MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 2260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	CT	3	6	204	209	0 %	50 %	0 %	50 %	220910611
2	NC_011885	GC	3	6	240	245	0 %	0 %	50 %	50 %	220910611
3	NC_011885	ACC	2	6	310	315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910611
4	NC_011885	CTG	2	6	362	367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910611
5	NC_011885	GCA	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910611
6	NC_011885	GGC	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910611
7	NC_011885	TTG	2	6	568	573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910611
8	NC_011885	C	6	6	628	633	0 %	0 %	0 %	100 %	220910611
9	NC_011885	TGA	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910611
10	NC_011885	CGAT	2	8	1014	1021	25 %	25 %	25 %	25 %	220910611
11	NC_011885	G	6	6	1059	1064	0 %	0 %	100 %	0 %	220910611
12	NC_011885	CCAG	2	8	1262	1269	25 %	0 %	25 %	50 %	220910611
13	NC_011885	G	7	7	1269	1275	0 %	0 %	100 %	0 %	220910611
14	NC_011885	CGGG	2	8	1286	1293	0 %	0 %	75 %	25 %	220910611
15	NC_011885	ATCG	2	8	1311	1318	25 %	25 %	25 %	25 %	220910611
16	NC_011885	GGCA	2	8	1436	1443	25 %	0 %	50 %	25 %	220910611
17	NC_011885	TGC	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910611
18	NC_011885	ACTC	2	8	1475	1482	25 %	25 %	0 %	50 %	220910611
19	NC_011885	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910611
20	NC_011885	CAAT	2	8	1785	1792	50 %	25 %	0 %	25 %	220910612
21	NC_011885	ACC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910612
22	NC_011885	CTT	2	6	1814	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910612
23	NC_011885	TAAA	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	220910612
24	NC_011885	GTA	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910612
25	NC_011885	CCGCG	2	10	2081	2090	0 %	0 %	40 %	60 %	220910612
26	NC_011885	AAT	2	6	2136	2141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910612
27	NC_011885	GCG	2	6	2197	2202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910612
28	NC_011885	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910612
29	NC_011885	CCA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910612
30	NC_011885	CCA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910612
31	NC_011885	A	6	6	2518	2523	100 %	0 %	0 %	0 %	220910612
32	NC_011885	CAG	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910613
33	NC_011885	ATC	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910613
34	NC_011885	GGCT	2	8	2889	2896	0 %	25 %	50 %	25 %	220910613
35	NC_011885	A	6	6	3018	3023	100 %	0 %	0 %	0 %	220910613
36	NC_011885	ACG	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910613
37	NC_011885	A	7	7	3057	3063	100 %	0 %	0 %	0 %	220910613
38	NC_011885	CAA	2	6	3082	3087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910613
39	NC_011885	CTG	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910613
40	NC_011885	AGG	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910613
41	NC_011885	CTG	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910613
42	NC_011885	GAT	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910613
43	NC_011885	TTG	2	6	3525	3530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910613
44	NC_011885	GA	3	6	3578	3583	50 %	0 %	50 %	0 %	220910613
45	NC_011885	G	6	6	3637	3642	0 %	0 %	100 %	0 %	220910613
46	NC_011885	TCA	2	6	3830	3835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910613
47	NC_011885	AAC	2	6	3935	3940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910613
48	NC_011885	CAAT	2	8	3965	3972	50 %	25 %	0 %	25 %	220910613
49	NC_011885	GGT	2	6	4915	4920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910614
50	NC_011885	GGA	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910614
51	NC_011885	TGC	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910614
52	NC_011885	GCC	2	6	5181	5186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910614
53	NC_011885	CAA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910614
54	NC_011885	ACT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910614
55	NC_011885	GAC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910614
56	NC_011885	TTG	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910614
57	NC_011885	GCA	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910614
58	NC_011885	CTG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910614
59	NC_011885	GTT	3	9	5404	5412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910614
60	NC_011885	GCT	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910614
61	NC_011885	ATG	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910614
62	NC_011885	CAC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910614
63	NC_011885	GGT	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910614
64	NC_011885	CGC	2	6	6001	6006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910614
65	NC_011885	CTC	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910615
66	NC_011885	TC	3	6	6120	6125	0 %	50 %	0 %	50 %	220910615
67	NC_011885	CGAT	2	8	6136	6143	25 %	25 %	25 %	25 %	220910615
68	NC_011885	AGC	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910615
69	NC_011885	ACT	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910615
70	NC_011885	CGC	2	6	6273	6278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910615
71	NC_011885	GCA	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910615
72	NC_011885	T	7	7	6556	6562	0 %	100 %	0 %	0 %	220910616
73	NC_011885	TAG	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910616
74	NC_011885	ACG	2	6	6631	6636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910616
75	NC_011885	GAC	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910616
76	NC_011885	CTGC	2	8	6702	6709	0 %	25 %	25 %	50 %	220910616
77	NC_011885	CAA	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910616
78	NC_011885	GTTG	2	8	6878	6885	0 %	50 %	50 %	0 %	220910616
