MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_012032	TC	3	6	993864	993869	0 %	50 %	0 %	50 %	222524069
15503	NC_012032	CGC	2	6	993870	993875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524069
15504	NC_012032	CGC	2	6	994016	994021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524069
15505	NC_012032	GAC	2	6	994037	994042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524069
15506	NC_012032	ACCAG	2	10	994045	994054	40 %	0 %	20 %	40 %	222524069
15507	NC_012032	CCTT	2	8	994084	994091	0 %	50 %	0 %	50 %	222524069
15508	NC_012032	TCA	2	6	994341	994346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524070
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15511	NC_012032	AAT	2	6	994550	994555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524070
15512	NC_012032	ACC	2	6	994574	994579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524070
15513	NC_012032	ATT	2	6	994637	994642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524070
15514	NC_012032	ACAG	2	8	994722	994729	50 %	0 %	25 %	25 %	222524070
15515	NC_012032	TAT	2	6	994884	994889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524071
15516	NC_012032	CGA	3	9	994890	994898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524071
15517	NC_012032	TC	3	6	994917	994922	0 %	50 %	0 %	50 %	222524071
15518	NC_012032	TGT	2	6	994950	994955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524071
15519	NC_012032	ATG	2	6	995029	995034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524071
15520	NC_012032	TCT	2	6	995102	995107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524071
15521	NC_012032	ATT	2	6	995167	995172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524071
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15524	NC_012032	GCA	2	6	995232	995237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524072
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15526	NC_012032	ATGTGC	2	12	995343	995354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222524072
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15528	NC_012032	AAT	2	6	995466	995471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524072
15529	NC_012032	GCG	2	6	995496	995501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524072
15530	NC_012032	CAT	2	6	995611	995616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524072
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15532	NC_012032	GAT	2	6	995817	995822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524073
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15536	NC_012032	CAT	2	6	996144	996149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524073
15537	NC_012032	CG	3	6	996171	996176	0 %	0 %	50 %	50 %	222524073
15538	NC_012032	CGTAAG	2	12	996261	996272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222524073
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15541	NC_012032	CCCA	2	8	996415	996422	25 %	0 %	0 %	75 %	222524073
15542	NC_012032	GAAA	2	8	996437	996444	75 %	0 %	25 %	0 %	222524073
15543	NC_012032	GTC	2	6	996454	996459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524073
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15553	NC_012032	CTCG	2	8	997565	997572	0 %	25 %	25 %	50 %	222524074
15554	NC_012032	CCG	2	6	997602	997607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524074
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15565	NC_012032	GGT	3	9	998095	998103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524074
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15589	NC_012032	AGC	2	6	999382	999387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524075
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15608	NC_012032	CCTC	2	8	1000600	1000607	0 %	25 %	0 %	75 %	222524077
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15618	NC_012032	CCAAC	2	10	1001219	1001228	40 %	0 %	0 %	60 %	222524078
15619	NC_012032	CGG	2	6	1001229	1001234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524078
15620	NC_012032	CAA	2	6	1001275	1001280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524078
15621	NC_012032	CCA	2	6	1001345	1001350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524078
15622	NC_012032	GCA	2	6	1001373	1001378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524078
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15624	NC_012032	CAG	2	6	1001428	1001433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524078
15625	NC_012032	GCC	2	6	1001449	1001454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524078
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15630	NC_012032	ACC	2	6	1001741	1001746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524078
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15646	NC_012032	GCA	2	6	1002509	1002514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524079
15647	NC_012032	GCG	2	6	1002525	1002530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524079
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15649	NC_012032	CAG	2	6	1002590	1002595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524079
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15652	NC_012032	GCCCG	2	10	1002680	1002689	0 %	0 %	40 %	60 %	222524079
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15695	NC_012032	TGC	2	6	1005628	1005633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524081
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15699	NC_012032	CGT	2	6	1005785	1005790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524081
15700	NC_012032	TC	3	6	1006252	1006257	0 %	50 %	0 %	50 %	222524082
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15704	NC_012032	TGC	2	6	1006405	1006410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524082
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15715	NC_012032	CGAG	2	8	1006801	1006808	25 %	0 %	50 %	25 %	222524082
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15722	NC_012032	GCG	2	6	1007037	1007042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524082
15723	NC_012032	GTT	2	6	1007092	1007097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524082
15724	NC_012032	CGA	2	6	1007116	1007121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524082
15725	NC_012032	TGC	2	6	1007248	1007253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524082
15726	NC_012032	CCG	2	6	1007328	1007333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524082
15727	NC_012032	TAC	2	6	1007351	1007356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524082
15728	NC_012032	TGC	2	6	1007407	1007412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524082
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15732	NC_012032	CGC	2	6	1007566	1007571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524082
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15734	NC_012032	GTC	2	6	1007685	1007690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524082
15735	NC_012032	ACC	2	6	1007710	1007715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524082
15736	NC_012032	CGC	2	6	1007857	1007862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524082
15737	NC_012032	AC	3	6	1007879	1007884	50 %	0 %	0 %	50 %	222524082
15738	NC_012032	TAC	2	6	1007895	1007900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524082
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15743	NC_012032	GCA	2	6	1007981	1007986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524082
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15746	NC_012032	CGT	2	6	1008143	1008148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524082
15747	NC_012032	CAT	2	6	1008163	1008168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524082
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15750	NC_012032	GC	3	6	1009382	1009387	0 %	0 %	50 %	50 %	222524083
