MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_011831	CACCG	2	10	169153	169162	20 %	0 %	20 %	60 %	219847077
3003	NC_011831	TGC	2	6	169234	169239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847077
3004	NC_011831	GCA	2	6	169259	169264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847077
3005	NC_011831	TTG	2	6	169265	169270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847077
3006	NC_011831	GCC	2	6	169283	169288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847077
3007	NC_011831	CG	3	6	169296	169301	0 %	0 %	50 %	50 %	219847077
3008	NC_011831	TGA	2	6	169402	169407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847077
3009	NC_011831	ATT	2	6	169465	169470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847077
3010	NC_011831	GCA	2	6	169577	169582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847077
3011	NC_011831	CAA	2	6	169598	169603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847077
3012	NC_011831	TCG	2	6	169656	169661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847077
3013	NC_011831	GTG	2	6	169697	169702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847077
3014	NC_011831	TGGT	2	8	169848	169855	0 %	50 %	50 %	0 %	219847077
3015	NC_011831	TGT	2	6	169888	169893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847077
3016	NC_011831	GCG	3	9	169967	169975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847077
3017	NC_011831	CCA	2	6	170006	170011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847077
3018	NC_011831	TTG	2	6	170090	170095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847077
3019	NC_011831	TTG	2	6	170111	170116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847077
3020	NC_011831	AAC	2	6	170137	170142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847077
3021	NC_011831	TGGT	2	8	170214	170221	0 %	50 %	50 %	0 %	219847077
3022	NC_011831	GCTT	2	8	170262	170269	0 %	50 %	25 %	25 %	219847077
3023	NC_011831	TGG	2	6	170292	170297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847077
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3025	NC_011831	TC	3	6	170437	170442	0 %	50 %	0 %	50 %	219847077
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3032	NC_011831	CTA	2	6	170785	170790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847077
3033	NC_011831	TGC	2	6	170827	170832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847077
3034	NC_011831	TCG	2	6	170867	170872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847077
3035	NC_011831	CGAGC	2	10	170967	170976	20 %	0 %	40 %	40 %	219847077
3036	NC_011831	GTC	2	6	170996	171001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847077
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3042	NC_011831	ATT	2	6	171343	171348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847077
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3053	NC_011831	CGA	2	6	172116	172121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847079
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3122	NC_011831	GTT	2	6	175508	175513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847082
3123	NC_011831	GGA	2	6	175514	175519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847082
3124	NC_011831	GAT	2	6	175553	175558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847082
3125	NC_011831	TAGT	2	8	175667	175674	25 %	50 %	25 %	0 %	219847082
3126	NC_011831	GCT	2	6	175723	175728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847082
3127	NC_011831	GTA	2	6	175734	175739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847082
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3151	NC_011831	CTTG	2	8	176945	176952	0 %	50 %	25 %	25 %	219847083
3152	NC_011831	GTG	2	6	176965	176970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847083
3153	NC_011831	CGGTA	2	10	177077	177086	20 %	20 %	40 %	20 %	219847083
3154	NC_011831	GCAA	2	8	177155	177162	50 %	0 %	25 %	25 %	219847083
3155	NC_011831	GGCC	2	8	177175	177182	0 %	0 %	50 %	50 %	219847083
3156	NC_011831	TACC	2	8	177206	177213	25 %	25 %	0 %	50 %	219847083
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3219	NC_011831	CGGC	2	8	182927	182934	0 %	0 %	50 %	50 %	219847087
3220	NC_011831	TAGGT	2	10	182991	183000	20 %	40 %	40 %	0 %	219847087
3221	NC_011831	CAT	2	6	183100	183105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847088
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3223	NC_011831	AT	3	6	183130	183135	50 %	50 %	0 %	0 %	219847088
3224	NC_011831	CTAT	2	8	183153	183160	25 %	50 %	0 %	25 %	219847088
3225	NC_011831	CCG	2	6	183208	183213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847088
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3229	NC_011831	CCAA	2	8	183248	183255	50 %	0 %	0 %	50 %	219847088
3230	NC_011831	GCG	2	6	183283	183288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847088
3231	NC_011831	CGG	2	6	183330	183335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847088
3232	NC_011831	TGG	2	6	183339	183344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847088
3233	NC_011831	TTGC	2	8	183350	183357	0 %	50 %	25 %	25 %	219847088
3234	NC_011831	GTC	2	6	183383	183388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
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3237	NC_011831	TGAG	2	8	183435	183442	25 %	25 %	50 %	0 %	219847088
3238	NC_011831	TGT	2	6	183463	183468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847088
3239	NC_011831	TCG	2	6	183543	183548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
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3241	NC_011831	GCA	2	6	183599	183604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847088
3242	NC_011831	TGC	2	6	183613	183618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
3243	NC_011831	TCG	2	6	183654	183659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847088
3244	NC_011831	ACC	2	6	183709	183714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847088
3245	NC_011831	TAT	2	6	183724	183729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847088
3246	NC_011831	TGA	2	6	183868	183873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847088
