MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_011831	TCA	2	6	1208500	1208505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847897
21502	NC_011831	GAT	2	6	1208543	1208548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847897
21503	NC_011831	CAC	2	6	1209056	1209061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847898
21504	NC_011831	TCA	2	6	1209077	1209082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847898
21505	NC_011831	TTG	2	6	1209083	1209088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847898
21506	NC_011831	ATC	2	6	1209094	1209099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847898
21507	NC_011831	GTTG	2	8	1209105	1209112	0 %	50 %	50 %	0 %	219847898
21508	NC_011831	TCG	2	6	1209123	1209128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847898
21509	NC_011831	GCG	2	6	1209129	1209134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847898
21510	NC_011831	GCT	2	6	1209136	1209141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847898
21511	NC_011831	C	6	6	1209159	1209164	0 %	0 %	0 %	100 %	219847898
21512	NC_011831	GAA	2	6	1209208	1209213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847898
21513	NC_011831	GCA	2	6	1209340	1209345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847898
21514	NC_011831	CCT	2	6	1209349	1209354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847898
21515	NC_011831	ACC	2	6	1209420	1209425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847898
21516	NC_011831	AC	3	6	1209444	1209449	50 %	0 %	0 %	50 %	219847898
21517	NC_011831	GAT	2	6	1209463	1209468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847898
21518	NC_011831	TCG	2	6	1209476	1209481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847898
21519	NC_011831	GATC	2	8	1209516	1209523	25 %	25 %	25 %	25 %	219847898
21520	NC_011831	TATTCG	2	12	1209534	1209545	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219847898
21521	NC_011831	TGT	2	6	1209618	1209623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847898
21522	NC_011831	CTCA	2	8	1209642	1209649	25 %	25 %	0 %	50 %	219847898
21523	NC_011831	CGA	2	6	1209743	1209748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847898
21524	NC_011831	GGC	2	6	1209847	1209852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847898
21525	NC_011831	GGT	2	6	1209895	1209900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847898
21526	NC_011831	GC	3	6	1209931	1209936	0 %	0 %	50 %	50 %	219847898
21527	NC_011831	TAC	2	6	1209955	1209960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847898
21528	NC_011831	ATCT	2	8	1210078	1210085	25 %	50 %	0 %	25 %	219847898
21529	NC_011831	GATC	2	8	1210110	1210117	25 %	25 %	25 %	25 %	219847898
21530	NC_011831	CGTG	2	8	1210188	1210195	0 %	25 %	50 %	25 %	219847898
21531	NC_011831	GAT	2	6	1210237	1210242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847898
21532	NC_011831	AGC	2	6	1210245	1210250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847898
21533	NC_011831	ACC	2	6	1210332	1210337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847899
21534	NC_011831	AGCT	2	8	1210372	1210379	25 %	25 %	25 %	25 %	219847899
21535	NC_011831	CAAG	2	8	1210455	1210462	50 %	0 %	25 %	25 %	219847899
21536	NC_011831	CGC	2	6	1210665	1210670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847899
21537	NC_011831	GAT	2	6	1210752	1210757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847899
21538	NC_011831	TGG	2	6	1210789	1210794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847899
21539	NC_011831	GAC	2	6	1210817	1210822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847899
21540	NC_011831	CAC	2	6	1210888	1210893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847899
21541	NC_011831	CGC	3	9	1210895	1210903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847899
21542	NC_011831	TGG	2	6	1210990	1210995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847899
21543	NC_011831	TCC	2	6	1211056	1211061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847899
21544	NC_011831	GAT	2	6	1211454	1211459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847900
21545	NC_011831	CGC	2	6	1211472	1211477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847900
21546	NC_011831	GATC	2	8	1211553	1211560	25 %	25 %	25 %	25 %	219847900
21547	NC_011831	TGC	2	6	1211573	1211578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847900
21548	NC_011831	TGA	2	6	1211610	1211615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847900
21549	NC_011831	GTAT	2	8	1211711	1211718	25 %	50 %	25 %	0 %	219847900
21550	NC_011831	GC	3	6	1211859	1211864	0 %	0 %	50 %	50 %	219847900
21551	NC_011831	CAA	2	6	1211869	1211874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847900
21552	NC_011831	CCA	2	6	1211889	1211894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847900
21553	NC_011831	ATG	2	6	1211962	1211967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847900
