MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_012032	GAA	2	6	939346	939351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524035
14503	NC_012032	GGA	2	6	939366	939371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524035
14504	NC_012032	GCC	2	6	939388	939393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14505	NC_012032	CAG	3	9	939394	939402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524035
14506	NC_012032	CGC	2	6	939411	939416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14507	NC_012032	GAA	2	6	939451	939456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524035
14508	NC_012032	GGA	2	6	939471	939476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524035
14509	NC_012032	GCC	2	6	939493	939498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14510	NC_012032	CAG	3	9	939502	939510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524035
14511	NC_012032	CCG	2	6	939527	939532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14512	NC_012032	C	6	6	939544	939549	0 %	0 %	0 %	100 %	222524035
14513	NC_012032	GAA	2	6	939559	939564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524035
14514	NC_012032	GGA	2	6	939579	939584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524035
14515	NC_012032	GCC	2	6	939601	939606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14516	NC_012032	CAG	2	6	939610	939615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524035
14517	NC_012032	CGC	2	6	939624	939629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14518	NC_012032	GAA	2	6	939664	939669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524035
14519	NC_012032	GGA	2	6	939684	939689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524035
14520	NC_012032	GCC	2	6	939706	939711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14521	NC_012032	CAG	3	9	939715	939723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524035
14522	NC_012032	CGC	2	6	939732	939737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14523	NC_012032	GGA	2	6	939792	939797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524035
14524	NC_012032	GGC	2	6	939813	939818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524035
14525	NC_012032	CAG	3	9	939820	939828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524035
14526	NC_012032	CGC	2	6	939837	939842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14527	NC_012032	GGA	2	6	939897	939902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524035
14528	NC_012032	GCC	2	6	939919	939924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14529	NC_012032	CAG	3	9	939928	939936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524035
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14533	NC_012032	CGC	2	6	940050	940055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524035
14534	NC_012032	GGA	2	6	940110	940115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222524035
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14544	NC_012032	CCA	2	6	940483	940488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524035
14545	NC_012032	AAGAG	2	10	940533	940542	60 %	0 %	40 %	0 %	222524035
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14550	NC_012032	CGA	2	6	940683	940688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524035
14551	NC_012032	TTAC	2	8	940689	940696	25 %	50 %	0 %	25 %	222524035
14552	NC_012032	CT	3	6	940725	940730	0 %	50 %	0 %	50 %	222524035
14553	NC_012032	TCG	2	6	940794	940799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524035
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14559	NC_012032	CCG	2	6	941209	941214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524036
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14587	NC_012032	AGC	2	6	942837	942842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524038
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14598	NC_012032	TAC	3	9	943603	943611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524039
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14605	NC_012032	ATT	2	6	943787	943792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222524039
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14618	NC_012032	CT	3	6	944244	944249	0 %	50 %	0 %	50 %	222524039
14619	NC_012032	TCA	2	6	944326	944331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524039
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14623	NC_012032	ACC	2	6	944591	944596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524040
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14735	NC_012032	GGC	2	6	950932	950937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524046
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14738	NC_012032	GAT	2	6	951059	951064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524046
14739	NC_012032	GAT	2	6	951215	951220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524046
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14856	NC_012032	AGC	2	6	958879	958884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524051
14857	NC_012032	GCTG	2	8	958923	958930	0 %	25 %	50 %	25 %	222524051
14858	NC_012032	TGA	2	6	958956	958961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524051
14859	NC_012032	ACC	2	6	959031	959036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222524051
14860	NC_012032	GTC	2	6	959099	959104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524051
14861	NC_012032	CCT	2	6	959119	959124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222524051
14862	NC_012032	GGGC	2	8	959272	959279	0 %	0 %	75 %	25 %	222524051
14863	NC_012032	TGCT	2	8	959403	959410	0 %	50 %	25 %	25 %	222524051
14864	NC_012032	CT	3	6	959412	959417	0 %	50 %	0 %	50 %	222524051
14865	NC_012032	AGA	2	6	959433	959438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524051
14866	NC_012032	TGGC	2	8	959462	959469	0 %	25 %	50 %	25 %	222524051
14867	NC_012032	CAT	2	6	959545	959550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524051
14868	NC_012032	CTGG	2	8	959608	959615	0 %	25 %	50 %	25 %	222524051
14869	NC_012032	CTG	2	6	959618	959623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524051
14870	NC_012032	GCG	2	6	959624	959629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524051
14871	NC_012032	AGA	2	6	959752	959757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222524051
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14880	NC_012032	TGGC	2	8	960408	960415	0 %	25 %	50 %	25 %	222524052
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14883	NC_012032	ATCT	2	8	960597	960604	25 %	50 %	0 %	25 %	222524052
14884	NC_012032	CAT	2	6	960620	960625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524052
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14888	NC_012032	GCG	2	6	960783	960788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524052
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14892	NC_012032	TCG	2	6	960934	960939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524052
14893	NC_012032	GCC	2	6	960975	960980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524052
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14900	NC_012032	GGCT	2	8	961409	961416	0 %	25 %	50 %	25 %	222524053
14901	NC_012032	CGCTG	2	10	961429	961438	0 %	20 %	40 %	40 %	222524053
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14905	NC_012032	GATG	2	8	961587	961594	25 %	25 %	50 %	0 %	222524053
14906	NC_012032	GAGT	2	8	961609	961616	25 %	25 %	50 %	0 %	222524053
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14964	NC_012032	GATC	2	8	964361	964368	25 %	25 %	25 %	25 %	222524054
14965	NC_012032	TGA	2	6	964391	964396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222524054
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14967	NC_012032	TGT	2	6	964564	964569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222524054
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14970	NC_012032	TGTT	2	8	964636	964643	0 %	75 %	25 %	0 %	222524054
14971	NC_012032	GGC	2	6	964661	964666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524054
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14973	NC_012032	CGG	2	6	964698	964703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222524054
14974	NC_012032	G	6	6	964702	964707	0 %	0 %	100 %	0 %	222524054
14975	NC_012032	GCC	2	6	964746	964751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524054
14976	NC_012032	CCG	2	6	964780	964785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524054
14977	NC_012032	CGCAG	2	10	964838	964847	20 %	0 %	40 %	40 %	222524054
14978	NC_012032	GCC	3	9	964893	964901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524054
14979	NC_012032	GCC	2	6	964905	964910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524054
14980	NC_012032	ACGC	2	8	964963	964970	25 %	0 %	25 %	50 %	222524054
14981	NC_012032	CTG	2	6	965028	965033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524054
14982	NC_012032	CCG	2	6	965065	965070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222524054
14983	NC_012032	TGC	2	6	965086	965091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524054
14984	NC_012032	GC	3	6	965115	965120	0 %	0 %	50 %	50 %	222524054
14985	NC_012032	CCGCC	2	10	965187	965196	0 %	0 %	20 %	80 %	222524054
14986	NC_012032	GATC	2	8	965210	965217	25 %	25 %	25 %	25 %	222524054
14987	NC_012032	CGA	2	6	965222	965227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524054
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14990	NC_012032	CAT	2	6	965513	965518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222524054
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14992	NC_012032	TGAGA	2	10	965629	965638	40 %	20 %	40 %	0 %	222524054
14993	NC_012032	TGG	2	6	965712	965717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222524055
14994	NC_012032	TCGCCG	2	12	965719	965730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222524055
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14996	NC_012032	CGA	2	6	965801	965806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222524055
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14999	NC_012032	GCT	2	6	966071	966076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222524055
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