MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012032	TCAG	2	8	649757	649764	25 %	25 %	25 %	25 %	222523836
10502	NC_012032	ACC	2	6	649780	649785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523836
10503	NC_012032	GGGC	2	8	649989	649996	0 %	0 %	75 %	25 %	222523836
10504	NC_012032	GAT	2	6	650020	650025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523836
10505	NC_012032	CAG	2	6	650037	650042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10506	NC_012032	GCT	2	6	650061	650066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10507	NC_012032	TGC	2	6	650141	650146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10508	NC_012032	AGT	2	6	650148	650153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523836
10509	NC_012032	TCG	2	6	650236	650241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10510	NC_012032	GAT	2	6	650272	650277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523836
10511	NC_012032	CAG	2	6	650296	650301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10512	NC_012032	ACA	3	9	650310	650318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523836
10513	NC_012032	CCAAC	2	10	650321	650330	40 %	0 %	0 %	60 %	222523836
10514	NC_012032	GGT	2	6	650375	650380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523836
10515	NC_012032	CAC	2	6	650417	650422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523836
10516	NC_012032	AGCC	2	8	650447	650454	25 %	0 %	25 %	50 %	222523836
10517	NC_012032	GC	3	6	650485	650490	0 %	0 %	50 %	50 %	222523836
10518	NC_012032	CT	3	6	650497	650502	0 %	50 %	0 %	50 %	222523836
10519	NC_012032	AGC	2	6	650513	650518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10520	NC_012032	CAC	2	6	650541	650546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523836
10521	NC_012032	CAAT	2	8	650589	650596	50 %	25 %	0 %	25 %	222523836
10522	NC_012032	CAC	2	6	650613	650618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523836
10523	NC_012032	ACT	2	6	650720	650725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523836
10524	NC_012032	CGT	2	6	650887	650892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10525	NC_012032	CAG	2	6	650914	650919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10526	NC_012032	AACC	2	8	651000	651007	50 %	0 %	0 %	50 %	222523836
10527	NC_012032	TGC	2	6	651016	651021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10528	NC_012032	GCC	2	6	651026	651031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523836
10529	NC_012032	CCAGC	2	10	651136	651145	20 %	0 %	20 %	60 %	222523836
10530	NC_012032	CAG	2	6	651187	651192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10531	NC_012032	AT	3	6	651242	651247	50 %	50 %	0 %	0 %	222523836
10532	NC_012032	AGC	2	6	651314	651319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10533	NC_012032	TGC	2	6	652042	652047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523837
10534	NC_012032	CACC	2	8	652053	652060	25 %	0 %	0 %	75 %	222523837
10535	NC_012032	CAA	2	6	652155	652160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523837
10536	NC_012032	TCAA	2	8	652214	652221	50 %	25 %	0 %	25 %	222523837
10537	NC_012032	CCA	2	6	652226	652231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523837
10538	NC_012032	GGC	2	6	652248	652253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523837
10539	NC_012032	GC	3	6	652285	652290	0 %	0 %	50 %	50 %	222523837
10540	NC_012032	ACTG	2	8	652299	652306	25 %	25 %	25 %	25 %	222523837
10541	NC_012032	TCCCA	2	10	652361	652370	20 %	20 %	0 %	60 %	222523838
10542	NC_012032	TCA	2	6	652375	652380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523838
10543	NC_012032	CAC	2	6	652424	652429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523838
10544	NC_012032	GC	3	6	652503	652508	0 %	0 %	50 %	50 %	222523838
10545	NC_012032	CGG	2	6	652515	652520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523838
10546	NC_012032	TCGACA	2	12	652555	652566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222523838
10547	NC_012032	CGG	2	6	652656	652661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523838
10548	NC_012032	ATC	2	6	652878	652883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523838
10549	NC_012032	ACAA	2	8	652953	652960	75 %	0 %	0 %	25 %	222523838
10550	NC_012032	TGC	2	6	653136	653141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523838
10551	NC_012032	TCGC	2	8	653200	653207	0 %	25 %	25 %	50 %	222523838
10552	NC_012032	TCTG	2	8	653218	653225	0 %	50 %	25 %	25 %	222523838
10553	NC_012032	GAT	2	6	653234	653239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523838
10554	NC_012032	GAC	2	6	653255	653260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523838
10555	NC_012032	CAA	2	6	653276	653281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523838
10556	NC_012032	CAT	2	6	653285	653290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523838
10557	NC_012032	TCGATA	2	12	653307	653318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222523839