79	NC_011885	CGTAG	2	10	6921	6930	20 %	20 %	40 %	20 %	220910616
80	NC_011885	TACT	2	8	6956	6963	25 %	50 %	0 %	25 %	220910616
81	NC_011885	GTG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910616
82	NC_011885	ATA	2	6	7022	7027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910616
83	NC_011885	TCC	2	6	7118	7123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910616
84	NC_011885	ATT	2	6	7165	7170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910616
85	NC_011885	GCTTC	2	10	7194	7203	0 %	40 %	20 %	40 %	220910616
86	NC_011885	GAA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910616
87	NC_011885	CGT	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910616
88	NC_011885	TAC	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910616
89	NC_011885	GCG	3	9	7486	7494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910617
90	NC_011885	AGAA	2	8	7588	7595	75 %	0 %	25 %	0 %	220910617
91	NC_011885	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910617
92	NC_011885	GA	3	6	7681	7686	50 %	0 %	50 %	0 %	220910617
93	NC_011885	TC	3	6	7689	7694	0 %	50 %	0 %	50 %	220910617
94	NC_011885	AAC	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910617
95	NC_011885	CAA	2	6	7893	7898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910617
96	NC_011885	CTC	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910617
97	NC_011885	GTA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910617
98	NC_011885	CTCG	2	8	7995	8002	0 %	25 %	25 %	50 %	220910617
99	NC_011885	GCA	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910617
100	NC_011885	ATA	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910618
101	NC_011885	CTG	2	6	8221	8226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910618
102	NC_011885	CCG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910618
103	NC_011885	A	6	6	8366	8371	100 %	0 %	0 %	0 %	220910618
104	NC_011885	AAT	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910618
105	NC_011885	GCG	2	6	8409	8414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910618
106	NC_011885	TGCC	2	8	8419	8426	0 %	25 %	25 %	50 %	220910618
107	NC_011885	ATG	2	6	8432	8437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910618
108	NC_011885	CG	3	6	8452	8457	0 %	0 %	50 %	50 %	220910618
109	NC_011885	CCAG	2	8	8531	8538	25 %	0 %	25 %	50 %	220910618
110	NC_011885	GATTGC	2	12	8605	8616	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910618
111	NC_011885	AGG	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910618
112	NC_011885	GCA	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910618
113	NC_011885	AAC	2	6	8826	8831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910618
114	NC_011885	GAT	2	6	8897	8902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910618
115	NC_011885	TTGG	2	8	8988	8995	0 %	50 %	50 %	0 %	220910618
116	NC_011885	GCA	2	6	9019	9024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910618
117	NC_011885	CCT	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910618
118	NC_011885	C	6	6	9323	9328	0 %	0 %	0 %	100 %	220910618
119	NC_011885	ATG	2	6	9390	9395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910618
120	NC_011885	CGA	2	6	9792	9797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910619
121	NC_011885	CAT	2	6	9827	9832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910619
122	NC_011885	GCG	2	6	9872	9877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910619
123	NC_011885	GTTC	2	8	9900	9907	0 %	50 %	25 %	25 %	220910619
124	NC_011885	CAC	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910619
125	NC_011885	TGG	2	6	9997	10002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910619
126	NC_011885	T	6	6	10011	10016	0 %	100 %	0 %	0 %	220910619
127	NC_011885	AC	5	10	10125	10134	50 %	0 %	0 %	50 %	220910619
128	NC_011885	GCC	2	6	10193	10198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910619
129	NC_011885	TCC	2	6	10212	10217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910619
130	NC_011885	CGGGG	2	10	10483	10492	0 %	0 %	80 %	20 %	220910619
131	NC_011885	GCA	2	6	11248	11253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910620
132	NC_011885	AGTC	2	8	11259	11266	25 %	25 %	25 %	25 %	220910620
133	NC_011885	GCG	2	6	11296	11301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910620
134	NC_011885	ATC	2	6	11302	11307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910620
135	NC_011885	GCA	2	6	11338	11343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910620
136	NC_011885	AAC	2	6	11393	11398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910620
137	NC_011885	ATCCAC	2	12	11404	11415	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220910620
138	NC_011885	AGG	2	6	11417	11422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910620
139	NC_011885	GCA	2	6	11440	11445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910620
140	NC_011885	CCAG	2	8	11494	11501	25 %	0 %	25 %	50 %	220910620
141	NC_011885	AGT	2	6	11593	11598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910620
142	NC_011885	GCT	2	6	11599	11604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910620
143	NC_011885	GCT	2	6	11840	11845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910621
144	NC_011885	AAAC	2	8	11869	11876	75 %	0 %	0 %	25 %	220910621
145	NC_011885	A	6	6	11885	11890	100 %	0 %	0 %	0 %	220910621
146	NC_011885	TAGG	2	8	12024	12031	25 %	25 %	50 %	0 %	220910621
147	NC_011885	TTTG	2	8	12115	12122	0 %	75 %	25 %	0 %	220910621
148	NC_011885	ACTGG	2	10	12223	12232	20 %	20 %	40 %	20 %	220910621
149	NC_011885	GGC	2	6	12263	12268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910621
150	NC_011885	CAC	2	6	12368	12373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910621
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152	NC_011885	CCTG	2	8	12486	12493	0 %	25 %	25 %	50 %	220910621
153	NC_011885	ATG	2	6	12561	12566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910621
