MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012032	CGG	2	6	966189	966194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524055
15002	NC_012032	GAT	2	6	966212	966217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524055
15003	NC_012032	TGG	2	6	966279	966284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524055
15004	NC_012032	CAG	2	6	966327	966332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15005	NC_012032	CGG	2	6	966401	966406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524055
15006	NC_012032	ACC	2	6	966423	966428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524055
15007	NC_012032	CCG	2	6	966460	966465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524055
15008	NC_012032	TTA	2	6	966513	966518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524055
15009	NC_012032	CCCGG	2	10	966566	966575	0 %	0 %	40 %	60 %	222524055
15010	NC_012032	CTT	2	6	966608	966613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524055
15011	NC_012032	GAT	2	6	966630	966635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524055
15012	NC_012032	ATC	2	6	966714	966719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524055
15013	NC_012032	CGG	2	6	966725	966730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524055
15014	NC_012032	ACA	2	6	966771	966776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524055
15015	NC_012032	CTT	2	6	966794	966799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524055
15016	NC_012032	GC	3	6	966800	966805	0 %	0 %	50 %	50 %	222524055
15017	NC_012032	GTT	2	6	966824	966829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524055
15018	NC_012032	CAC	2	6	966857	966862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524055
15019	NC_012032	GCG	2	6	966939	966944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524055
15020	NC_012032	GCT	2	6	967043	967048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15021	NC_012032	GCC	2	6	967104	967109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524055
15022	NC_012032	CGGCAA	2	12	967117	967128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15023	NC_012032	CTG	2	6	967203	967208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15024	NC_012032	GAT	2	6	967212	967217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524055
15025	NC_012032	GCG	2	6	967224	967229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524055
15026	NC_012032	GCTG	2	8	967234	967241	0 %	25 %	50 %	25 %	222524055
15027	NC_012032	GCCC	2	8	967262	967269	0 %	0 %	25 %	75 %	222524055
15028	NC_012032	CTG	2	6	967284	967289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15029	NC_012032	CGG	2	6	967308	967313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524055
15030	NC_012032	G	6	6	967312	967317	0 %	0 %	100 %	0 %	222524055
15031	NC_012032	GCG	2	6	967331	967336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524055
15032	NC_012032	TCG	3	9	967423	967431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15033	NC_012032	GAC	2	6	967502	967507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15034	NC_012032	CAG	2	6	967548	967553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524055
15035	NC_012032	GGCC	2	8	967575	967582	0 %	0 %	50 %	50 %	222524055
15036	NC_012032	AGA	2	6	967697	967702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524055
15037	NC_012032	ACCT	2	8	967724	967731	25 %	25 %	0 %	50 %	222524055
15038	NC_012032	GTG	2	6	967822	967827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524056
15039	NC_012032	ACG	2	6	967902	967907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524056
15040	NC_012032	GTG	2	6	968031	968036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524056
15041	NC_012032	CTGG	2	8	968044	968051	0 %	25 %	50 %	25 %	222524056
15042	NC_012032	GCC	2	6	968153	968158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524056
15043	NC_012032	GCC	2	6	968165	968170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524056
15044	NC_012032	CAC	2	6	968224	968229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524056
15045	NC_012032	GCG	2	6	968240	968245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524056
15046	NC_012032	TGG	2	6	968246	968251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524056
15047	NC_012032	CTG	2	6	968255	968260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524056
15048	NC_012032	GGC	2	6	968265	968270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524056
15049	NC_012032	GCT	2	6	968365	968370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524056
15050	NC_012032	TGC	2	6	968395	968400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524056
15051	NC_012032	CCA	2	6	968460	968465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524056
15052	NC_012032	CGAG	2	8	968629	968636	25 %	0 %	50 %	25 %	222524056
15053	NC_012032	TGC	2	6	968691	968696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524056
