MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8003	NC_012032	TCAT	2	8	501791	501798	25 %	50 %	0 %	25 %	222523715
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8006	NC_012032	GAC	2	6	502194	502199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523716
8007	NC_012032	CGAC	2	8	502247	502254	25 %	0 %	25 %	50 %	222523716
8008	NC_012032	AT	3	6	502266	502271	50 %	50 %	0 %	0 %	222523716
8009	NC_012032	GTG	2	6	502318	502323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523716
8010	NC_012032	CGT	2	6	502357	502362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523716
8011	NC_012032	GCC	2	6	502366	502371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523716
8012	NC_012032	TCA	3	9	502385	502393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523716
8013	NC_012032	GGC	2	6	502399	502404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523716
8014	NC_012032	CCG	2	6	502416	502421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523716
8015	NC_012032	CGG	2	6	502517	502522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523716
8016	NC_012032	TGCC	2	8	502573	502580	0 %	25 %	25 %	50 %	222523716
8017	NC_012032	GGA	2	6	502816	502821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523717
8018	NC_012032	CCG	2	6	502892	502897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523717
8019	NC_012032	GC	3	6	502979	502984	0 %	0 %	50 %	50 %	222523717
8020	NC_012032	GC	3	6	502996	503001	0 %	0 %	50 %	50 %	222523717
8021	NC_012032	CGGG	2	8	503002	503009	0 %	0 %	75 %	25 %	222523717
8022	NC_012032	GAA	2	6	503162	503167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523717
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8024	NC_012032	CCCGG	2	10	503228	503237	0 %	0 %	40 %	60 %	222523717
8025	NC_012032	GTG	2	6	503286	503291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523717
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8029	NC_012032	GTG	2	6	503575	503580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523718
8030	NC_012032	GTA	2	6	503597	503602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523718
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8045	NC_012032	GAT	2	6	504799	504804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523720
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8053	NC_012032	CGGA	2	8	505730	505737	25 %	0 %	50 %	25 %	222523721
8054	NC_012032	CCA	2	6	505798	505803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523721
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8120	NC_012032	CAC	2	6	509386	509391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523722
8121	NC_012032	GCT	2	6	509420	509425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523722
8122	NC_012032	CGC	2	6	509426	509431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523722
8123	NC_012032	CCG	2	6	509467	509472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523722
8124	NC_012032	AGGT	2	8	509489	509496	25 %	25 %	50 %	0 %	222523722
8125	NC_012032	TCA	2	6	509510	509515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523722
8126	NC_012032	TGCAT	2	10	509582	509591	20 %	40 %	20 %	20 %	222523722
8127	NC_012032	TGC	2	6	509609	509614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523722
8128	NC_012032	AGC	2	6	509741	509746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523722
8129	NC_012032	CAC	2	6	509785	509790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523722
8130	NC_012032	ACT	2	6	509884	509889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523722
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8132	NC_012032	GTA	2	6	509932	509937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523722
8133	NC_012032	CCA	2	6	509992	509997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523722
8134	NC_012032	TGC	2	6	510035	510040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523722
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8136	NC_012032	GCCAGT	2	12	510086	510097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222523722
8137	NC_012032	CA	3	6	510102	510107	50 %	0 %	0 %	50 %	222523722
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8140	NC_012032	GAT	2	6	510187	510192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523722
8141	NC_012032	GCA	2	6	510218	510223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523722
8142	NC_012032	GAC	2	6	510236	510241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523722
8143	NC_012032	ACC	2	6	510260	510265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523722
8144	NC_012032	AATG	2	8	510274	510281	50 %	25 %	25 %	0 %	222523722
8145	NC_012032	AAT	2	6	510292	510297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523722
8146	NC_012032	C	7	7	510327	510333	0 %	0 %	0 %	100 %	222523722
8147	NC_012032	CCG	2	6	510344	510349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523722
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8149	NC_012032	CACC	2	8	510396	510403	25 %	0 %	0 %	75 %	222523722
8150	NC_012032	TAC	2	6	510421	510426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523722
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8152	NC_012032	CTG	2	6	510606	510611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523723
8153	NC_012032	GATGA	2	10	510643	510652	40 %	20 %	40 %	0 %	222523723