21554	NC_011831	AAG	2	6	1212025	1212030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847900
21555	NC_011831	GTG	2	6	1212057	1212062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847900
21556	NC_011831	CAG	2	6	1212172	1212177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847900
21557	NC_011831	CGG	2	6	1212230	1212235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847900
21558	NC_011831	CGC	2	6	1212244	1212249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847900
21559	NC_011831	CGGT	2	8	1212290	1212297	0 %	25 %	50 %	25 %	219847900
21560	NC_011831	GAT	2	6	1212334	1212339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847900
21561	NC_011831	GCA	2	6	1212364	1212369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847900
21562	NC_011831	TGC	2	6	1212377	1212382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847900
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21564	NC_011831	TGA	2	6	1212404	1212409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847900
21565	NC_011831	ATT	2	6	1212433	1212438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847900
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21567	NC_011831	ACT	2	6	1212701	1212706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847901
21568	NC_011831	CCCCA	2	10	1212707	1212716	20 %	0 %	0 %	80 %	219847901
21569	NC_011831	CCA	2	6	1212754	1212759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847901
21570	NC_011831	TGT	2	6	1212814	1212819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847901
21571	NC_011831	TCGC	2	8	1212933	1212940	0 %	25 %	25 %	50 %	219847901
21572	NC_011831	AAT	2	6	1213016	1213021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847901
21573	NC_011831	ACA	2	6	1213170	1213175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847901
21574	NC_011831	CTCACG	2	12	1213388	1213399	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219847901
21575	NC_011831	TCAC	2	8	1213407	1213414	25 %	25 %	0 %	50 %	219847901
21576	NC_011831	GCC	2	6	1213423	1213428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847901
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21579	NC_011831	GAG	2	6	1213586	1213591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847901
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21582	NC_011831	CTA	2	6	1213728	1213733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847901
21583	NC_011831	GC	3	6	1213806	1213811	0 %	0 %	50 %	50 %	219847901
21584	NC_011831	CCG	2	6	1213862	1213867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847901
21585	NC_011831	TCA	2	6	1213899	1213904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847901
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21587	NC_011831	CGGC	2	8	1213965	1213972	0 %	0 %	50 %	50 %	219847901
21588	NC_011831	GCTC	2	8	1214077	1214084	0 %	25 %	25 %	50 %	219847901
21589	NC_011831	TCG	2	6	1214177	1214182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847901
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21592	NC_011831	GTG	2	6	1214284	1214289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847901
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21597	NC_011831	ACCG	2	8	1214568	1214575	25 %	0 %	25 %	50 %	219847901
21598	NC_011831	ATC	2	6	1214585	1214590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847901
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21600	NC_011831	CAGC	2	8	1214657	1214664	25 %	0 %	25 %	50 %	219847901
21601	NC_011831	GGA	2	6	1214701	1214706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847901
21602	NC_011831	GCC	2	6	1214769	1214774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847901
21603	NC_011831	ATC	2	6	1214801	1214806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847901
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21605	NC_011831	TGA	2	6	1215176	1215181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847902
21606	NC_011831	ATCG	2	8	1215228	1215235	25 %	25 %	25 %	25 %	219847902
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21610	NC_011831	CAAC	2	8	1215459	1215466	50 %	0 %	0 %	50 %	219847903
21611	NC_011831	AGA	2	6	1215472	1215477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847903
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21613	NC_011831	GC	3	6	1215566	1215571	0 %	0 %	50 %	50 %	219847903
21614	NC_011831	GC	3	6	1215604	1215609	0 %	0 %	50 %	50 %	219847903
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21616	NC_011831	ATCA	2	8	1215659	1215666	50 %	25 %	0 %	25 %	219847903
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21618	NC_011831	GCT	2	6	1215739	1215744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847903
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22000	NC_011831	CGTG	2	8	1237070	1237077	0 %	25 %	50 %	25 %	219847921

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