15054	NC_012032	CTGG	2	8	968713	968720	0 %	25 %	50 %	25 %	222524056
15055	NC_012032	CTG	2	6	968756	968761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524056
15056	NC_012032	CCG	2	6	968783	968788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524056
15057	NC_012032	CGA	2	6	968815	968820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524056
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15059	NC_012032	TGGC	2	8	969011	969018	0 %	25 %	50 %	25 %	222524056
15060	NC_012032	CCAG	2	8	969043	969050	25 %	0 %	25 %	50 %	222524056
15061	NC_012032	GGC	2	6	969150	969155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524056
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15063	NC_012032	GCT	2	6	969200	969205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524056
15064	NC_012032	GGCA	2	8	969213	969220	25 %	0 %	50 %	25 %	222524056
15065	NC_012032	CGC	2	6	969313	969318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524056
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15068	NC_012032	GATC	2	8	969442	969449	25 %	25 %	25 %	25 %	222524056
15069	NC_012032	TGAT	2	8	969486	969493	25 %	50 %	25 %	0 %	222524056
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15095	NC_012032	GGCT	2	8	971099	971106	0 %	25 %	50 %	25 %	222524057
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15101	NC_012032	GTGC	2	8	971501	971508	0 %	25 %	50 %	25 %	222524057
15102	NC_012032	GCG	2	6	971531	971536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524057
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15241	NC_012032	CGGT	2	8	979167	979174	0 %	25 %	50 %	25 %	222524061
15242	NC_012032	CCGGC	2	10	979198	979207	0 %	0 %	40 %	60 %	222524061
15243	NC_012032	GCA	2	6	979213	979218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524061
15244	NC_012032	TCG	2	6	979230	979235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524061
15245	NC_012032	CGC	2	6	979261	979266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524061
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15248	NC_012032	GTT	2	6	979438	979443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524061
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15349	NC_012032	CAA	2	6	983928	983933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222524064
15350	NC_012032	CGTGA	2	10	983959	983968	20 %	20 %	40 %	20 %	222524064
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15359	NC_012032	TGG	2	6	984571	984576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524064
15360	NC_012032	CGC	2	6	984626	984631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524064
15361	NC_012032	CGC	2	6	984653	984658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524064
15362	NC_012032	TTGT	2	8	984724	984731	0 %	75 %	25 %	0 %	222524064
15363	NC_012032	GCG	2	6	984732	984737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524064
15364	NC_012032	GCC	2	6	984759	984764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524064
15365	NC_012032	TGC	2	6	984812	984817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524064
15366	NC_012032	GAC	2	6	984856	984861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524064
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15368	NC_012032	GCG	3	9	985172	985180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524064
15369	NC_012032	TGG	2	6	985209	985214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524064
15370	NC_012032	CG	3	6	985265	985270	0 %	0 %	50 %	50 %	222524064
15371	NC_012032	GCG	2	6	985331	985336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524064
15372	NC_012032	TG	3	6	985380	985385	0 %	50 %	50 %	0 %	222524064
15373	NC_012032	TGG	2	6	985445	985450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524064
15374	NC_012032	CGTGGT	2	12	985509	985520	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222524064
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15379	NC_012032	TCGT	2	8	985677	985684	0 %	50 %	25 %	25 %	222524064
15380	NC_012032	CAC	2	6	985746	985751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524064
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15382	NC_012032	TGA	2	6	985921	985926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524064
15383	NC_012032	TAC	2	6	986326	986331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524065
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15386	NC_012032	ATCC	2	8	986621	986628	25 %	25 %	0 %	50 %	222524065
15387	NC_012032	GGA	2	6	986713	986718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524065
15388	NC_012032	ATTG	2	8	986743	986750	25 %	50 %	25 %	0 %	222524065
15389	NC_012032	T	6	6	986923	986928	0 %	100 %	0 %	0 %	222524065
15390	NC_012032	GAA	2	6	986965	986970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524065
15391	NC_012032	CAGT	2	8	987075	987082	25 %	25 %	25 %	25 %	222524065
