MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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74002	NC_012032	AGC	2	6	4629120	4629125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526932
74003	NC_012032	AGT	2	6	4629154	4629159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222526932
74004	NC_012032	TGC	2	6	4629231	4629236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526932
74005	NC_012032	TGT	2	6	4629255	4629260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222526932
74006	NC_012032	GCG	2	6	4629329	4629334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222526933
74007	NC_012032	TGA	2	6	4629364	4629369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222526933
74008	NC_012032	CAC	2	6	4629374	4629379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222526933
74009	NC_012032	AGT	2	6	4629383	4629388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222526933
74010	NC_012032	CCA	2	6	4629452	4629457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222526933
74011	NC_012032	ATC	2	6	4629483	4629488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222526933
74012	NC_012032	GCAAT	2	10	4629489	4629498	40 %	20 %	20 %	20 %	222526933
74013	NC_012032	AGA	2	6	4629524	4629529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222526933
74014	NC_012032	GTG	2	6	4629542	4629547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222526933
74015	NC_012032	GGC	2	6	4629620	4629625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222526933
74016	NC_012032	CAA	2	6	4629684	4629689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222526933
74017	NC_012032	CCG	2	6	4629754	4629759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222526933
74018	NC_012032	GCA	2	6	4629770	4629775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526933
74019	NC_012032	CA	3	6	4629788	4629793	50 %	0 %	0 %	50 %	222526933
74020	NC_012032	CGC	2	6	4629886	4629891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222526933
74021	NC_012032	CG	4	8	4629980	4629987	0 %	0 %	50 %	50 %	222526933
74022	NC_012032	CGGG	2	8	4630001	4630008	0 %	0 %	75 %	25 %	222526933
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74026	NC_012032	CGG	2	6	4630169	4630174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222526933
74027	NC_012032	CCA	2	6	4630286	4630291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222526933
74028	NC_012032	ATC	2	6	4630356	4630361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222526933
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74032	NC_012032	GGGCC	2	10	4630580	4630589	0 %	0 %	60 %	40 %	222526933
74033	NC_012032	GGC	2	6	4630624	4630629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222526933
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74043	NC_012032	GC	3	6	4632459	4632464	0 %	0 %	50 %	50 %	222526934
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74046	NC_012032	GC	3	6	4632537	4632542	0 %	0 %	50 %	50 %	222526934
74047	NC_012032	GC	3	6	4632586	4632591	0 %	0 %	50 %	50 %	222526934
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74051	NC_012032	TGGTC	2	10	4632797	4632806	0 %	40 %	40 %	20 %	222526934
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74055	NC_012032	GC	3	6	4632880	4632885	0 %	0 %	50 %	50 %	222526934
74056	NC_012032	TCG	2	6	4632974	4632979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526934
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74062	NC_012032	GCT	2	6	4633136	4633141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526934
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74103	NC_012032	TTCA	2	8	4635757	4635764	25 %	50 %	0 %	25 %	222526938
74104	NC_012032	TCCGA	2	10	4635822	4635831	20 %	20 %	20 %	40 %	222526938
74105	NC_012032	A	6	6	4635887	4635892	100 %	0 %	0 %	0 %	222526938
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74109	NC_012032	CAATA	2	10	4636065	4636074	60 %	20 %	0 %	20 %	222526938
74110	NC_012032	GAC	2	6	4636078	4636083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526938
74111	NC_012032	A	6	6	4636088	4636093	100 %	0 %	0 %	0 %	222526938
74112	NC_012032	GCG	2	6	4636215	4636220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222526938
74113	NC_012032	AG	3	6	4636222	4636227	50 %	0 %	50 %	0 %	222526938
74114	NC_012032	TCG	2	6	4636244	4636249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526938
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74116	NC_012032	AAT	2	6	4636318	4636323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222526938
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74232	NC_012032	ACG	2	6	4643491	4643496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526947
74233	NC_012032	CTT	2	6	4643514	4643519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222526947
74234	NC_012032	CGT	2	6	4643530	4643535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526947
74235	NC_012032	TGGT	2	8	4643607	4643614	0 %	50 %	50 %	0 %	222526947
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74338	NC_012032	TGGG	2	8	4648959	4648966	0 %	25 %	75 %	0 %	222526951
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74347	NC_012032	CG	3	6	4650003	4650008	0 %	0 %	50 %	50 %	222526952
74348	NC_012032	GT	3	6	4650234	4650239	0 %	50 %	50 %	0 %	222526952
74349	NC_012032	CG	3	6	4650691	4650696	0 %	0 %	50 %	50 %	222526953
74350	NC_012032	CCG	2	6	4650699	4650704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222526953
74351	NC_012032	TCA	2	6	4650768	4650773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222526953
74352	NC_012032	GCC	2	6	4650779	4650784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222526953
74353	NC_012032	CTG	2	6	4650962	4650967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526953
74354	NC_012032	GTG	2	6	4650992	4650997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222526953
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74368	NC_012032	TGA	2	6	4652111	4652116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222526954
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74439	NC_012032	GCA	2	6	4657255	4657260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526958
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74450	NC_012032	CCG	2	6	4657949	4657954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222526959
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74453	NC_012032	CCACC	2	10	4658114	4658123	20 %	0 %	0 %	80 %	222526959
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74455	NC_012032	CGA	2	6	4658228	4658233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526959
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74463	NC_012032	CAC	2	6	4658672	4658677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222526959
74464	NC_012032	CCA	2	6	4658687	4658692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222526959
74465	NC_012032	TAA	2	6	4658756	4658761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222526959
74466	NC_012032	GTT	2	6	4658776	4658781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222526959
74467	NC_012032	CGG	2	6	4658789	4658794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222526959
74468	NC_012032	CG	3	6	4658861	4658866	0 %	0 %	50 %	50 %	222526959
74469	NC_012032	CAGCT	2	10	4658874	4658883	20 %	20 %	20 %	40 %	222526959
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74483	NC_012032	TGC	2	6	4659531	4659536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526959
74484	NC_012032	CAA	2	6	4659581	4659586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222526959
74485	NC_012032	GTC	2	6	4659690	4659695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526959
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74487	NC_012032	TGC	2	6	4659851	4659856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526960
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74490	NC_012032	TCT	2	6	4659945	4659950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222526960
74491	NC_012032	GCA	2	6	4659984	4659989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526960
74492	NC_012032	CTT	2	6	4660048	4660053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222526960
74493	NC_012032	TGG	2	6	4660093	4660098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222526960
74494	NC_012032	CA	3	6	4660169	4660174	50 %	0 %	0 %	50 %	222526960
74495	NC_012032	CAC	2	6	4660177	4660182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222526960
74496	NC_012032	CTGG	2	8	4660184	4660191	0 %	25 %	50 %	25 %	222526960
74497	NC_012032	TCAGAT	2	12	4660216	4660227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222526960
74498	NC_012032	CAG	3	9	4660247	4660255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222526960
74499	NC_012032	TGACCG	2	12	4660291	4660302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222526960
74500	NC_012032	CGT	2	6	4660445	4660450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222526961

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