3247	NC_011831	TGC	4	12	184063	184074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847089
3248	NC_011831	GGCGT	2	10	184077	184086	0 %	20 %	60 %	20 %	219847089
3249	NC_011831	TTGCG	2	10	184132	184141	0 %	40 %	40 %	20 %	219847089
3250	NC_011831	TGC	2	6	184153	184158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847089
3251	NC_011831	TGA	2	6	184163	184168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847089
3252	NC_011831	GGT	2	6	184449	184454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847090
3253	NC_011831	GAC	2	6	184510	184515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847090
3254	NC_011831	TAC	2	6	184529	184534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847090
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3256	NC_011831	CAC	2	6	184569	184574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847090
3257	NC_011831	AGT	2	6	184586	184591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847090
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3262	NC_011831	AGC	2	6	184721	184726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847090
3263	NC_011831	TGA	2	6	185032	185037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847090
3264	NC_011831	AGCG	2	8	185081	185088	25 %	0 %	50 %	25 %	219847090
3265	NC_011831	TGA	2	6	185098	185103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847090
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3273	NC_011831	GCT	2	6	185452	185457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847091
3274	NC_011831	GCT	2	6	185466	185471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847091
3275	NC_011831	GC	3	6	185562	185567	0 %	0 %	50 %	50 %	219847091
3276	NC_011831	GCC	2	6	185706	185711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847092
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3280	NC_011831	CGTTG	2	10	185935	185944	0 %	40 %	40 %	20 %	219847092
3281	NC_011831	CGG	2	6	186011	186016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847092
3282	NC_011831	CAC	2	6	186017	186022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847092
3283	NC_011831	ACC	2	6	186046	186051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847092
3284	NC_011831	CAT	2	6	186218	186223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847092
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3292	NC_011831	GCA	2	6	186626	186631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847093
3293	NC_011831	TCG	2	6	186638	186643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847093
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3295	NC_011831	CGG	2	6	186817	186822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847093
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3299	NC_011831	CAG	2	6	187039	187044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847093
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3302	NC_011831	CATC	2	8	187092	187099	25 %	25 %	0 %	50 %	219847093
3303	NC_011831	GAT	2	6	187147	187152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847093
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3314	NC_011831	ACG	2	6	187516	187521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847094
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3333	NC_011831	TCA	2	6	188808	188813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847095
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3337	NC_011831	A	7	7	188959	188965	100 %	0 %	0 %	0 %	219847095
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3343	NC_011831	CGGAA	2	10	189080	189089	40 %	0 %	40 %	20 %	219847095
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3352	NC_011831	GTA	2	6	189780	189785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847096
3353	NC_011831	GCT	2	6	189925	189930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847096
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3355	NC_011831	ACT	2	6	190032	190037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847096
3356	NC_011831	CGGT	2	8	190043	190050	0 %	25 %	50 %	25 %	219847096
3357	NC_011831	GCA	2	6	190118	190123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847096
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3359	NC_011831	TGC	2	6	190176	190181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847096
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3361	NC_011831	TGA	2	6	190241	190246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847096
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3364	NC_011831	ATC	2	6	190300	190305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847096
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3485	NC_011831	TAT	2	6	196600	196605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847099
3486	NC_011831	TCA	2	6	196632	196637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847099
3487	NC_011831	GGA	2	6	196665	196670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847099
3488	NC_011831	GTG	2	6	196848	196853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847099
3489	NC_011831	AGC	2	6	196902	196907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847099
3490	NC_011831	T	6	6	196978	196983	0 %	100 %	0 %	0 %	219847099
3491	NC_011831	TCA	2	6	197028	197033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847099
3492	NC_011831	TGG	2	6	197068	197073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847099
3493	NC_011831	TGTT	2	8	197151	197158	0 %	75 %	25 %	0 %	219847099
3494	NC_011831	GGCA	2	8	197207	197214	25 %	0 %	50 %	25 %	219847099
3495	NC_011831	ATCGGC	2	12	197237	197248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219847099
3496	NC_011831	CGT	2	6	197335	197340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847099
3497	NC_011831	GGC	2	6	197365	197370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847099
3498	NC_011831	GAC	2	6	197865	197870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847100
3499	NC_011831	TTC	2	6	197875	197880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847100
3500	NC_011831	GCG	2	6	197887	197892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847100

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