MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011831	GCC	2	6	141182	141187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847055
2502	NC_011831	GC	3	6	141251	141256	0 %	0 %	50 %	50 %	219847055
2503	NC_011831	GCC	2	6	141284	141289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847055
2504	NC_011831	AGC	2	6	141307	141312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847055
2505	NC_011831	GCC	2	6	141316	141321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847055
2506	NC_011831	G	6	6	141352	141357	0 %	0 %	100 %	0 %	219847055
2507	NC_011831	GC	3	6	141384	141389	0 %	0 %	50 %	50 %	219847055
2508	NC_011831	G	6	6	141444	141449	0 %	0 %	100 %	0 %	219847055
2509	NC_011831	GC	3	6	141476	141481	0 %	0 %	50 %	50 %	219847055
2510	NC_011831	GCC	2	6	141509	141514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847055
2511	NC_011831	AGC	2	6	141532	141537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847055
2512	NC_011831	GCC	2	6	141541	141546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847055
2513	NC_011831	GC	3	6	141610	141615	0 %	0 %	50 %	50 %	219847055
2514	NC_011831	AGC	2	6	141666	141671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847055
2515	NC_011831	CTT	2	6	141997	142002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847056
2516	NC_011831	GCC	2	6	142049	142054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847056
2517	NC_011831	TGGA	2	8	142076	142083	25 %	25 %	50 %	0 %	219847056
2518	NC_011831	CGTG	2	8	142264	142271	0 %	25 %	50 %	25 %	219847056
2519	NC_011831	AAGC	2	8	142365	142372	50 %	0 %	25 %	25 %	219847056
2520	NC_011831	GGT	2	6	142454	142459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847056
2521	NC_011831	CCCATG	2	12	142518	142529	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219847056
2522	NC_011831	GAG	2	6	142676	142681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847056
2523	NC_011831	TGA	2	6	142816	142821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847056
2524	NC_011831	AAG	2	6	142857	142862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847056
2525	NC_011831	ACGCCG	2	12	142875	142886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219847056
2526	NC_011831	ATG	2	6	142986	142991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847056
2527	NC_011831	GAT	2	6	143078	143083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847056
2528	NC_011831	CCG	2	6	143097	143102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847056
2529	NC_011831	CGAAGA	2	12	143116	143127	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219847056
2530	NC_011831	CGA	2	6	143130	143135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847056
2531	NC_011831	GCT	2	6	143185	143190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847056
2532	NC_011831	AGCCG	2	10	143257	143266	20 %	0 %	40 %	40 %	219847056
2533	NC_011831	ACG	2	6	143290	143295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847056
2534	NC_011831	GCT	2	6	143398	143403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847056
2535	NC_011831	AGA	2	6	144483	144488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847057
2536	NC_011831	GGC	3	9	144546	144554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847057
2537	NC_011831	GAGC	2	8	144602	144609	25 %	0 %	50 %	25 %	219847057
2538	NC_011831	TCC	2	6	144641	144646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847057
2539	NC_011831	CAG	2	6	144757	144762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2540	NC_011831	CG	3	6	144852	144857	0 %	0 %	50 %	50 %	219847057
2541	NC_011831	CACC	2	8	144897	144904	25 %	0 %	0 %	75 %	219847057
2542	NC_011831	TCGA	2	8	144920	144927	25 %	25 %	25 %	25 %	219847057
2543	NC_011831	GAT	2	6	145078	145083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847057
2544	NC_011831	GCGT	2	8	145095	145102	0 %	25 %	50 %	25 %	219847057
2545	NC_011831	TGC	2	6	145151	145156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2546	NC_011831	GCGAAT	2	12	145171	145182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219847057
2547	NC_011831	TGA	2	6	145286	145291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847057
2548	NC_011831	GTG	2	6	145302	145307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847057
2549	NC_011831	ATC	2	6	145357	145362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847057
2550	NC_011831	GTC	2	6	145395	145400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2551	NC_011831	GGCA	2	8	145429	145436	25 %	0 %	50 %	25 %	219847057
2552	NC_011831	TGC	2	6	145505	145510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2553	NC_011831	GC	3	6	145570	145575	0 %	0 %	50 %	50 %	219847057
2554	NC_011831	AGC	2	6	145648	145653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2555	NC_011831	CGCT	2	8	145688	145695	0 %	25 %	25 %	50 %	219847057
2556	NC_011831	GGAT	2	8	145791	145798	25 %	25 %	50 %	0 %	219847057
2557	NC_011831	TTCT	2	8	145900	145907	0 %	75 %	0 %	25 %	219847057
2558	NC_011831	GTG	2	6	145923	145928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847057
2559	NC_011831	TTGA	2	8	145933	145940	25 %	50 %	25 %	0 %	219847057
2560	NC_011831	CAA	2	6	145944	145949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847057
2561	NC_011831	AAT	2	6	145969	145974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847057
2562	NC_011831	GGT	2	6	146034	146039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847057
2563	NC_011831	GCC	2	6	146066	146071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847057
2564	NC_011831	TCA	2	6	146099	146104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847057
2565	NC_011831	CGC	2	6	146121	146126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847057
2566	NC_011831	CGA	2	6	146166	146171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2567	NC_011831	GTGA	2	8	146181	146188	25 %	25 %	50 %	0 %	219847057
2568	NC_011831	CGG	2	6	146200	146205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847057
2569	NC_011831	AAT	2	6	146233	146238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847057
2570	NC_011831	CAGA	2	8	146248	146255	50 %	0 %	25 %	25 %	219847057
2571	NC_011831	AC	3	6	146265	146270	50 %	0 %	0 %	50 %	219847057
2572	NC_011831	ACC	2	6	146346	146351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847057
2573	NC_011831	TTG	2	6	146366	146371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847057
2574	NC_011831	CGA	2	6	146391	146396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2575	NC_011831	TCG	2	6	146416	146421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847057
2576	NC_011831	CCA	2	6	146440	146445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847057
