60 %	0 %	222524142
16987	NC_012032	CAC	2	6	1083757	1083762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524142
16988	NC_012032	TGC	2	6	1083779	1083784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524142
16989	NC_012032	TGCCG	2	10	1083815	1083824	0 %	20 %	40 %	40 %	222524142
16990	NC_012032	GTT	2	6	1083839	1083844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524142
16991	NC_012032	TCG	2	6	1083848	1083853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524142
16992	NC_012032	GCC	2	6	1083887	1083892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524142
16993	NC_012032	CGT	2	6	1083902	1083907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524142
16994	NC_012032	CAA	2	6	1083942	1083947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524142
16995	NC_012032	AAC	2	6	1084052	1084057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524142
16996	NC_012032	TCA	2	6	1084061	1084066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524142
16997	NC_012032	CCG	2	6	1084273	1084278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524142
16998	NC_012032	CGG	2	6	1084284	1084289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524142
16999	NC_012032	GA	3	6	1084295	1084300	50 %	0 %	50 %	0 %	222524142
17000	NC_012032	GCT	2	6	1084374	1084379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524142

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