MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_011831	CAA	2	6	1012093	1012098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847738
18003	NC_011831	CAGC	2	8	1012146	1012153	25 %	0 %	25 %	50 %	219847738
18004	NC_011831	GCA	2	6	1012298	1012303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847738
18005	NC_011831	CGAC	2	8	1012395	1012402	25 %	0 %	25 %	50 %	219847738
18006	NC_011831	GCA	2	6	1012432	1012437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847738
18007	NC_011831	CAT	2	6	1012438	1012443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847738
18008	NC_011831	CCG	2	6	1012459	1012464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847738
18009	NC_011831	TATC	2	8	1012543	1012550	25 %	50 %	0 %	25 %	219847738
18010	NC_011831	CGG	3	9	1012552	1012560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847738
18011	NC_011831	TG	3	6	1012647	1012652	0 %	50 %	50 %	0 %	219847739
18012	NC_011831	CCAT	2	8	1012659	1012666	25 %	25 %	0 %	50 %	219847739
18013	NC_011831	ATT	2	6	1012763	1012768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847739
18014	NC_011831	GCA	2	6	1012808	1012813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847739
18015	NC_011831	GTG	2	6	1012888	1012893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847739
18016	NC_011831	TGA	5	15	1012899	1012913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847739
18017	NC_011831	CGA	2	6	1012930	1012935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847739
18018	NC_011831	TCG	2	6	1013005	1013010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847739
18019	NC_011831	T	6	6	1013046	1013051	0 %	100 %	0 %	0 %	219847739
18020	NC_011831	TCG	2	6	1013085	1013090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847739
18021	NC_011831	CTC	2	6	1013110	1013115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847739
18022	NC_011831	TGT	2	6	1013199	1013204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847739
18023	NC_011831	TTA	2	6	1013269	1013274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847739
18024	NC_011831	TC	3	6	1013301	1013306	0 %	50 %	0 %	50 %	219847739
18025	NC_011831	TC	3	6	1013409	1013414	0 %	50 %	0 %	50 %	219847739
18026	NC_011831	TCG	2	6	1013498	1013503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847739
18027	NC_011831	CGA	2	6	1013568	1013573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847739
18028	NC_011831	GCG	2	6	1013637	1013642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847739
18029	NC_011831	CGG	2	6	1013681	1013686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847739
18030	NC_011831	AG	3	6	1013691	1013696	50 %	0 %	50 %	0 %	219847739
18031	NC_011831	TGT	2	6	1013699	1013704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847739
18032	NC_011831	CGT	2	6	1013733	1013738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847739
18033	NC_011831	AGA	2	6	1013799	1013804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847739
18034	NC_011831	GTGC	2	8	1013827	1013834	0 %	25 %	50 %	25 %	219847739
18035	NC_011831	GCTC	2	8	1013850	1013857	0 %	25 %	25 %	50 %	219847739
18036	NC_011831	TACC	2	8	1013967	1013974	25 %	25 %	0 %	50 %	219847740
18037	NC_011831	ACATC	2	10	1014002	1014011	40 %	20 %	0 %	40 %	219847740
18038	NC_011831	CCT	2	6	1014040	1014045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847740
18039	NC_011831	CA	4	8	1014123	1014130	50 %	0 %	0 %	50 %	219847740
18040	NC_011831	CCA	2	6	1014131	1014136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847740
18041	NC_011831	GCA	2	6	1014137	1014142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18042	NC_011831	CGA	2	6	1014241	1014246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18043	NC_011831	GAT	2	6	1014296	1014301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847740
18044	NC_011831	TGC	2	6	1014310	1014315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18045	NC_011831	GCT	2	6	1014322	1014327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18046	NC_011831	GAT	2	6	1014394	1014399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847740
18047	NC_011831	GAG	2	6	1014401	1014406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847740
18048	NC_011831	ACT	2	6	1014409	1014414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847740
18049	NC_011831	CCG	2	6	1014415	1014420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847740
18050	NC_011831	GCTG	2	8	1014444	1014451	0 %	25 %	50 %	25 %	219847740
18051	NC_011831	TGC	2	6	1014517	1014522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18052	NC_011831	AGT	2	6	1014553	1014558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847740
18053	NC_011831	GCA	2	6	1014614	1014619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18054	NC_011831	CCA	2	6	1014643	1014648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847740