10558	NC_012032	ACA	2	6	653375	653380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523839
10559	NC_012032	ACC	2	6	653588	653593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523839
10560	NC_012032	TCA	2	6	653637	653642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523839
10561	NC_012032	GACCAA	2	12	653689	653700	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222523839
10562	NC_012032	ACA	2	6	653709	653714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523839
10563	NC_012032	CGG	2	6	653735	653740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523839
10564	NC_012032	GCC	2	6	653786	653791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523839
10565	NC_012032	CAT	2	6	653807	653812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523839
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10567	NC_012032	CGCTG	2	10	653853	653862	0 %	20 %	40 %	40 %	222523839
10568	NC_012032	AGC	2	6	653918	653923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523839
10569	NC_012032	AGCAG	2	10	653979	653988	40 %	0 %	40 %	20 %	222523839
10570	NC_012032	TGGA	2	8	654054	654061	25 %	25 %	50 %	0 %	222523839
10571	NC_012032	CCG	2	6	654150	654155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523839
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10574	NC_012032	CAA	2	6	654287	654292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523839
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10585	NC_012032	TTCC	2	8	654856	654863	0 %	50 %	0 %	50 %	222523840
10586	NC_012032	TGG	2	6	654869	654874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523840
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10589	NC_012032	ACC	2	6	655007	655012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523840
10590	NC_012032	ACA	2	6	655173	655178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523840
10591	NC_012032	CG	3	6	655183	655188	0 %	0 %	50 %	50 %	222523840
10592	NC_012032	GAC	2	6	655221	655226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523840
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10601	NC_012032	CGGTT	2	10	655688	655697	0 %	40 %	40 %	20 %	222523840
10602	NC_012032	ACC	3	9	655709	655717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523840
10603	NC_012032	CAA	2	6	655727	655732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523840
10604	NC_012032	GCT	2	6	655831	655836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523841
10605	NC_012032	CT	3	6	655842	655847	0 %	50 %	0 %	50 %	222523841
10606	NC_012032	GCT	2	6	655851	655856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523841
10607	NC_012032	ATG	2	6	655899	655904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523841
10608	NC_012032	TTG	2	6	656064	656069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523841
10609	NC_012032	CAGC	2	8	656197	656204	25 %	0 %	25 %	50 %	222523841
10610	NC_012032	CGA	2	6	656233	656238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523841
10611	NC_012032	CGG	2	6	656290	656295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523841
10612	NC_012032	G	7	7	656322	656328	0 %	0 %	100 %	0 %	222523841
10613	NC_012032	CAG	2	6	656444	656449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523841
10614	NC_012032	TTA	2	6	656499	656504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523841
10615	NC_012032	ACCCCA	2	12	656550	656561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523841
10616	NC_012032	CCA	2	6	656625	656630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523841
10617	NC_012032	TCGG	2	8	656650	656657	0 %	25 %	50 %	25 %	222523841
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10619	NC_012032	CCAT	2	8	656844	656851	25 %	25 %	0 %	50 %	222523841
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10858	NC_012032	TGAT	2	8	671076	671083	25 %	50 %	25 %	0 %	222523855
10859	NC_012032	CTG	2	6	671087	671092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523855
10860	NC_012032	CACC	2	8	671152	671159	25 %	0 %	0 %	75 %	222523855
10861	NC_012032	CTTGC	2	10	671186	671195	0 %	40 %	20 %	40 %	222523855
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10976	NC_012032	GCC	2	6	676751	676756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523857
10977	NC_012032	GAA	2	6	676779	676784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523857
10978	NC_012032	TGC	2	6	677185	677190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523858
10979	NC_012032	ATGT	2	8	677195	677202	25 %	50 %	25 %	0 %	222523858
10980	NC_012032	TGG	2	6	677284	677289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523858
10981	NC_012032	GTT	2	6	677290	677295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523858
10982	NC_012032	GCAG	2	8	677296	677303	25 %	0 %	50 %	25 %	222523858
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10999	NC_012032	GAT	2	6	678959	678964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523859
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