8154	NC_012032	CCA	2	6	510656	510661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523723
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8157	NC_012032	AC	4	8	510869	510876	50 %	0 %	0 %	50 %	222523723
8158	NC_012032	CAG	2	6	510877	510882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523723
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8165	NC_012032	GCCGG	2	10	512256	512265	0 %	0 %	60 %	40 %	222523725
8166	NC_012032	AT	4	8	512288	512295	50 %	50 %	0 %	0 %	222523725
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8223	NC_012032	T	6	6	515670	515675	0 %	100 %	0 %	0 %	222523730
8224	NC_012032	CA	3	6	515709	515714	50 %	0 %	0 %	50 %	222523730
8225	NC_012032	GCA	2	6	515817	515822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523730
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8227	NC_012032	CTG	2	6	516013	516018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523730
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8230	NC_012032	CTG	2	6	516193	516198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523730
8231	NC_012032	ATC	2	6	516229	516234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523730
8232	NC_012032	AGT	2	6	516311	516316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523730
8233	NC_012032	CGTG	2	8	516433	516440	0 %	25 %	50 %	25 %	222523730
8234	NC_012032	CGG	2	6	516443	516448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523730
8235	NC_012032	ATC	2	6	516466	516471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523730
8236	NC_012032	AAT	2	6	516478	516483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523730
8237	NC_012032	GCA	2	6	516558	516563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523730
8238	NC_012032	TCA	2	6	516644	516649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523730
8239	NC_012032	GCA	2	6	516777	516782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523730
8240	NC_012032	TGC	2	6	516812	516817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523730
8241	NC_012032	TTA	2	6	516879	516884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523730
8242	NC_012032	TCA	2	6	516917	516922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523730
8243	NC_012032	TTCCA	2	10	517186	517195	20 %	40 %	0 %	40 %	222523731
8244	NC_012032	AAT	2	6	517210	517215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523731
8245	NC_012032	AGC	2	6	517220	517225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523731
8246	NC_012032	TCA	3	9	517226	517234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523731
8247	NC_012032	CAC	2	6	517259	517264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523731
8248	NC_012032	GCG	2	6	517320	517325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523731
8249	NC_012032	GT	3	6	517386	517391	0 %	50 %	50 %	0 %	222523731
8250	NC_012032	TTG	2	6	517448	517453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523731
8251	NC_012032	TCA	2	6	517508	517513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523731
8252	NC_012032	CAA	2	6	517524	517529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523731
8253	NC_012032	CAC	2	6	517582	517587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523731
8254	NC_012032	AAT	2	6	518812	518817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523732
8255	NC_012032	ACTGC	2	10	518841	518850	20 %	20 %	20 %	40 %	222523732
8256	NC_012032	CCAG	2	8	518901	518908	25 %	0 %	25 %	50 %	222523732
8257	NC_012032	GCTGT	2	10	518928	518937	0 %	40 %	40 %	20 %	222523732
8258	NC_012032	TGC	2	6	519033	519038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8259	NC_012032	GCA	3	9	519042	519050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8260	NC_012032	CGCT	2	8	519068	519075	0 %	25 %	25 %	50 %	222523732
8261	NC_012032	GAG	2	6	519130	519135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523732
8262	NC_012032	CCA	2	6	519175	519180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
8263	NC_012032	TGCG	2	8	519218	519225	0 %	25 %	50 %	25 %	222523732
8264	NC_012032	CAC	2	6	519264	519269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
8265	NC_012032	GTA	2	6	519319	519324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523732
8266	NC_012032	CGG	2	6	519331	519336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523732
8267	NC_012032	GTCA	2	8	519367	519374	25 %	25 %	25 %	25 %	222523732
8268	NC_012032	TC	3	6	519438	519443	0 %	50 %	0 %	50 %	222523732
8269	NC_012032	CAGGT	2	10	519524	519533	20 %	20 %	40 %	20 %	222523732
8270	NC_012032	GTT	2	6	519604	519609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523732
8271	NC_012032	GAC	2	6	519631	519636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8272	NC_012032	CACCGT	2	12	519655	519666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222523732
8273	NC_012032	GTA	2	6	519716	519721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523732
8274	NC_012032	CAC	2	6	519733	519738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
8275	NC_012032	CAA	2	6	519763	519768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523732
8276	NC_012032	CGT	2	6	519957	519962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8277	NC_012032	TGC	2	6	519963	519968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8278	NC_012032	CGG	2	6	519975	519980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523732