15392	NC_012032	ATTCT	2	10	987235	987244	20 %	60 %	0 %	20 %	222524066
15393	NC_012032	A	6	6	987246	987251	100 %	0 %	0 %	0 %	222524066
15394	NC_012032	ACT	2	6	987266	987271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524066
15395	NC_012032	TGA	2	6	987328	987333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524066
15396	NC_012032	CTTC	2	8	987394	987401	0 %	50 %	0 %	50 %	222524066
15397	NC_012032	CTCA	2	8	987414	987421	25 %	25 %	0 %	50 %	222524066
15398	NC_012032	AGATG	2	10	987431	987440	40 %	20 %	40 %	0 %	222524066
15399	NC_012032	GAT	2	6	987486	987491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524066
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15401	NC_012032	T	6	6	987621	987626	0 %	100 %	0 %	0 %	222524066
15402	NC_012032	CTGG	2	8	987644	987651	0 %	25 %	50 %	25 %	222524066
15403	NC_012032	GCCACG	2	12	987672	987683	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222524066
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15406	NC_012032	CCG	2	6	987922	987927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524066
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15419	NC_012032	AGA	2	6	988783	988788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524066
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15424	NC_012032	TTC	2	6	988967	988972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524066
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15430	NC_012032	TTG	2	6	989537	989542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524067
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15433	NC_012032	TGC	2	6	989652	989657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524067
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15452	NC_012032	CTG	2	6	990751	990756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524068
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15458	NC_012032	ACGA	2	8	991075	991082	50 %	0 %	25 %	25 %	222524068
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15470	NC_012032	TTG	2	6	991672	991677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524068
15471	NC_012032	TTA	2	6	991693	991698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524068
15472	NC_012032	GTA	2	6	991785	991790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524068
15473	NC_012032	AGGG	2	8	992060	992067	25 %	0 %	75 %	0 %	222524068
15474	NC_012032	TGA	2	6	992120	992125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524068
15475	NC_012032	CAG	2	6	992130	992135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524068
15476	NC_012032	TTCA	2	8	992157	992164	25 %	50 %	0 %	25 %	222524068
15477	NC_012032	CCG	2	6	992168	992173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524068
15478	NC_012032	CGA	2	6	992174	992179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524068
15479	NC_012032	GC	3	6	992186	992191	0 %	0 %	50 %	50 %	222524068
15480	NC_012032	GCC	2	6	992205	992210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524068
15481	NC_012032	GC	3	6	992360	992365	0 %	0 %	50 %	50 %	222524068
15482	NC_012032	GAC	2	6	992374	992379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524068
15483	NC_012032	CGA	2	6	992504	992509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524068
15484	NC_012032	TTC	2	6	992622	992627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524068
15485	NC_012032	CT	3	6	992644	992649	0 %	50 %	0 %	50 %	222524068
15486	NC_012032	GAG	2	6	992679	992684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524068
15487	NC_012032	CCA	2	6	992723	992728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524068
15488	NC_012032	CTC	2	6	992791	992796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524068
15489	NC_012032	CGGC	2	8	992833	992840	0 %	0 %	50 %	50 %	222524068
15490	NC_012032	CCG	2	6	993073	993078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524068
15491	NC_012032	TTC	2	6	993162	993167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222524068
15492	NC_012032	CAC	2	6	993201	993206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524068
15493	NC_012032	CGC	3	9	993216	993224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524068
15494	NC_012032	GAG	2	6	993326	993331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524069
15495	NC_012032	TTACT	2	10	993407	993416	20 %	60 %	0 %	20 %	222524069
15496	NC_012032	CAC	2	6	993489	993494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524069
15497	NC_012032	GC	3	6	993535	993540	0 %	0 %	50 %	50 %	222524069
15498	NC_012032	GAT	2	6	993542	993547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524069
15499	NC_012032	AGC	2	6	993615	993620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524069
15500	NC_012032	ATC	2	6	993683	993688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524069

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