MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012032	CGC	2	6	679157	679162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523859
11002	NC_012032	G	6	6	679188	679193	0 %	0 %	100 %	0 %	222523859
11003	NC_012032	CTGA	2	8	679311	679318	25 %	25 %	25 %	25 %	222523859
11004	NC_012032	TAT	2	6	679338	679343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523859
11005	NC_012032	CCA	2	6	679347	679352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523859
11006	NC_012032	GTT	2	6	679520	679525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523859
11007	NC_012032	GAA	2	6	679592	679597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523859
11008	NC_012032	CGA	2	6	679601	679606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523859
11009	NC_012032	GCAG	2	8	679835	679842	25 %	0 %	50 %	25 %	222523860
11010	NC_012032	TGG	2	6	679936	679941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523860
11011	NC_012032	GGCA	2	8	679978	679985	25 %	0 %	50 %	25 %	222523860
11012	NC_012032	TCA	2	6	680062	680067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523860
11013	NC_012032	GGCC	2	8	680099	680106	0 %	0 %	50 %	50 %	222523860
11014	NC_012032	TGC	2	6	680150	680155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523860
11015	NC_012032	GC	3	6	680268	680273	0 %	0 %	50 %	50 %	222523860
11016	NC_012032	GCA	2	6	680347	680352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523860
11017	NC_012032	ACC	2	6	680385	680390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523860
11018	NC_012032	TCC	2	6	680458	680463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523860
11019	NC_012032	GTT	2	6	680510	680515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523860
11020	NC_012032	ACG	2	6	680523	680528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523860
11021	NC_012032	CGC	2	6	680567	680572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523860
11022	NC_012032	ATT	2	6	680604	680609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523860
11023	NC_012032	TGGCAA	2	12	680611	680622	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222523860
11024	NC_012032	GGT	2	6	680628	680633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523860
11025	NC_012032	CTT	2	6	680693	680698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523860
11026	NC_012032	CGGT	2	8	680752	680759	0 %	25 %	50 %	25 %	222523860
11027	NC_012032	ATC	2	6	680760	680765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523860
11028	NC_012032	GGGT	2	8	680783	680790	0 %	25 %	75 %	0 %	222523860
11029	NC_012032	GC	3	6	680819	680824	0 %	0 %	50 %	50 %	222523860
11030	NC_012032	CCGG	2	8	681111	681118	0 %	0 %	50 %	50 %	222523861
11031	NC_012032	GGC	2	6	681123	681128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523861
11032	NC_012032	GAA	2	6	681133	681138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523861
11033	NC_012032	TCA	2	6	681162	681167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523861
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11035	NC_012032	TGATG	2	10	681198	681207	20 %	40 %	40 %	0 %	222523861
11036	NC_012032	GATT	2	8	681285	681292	25 %	50 %	25 %	0 %	222523861
11037	NC_012032	TGG	2	6	681365	681370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523861
11038	NC_012032	TTG	3	9	681490	681498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523861
11039	NC_012032	CGA	2	6	681501	681506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523861
11040	NC_012032	GCT	2	6	681547	681552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523861
11041	NC_012032	AAC	2	6	681576	681581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523861
11042	NC_012032	CGA	2	6	681596	681601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523862
11043	NC_012032	GAC	2	6	681653	681658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523862
11044	NC_012032	ACG	2	6	681847	681852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523862
11045	NC_012032	TAC	2	6	682026	682031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523862
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11048	NC_012032	CCGACA	2	12	682201	682212	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222523863
11049	NC_012032	GATC	2	8	682308	682315	25 %	25 %	25 %	25 %	222523863
11050	NC_012032	GTC	2	6	682333	682338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523863
11051	NC_012032	CAC	2	6	682355	682360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523863
11052	NC_012032	GGC	2	6	682411	682416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523863
11053	NC_012032	T	6	6	682417	682422	0 %	100 %	0 %	0 %	222523863
11054	NC_012032	CAG	2	6	682426	682431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523863
11055	NC_012032	GCT	2	6	682446	682451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523863
11056	NC_012032	CAG	2	6	682462	682467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523863
11057	NC_012032	CGA	2	6	682635	682640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523863
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11059	NC_012032	TTC	2	6	682800	682805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523863
11060	NC_012032	T	6	6	683018	683023	0 %	100 %	0 %	0 %	222523864
11061	NC_012032	TGG	2	6	683090	683095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523864
11062	NC_012032	TCA	2	6	683121	683126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523864
11063	NC_012032	CAA	2	6	683227	683232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523864
11064	NC_012032	TGC	2	6	683355	683360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523864
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11068	NC_012032	TGA	2	6	683487	683492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523864
11069	NC_012032	TCGCT	2	10	683518	683527	0 %	40 %	20 %	40 %	222523864
11070	NC_012032	GGCT	2	8	683531	683538	0 %	25 %	50 %	25 %	222523864
11071	NC_012032	TAT	2	6	683572	683577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523864
11072	NC_012032	CTGG	2	8	683641	683648	0 %	25 %	50 %	25 %	222523864
11073	NC_012032	ATGC	2	8	683675	683682	25 %	25 %	25 %	25 %	222523864
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11085	NC_012032	CGGTT	2	10	684358	684367	0 %	40 %	40 %	20 %	222523865
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11089	NC_012032	GGC	2	6	684650	684655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523865
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11099	NC_012032	C	6	6	685184	685189	0 %	0 %	0 %	100 %	222523865
11100	NC_012032	GAC	2	6	685265	685270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523865
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11104	NC_012032	GCTG	2	8	685552	685559	0 %	25 %	50 %	25 %	222523866
11105	NC_012032	GCA	2	6	685567	685572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523866
