MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12005	NC_012032	CAGG	2	8	771152	771159	25 %	0 %	50 %	25 %	222523919
12006	NC_012032	CCA	2	6	771205	771210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523919
12007	NC_012032	CAT	2	6	771395	771400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523919
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12009	NC_012032	CGTCGC	2	12	771496	771507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523919
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12022	NC_012032	TAC	2	6	772403	772408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523920
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12119	NC_012032	CGT	2	6	783082	783087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523923
12120	NC_012032	GCA	2	6	783112	783117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523923
12121	NC_012032	ACA	2	6	783120	783125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523923
12122	NC_012032	TGC	2	6	783212	783217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523923
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12124	NC_012032	CAA	2	6	783324	783329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523924
12125	NC_012032	CCA	2	6	783342	783347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523924
12126	NC_012032	GCA	2	6	783425	783430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523924
12127	NC_012032	CGA	2	6	783485	783490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523924
12128	NC_012032	TGC	2	6	783517	783522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523924
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12131	NC_012032	CAAGC	2	10	783691	783700	40 %	0 %	20 %	40 %	222523924
12132	NC_012032	CAG	2	6	783790	783795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523924
12133	NC_012032	CTGC	2	8	783804	783811	0 %	25 %	25 %	50 %	222523924
12134	NC_012032	TGC	2	6	783856	783861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523924
12135	NC_012032	GTT	2	6	783899	783904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523924
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12140	NC_012032	CGTG	2	8	784424	784431	0 %	25 %	50 %	25 %	222523926
12141	NC_012032	TGT	2	6	784475	784480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523926
12142	NC_012032	GCAA	2	8	784506	784513	50 %	0 %	25 %	25 %	222523926
12143	NC_012032	CAA	2	6	784531	784536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523926
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12146	NC_012032	TGA	2	6	784748	784753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523926
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12150	NC_012032	ACC	2	6	784905	784910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523926
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12155	NC_012032	GCC	2	6	785248	785253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523927
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12174	NC_012032	CGCC	2	8	785927	785934	0 %	0 %	25 %	75 %	222523927
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12182	NC_012032	CAGA	2	8	786259	786266	50 %	0 %	25 %	25 %	222523928
12183	NC_012032	GTA	2	6	786270	786275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523928
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12192	NC_012032	GGGTC	2	10	786887	786896	0 %	20 %	60 %	20 %	222523928
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12197	NC_012032	GCT	2	6	787162	787167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523928
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12204	NC_012032	GCA	2	6	787712	787717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523929
12205	NC_012032	GCAG	2	8	787720	787727	25 %	0 %	50 %	25 %	222523929
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12215	NC_012032	CTA	2	6	788299	788304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523929
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12218	NC_012032	TTGA	2	8	788695	788702	25 %	50 %	25 %	0 %	222523929
12219	NC_012032	CAT	2	6	789005	789010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523930
12220	NC_012032	CA	3	6	789045	789050	50 %	0 %	0 %	50 %	222523930
12221	NC_012032	ATAC	2	8	789066	789073	50 %	25 %	0 %	25 %	222523930
12222	NC_012032	CCAC	2	8	789124	789131	25 %	0 %	0 %	75 %	222523930
12223	NC_012032	TG	3	6	789144	789149	0 %	50 %	50 %	0 %	222523930
12224	NC_012032	TC	3	6	789170	789175	0 %	50 %	0 %	50 %	222523930
12225	NC_012032	ATC	2	6	789287	789292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523930
12226	NC_012032	GCA	3	9	789401	789409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523930
12227	NC_012032	GAT	2	6	789453	789458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523930
12228	NC_012032	ATC	2	6	789489	789494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523930
12229	NC_012032	GCC	2	6	789651	789656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523930
12230	NC_012032	CGC	2	6	789706	789711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523930
12231	NC_012032	AGCC	2	8	789715	789722	25 %	0 %	25 %	50 %	222523930
12232	NC_012032	GAA	2	6	789753	789758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523930
12233	NC_012032	TCG	2	6	790265	790270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523931
12234	NC_012032	GGA	2	6	790305	790310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523931
12235	NC_012032	CTTC	2	8	790313	790320	0 %	50 %	0 %	50 %	222523931
12236	NC_012032	TCA	2	6	791066	791071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523932
12237	NC_012032	CCG	2	6	791112	791117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523932
12238	NC_012032	GTGA	2	8	791167	791174	25 %	25 %	50 %	0 %	222523932
12239	NC_012032	TCG	2	6	791245	791250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523932
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12357	NC_012032	AGC	2	6	801223	801228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523938
12358	NC_012032	TCAAC	2	10	801245	801254	40 %	20 %	0 %	40 %	222523938
12359	NC_012032	GAT	2	6	801432	801437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523938
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12472	NC_012032	GCCTG	2	10	810109	810118	0 %	20 %	40 %	40 %	222523944
12473	NC_012032	TGA	2	6	810257	810262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523944
12474	NC_012032	TGA	2	6	810281	810286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523944
12475	NC_012032	GAT	2	6	810341	810346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523944
12476	NC_012032	CGC	2	6	810351	810356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523944
12477	NC_012032	CACC	2	8	810374	810381	25 %	0 %	0 %	75 %	222523944
12478	NC_012032	GGCG	2	8	810438	810445	0 %	0 %	75 %	25 %	222523944
12479	NC_012032	TAT	2	6	810466	810471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523944
12480	NC_012032	CCG	2	6	810472	810477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523944
12481	NC_012032	AAC	2	6	810478	810483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523944
12482	NC_012032	TGA	2	6	810488	810493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523944
12483	NC_012032	AATT	2	8	810595	810602	50 %	50 %	0 %	0 %	222523944
12484	NC_012032	GC	3	6	810766	810771	0 %	0 %	50 %	50 %	222523945
12485	NC_012032	GCT	2	6	810790	810795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523945
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12487	NC_012032	TTTC	2	8	811039	811046	0 %	75 %	0 %	25 %	222523945
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12491	NC_012032	TGG	2	6	811289	811294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523945
12492	NC_012032	GGC	2	6	811302	811307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523945
12493	NC_012032	AGCC	2	8	811330	811337	25 %	0 %	25 %	50 %	222523945
12494	NC_012032	GCAG	2	8	811357	811364	25 %	0 %	50 %	25 %	222523945
12495	NC_012032	CTGG	2	8	811377	811384	0 %	25 %	50 %	25 %	222523945
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