154	NC_011885	CAG	2	6	12584	12589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910621
155	NC_011885	CGAT	2	8	12696	12703	25 %	25 %	25 %	25 %	220910621
156	NC_011885	AGT	2	6	12772	12777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910621
157	NC_011885	GGCA	2	8	12812	12819	25 %	0 %	50 %	25 %	220910621
158	NC_011885	TCG	2	6	12832	12837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910621
159	NC_011885	AAG	2	6	12887	12892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910621
160	NC_011885	AG	3	6	12891	12896	50 %	0 %	50 %	0 %	220910621
161	NC_011885	TGC	2	6	13045	13050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910622
162	NC_011885	ACC	2	6	13133	13138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910622
163	NC_011885	T	6	6	13143	13148	0 %	100 %	0 %	0 %	220910622
164	NC_011885	TAG	2	6	13183	13188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910622
165	NC_011885	GCC	3	9	13190	13198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910622
166	NC_011885	CTC	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910622
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173	NC_011885	ACC	2	6	13609	13614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910622
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178	NC_011885	TGA	2	6	14120	14125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910623
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245	NC_011885	ATTG	2	8	20641	20648	25 %	50 %	25 %	0 %	220910632
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249	NC_011885	GCT	2	6	20890	20895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910632
250	NC_011885	CCA	2	6	20928	20933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910632
251	NC_011885	CAT	2	6	21010	21015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910632
252	NC_011885	GTTT	2	8	21079	21086	0 %	75 %	25 %	0 %	220910632
253	NC_011885	CGT	2	6	21335	21340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910632
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256	NC_011885	AGTA	2	8	21411	21418	50 %	25 %	25 %	0 %	220910632
257	NC_011885	CGC	2	6	21433	21438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910632
258	NC_011885	AATGA	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	220910632
259	NC_011885	ATA	2	6	21485	21490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910632
260	NC_011885	CCG	2	6	21498	21503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910632
261	NC_011885	TCCA	2	8	21566	21573	25 %	25 %	0 %	50 %	220910632
262	NC_011885	CAC	2	6	21635	21640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910632
263	NC_011885	TCA	2	6	21666	21671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910632
264	NC_011885	GAT	2	6	21679	21684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910632
265	NC_011885	CTGG	2	8	21734	21741	0 %	25 %	50 %	25 %	220910632
266	NC_011885	GTT	2	6	21768	21773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910632
267	NC_011885	GTT	2	6	21793	21798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910632
268	NC_011885	CAT	2	6	21808	21813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910632
269	NC_011885	TCGGTG	2	12	21858	21869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220910632
270	NC_011885	GATG	2	8	21958	21965	25 %	25 %	50 %	0 %	220910632
271	NC_011885	GGTC	2	8	22015	22022	0 %	25 %	50 %	25 %	220910632
272	NC_011885	TGCC	2	8	22067	22074	0 %	25 %	25 %	50 %	220910632
273	NC_011885	GTA	2	6	22151	22156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910632
274	NC_011885	CTTC	2	8	22173	22180	0 %	50 %	0 %	50 %	220910632
275	NC_011885	AGA	2	6	22222	22227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910632
276	NC_011885	GAC	2	6	22243	22248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910632
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280	NC_011885	CTT	2	6	22369	22374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910632
281	NC_011885	T	6	6	22373	22378	0 %	100 %	0 %	0 %	220910632
282	NC_011885	GC	3	6	22407	22412	0 %	0 %	50 %	50 %	220910632
283	NC_011885	ATC	2	6	22448	22453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910632
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286	NC_011885	GCT	2	6	22737	22742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910632
287	NC_011885	TAC	2	6	22744	22749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910632
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292	NC_011885	ATCA	2	8	22985	22992	50 %	25 %	0 %	25 %	220910632
293	NC_011885	TGAG	2	8	23004	23011	25 %	25 %	50 %	0 %	220910632
294	NC_011885	CTT	2	6	23097	23102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910632
295	NC_011885	TCT	2	6	23103	23108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910632
296	NC_011885	CAC	2	6	23123	23128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910632
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299	NC_011885	CCA	2	6	23251	23256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910632
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380	NC_011885	T	7	7	29606	29612	0 %	100 %	0 %	0 %	220910635
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386	NC_011885	GGCC	2	8	29930	29937	0 %	0 %	50 %	50 %	220910635
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388	NC_011885	ATT	2	6	30098	30103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910635
389	NC_011885	TTC	2	6	30115	30120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910635
390	NC_011885	AGCTT	2	10	30219	30228	20 %	40 %	20 %	20 %	220910636
391	NC_011885	ATCTT	2	10	30246	30255	20 %	60 %	0 %	20 %	220910636
392	NC_011885	TGT	2	6	30277	30282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910636
393	NC_011885	GTTCT	2	10	30294	30303	0 %	60 %	20 %	20 %	220910636
394	NC_011885	CT	3	6	30327	30332	0 %	50 %	0 %	50 %	220910636
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