MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012032	TCG	3	9	411292	411300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523640
6502	NC_012032	AGC	2	6	411412	411417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523640
6503	NC_012032	GAT	2	6	411441	411446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523640
6504	NC_012032	AGCAA	2	10	411491	411500	60 %	0 %	20 %	20 %	222523640
6505	NC_012032	GAT	2	6	411509	411514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523640
6506	NC_012032	AGA	2	6	411560	411565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523640
6507	NC_012032	TGA	2	6	411566	411571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523640
6508	NC_012032	ATC	2	6	411600	411605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523640
6509	NC_012032	ACA	2	6	411642	411647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523640
6510	NC_012032	TCC	2	6	412349	412354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523641
6511	NC_012032	C	6	6	412362	412367	0 %	0 %	0 %	100 %	222523641
6512	NC_012032	AC	3	6	412402	412407	50 %	0 %	0 %	50 %	222523641
6513	NC_012032	TCA	2	6	412571	412576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523641
6514	NC_012032	GA	3	6	412637	412642	50 %	0 %	50 %	0 %	222523641
6515	NC_012032	GCCC	2	8	412688	412695	0 %	0 %	25 %	75 %	222523641
6516	NC_012032	A	6	6	412717	412722	100 %	0 %	0 %	0 %	222523641
6517	NC_012032	TGG	2	6	412748	412753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523641
6518	NC_012032	CTT	2	6	412830	412835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523641
6519	NC_012032	AAG	2	6	412853	412858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523641
6520	NC_012032	AGA	2	6	412880	412885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523641
6521	NC_012032	GCT	2	6	412893	412898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523641
6522	NC_012032	CAA	2	6	412951	412956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523641
6523	NC_012032	TCGC	2	8	413002	413009	0 %	25 %	25 %	50 %	222523641
6524	NC_012032	AC	3	6	413076	413081	50 %	0 %	0 %	50 %	222523641
6525	NC_012032	CCG	2	6	413185	413190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523641
6526	NC_012032	GGC	2	6	413198	413203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523641
6527	NC_012032	TGC	2	6	413247	413252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523641
6528	NC_012032	GCC	2	6	413348	413353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523641
6529	NC_012032	TCA	2	6	413436	413441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523641
6530	NC_012032	TC	3	6	413468	413473	0 %	50 %	0 %	50 %	222523642
6531	NC_012032	CCGA	2	8	413500	413507	25 %	0 %	25 %	50 %	222523642
6532	NC_012032	TACC	2	8	413515	413522	25 %	25 %	0 %	50 %	222523642
6533	NC_012032	GCT	2	6	413562	413567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523642
6534	NC_012032	CAA	2	6	413639	413644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523642
6535	NC_012032	TCA	2	6	413662	413667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523642
6536	NC_012032	TGAG	2	8	413819	413826	25 %	25 %	50 %	0 %	222523642
6537	NC_012032	CAC	2	6	413843	413848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523642
6538	NC_012032	AC	3	6	413899	413904	50 %	0 %	0 %	50 %	222523642
6539	NC_012032	CAC	2	6	413907	413912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523642
6540	NC_012032	CCAG	2	8	413941	413948	25 %	0 %	25 %	50 %	222523642
6541	NC_012032	GT	3	6	414050	414055	0 %	50 %	50 %	0 %	222523642
6542	NC_012032	GCC	2	6	414075	414080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523642
6543	NC_012032	GCACCG	2	12	414096	414107	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222523642
6544	NC_012032	GGC	2	6	414257	414262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523642
6545	NC_012032	CAG	2	6	414380	414385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523642
6546	NC_012032	CAT	2	6	414422	414427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523642
6547	NC_012032	CGTAC	2	10	414480	414489	20 %	20 %	20 %	40 %	222523642
6548	NC_012032	AGGG	2	8	414537	414544	25 %	0 %	75 %	0 %	222523642
6549	NC_012032	GC	3	6	414545	414550	0 %	0 %	50 %	50 %	222523642
6550	NC_012032	GCA	2	6	414556	414561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523642
6551	NC_012032	GCA	2	6	414642	414647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523642
6552	NC_012032	ATAG	2	8	414655	414662	50 %	25 %	25 %	0 %	222523642
6553	NC_012032	CCG	2	6	414702	414707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523642
6554	NC_012032	GC	3	6	414750	414755	0 %	0 %	50 %	50 %	222523642
6555	NC_012032	ACCGG	2	10	414768	414777	20 %	0 %	40 %	40 %	222523642
6556	NC_012032	GCA	2	6	414835	414840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523642
