MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_012032	GAAGA	2	10	5254178	5254187	60 %	0 %	40 %	0 %	222527444
84502	NC_012032	TGA	2	6	5254192	5254197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527444
84503	NC_012032	ATG	2	6	5254227	5254232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527444
84504	NC_012032	GAA	3	9	5254274	5254282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222527444
84505	NC_012032	TGC	2	6	5254773	5254778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527445
84506	NC_012032	GGCC	2	8	5254830	5254837	0 %	0 %	50 %	50 %	222527445
84507	NC_012032	CGC	2	6	5254840	5254845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527445
84508	NC_012032	CTA	2	6	5254884	5254889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527445
84509	NC_012032	CTG	2	6	5254942	5254947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527445
84510	NC_012032	GCT	2	6	5254953	5254958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527445
84511	NC_012032	GCCA	2	8	5254966	5254973	25 %	0 %	25 %	50 %	222527445
84512	NC_012032	CTGG	2	8	5254974	5254981	0 %	25 %	50 %	25 %	222527445
84513	NC_012032	CGCT	2	8	5255050	5255057	0 %	25 %	25 %	50 %	222527445
84514	NC_012032	CCA	2	6	5255116	5255121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527445
84515	NC_012032	CCT	2	6	5255238	5255243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222527445
84516	NC_012032	TCT	2	6	5255478	5255483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222527446
84517	NC_012032	GTC	2	6	5255675	5255680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84518	NC_012032	CAG	2	6	5255981	5255986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84519	NC_012032	CAA	2	6	5256019	5256024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222527446
84520	NC_012032	TGA	2	6	5256034	5256039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527446
84521	NC_012032	CGA	2	6	5256109	5256114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84522	NC_012032	GAC	2	6	5256154	5256159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84523	NC_012032	ACG	2	6	5256185	5256190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84524	NC_012032	CGC	2	6	5256205	5256210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527446
84525	NC_012032	TCG	2	6	5256212	5256217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84526	NC_012032	GC	3	6	5256283	5256288	0 %	0 %	50 %	50 %	222527446
84527	NC_012032	GAT	2	6	5256340	5256345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527446
84528	NC_012032	ATC	2	6	5256392	5256397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527446
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84530	NC_012032	GCC	2	6	5256557	5256562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527446
84531	NC_012032	GAC	2	6	5256628	5256633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84532	NC_012032	GTA	2	6	5256677	5256682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527446
84533	NC_012032	TGC	2	6	5256733	5256738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84534	NC_012032	GTATG	2	10	5256943	5256952	20 %	40 %	40 %	0 %	222527446
84535	NC_012032	GCC	2	6	5256966	5256971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527446
84536	NC_012032	CGA	2	6	5256985	5256990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84537	NC_012032	TGA	2	6	5257029	5257034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527446
84538	NC_012032	GGC	2	6	5257073	5257078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527446
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84541	NC_012032	GCA	2	6	5257412	5257417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84542	NC_012032	TGC	2	6	5257431	5257436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84543	NC_012032	TCG	2	6	5257494	5257499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527446
84544	NC_012032	CAT	2	6	5257502	5257507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527446
84545	NC_012032	GTC	2	6	5257523	5257528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527446
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84547	NC_012032	ATG	2	6	5257564	5257569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527447
84548	NC_012032	GT	4	8	5257618	5257625	0 %	50 %	50 %	0 %	222527447
84549	NC_012032	TGC	2	6	5257631	5257636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527447
84550	NC_012032	GCA	2	6	5257644	5257649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527447
84551	NC_012032	CA	3	6	5257699	5257704	50 %	0 %	0 %	50 %	222527447
84552	NC_012032	TGC	2	6	5257728	5257733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527447
84553	NC_012032	TTG	2	6	5257892	5257897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527447
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84555	NC_012032	ATCA	2	8	5258074	5258081	50 %	25 %	0 %	25 %	222527447
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84557	NC_012032	TGA	2	6	5258273	5258278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527447
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84565	NC_012032	TGGA	2	8	5258754	5258761	25 %	25 %	50 %	0 %	222527448
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84586	NC_012032	CG	3	6	5260103	5260108	0 %	0 %	50 %	50 %	222527450
84587	NC_012032	TAC	2	6	5260182	5260187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527450
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84599	NC_012032	CTGC	2	8	5261067	5261074	0 %	25 %	25 %	50 %	222527451
84600	NC_012032	GCGTC	2	10	5261134	5261143	0 %	20 %	40 %	40 %	222527451
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84606	NC_012032	CA	3	6	5261409	5261414	50 %	0 %	0 %	50 %	222527452
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84612	NC_012032	TCA	2	6	5261527	5261532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527452
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84615	NC_012032	TGG	2	6	5261655	5261660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527452
84616	NC_012032	TGG	2	6	5261680	5261685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527452
84617	NC_012032	TGG	3	9	5261697	5261705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527452
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84619	NC_012032	GTC	2	6	5261732	5261737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527452
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84621	NC_012032	CGG	2	6	5261835	5261840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527452
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84626	NC_012032	TCG	2	6	5262207	5262212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527453
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84726	NC_012032	ATG	2	6	5267409	5267414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527459
84727	NC_012032	GGC	2	6	5267593	5267598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527459
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84729	NC_012032	TGA	2	6	5267958	5267963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527460
84730	NC_012032	TGC	2	6	5268099	5268104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527460
84731	NC_012032	ATC	2	6	5268121	5268126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527460
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