MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 2770

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011880	AGT	2	6	135397	135402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883201
2002	NC_011880	GGCT	2	8	135409	135416	0 %	25 %	50 %	25 %	219883201
2003	NC_011880	ATC	2	6	135466	135471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883201
2004	NC_011880	TGG	2	6	135553	135558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883201
2005	NC_011880	CAG	2	6	135568	135573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883201
2006	NC_011880	AGACG	2	10	135591	135600	40 %	0 %	40 %	20 %	219883201
2007	NC_011880	GAGG	2	8	135648	135655	25 %	0 %	75 %	0 %	219883201
2008	NC_011880	TGTTT	2	10	135660	135669	0 %	80 %	20 %	0 %	219883201
2009	NC_011880	TTG	2	6	135706	135711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883201
2010	NC_011880	CAG	2	6	135735	135740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883201
2011	NC_011880	TTG	2	6	135744	135749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883201
2012	NC_011880	CGAG	2	8	135882	135889	25 %	0 %	50 %	25 %	219883201
2013	NC_011880	AAC	2	6	135935	135940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883201
2014	NC_011880	GCG	2	6	135967	135972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883201
2015	NC_011880	GCG	2	6	136012	136017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883201
2016	NC_011880	GTG	2	6	136132	136137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883201
2017	NC_011880	GCAAG	2	10	136227	136236	40 %	0 %	40 %	20 %	219883201
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2021	NC_011880	GTT	2	6	136448	136453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883202
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2023	NC_011880	AGA	2	6	136526	136531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883202
2024	NC_011880	ATC	2	6	136542	136547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883202
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2033	NC_011880	CAGA	2	8	138536	138543	50 %	0 %	25 %	25 %	219883204
2034	NC_011880	ACG	2	6	138621	138626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883204
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2040	NC_011880	CCCAG	2	10	138867	138876	20 %	0 %	20 %	60 %	219883204
2041	NC_011880	TTC	2	6	138928	138933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883204
2042	NC_011880	CGC	2	6	138977	138982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883204
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2045	NC_011880	CACC	2	8	139230	139237	25 %	0 %	0 %	75 %	219883204
2046	NC_011880	ATTC	2	8	139248	139255	25 %	50 %	0 %	25 %	219883204
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2093	NC_011880	TAAG	2	8	141795	141802	50 %	25 %	25 %	0 %	219883206
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2106	NC_011880	G	6	6	142694	142699	0 %	0 %	100 %	0 %	219883207
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2245	NC_011880	CTGA	2	8	149971	149978	25 %	25 %	25 %	25 %	219883214
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2366	NC_011880	TCA	2	6	159420	159425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883219
2367	NC_011880	CTG	2	6	159475	159480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883219
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2485	NC_011880	CGG	2	6	168345	168350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883226
2486	NC_011880	ACT	2	6	168379	168384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883226
2487	NC_011880	TGC	2	6	168465	168470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883226
2488	NC_011880	ACC	3	9	168627	168635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883226
2489	NC_011880	TCC	4	12	168665	168676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883226
2490	NC_011880	GGT	2	6	168698	168703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883226
2491	NC_011880	AC	3	6	168786	168791	50 %	0 %	0 %	50 %	219883226
2492	NC_011880	ACACAG	2	12	168891	168902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	219883226
2493	NC_011880	ATG	2	6	168929	168934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883226
2494	NC_011880	ACT	2	6	169014	169019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883226
2495	NC_011880	ATG	2	6	169034	169039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883226
2496	NC_011880	ATG	2	6	169136	169141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883226
2497	NC_011880	CAG	2	6	169150	169155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883226
2498	NC_011880	ACG	3	9	169252	169260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883226
2499	NC_011880	CCGTG	2	10	169306	169315	0 %	20 %	40 %	40 %	219883226
2500	NC_011880	TTGGG	2	10	169499	169508	0 %	40 %	60 %	0 %	219883226

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