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15754	NC_012032	AGC	2	6	1009493	1009498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524083
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15761	NC_012032	CCCA	2	8	1010156	1010163	25 %	0 %	0 %	75 %	222524084
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15770	NC_012032	GAA	2	6	1010692	1010697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524084
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15842	NC_012032	GGCCT	2	10	1015713	1015722	0 %	20 %	40 %	40 %	222524089
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15850	NC_012032	GCC	3	9	1016096	1016104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524089
15851	NC_012032	CGA	2	6	1016120	1016125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524089
15852	NC_012032	GCC	2	6	1016132	1016137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524089
15853	NC_012032	TCG	2	6	1016164	1016169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524089
15854	NC_012032	CGT	2	6	1016181	1016186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524089
15855	NC_012032	CTG	2	6	1016199	1016204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524089
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15857	NC_012032	TGG	2	6	1016329	1016334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524089
15858	NC_012032	GTC	2	6	1016427	1016432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524089
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15862	NC_012032	GCC	2	6	1016557	1016562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524089
15863	NC_012032	GTC	2	6	1016589	1016594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524089
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15870	NC_012032	GAT	2	6	1017639	1017644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524090
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15880	NC_012032	GTA	2	6	1018110	1018115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524090
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15889	NC_012032	GTA	2	6	1018918	1018923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524091
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15919	NC_012032	CAGC	2	8	1020423	1020430	25 %	0 %	25 %	50 %	222524092
15920	NC_012032	TCA	2	6	1020434	1020439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524092
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15938	NC_012032	AG	3	6	1022651	1022656	50 %	0 %	50 %	0 %	222524094
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15945	NC_012032	CGC	2	6	1023189	1023194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524094
15946	NC_012032	GAT	2	6	1023202	1023207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524094
15947	NC_012032	AAG	2	6	1023272	1023277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524094
15948	NC_012032	AGT	2	6	1023303	1023308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524094
15949	NC_012032	AGC	2	6	1023348	1023353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524094
15950	NC_012032	ATC	2	6	1023500	1023505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524095
15951	NC_012032	CGG	2	6	1023536	1023541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524095
15952	NC_012032	GTC	2	6	1023543	1023548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15953	NC_012032	GCT	2	6	1023574	1023579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15954	NC_012032	CGGG	2	8	1023715	1023722	0 %	0 %	75 %	25 %	222524095
15955	NC_012032	GATC	2	8	1023730	1023737	25 %	25 %	25 %	25 %	222524095
15956	NC_012032	GAT	3	9	1023746	1023754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524095
15957	NC_012032	CAC	2	6	1023826	1023831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524095
15958	NC_012032	CTG	2	6	1023965	1023970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15959	NC_012032	ATG	2	6	1023975	1023980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524095
15960	NC_012032	CAT	2	6	1024063	1024068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524095
15961	NC_012032	CTG	2	6	1024085	1024090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15962	NC_012032	CAA	2	6	1024153	1024158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524095
15963	NC_012032	GAT	2	6	1024201	1024206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524095
15964	NC_012032	CAC	2	6	1024232	1024237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524095
15965	NC_012032	ACCGGT	2	12	1024292	1024303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15966	NC_012032	CGA	2	6	1024324	1024329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15967	NC_012032	ACC	2	6	1024409	1024414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524095
15968	NC_012032	AACTC	2	10	1024509	1024518	40 %	20 %	0 %	40 %	222524095
15969	NC_012032	GCA	2	6	1024530	1024535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15970	NC_012032	TGC	2	6	1024555	1024560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524095
15971	NC_012032	CGC	3	9	1024561	1024569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524095
15972	NC_012032	AAT	2	6	1024668	1024673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222524096
15973	NC_012032	GCG	2	6	1024685	1024690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524096
15974	NC_012032	ATC	2	6	1024715	1024720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524096
15975	NC_012032	GGC	2	6	1024737	1024742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524096
15976	NC_012032	CGCC	2	8	1024743	1024750	0 %	0 %	25 %	75 %	222524096
15977	NC_012032	GAGT	2	8	1024805	1024812	25 %	25 %	50 %	0 %	222524096
15978	NC_012032	C	6	6	1024821	1024826	0 %	0 %	0 %	100 %	222524096
15979	NC_012032	ACCC	2	8	1024828	1024835	25 %	0 %	0 %	75 %	222524096
15980	NC_012032	GTC	2	6	1024865	1024870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524096
15981	NC_012032	AGA	2	6	1024875	1024880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524096
15982	NC_012032	TCG	2	6	1024881	1024886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524096
15983	NC_012032	GCCG	2	8	1024925	1024932	0 %	0 %	50 %	50 %	222524096
15984	NC_012032	TTC	2	6	1024988	1024993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524096
15985	NC_012032	TCA	2	6	1025085	1025090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524096
15986	NC_012032	GCGG	2	8	1025097	1025104	0 %	0 %	75 %	25 %	222524096
15987	NC_012032	CGG	2	6	1025146	1025151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524096
15988	NC_012032	CGG	2	6	1025156	1025161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524096
15989	NC_012032	TGC	2	6	1025196	1025201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524096
15990	NC_012032	CCA	2	6	1025202	1025207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524096
15991	NC_012032	GGT	2	6	1025261	1025266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524096
15992	NC_012032	GCC	2	6	1025270	1025275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524096
15993	NC_012032	CACGC	2	10	1025291	1025300	20 %	0 %	20 %	60 %	222524096
15994	NC_012032	GTC	2	6	1025306	1025311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524096
15995	NC_012032	CGG	2	6	1025329	1025334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524096
15996	NC_012032	CAGC	2	8	1025335	1025342	25 %	0 %	25 %	50 %	222524096
15997	NC_012032	ATC	2	6	1025357	1025362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524096
15998	NC_012032	CCCG	2	8	1025373	1025380	0 %	0 %	25 %	75 %	222524096
15999	NC_012032	TCGCC	2	10	1025413	1025422	0 %	20 %	20 %	60 %	222524096
16000	NC_012032	TGA	2	6	1025425	1025430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524096

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