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11107	NC_012032	AGC	2	6	685821	685826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523867
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11110	NC_012032	TAC	2	6	685920	685925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523867
11111	NC_012032	TCG	3	9	686005	686013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523867
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11114	NC_012032	GCC	2	6	686159	686164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523867
11115	NC_012032	GATT	2	8	686171	686178	25 %	50 %	25 %	0 %	222523867
11116	NC_012032	ACG	2	6	686245	686250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523867
11117	NC_012032	GGAT	2	8	686274	686281	25 %	25 %	50 %	0 %	222523867
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11234	NC_012032	GTA	2	6	694691	694696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523873
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11238	NC_012032	TGCG	2	8	696758	696765	0 %	25 %	50 %	25 %	222523874
11239	NC_012032	AGCC	2	8	696889	696896	25 %	0 %	25 %	50 %	222523874
11240	NC_012032	TGCC	2	8	696904	696911	0 %	25 %	25 %	50 %	222523874
11241	NC_012032	GTC	2	6	696936	696941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523874
11242	NC_012032	CGA	2	6	696971	696976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523874
11243	NC_012032	CG	3	6	696981	696986	0 %	0 %	50 %	50 %	222523874
11244	NC_012032	CAT	3	9	697157	697165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523874
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11246	NC_012032	ATG	2	6	697216	697221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523874
11247	NC_012032	GTG	2	6	697306	697311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523874
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11251	NC_012032	GGC	2	6	697509	697514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523874
11252	NC_012032	GGC	2	6	697563	697568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523874
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11257	NC_012032	ACA	2	6	697720	697725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523874
11258	NC_012032	GC	3	6	697743	697748	0 %	0 %	50 %	50 %	222523874
11259	NC_012032	CGG	2	6	697772	697777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523874
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11266	NC_012032	GCG	3	9	697993	698001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523874
11267	NC_012032	TGCC	2	8	698002	698009	0 %	25 %	25 %	50 %	222523874
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11271	NC_012032	GCG	2	6	698194	698199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523874
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11274	NC_012032	ACCG	2	8	698304	698311	25 %	0 %	25 %	50 %	222523874
11275	NC_012032	TGGT	2	8	698367	698374	0 %	50 %	50 %	0 %	222523874
11276	NC_012032	GCA	2	6	698899	698904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523875
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11281	NC_012032	GAT	2	6	699847	699852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523876
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11288	NC_012032	GATC	2	8	700330	700337	25 %	25 %	25 %	25 %	222523876
11289	NC_012032	CTT	2	6	700381	700386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523876
11290	NC_012032	GTA	2	6	700427	700432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523876
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11294	NC_012032	TCAA	2	8	701513	701520	50 %	25 %	0 %	25 %	222523877
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11303	NC_012032	GTC	2	6	702133	702138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523877
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11309	NC_012032	CCA	2	6	702571	702576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523879
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11340	NC_012032	GCT	2	6	705415	705420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523881
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11343	NC_012032	TGC	2	6	705623	705628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523881
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11345	NC_012032	TGC	2	6	706234	706239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523882
11346	NC_012032	CGGGC	2	10	706315	706324	0 %	0 %	60 %	40 %	222523882
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11348	NC_012032	TTG	2	6	706488	706493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523882
11349	NC_012032	TCGTC	2	10	706554	706563	0 %	40 %	20 %	40 %	222523882
11350	NC_012032	CGG	3	9	706572	706580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523882
11351	NC_012032	AACC	2	8	706693	706700	50 %	0 %	0 %	50 %	222523882
11352	NC_012032	GAT	2	6	706756	706761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523882
11353	NC_012032	TGC	2	6	706768	706773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523882
11354	NC_012032	TGA	2	6	706797	706802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523882
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11356	NC_012032	ATC	2	6	706895	706900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523882
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11358	NC_012032	CTG	2	6	707039	707044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523882
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11475	NC_012032	GGC	2	6	735576	735581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523891
11476	NC_012032	AC	3	6	735593	735598	50 %	0 %	0 %	50 %	222523891
11477	NC_012032	GAT	2	6	735706	735711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523891
11478	NC_012032	CGC	2	6	735726	735731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523891
11479	NC_012032	CAG	2	6	735797	735802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523891
11480	NC_012032	CTG	2	6	735884	735889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523891
11481	NC_012032	GCTGCC	2	12	735931	735942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523891
11482	NC_012032	CTG	2	6	735962	735967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523891
11483	NC_012032	ACC	2	6	736005	736010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523891
11484	NC_012032	TGAG	2	8	736011	736018	25 %	25 %	50 %	0 %	222523891
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11487	NC_012032	TTGA	2	8	736097	736104	25 %	50 %	25 %	0 %	222523891
11488	NC_012032	GCC	2	6	736239	736244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523891
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11497	NC_012032	CTG	2	6	736631	736636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523891
11498	NC_012032	CAG	2	6	736673	736678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523891
11499	NC_012032	AAT	2	6	736685	736690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523891
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