6557	NC_012032	CCAG	2	8	414889	414896	25 %	0 %	25 %	50 %	222523642
6558	NC_012032	CAG	2	6	414911	414916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523642
6559	NC_012032	TGC	2	6	414993	414998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523642
6560	NC_012032	CA	3	6	414999	415004	50 %	0 %	0 %	50 %	222523642
6561	NC_012032	GTT	2	6	415120	415125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523642
6562	NC_012032	TCA	2	6	415247	415252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523643
6563	NC_012032	CTG	2	6	415323	415328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523643
6564	NC_012032	CAAG	2	8	415421	415428	50 %	0 %	25 %	25 %	222523643
6565	NC_012032	GGCG	2	8	415448	415455	0 %	0 %	75 %	25 %	222523643
6566	NC_012032	GTC	2	6	415459	415464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523643
6567	NC_012032	GTA	2	6	415566	415571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523643
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6569	NC_012032	TCC	2	6	415596	415601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523643
6570	NC_012032	CCAG	2	8	415662	415669	25 %	0 %	25 %	50 %	222523643
6571	NC_012032	GTG	2	6	415698	415703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523643
6572	NC_012032	GCT	2	6	415713	415718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523643
6573	NC_012032	CAG	2	6	415756	415761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523643
6574	NC_012032	GA	3	6	415861	415866	50 %	0 %	50 %	0 %	222523643
6575	NC_012032	GCA	2	6	415940	415945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523643
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6578	NC_012032	GTAGAC	2	12	416139	416150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222523643
6579	NC_012032	GAC	2	6	416223	416228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523643
6580	NC_012032	CCA	2	6	416285	416290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523643
6581	NC_012032	TAC	2	6	416295	416300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523643
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6583	NC_012032	CAA	2	6	416315	416320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523643
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6587	NC_012032	GC	3	6	416817	416822	0 %	0 %	50 %	50 %	222523644
6588	NC_012032	CTGC	2	8	416861	416868	0 %	25 %	25 %	50 %	222523644
6589	NC_012032	AAC	2	6	416878	416883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523644
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6592	NC_012032	CGG	2	6	417048	417053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523644
6593	NC_012032	CGC	2	6	417066	417071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523644
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6597	NC_012032	CACC	2	8	417287	417294	25 %	0 %	0 %	75 %	222523644
6598	NC_012032	TGT	2	6	417357	417362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523644
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6601	NC_012032	GCC	2	6	417600	417605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523645
6602	NC_012032	CAG	2	6	417628	417633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523645
6603	NC_012032	TGATC	2	10	417655	417664	20 %	40 %	20 %	20 %	222523645
6604	NC_012032	GA	3	6	419403	419408	50 %	0 %	50 %	0 %	222523646
6605	NC_012032	T	6	6	419441	419446	0 %	100 %	0 %	0 %	222523647
6606	NC_012032	CTG	2	6	419568	419573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523647
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6608	NC_012032	GCTCG	2	10	419666	419675	0 %	20 %	40 %	40 %	222523647
6609	NC_012032	GC	3	6	419688	419693	0 %	0 %	50 %	50 %	222523647
6610	NC_012032	GGTC	2	8	419908	419915	0 %	25 %	50 %	25 %	222523647
6611	NC_012032	ACG	2	6	419955	419960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523647
6612	NC_012032	GC	3	6	420137	420142	0 %	0 %	50 %	50 %	222523647
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6617	NC_012032	TCGG	2	8	420351	420358	0 %	25 %	50 %	25 %	222523647
6618	NC_012032	TGC	2	6	420457	420462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523647
6619	NC_012032	GAGC	2	8	420574	420581	25 %	0 %	50 %	25 %	222523648
6620	NC_012032	GC	3	6	420613	420618	0 %	0 %	50 %	50 %	222523648
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6622	NC_012032	CGT	2	6	420742	420747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523648
6623	NC_012032	GATC	2	8	420748	420755	25 %	25 %	25 %	25 %	222523648
6624	NC_012032	CGC	2	6	420766	420771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523648
6625	NC_012032	CCG	2	6	420783	420788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523648