8279	NC_012032	CGG	2	6	519996	520001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523732
8280	NC_012032	GCA	2	6	520032	520037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
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8282	NC_012032	CGAC	2	8	520074	520081	25 %	0 %	25 %	50 %	222523732
8283	NC_012032	CCA	2	6	520151	520156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
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8315	NC_012032	TCA	2	6	521453	521458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523732
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8318	NC_012032	CCG	2	6	521520	521525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523732
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8323	NC_012032	GCTG	2	8	521767	521774	0 %	25 %	50 %	25 %	222523732
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8326	NC_012032	AGT	2	6	521986	521991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523732
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8330	NC_012032	TCC	2	6	522158	522163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523732
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8338	NC_012032	CAGGT	2	10	522500	522509	20 %	20 %	40 %	20 %	222523732
8339	NC_012032	CAC	2	6	522585	522590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
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8342	NC_012032	TGGC	2	8	522911	522918	0 %	25 %	50 %	25 %	222523732
8343	NC_012032	CCG	2	6	522927	522932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523732
8344	NC_012032	TCA	2	6	522935	522940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523732
8345	NC_012032	GTA	2	6	522997	523002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523732
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8347	NC_012032	GCC	2	6	523043	523048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523732
8348	NC_012032	GAC	2	6	523159	523164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
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8350	NC_012032	TGT	2	6	523311	523316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523732
8351	NC_012032	CCGG	2	8	523319	523326	0 %	0 %	50 %	50 %	222523732
8352	NC_012032	CTG	2	6	523385	523390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8353	NC_012032	CGC	2	6	523402	523407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523732
8354	NC_012032	CAT	2	6	523416	523421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523732
8355	NC_012032	CAC	3	9	523422	523430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
8356	NC_012032	CCGTTG	2	12	523508	523519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8357	NC_012032	GTC	2	6	523625	523630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8358	NC_012032	CGAGT	2	10	523642	523651	20 %	20 %	40 %	20 %	222523732
8359	NC_012032	GGC	2	6	523672	523677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523732
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8476	NC_012032	GCA	2	6	529269	529274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8477	NC_012032	GGT	2	6	529300	529305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523732
8478	NC_012032	TCA	2	6	529307	529312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523732
8479	NC_012032	CAG	2	6	529464	529469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8480	NC_012032	CAC	2	6	529476	529481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
8481	NC_012032	GAC	2	6	529528	529533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8482	NC_012032	GTC	2	6	529586	529591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8483	NC_012032	AC	3	6	529725	529730	50 %	0 %	0 %	50 %	222523732
8484	NC_012032	TCG	2	6	529814	529819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8485	NC_012032	CG	3	6	529836	529841	0 %	0 %	50 %	50 %	222523732
8486	NC_012032	CGA	2	6	529878	529883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8487	NC_012032	CAT	2	6	529956	529961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523732
8488	NC_012032	CAT	2	6	529980	529985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523732
8489	NC_012032	CCA	2	6	530033	530038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523732
8490	NC_012032	GCCATT	2	12	530047	530058	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222523732
8491	NC_012032	CGT	2	6	530143	530148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8492	NC_012032	CGT	2	6	530164	530169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732
8493	NC_012032	TGA	2	6	530220	530225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523732
8494	NC_012032	AGCA	2	8	530266	530273	50 %	0 %	25 %	25 %	222523732
8495	NC_012032	GTT	2	6	530372	530377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523732
8496	NC_012032	ATC	2	6	530542	530547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523732
8497	NC_012032	CAGG	2	8	530583	530590	25 %	0 %	50 %	25 %	222523732
8498	NC_012032	GTA	2	6	530602	530607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523732
8499	NC_012032	GTG	4	12	530654	530665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523732
8500	NC_012032	CTG	2	6	530678	530683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523732

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