2577	NC_011831	CAA	2	6	146512	146517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847057
2578	NC_011831	AGA	2	6	146523	146528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847057
2579	NC_011831	CCA	2	6	146578	146583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847057
2580	NC_011831	CCA	2	6	146618	146623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847057
2581	NC_011831	ATC	2	6	146690	146695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847057
2582	NC_011831	GCC	2	6	146708	146713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847057
2583	NC_011831	AT	3	6	147123	147128	50 %	50 %	0 %	0 %	219847058
2584	NC_011831	GTCC	2	8	147209	147216	0 %	25 %	25 %	50 %	219847058
2585	NC_011831	A	6	6	147232	147237	100 %	0 %	0 %	0 %	219847058
2586	NC_011831	GCG	2	6	147279	147284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847058
2587	NC_011831	AAG	2	6	147401	147406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847058
2588	NC_011831	ACCG	2	8	147410	147417	25 %	0 %	25 %	50 %	219847058
2589	NC_011831	TG	3	6	147426	147431	0 %	50 %	50 %	0 %	219847058
2590	NC_011831	TTG	2	6	147494	147499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847058
2591	NC_011831	TGC	2	6	147519	147524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847058
2592	NC_011831	TGT	2	6	147565	147570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847058
2593	NC_011831	ATC	2	6	147589	147594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847058
2594	NC_011831	GATC	2	8	147746	147753	25 %	25 %	25 %	25 %	219847059
2595	NC_011831	TGC	2	6	147908	147913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847059
2596	NC_011831	TCA	2	6	147949	147954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847059
2597	NC_011831	GCG	2	6	148031	148036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847059
2598	NC_011831	CAG	2	6	148038	148043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847059
2599	NC_011831	GAAC	2	8	148091	148098	50 %	0 %	25 %	25 %	219847059
2600	NC_011831	CGC	2	6	148131	148136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847059
2601	NC_011831	CGT	2	6	148167	148172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847059
2602	NC_011831	GTG	3	9	148309	148317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847059
2603	NC_011831	TGA	2	6	148340	148345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847059
2604	NC_011831	TTG	2	6	148356	148361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847059
2605	NC_011831	GGC	2	6	148553	148558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847059
2606	NC_011831	GGC	2	6	148560	148565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847059
2607	NC_011831	TGCG	2	8	148569	148576	0 %	25 %	50 %	25 %	219847059
2608	NC_011831	CTATT	2	10	148737	148746	20 %	60 %	0 %	20 %	219847060
2609	NC_011831	AGA	2	6	148759	148764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847060
2610	NC_011831	GAT	2	6	148783	148788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847060
2611	NC_011831	GAA	2	6	148852	148857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847060
2612	NC_011831	ACT	2	6	148877	148882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847060
2613	NC_011831	GAT	2	6	148904	148909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847060
2614	NC_011831	GACC	2	8	148972	148979	25 %	0 %	25 %	50 %	219847060
2615	NC_011831	TGC	2	6	148996	149001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847060
2616	NC_011831	GGT	2	6	149030	149035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847060
2617	NC_011831	CGG	2	6	149049	149054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847060
2618	NC_011831	TGA	2	6	149131	149136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847060
2619	NC_011831	GCG	2	6	149138	149143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847060
2620	NC_011831	GCA	2	6	149213	149218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847060
2621	NC_011831	ATG	2	6	149233	149238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847060
2622	NC_011831	GAG	2	6	149299	149304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847061
2623	NC_011831	CGA	2	6	149349	149354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847061
2624	NC_011831	CGA	2	6	149366	149371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847061
2625	NC_011831	GTG	3	9	149521	149529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847061
2626	NC_011831	GAT	2	6	149607	149612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847061
2627	NC_011831	GCTCA	2	10	149647	149656	20 %	20 %	20 %	40 %	219847061
2628	NC_011831	GCT	2	6	149680	149685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847061
2629	NC_011831	GCT	2	6	149716	149721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847061
2630	NC_011831	ACC	2	6	149820	149825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847061
2631	NC_011831	TGC	2	6	149930	149935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847061
2632	NC_011831	TG	3	6	149977	149982	0 %	50 %	50 %	0 %	219847061
2633	NC_011831	CGG	2	6	150047	150052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847061
2634	NC_011831	TAC	2	6	150091	150096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847061
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2644	NC_011831	GAT	2	6	150680	150685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847062
2645	NC_011831	TCGGCT	2	12	150704	150715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847062
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2649	NC_011831	TCG	2	6	150832	150837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847062
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2651	NC_011831	TGA	2	6	150931	150936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847062
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2728	NC_011831	GCCAG	2	10	155252	155261	20 %	0 %	40 %	40 %	219847065
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2983	NC_011831	GAT	2	6	168037	168042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847076
2984	NC_011831	TCG	2	6	168055	168060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847076
2985	NC_011831	AGT	2	6	168122	168127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847076
2986	NC_011831	TGA	2	6	168178	168183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847076
2987	NC_011831	GCG	2	6	168415	168420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847076
2988	NC_011831	GCC	2	6	168455	168460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847076
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