18055	NC_011831	TGGA	2	8	1014665	1014672	25 %	25 %	50 %	0 %	219847740
18056	NC_011831	GC	3	6	1014716	1014721	0 %	0 %	50 %	50 %	219847740
18057	NC_011831	ACG	2	6	1014768	1014773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847740
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18059	NC_011831	ACT	2	6	1014939	1014944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847740
18060	NC_011831	CAA	2	6	1014959	1014964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847740
18061	NC_011831	GCA	2	6	1015050	1015055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18062	NC_011831	ACG	2	6	1015090	1015095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847740
18063	NC_011831	GGAT	2	8	1015124	1015131	25 %	25 %	50 %	0 %	219847740
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18074	NC_011831	ACC	2	6	1015484	1015489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847741
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18077	NC_011831	ATC	2	6	1015650	1015655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847741
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18083	NC_011831	TTG	2	6	1015975	1015980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847741
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18087	NC_011831	CGA	2	6	1016221	1016226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847741
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18096	NC_011831	GC	3	6	1016604	1016609	0 %	0 %	50 %	50 %	219847742
18097	NC_011831	TTG	2	6	1016634	1016639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847742
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18099	NC_011831	G	6	6	1016744	1016749	0 %	0 %	100 %	0 %	219847742
18100	NC_011831	GAA	2	6	1016775	1016780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847742
18101	NC_011831	ATT	2	6	1016790	1016795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847742
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18103	NC_011831	CGA	2	6	1016828	1016833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847742
18104	NC_011831	GCG	2	6	1016910	1016915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847742
18105	NC_011831	GCA	2	6	1016934	1016939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847742
18106	NC_011831	ACACC	2	10	1017013	1017022	40 %	0 %	0 %	60 %	219847742
18107	NC_011831	GAAC	2	8	1017053	1017060	50 %	0 %	25 %	25 %	219847742
18108	NC_011831	CAG	3	9	1017103	1017111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847742
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18116	NC_011831	GCC	2	6	1017429	1017434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847742
18117	NC_011831	GCT	2	6	1017441	1017446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847742
18118	NC_011831	GGC	2	6	1017455	1017460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847742
18119	NC_011831	GATCGG	2	12	1017724	1017735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219847743
18120	NC_011831	TTG	2	6	1017780	1017785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847743
18121	NC_011831	GTG	2	6	1017837	1017842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847743
18122	NC_011831	AGG	2	6	1017880	1017885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847743
18123	NC_011831	TGA	2	6	1017912	1017917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847743
18124	NC_011831	GGT	2	6	1018022	1018027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847743
18125	NC_011831	GAT	2	6	1018040	1018045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847743
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18128	NC_011831	TG	3	6	1018262	1018267	0 %	50 %	50 %	0 %	219847743
18129	NC_011831	GC	3	6	1018283	1018288	0 %	0 %	50 %	50 %	219847743
18130	NC_011831	GCAG	2	8	1018327	1018334	25 %	0 %	50 %	25 %	219847743
18131	NC_011831	CTGT	2	8	1018414	1018421	0 %	50 %	25 %	25 %	219847744
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18134	NC_011831	TGA	2	6	1018512	1018517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847744
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18138	NC_011831	GCGA	2	8	1018583	1018590	25 %	0 %	50 %	25 %	219847744
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18230	NC_011831	AC	3	6	1023518	1023523	50 %	0 %	0 %	50 %	219847747
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18232	NC_011831	ACT	2	6	1023573	1023578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847747
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18348	NC_011831	G	6	6	1030353	1030358	0 %	0 %	100 %	0 %	219847754
18349	NC_011831	TTA	2	6	1030401	1030406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847754
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18352	NC_011831	CGG	2	6	1030527	1030532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847754
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