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6631	NC_012032	CGC	2	6	421135	421140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523648
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6633	NC_012032	GATC	2	8	421312	421319	25 %	25 %	25 %	25 %	222523648
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6635	NC_012032	GCC	2	6	421457	421462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523648
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6726	NC_012032	GGT	2	6	428843	428848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523657
6727	NC_012032	GTC	2	6	428968	428973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523657
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6732	NC_012032	CGA	2	6	429347	429352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523657
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6734	NC_012032	GTT	3	9	429365	429373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523657
6735	NC_012032	TGA	2	6	429614	429619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523658
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6737	NC_012032	ACG	2	6	429743	429748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523659
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6739	NC_012032	TTTC	2	8	429780	429787	0 %	75 %	0 %	25 %	222523659
6740	NC_012032	GGT	2	6	429807	429812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523659
6741	NC_012032	GTG	2	6	429973	429978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523659
6742	NC_012032	GAT	2	6	429993	429998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523659
6743	NC_012032	AACTT	2	10	430004	430013	40 %	40 %	0 %	20 %	222523659
6744	NC_012032	AGC	2	6	430044	430049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523659
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6746	NC_012032	TCG	2	6	430091	430096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523659
6747	NC_012032	AAC	2	6	430322	430327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523659
6748	NC_012032	TCG	2	6	430403	430408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523659
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6756	NC_012032	GAC	2	6	430737	430742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523659
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6758	NC_012032	GAT	2	6	430891	430896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523659
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6761	NC_012032	CGA	2	6	431061	431066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523659
6762	NC_012032	TGG	2	6	431099	431104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523659
6763	NC_012032	CCG	2	6	431159	431164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523659
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6771	NC_012032	CCG	2	6	431675	431680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523660
6772	NC_012032	GAC	3	9	431709	431717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523660
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6775	NC_012032	ACG	2	6	431833	431838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523660
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6984	NC_012032	CAG	2	6	444163	444168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523670
6985	NC_012032	TGC	2	6	444197	444202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523670
6986	NC_012032	CAG	2	6	444239	444244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523670
6987	NC_012032	ATC	2	6	444245	444250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523670
6988	NC_012032	ACC	2	6	444430	444435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523670
6989	NC_012032	ACT	2	6	444458	444463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523670
6990	NC_012032	AGGT	2	8	444525	444532	25 %	25 %	50 %	0 %	222523670
6991	NC_012032	GTA	2	6	444566	444571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523670
6992	NC_012032	CAA	2	6	444587	444592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523670
6993	NC_012032	GCCA	2	8	444602	444609	25 %	0 %	25 %	50 %	222523670
6994	NC_012032	ATTC	2	8	444661	444668	25 %	50 %	0 %	25 %	222523671
6995	NC_012032	CAAACT	2	12	444673	444684	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222523671
6996	NC_012032	AGC	2	6	444705	444710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523671
6997	NC_012032	TAT	2	6	444790	444795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523671
6998	NC_012032	CGG	2	6	444829	444834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523671
6999	NC_012032	TCA	2	6	444987	444992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523671
7000	NC_012032	TGC	2	6	445007	445012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523671

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